MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011528	CGC	2	6	180242	180247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217872
4002	NC_011528	T	6	6	180250	180255	0 %	100 %	0 %	0 %	212217872
4003	NC_011528	TAC	2	6	180357	180362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011528	TGAA	2	8	180407	180414	50 %	25 %	25 %	0 %	212217873
4005	NC_011528	TTTTC	2	10	180422	180431	0 %	80 %	0 %	20 %	212217873
4006	NC_011528	T	7	7	180465	180471	0 %	100 %	0 %	0 %	212217873
4007	NC_011528	TTG	2	6	180476	180481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217873
4008	NC_011528	TTC	3	9	180482	180490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217873
4009	NC_011528	GAA	2	6	180491	180496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217873
4010	NC_011528	ATT	2	6	180504	180509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217873
4011	NC_011528	TAA	2	6	180526	180531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011528	GA	4	8	180583	180590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011528	GGT	2	6	180634	180639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011528	C	6	6	180648	180653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4015	NC_011528	T	8	8	180654	180661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011528	ATT	2	6	180662	180667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217874
4017	NC_011528	TC	3	6	180692	180697	0 %	50 %	0 %	50 %	212217874
4018	NC_011528	TCA	2	6	180709	180714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217874
4019	NC_011528	TAC	2	6	180716	180721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217874
4020	NC_011528	AGT	2	6	180809	180814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217874
4021	NC_011528	CAC	2	6	180854	180859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217874
4022	NC_011528	TGC	2	6	180862	180867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217874
4023	NC_011528	CGC	2	6	180903	180908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217874
4024	NC_011528	CGTT	2	8	180934	180941	0 %	50 %	25 %	25 %	212217874
4025	NC_011528	TTC	2	6	181011	181016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217874
4026	NC_011528	CTAA	2	8	181045	181052	50 %	25 %	0 %	25 %	212217874
4027	NC_011528	T	6	6	181073	181078	0 %	100 %	0 %	0 %	212217874
4028	NC_011528	TTC	2	6	181092	181097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217874
4029	NC_011528	T	6	6	181116	181121	0 %	100 %	0 %	0 %	212217874
4030	NC_011528	CCG	2	6	181130	181135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217874
4031	NC_011528	GAA	2	6	181234	181239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217874
4032	NC_011528	ATGAC	2	10	181264	181273	40 %	20 %	20 %	20 %	212217874
4033	NC_011528	T	7	7	181334	181340	0 %	100 %	0 %	0 %	212217874
4034	NC_011528	CTG	2	6	181359	181364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217874
4035	NC_011528	TCGA	2	8	181404	181411	25 %	25 %	25 %	25 %	212217874
4036	NC_011528	TTTTCT	2	12	181441	181452	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212217874
4037	NC_011528	AAG	2	6	181460	181465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217874
4038	NC_011528	TCA	2	6	181472	181477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217874
4039	NC_011528	T	6	6	181571	181576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011528	GC	3	6	181635	181640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_011528	GCA	2	6	181644	181649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_011528	GAC	2	6	181678	181683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_011528	GAA	2	6	181722	181727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011528	T	7	7	181738	181744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011528	A	7	7	181747	181753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011528	GAT	2	6	181766	181771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011528	AATA	2	8	181772	181779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011528	CAG	2	6	181796	181801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_011528	ACGCCT	2	12	181873	181884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_011528	GGT	2	6	181908	181913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011528	GCA	2	6	181930	181935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_011528	ACC	2	6	181945	181950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_011528	GCA	2	6	181972	181977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_011528	TGG	2	6	182018	182023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011528	GC	3	6	182069	182074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_011528	TGCG	2	8	182099	182106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_011528	CAC	2	6	182120	182125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_011528	ACCA	2	8	182139	182146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_011528	GCC	2	6	182149	182154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_011528	CAT	2	6	182177	182182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_011528	CGT	2	6	182296	182301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_011528	AAT	2	6	182302	182307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011528	A	6	6	182316	182321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011528	ATA	2	6	182323	182328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011528	A	6	6	182521	182526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011528	AAT	2	6	182544	182549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011528	TGA	2	6	182555	182560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011528	ATGG	2	8	182595	182602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011528	ACA	2	6	182614	182619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_011528	AAGCCA	2	12	182623	182634	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_011528	GTT	2	6	182657	182662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011528	TAA	2	6	182713	182718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011528	TAA	2	6	182740	182745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011528	TAAA	2	8	182760	182767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_011528	CCGA	2	8	182888	182895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_011528	A	6	6	182943	182948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011528	TAACA	2	10	183019	183028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4078	NC_011528	ATT	3	9	183198	183206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217875
4079	NC_011528	T	6	6	183211	183216	0 %	100 %	0 %	0 %	212217875
4080	NC_011528	T	6	6	183477	183482	0 %	100 %	0 %	0 %	212217875
4081	NC_011528	ATT	2	6	183540	183545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217875
4082	NC_011528	AAG	2	6	183566	183571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217875
4083	NC_011528	CAA	2	6	183595	183600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217875
4084	NC_011528	A	6	6	183668	183673	100 %	0 %	0 %	0 %	212217875
4085	NC_011528	TTA	2	6	183676	183681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217875
4086	NC_011528	T	7	7	183695	183701	0 %	100 %	0 %	0 %	212217875
4087	NC_011528	ATA	2	6	183709	183714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217875
4088	NC_011528	ATT	2	6	183768	183773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217875
4089	NC_011528	CTTC	2	8	183794	183801	0 %	50 %	0 %	50 %	212217876
4090	NC_011528	AGA	2	6	183901	183906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217876
4091	NC_011528	GC	4	8	184024	184031	0 %	0 %	50 %	50 %	212217876
4092	NC_011528	ATT	2	6	184032	184037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217876
4093	NC_011528	GAT	2	6	184069	184074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217876
4094	NC_011528	CCA	2	6	184113	184118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217876
4095	NC_011528	TAA	2	6	184167	184172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217876
4096	NC_011528	TAA	2	6	184195	184200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217876
4097	NC_011528	GAT	2	6	184223	184228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217876
4098	NC_011528	GGA	2	6	184252	184257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217876
4099	NC_011528	TA	3	6	184334	184339	50 %	50 %	0 %	0 %	212217876
4100	NC_011528	CAG	2	6	184368	184373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217876
4101	NC_011528	AAC	2	6	184569	184574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217876
4102	NC_011528	TTCA	2	8	184586	184593	25 %	50 %	0 %	25 %	212217876
4103	NC_011528	TCA	2	6	184698	184703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217877
4104	NC_011528	TATC	2	8	184740	184747	25 %	50 %	0 %	25 %	212217877
4105	NC_011528	T	6	6	184770	184775	0 %	100 %	0 %	0 %	212217877
4106	NC_011528	ATCA	2	8	184829	184836	50 %	25 %	0 %	25 %	212217877
4107	NC_011528	TGA	2	6	184884	184889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217877
4108	NC_011528	AGG	2	6	184937	184942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217877
4109	NC_011528	ATTA	2	8	185019	185026	50 %	50 %	0 %	0 %	212217877
4110	NC_011528	ATT	2	6	185035	185040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217877
4111	NC_011528	TTA	2	6	185081	185086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217877
4112	NC_011528	ATA	2	6	185137	185142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217877
4113	NC_011528	AATT	2	8	185234	185241	50 %	50 %	0 %	0 %	212217877
4114	NC_011528	GCT	2	6	185257	185262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217877
4115	NC_011528	CAT	2	6	185347	185352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_011528	ATT	2	6	185358	185363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011528	TTA	2	6	185377	185382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011528	ATA	2	6	185390	185395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011528	GTA	2	6	185406	185411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011528	ATT	2	6	185455	185460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217878
4121	NC_011528	ACA	2	6	185516	185521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217878
4122	NC_011528	C	6	6	185571	185576	0 %	0 %	0 %	100 %	212217878
4123	NC_011528	ATTG	2	8	185583	185590	25 %	50 %	25 %	0 %	212217878
4124	NC_011528	TATAAT	2	12	185598	185609	50 %	50 %	0 %	0 %	212217878
4125	NC_011528	A	8	8	185661	185668	100 %	0 %	0 %	0 %	212217878
4126	NC_011528	T	9	9	185687	185695	0 %	100 %	0 %	0 %	212217878
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4128	NC_011528	ATG	2	6	185728	185733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217878
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4255	NC_011528	ATT	2	6	191183	191188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_011528	GCC	2	6	191202	191207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_011528	GCACA	2	10	191403	191412	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4259	NC_011528	GAG	2	6	191492	191497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_011528	GAC	2	6	191521	191526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4279	NC_011528	TGT	2	6	192326	192331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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