MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011528	ATTC	2	8	158074	158081	25 %	50 %	0 %	25 %	212217847
3502	NC_011528	GTG	2	6	158180	158185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217847
3503	NC_011528	CTT	2	6	158239	158244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217847
3504	NC_011528	T	7	7	158290	158296	0 %	100 %	0 %	0 %	212217847
3505	NC_011528	TCGC	2	8	158304	158311	0 %	25 %	25 %	50 %	212217847
3506	NC_011528	T	6	6	158368	158373	0 %	100 %	0 %	0 %	212217848
3507	NC_011528	T	6	6	158385	158390	0 %	100 %	0 %	0 %	212217848
3508	NC_011528	TCA	2	6	158403	158408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217848
3509	NC_011528	GTG	2	6	158446	158451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217848
3510	NC_011528	TCA	2	6	158457	158462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217848
3511	NC_011528	CGA	2	6	158465	158470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217848
3512	NC_011528	T	6	6	158476	158481	0 %	100 %	0 %	0 %	212217848
3513	NC_011528	CGC	2	6	158497	158502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217848
3514	NC_011528	GCT	2	6	158565	158570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217848
3515	NC_011528	GCT	2	6	158604	158609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217848
3516	NC_011528	ATTG	2	8	158613	158620	25 %	50 %	25 %	0 %	212217848
3517	NC_011528	CCG	2	6	158700	158705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217848
3518	NC_011528	TCA	2	6	158789	158794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217848
3519	NC_011528	TAAA	2	8	158823	158830	75 %	25 %	0 %	0 %	212217848
3520	NC_011528	ATC	2	6	158854	158859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217848
3521	NC_011528	TTG	2	6	158869	158874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217848
3522	NC_011528	CGA	2	6	158931	158936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217848
3523	NC_011528	CTT	2	6	158970	158975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217848
3524	NC_011528	CG	3	6	158996	159001	0 %	0 %	50 %	50 %	212217848
3525	NC_011528	ACA	2	6	159047	159052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217848
3526	NC_011528	AAAC	2	8	159061	159068	75 %	0 %	0 %	25 %	212217848
3527	NC_011528	AAT	2	6	159070	159075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217848
3528	NC_011528	CAT	2	6	159109	159114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217848
3529	NC_011528	TCA	2	6	159138	159143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217848
3530	NC_011528	CCG	2	6	159309	159314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217849
3531	NC_011528	TAA	2	6	159395	159400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217849
3532	NC_011528	TAT	2	6	159516	159521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217849
3533	NC_011528	A	6	6	159555	159560	100 %	0 %	0 %	0 %	212217849
3534	NC_011528	GCA	2	6	159635	159640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217849
3535	NC_011528	ATT	2	6	159641	159646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217849
3536	NC_011528	TTTC	2	8	159692	159699	0 %	75 %	0 %	25 %	212217849
3537	NC_011528	TTG	2	6	159701	159706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217849
3538	NC_011528	GAA	2	6	159846	159851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217849
3539	NC_011528	TGC	2	6	159854	159859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217849
3540	NC_011528	A	6	6	159926	159931	100 %	0 %	0 %	0 %	212217849
3541	NC_011528	GCGA	2	8	159974	159981	25 %	0 %	50 %	25 %	212217849
3542	NC_011528	A	6	6	159987	159992	100 %	0 %	0 %	0 %	212217849
3543	NC_011528	GAA	2	6	160011	160016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217849
3544	NC_011528	ATG	2	6	160068	160073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217849
3545	NC_011528	AAG	2	6	160171	160176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217849
3546	NC_011528	CGG	2	6	160195	160200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217849
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3548	NC_011528	GGC	2	6	160243	160248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217849
3549	NC_011528	CGG	2	6	160256	160261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217849
3550	NC_011528	ATA	2	6	160372	160377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217849
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3552	NC_011528	TTA	2	6	160452	160457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217849
3553	NC_011528	AAAG	2	8	160486	160493	75 %	0 %	25 %	0 %	212217849
3554	NC_011528	TTA	2	6	160648	160653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217850
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3556	NC_011528	TTTA	2	8	160830	160837	25 %	75 %	0 %	0 %	212217850
3557	NC_011528	GTG	2	6	160877	160882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217850
3558	NC_011528	ATT	2	6	160918	160923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217850
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3560	NC_011528	T	6	6	161052	161057	0 %	100 %	0 %	0 %	212217850
3561	NC_011528	ATT	2	6	161174	161179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217850
3562	NC_011528	GC	3	6	161252	161257	0 %	0 %	50 %	50 %	212217850
3563	NC_011528	A	6	6	161333	161338	100 %	0 %	0 %	0 %	212217850
3564	NC_011528	ATC	2	6	161363	161368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217850
3565	NC_011528	ATT	2	6	161373	161378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217850
3566	NC_011528	GCA	2	6	161526	161531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_011528	AAT	4	12	161573	161584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011528	CTTC	2	8	161600	161607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_011528	AGACAT	2	12	161659	161670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3570	NC_011528	CAAG	2	8	161747	161754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_011528	CAAT	2	8	161756	161763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_011528	ATTTTT	2	12	161773	161784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011528	T	7	7	161780	161786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_011528	CTC	2	6	161802	161807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_011528	ACCATT	3	18	161815	161832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_011528	ATGA	2	8	161913	161920	50 %	25 %	25 %	0 %	212217851
3577	NC_011528	CGAC	2	8	162013	162020	25 %	0 %	25 %	50 %	212217851
3578	NC_011528	GGC	2	6	162141	162146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217851
3579	NC_011528	CATCCC	2	12	162189	162200	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	212217851
3580	NC_011528	TGA	2	6	162271	162276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217851
3581	NC_011528	TTA	2	6	162303	162308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217851
3582	NC_011528	CG	3	6	162324	162329	0 %	0 %	50 %	50 %	212217851
3583	NC_011528	AATT	2	8	162364	162371	50 %	50 %	0 %	0 %	212217851
3584	NC_011528	ATTT	2	8	162387	162394	25 %	75 %	0 %	0 %	212217851
3585	NC_011528	A	6	6	162453	162458	100 %	0 %	0 %	0 %	212217851
3586	NC_011528	A	7	7	162470	162476	100 %	0 %	0 %	0 %	212217851
3587	NC_011528	ACG	2	6	162491	162496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217851
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3589	NC_011528	GAC	3	9	162510	162518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217851
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3591	NC_011528	GCTT	2	8	162536	162543	0 %	50 %	25 %	25 %	212217851
3592	NC_011528	A	7	7	162545	162551	100 %	0 %	0 %	0 %	212217851
3593	NC_011528	TTA	2	6	162568	162573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217851
3594	NC_011528	GCCCC	2	10	162604	162613	0 %	0 %	20 %	80 %	212217851
3595	NC_011528	TGT	2	6	162617	162622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217851
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3599	NC_011528	ATT	2	6	162729	162734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217852
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3603	NC_011528	TAA	2	6	162821	162826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217852
3604	NC_011528	T	6	6	162831	162836	0 %	100 %	0 %	0 %	212217852
3605	NC_011528	AAT	2	6	162864	162869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217852
3606	NC_011528	TA	3	6	162884	162889	50 %	50 %	0 %	0 %	212217852
3607	NC_011528	TGTCT	2	10	163010	163019	0 %	60 %	20 %	20 %	212217852
3608	NC_011528	TGAT	2	8	163050	163057	25 %	50 %	25 %	0 %	212217852
3609	NC_011528	AATAA	2	10	163074	163083	80 %	20 %	0 %	0 %	212217852
3610	NC_011528	A	6	6	163082	163087	100 %	0 %	0 %	0 %	212217852
3611	NC_011528	T	6	6	163317	163322	0 %	100 %	0 %	0 %	212217852
3612	NC_011528	AAC	2	6	163388	163393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217852
3613	NC_011528	ACTTT	2	10	163489	163498	20 %	60 %	0 %	20 %	212217852
3614	NC_011528	TCA	2	6	163600	163605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217852
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3616	NC_011528	CTT	2	6	163646	163651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217852
3617	NC_011528	GATT	2	8	163664	163671	25 %	50 %	25 %	0 %	212217852
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3620	NC_011528	TTA	2	6	163717	163722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217852
3621	NC_011528	TCTG	2	8	163840	163847	0 %	50 %	25 %	25 %	212217852
3622	NC_011528	TGG	2	6	163912	163917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217852
3623	NC_011528	T	6	6	164008	164013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011528	GGC	2	6	164091	164096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217853
3625	NC_011528	AGG	2	6	164099	164104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217853
3626	NC_011528	CCGCAG	2	12	164107	164118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212217853
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3628	NC_011528	TCT	3	9	164269	164277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217853
3629	NC_011528	TCG	2	6	164302	164307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217853
3630	NC_011528	CGC	2	6	164357	164362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217853
3631	NC_011528	TGA	2	6	164366	164371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217853
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3638	NC_011528	TCC	2	6	164551	164556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3646	NC_011528	GAG	2	6	164822	164827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217854
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3650	NC_011528	GTT	2	6	164930	164935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217854
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3998	NC_011528	TCC	2	6	180095	180100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217872
3999	NC_011528	GTT	2	6	180130	180135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217872
4000	NC_011528	TCTT	2	8	180143	180150	0 %	75 %	0 %	25 %	212217872

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