MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011528	CATT	2	8	1224590	1224597	25 %	50 %	0 %	25 %	212218808
27003	NC_011528	GAT	2	6	1224749	1224754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218808
27004	NC_011528	ATGA	2	8	1224809	1224816	50 %	25 %	25 %	0 %	212218808
27005	NC_011528	TCC	2	6	1224998	1225003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27006	NC_011528	ACG	2	6	1225079	1225084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218809
27007	NC_011528	ATG	2	6	1225104	1225109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218809
27008	NC_011528	TCGGG	2	10	1225129	1225138	0 %	20 %	60 %	20 %	212218809
27009	NC_011528	GCA	2	6	1225276	1225281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218809
27010	NC_011528	T	8	8	1225321	1225328	0 %	100 %	0 %	0 %	212218809
27011	NC_011528	CAT	2	6	1225425	1225430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218809
27012	NC_011528	ATG	2	6	1225482	1225487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218809
27013	NC_011528	TAAT	2	8	1225501	1225508	50 %	50 %	0 %	0 %	212218809
27014	NC_011528	ATTA	2	8	1225562	1225569	50 %	50 %	0 %	0 %	212218809
27015	NC_011528	AAT	2	6	1225617	1225622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218809
27016	NC_011528	TAA	2	6	1225625	1225630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218809
27017	NC_011528	TTTG	2	8	1225700	1225707	0 %	75 %	25 %	0 %	212218809
27018	NC_011528	ATC	2	6	1225797	1225802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218809
27019	NC_011528	ATT	2	6	1225809	1225814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218809
27020	NC_011528	TATT	3	12	1225811	1225822	25 %	75 %	0 %	0 %	212218809
27021	NC_011528	TTA	2	6	1225920	1225925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218809
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27033	NC_011528	GTTT	2	8	1226404	1226411	0 %	75 %	25 %	0 %	212218809
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27052	NC_011528	GCA	2	6	1227225	1227230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218810
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27119	NC_011528	TTTTG	2	10	1230734	1230743	0 %	80 %	20 %	0 %	212218813
27120	NC_011528	GTT	2	6	1230749	1230754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212218813
27121	NC_011528	ATG	2	6	1230771	1230776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218813
27122	NC_011528	ATTA	2	8	1230832	1230839	50 %	50 %	0 %	0 %	212218813
27123	NC_011528	GCT	2	6	1230849	1230854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27124	NC_011528	ATA	2	6	1230855	1230860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27125	NC_011528	ATTA	2	8	1230870	1230877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27126	NC_011528	CTGG	2	8	1230920	1230927	0 %	25 %	50 %	25 %	212218814
27127	NC_011528	AAC	2	6	1230970	1230975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218814
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27130	NC_011528	TGA	2	6	1231081	1231086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218814
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27138	NC_011528	GCA	2	6	1231438	1231443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218814
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27147	NC_011528	CGCT	2	8	1231763	1231770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27148	NC_011528	TCG	2	6	1231850	1231855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27149	NC_011528	TGG	2	6	1231858	1231863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27150	NC_011528	T	7	7	1231887	1231893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27151	NC_011528	TCA	2	6	1231926	1231931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27200	NC_011528	GAA	2	6	1233903	1233908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27222	NC_011528	A	7	7	1234764	1234770	100 %	0 %	0 %	0 %	212218818
27223	NC_011528	T	7	7	1234775	1234781	0 %	100 %	0 %	0 %	212218818
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27356	NC_011528	TGA	2	6	1240873	1240878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218822
27357	NC_011528	TTA	2	6	1240895	1240900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218822
27358	NC_011528	CAA	2	6	1240909	1240914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218822
27359	NC_011528	TAA	2	6	1240935	1240940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218822
27360	NC_011528	TTA	2	6	1240941	1240946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218822
27361	NC_011528	TAA	2	6	1240948	1240953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212218822
27362	NC_011528	CAA	2	6	1240967	1240972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218822
27363	NC_011528	A	6	6	1240971	1240976	100 %	0 %	0 %	0 %	212218822
27364	NC_011528	AAC	2	6	1241061	1241066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218822
27365	NC_011528	A	7	7	1241071	1241077	100 %	0 %	0 %	0 %	212218822
27366	NC_011528	TCT	2	6	1241110	1241115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218822
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27371	NC_011528	GCC	2	6	1241264	1241269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212218822
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27377	NC_011528	CAT	2	6	1241719	1241724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212218823
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27379	NC_011528	TAATT	2	10	1241834	1241843	40 %	60 %	0 %	0 %	212218823
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27384	NC_011528	CAA	2	6	1242267	1242272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218823
27385	NC_011528	A	6	6	1242296	1242301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27386	NC_011528	T	6	6	1242315	1242320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27387	NC_011528	AAT	2	6	1242337	1242342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27388	NC_011528	C	6	6	1242437	1242442	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27389	NC_011528	TCG	2	6	1242553	1242558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218824
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27392	NC_011528	ACCC	2	8	1242780	1242787	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27393	NC_011528	TTG	2	6	1242788	1242793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27394	NC_011528	CAA	2	6	1242795	1242800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27395	NC_011528	TGA	2	6	1242808	1242813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27396	NC_011528	AAAG	2	8	1242814	1242821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27397	NC_011528	CCA	2	6	1242861	1242866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27398	NC_011528	TGA	2	6	1242876	1242881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27401	NC_011528	T	8	8	1243022	1243029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27402	NC_011528	CGG	2	6	1243035	1243040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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27424	NC_011528	T	7	7	1244075	1244081	0 %	100 %	0 %	0 %	212218825
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27427	NC_011528	TAA	2	6	1244253	1244258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27428	NC_011528	TGA	2	6	1244304	1244309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218826
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27461	NC_011528	TCGT	2	8	1245793	1245800	0 %	50 %	25 %	25 %	212218828
27462	NC_011528	ATCT	2	8	1245837	1245844	25 %	50 %	0 %	25 %	212218828
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27471	NC_011528	AGCGAC	2	12	1246490	1246501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218828
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27473	NC_011528	T	7	7	1246603	1246609	0 %	100 %	0 %	0 %	212218828
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27475	NC_011528	GGT	2	6	1246655	1246660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212218828
27476	NC_011528	CGA	2	6	1246757	1246762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212218828
27477	NC_011528	CAA	2	6	1246799	1246804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218828
27478	NC_011528	GCG	2	6	1246824	1246829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212218828
27479	NC_011528	AGT	2	6	1246856	1246861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218828
27480	NC_011528	ATTA	2	8	1246905	1246912	50 %	50 %	0 %	0 %	212218828
27481	NC_011528	A	6	6	1246930	1246935	100 %	0 %	0 %	0 %	212218828
27482	NC_011528	CTT	2	6	1246944	1246949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212218828
27483	NC_011528	ACA	2	6	1246984	1246989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212218828
27484	NC_011528	TATTT	2	10	1247124	1247133	20 %	80 %	0 %	0 %	212218829
27485	NC_011528	GCAA	2	8	1247137	1247144	50 %	0 %	25 %	25 %	212218829
27486	NC_011528	AAAC	2	8	1247167	1247174	75 %	0 %	0 %	25 %	212218829
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27488	NC_011528	TCC	2	6	1247223	1247228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212218829
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27490	NC_011528	ATT	3	9	1247271	1247279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218829
27491	NC_011528	GGT	2	6	1247327	1247332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212218829
27492	NC_011528	T	6	6	1247343	1247348	0 %	100 %	0 %	0 %	212218829
27493	NC_011528	GAT	2	6	1247388	1247393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212218829
27494	NC_011528	TAT	2	6	1247401	1247406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218829
27495	NC_011528	AACA	2	8	1247413	1247420	75 %	0 %	0 %	25 %	212218829
27496	NC_011528	TCC	2	6	1247424	1247429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212218829
27497	NC_011528	TC	3	6	1247452	1247457	0 %	50 %	0 %	50 %	212218829
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27499	NC_011528	TGC	3	9	1247523	1247531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212218829
27500	NC_011528	TAT	2	6	1247546	1247551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212218829

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