MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011528	A	6	6	23630	23635	100 %	0 %	0 %	0 %	212217710
502	NC_011528	CGC	3	9	23655	23663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217710
503	NC_011528	GAA	2	6	23671	23676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217710
504	NC_011528	CTG	2	6	23733	23738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217711
505	NC_011528	TA	3	6	23749	23754	50 %	50 %	0 %	0 %	212217711
506	NC_011528	ATA	2	6	23771	23776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217711
507	NC_011528	TAT	2	6	23795	23800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217711
508	NC_011528	GA	3	6	23802	23807	50 %	0 %	50 %	0 %	212217711
509	NC_011528	GCAA	2	8	23840	23847	50 %	0 %	25 %	25 %	212217711
510	NC_011528	AGG	2	6	23898	23903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217711
511	NC_011528	AAGA	2	8	23914	23921	75 %	0 %	25 %	0 %	212217711
512	NC_011528	TCG	2	6	23943	23948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217711
513	NC_011528	TTG	2	6	23949	23954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217711
514	NC_011528	CTC	3	9	24043	24051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217711
515	NC_011528	TGG	2	6	24219	24224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217712
516	NC_011528	AAT	2	6	24282	24287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217713
517	NC_011528	TTG	2	6	24299	24304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217713
518	NC_011528	GGC	2	6	24441	24446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217713
519	NC_011528	AAAC	2	8	24607	24614	75 %	0 %	0 %	25 %	212217713
520	NC_011528	GCG	2	6	24632	24637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217713
521	NC_011528	AAATGG	2	12	24675	24686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212217713
522	NC_011528	CAAC	2	8	24688	24695	50 %	0 %	0 %	50 %	212217713
523	NC_011528	A	6	6	24717	24722	100 %	0 %	0 %	0 %	212217713
524	NC_011528	GAT	2	6	24823	24828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217713
525	NC_011528	GAA	2	6	24855	24860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217713
526	NC_011528	CCG	2	6	24906	24911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217713
527	NC_011528	ACC	2	6	24915	24920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217713
528	NC_011528	CAA	2	6	25063	25068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217713
529	NC_011528	ACT	2	6	25118	25123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217713
530	NC_011528	AGCG	2	8	25140	25147	25 %	0 %	50 %	25 %	212217713
531	NC_011528	TGGT	2	8	25166	25173	0 %	50 %	50 %	0 %	212217713
532	NC_011528	AATG	2	8	25188	25195	50 %	25 %	25 %	0 %	212217713
533	NC_011528	GCC	2	6	25213	25218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217713
534	NC_011528	GAAC	2	8	25285	25292	50 %	0 %	25 %	25 %	212217713
535	NC_011528	TTTTG	2	10	25328	25337	0 %	80 %	20 %	0 %	212217713
536	NC_011528	TAT	3	9	25383	25391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217713
537	NC_011528	ACG	2	6	25393	25398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217713
538	NC_011528	T	6	6	25415	25420	0 %	100 %	0 %	0 %	212217713
539	NC_011528	GC	3	6	25453	25458	0 %	0 %	50 %	50 %	212217713
540	NC_011528	GAT	2	6	25507	25512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217713
541	NC_011528	CG	3	6	25528	25533	0 %	0 %	50 %	50 %	212217713
542	NC_011528	GGC	2	6	25573	25578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217713
543	NC_011528	TATT	2	8	25607	25614	25 %	75 %	0 %	0 %	212217713
544	NC_011528	TTA	2	6	25628	25633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217713
545	NC_011528	TAT	2	6	25702	25707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217713
546	NC_011528	CAA	2	6	25744	25749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217713
547	NC_011528	CAA	2	6	25780	25785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217713
548	NC_011528	A	6	6	25784	25789	100 %	0 %	0 %	0 %	212217713
549	NC_011528	TCA	2	6	25826	25831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217713
550	NC_011528	CAA	2	6	25866	25871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217713
551	NC_011528	GTG	2	6	25873	25878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217713
552	NC_011528	GCGCG	2	10	25939	25948	0 %	0 %	60 %	40 %	212217713
553	NC_011528	GCTTC	2	10	25984	25993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
554	NC_011528	TTG	2	6	26015	26020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011528	AG	4	8	26033	26040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011528	GCA	2	6	26058	26063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011528	ACA	2	6	26157	26162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217714
558	NC_011528	TGG	2	6	26171	26176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217714
559	NC_011528	TAG	2	6	26183	26188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217714
560	NC_011528	CAG	2	6	26227	26232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_011528	TGT	2	6	26235	26240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011528	GGA	2	6	26269	26274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011528	TAT	2	6	26394	26399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217715
564	NC_011528	ATC	2	6	26421	26426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217715
565	NC_011528	TGC	2	6	26488	26493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217715
566	NC_011528	G	6	6	26516	26521	0 %	0 %	100 %	0 %	212217715
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568	NC_011528	TGA	2	6	26641	26646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217715
569	NC_011528	CGG	2	6	26716	26721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217715
570	NC_011528	TTA	2	6	26741	26746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217715
571	NC_011528	GC	4	8	26766	26773	0 %	0 %	50 %	50 %	212217715
572	NC_011528	GCCC	2	8	26777	26784	0 %	0 %	25 %	75 %	212217715
573	NC_011528	AAGCGG	2	12	26835	26846	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212217715
574	NC_011528	AGC	2	6	26878	26883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217715
575	NC_011528	CGTT	2	8	26897	26904	0 %	50 %	25 %	25 %	212217715
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577	NC_011528	GAA	3	9	26993	27001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217715
578	NC_011528	CGA	2	6	27016	27021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217715
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591	NC_011528	A	6	6	27559	27564	100 %	0 %	0 %	0 %	212217715
592	NC_011528	A	6	6	27571	27576	100 %	0 %	0 %	0 %	212217715
593	NC_011528	CCAC	2	8	27594	27601	25 %	0 %	0 %	75 %	212217715
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599	NC_011528	T	6	6	27865	27870	0 %	100 %	0 %	0 %	212217716
600	NC_011528	C	6	6	27907	27912	0 %	0 %	0 %	100 %	212217716
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612	NC_011528	TCAA	2	8	28308	28315	50 %	25 %	0 %	25 %	212217716
613	NC_011528	A	7	7	28349	28355	100 %	0 %	0 %	0 %	212217716
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616	NC_011528	T	6	6	28411	28416	0 %	100 %	0 %	0 %	212217716
617	NC_011528	TCGCT	2	10	28431	28440	0 %	40 %	20 %	40 %	212217716
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619	NC_011528	AGCGA	2	10	28476	28485	40 %	0 %	40 %	20 %	212217716
620	NC_011528	AATTC	2	10	28495	28504	40 %	40 %	0 %	20 %	212217716
621	NC_011528	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011528	TAT	2	6	28575	28580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011528	T	8	8	28582	28589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011528	A	7	7	28598	28604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_011528	CAG	2	6	28736	28741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011528	GAAA	2	8	28742	28749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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