MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 45441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011528	GCGT	2	8	225578	225585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_011528	AAT	2	6	225650	225655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011528	AGCG	2	8	225674	225681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_011528	A	6	6	225699	225704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011528	GAG	2	6	225750	225755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011528	AAAC	2	8	225759	225766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_011528	ATT	2	6	225838	225843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011528	TTA	2	6	225882	225887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011528	TTAA	2	8	225960	225967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011528	TTTAT	2	10	225968	225977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011528	CAG	2	6	226002	226007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011528	ATT	2	6	226019	226024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011528	GTG	2	6	226047	226052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011528	GAA	2	6	226115	226120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011528	CAAA	2	8	226130	226137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_011528	TGG	2	6	226242	226247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011528	GA	3	6	226287	226292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011528	TGT	2	6	226306	226311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011528	AGA	2	6	226352	226357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011528	TTA	2	6	226416	226421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011528	TGG	2	6	226459	226464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011528	A	6	6	226465	226470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011528	TTG	2	6	226479	226484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011528	GGT	2	6	226487	226492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011528	AGC	2	6	226523	226528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_011528	CTA	2	6	226529	226534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_011528	CTG	2	6	226548	226553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_011528	TAT	2	6	226615	226620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011528	TCC	2	6	226626	226631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_011528	TGAA	2	8	226867	226874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011528	CAA	2	6	226899	226904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_011528	A	7	7	226930	226936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011528	ATT	2	6	226968	226973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011528	ATT	2	6	227018	227023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011528	CTT	2	6	227031	227036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_011528	GCA	2	6	227043	227048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_011528	TTA	2	6	227097	227102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011528	GGTCTC	2	12	227213	227224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_011528	AGCC	2	8	227247	227254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_011528	A	6	6	227255	227260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011528	AGA	2	6	227278	227283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011528	A	7	7	227388	227394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_011528	AAT	2	6	227407	227412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011528	GAA	3	9	227435	227443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011528	TTA	2	6	227447	227452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011528	GTA	2	6	227468	227473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011528	CCT	2	6	227485	227490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_011528	TTA	2	6	227522	227527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011528	GGA	2	6	227552	227557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011528	CAGT	2	8	227606	227613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_011528	ATT	2	6	227617	227622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011528	TAT	2	6	227630	227635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_011528	TTG	2	6	227668	227673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011528	AGG	2	6	227709	227714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011528	TGCG	2	8	227733	227740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_011528	A	6	6	227772	227777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011528	T	6	6	227860	227865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011528	TTG	2	6	227875	227880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217919
5059	NC_011528	GAC	2	6	227887	227892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217919
5060	NC_011528	TAA	2	6	227917	227922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217919
5061	NC_011528	GCC	2	6	228001	228006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217919
5062	NC_011528	AAATA	3	15	228110	228124	80 %	20 %	0 %	0 %	212217919
5063	NC_011528	CA	3	6	228143	228148	50 %	0 %	0 %	50 %	212217919
5064	NC_011528	AG	3	6	228187	228192	50 %	0 %	50 %	0 %	212217919
5065	NC_011528	CAT	2	6	228217	228222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217919
5066	NC_011528	GACT	2	8	228240	228247	25 %	25 %	25 %	25 %	212217919
5067	NC_011528	CCG	2	6	228287	228292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217919
5068	NC_011528	A	6	6	228295	228300	100 %	0 %	0 %	0 %	212217919
5069	NC_011528	AAT	2	6	228305	228310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217919
5070	NC_011528	AGCG	2	8	228316	228323	25 %	0 %	50 %	25 %	212217919
5071	NC_011528	AAAG	2	8	228376	228383	75 %	0 %	25 %	0 %	212217919
5072	NC_011528	ATG	2	6	228487	228492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217919
5073	NC_011528	AAT	2	6	228585	228590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217919
5074	NC_011528	TTC	2	6	228673	228678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217919
5075	NC_011528	CCCGC	2	10	228728	228737	0 %	0 %	20 %	80 %	212217919
5076	NC_011528	TAA	2	6	228763	228768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217919
5077	NC_011528	ACA	2	6	228794	228799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217919
5078	NC_011528	ATG	2	6	228812	228817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217919
5079	NC_011528	GTT	2	6	228837	228842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217919
5080	NC_011528	GGC	2	6	229009	229014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217919
5081	NC_011528	ATA	2	6	229032	229037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217919
5082	NC_011528	TTA	2	6	229040	229045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217919
5083	NC_011528	GGA	2	6	229114	229119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217920
5084	NC_011528	AG	3	6	229123	229128	50 %	0 %	50 %	0 %	212217920
5085	NC_011528	GGCG	2	8	229143	229150	0 %	0 %	75 %	25 %	212217920
5086	NC_011528	GGT	2	6	229154	229159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217920
5087	NC_011528	T	6	6	229190	229195	0 %	100 %	0 %	0 %	212217920
5088	NC_011528	TGA	2	6	229240	229245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217921
5089	NC_011528	GAA	2	6	229274	229279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217921
5090	NC_011528	A	6	6	229285	229290	100 %	0 %	0 %	0 %	212217921
5091	NC_011528	GAT	2	6	229301	229306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217921
5092	NC_011528	CGC	2	6	229329	229334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217921
5093	NC_011528	T	6	6	229366	229371	0 %	100 %	0 %	0 %	212217921
5094	NC_011528	CAC	2	6	229448	229453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217921
5095	NC_011528	GAT	2	6	229523	229528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217921
5096	NC_011528	AGG	2	6	229549	229554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217921
5097	NC_011528	AGGGA	2	10	229570	229579	40 %	0 %	60 %	0 %	212217921
5098	NC_011528	ACG	2	6	229601	229606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217921
5099	NC_011528	GAT	2	6	229615	229620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217921
5100	NC_011528	A	6	6	229757	229762	100 %	0 %	0 %	0 %	212217921
5101	NC_011528	TCG	2	6	229822	229827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217921
5102	NC_011528	TAT	2	6	229839	229844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011528	GAG	2	6	229889	229894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217922
5104	NC_011528	CCG	2	6	229954	229959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217922
5105	NC_011528	CTT	2	6	230011	230016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217922
5106	NC_011528	GCC	2	6	230017	230022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217922
5107	NC_011528	TGC	2	6	230025	230030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217922
5108	NC_011528	TCC	2	6	230097	230102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217922
5109	NC_011528	CAAT	2	8	230160	230167	50 %	25 %	0 %	25 %	212217922
5110	NC_011528	TTTC	2	8	230227	230234	0 %	75 %	0 %	25 %	212217922
5111	NC_011528	TGAT	2	8	230249	230256	25 %	50 %	25 %	0 %	212217922
5112	NC_011528	GCT	2	6	230291	230296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_011528	TAAA	2	8	230301	230308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_011528	TTA	2	6	230321	230326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011528	GACA	2	8	230364	230371	50 %	0 %	25 %	25 %	212217923
5116	NC_011528	CTT	2	6	230384	230389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
5117	NC_011528	A	6	6	230473	230478	100 %	0 %	0 %	0 %	212217923
5118	NC_011528	CCT	2	6	230489	230494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217923
5119	NC_011528	TTC	2	6	230501	230506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
5120	NC_011528	TCTT	2	8	230521	230528	0 %	75 %	0 %	25 %	212217923
5121	NC_011528	TTATCC	2	12	230584	230595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212217923
5122	NC_011528	CCT	2	6	230624	230629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217923
5123	NC_011528	G	7	7	230646	230652	0 %	0 %	100 %	0 %	212217923
5124	NC_011528	TCA	2	6	230659	230664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
5125	NC_011528	T	7	7	230740	230746	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
5126	NC_011528	GCC	2	6	230832	230837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217923
5127	NC_011528	TCTCAA	2	12	230849	230860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
5128	NC_011528	GTT	2	6	230871	230876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217923
5129	NC_011528	TCA	2	6	230980	230985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
5130	NC_011528	TTA	2	6	231017	231022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217923
5131	NC_011528	CTT	2	6	231037	231042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
5132	NC_011528	T	6	6	231157	231162	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
5133	NC_011528	T	6	6	231192	231197	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
5134	NC_011528	TTG	2	6	231225	231230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217923
5135	NC_011528	TCG	2	6	231250	231255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217923
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5137	NC_011528	ATCG	2	8	231326	231333	25 %	25 %	25 %	25 %	212217923
5138	NC_011528	TCA	2	6	231364	231369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217923
5139	NC_011528	TTTTG	2	10	231410	231419	0 %	80 %	20 %	0 %	212217923
5140	NC_011528	GGC	2	6	231441	231446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217923
5141	NC_011528	CTTC	2	8	231464	231471	0 %	50 %	0 %	50 %	212217923
5142	NC_011528	CTT	2	6	231476	231481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
5143	NC_011528	T	7	7	231503	231509	0 %	100 %	0 %	0 %	212217923
5144	NC_011528	TGC	2	6	231515	231520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217923
5145	NC_011528	TTC	2	6	231537	231542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217923
5146	NC_011528	TC	3	6	231574	231579	0 %	50 %	0 %	50 %	212217923
5147	NC_011528	CGGGT	2	10	231628	231637	0 %	20 %	60 %	20 %	212217924
5148	NC_011528	CTT	2	6	231655	231660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217924
5149	NC_011528	TCC	2	6	231672	231677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217924
5150	NC_011528	T	6	6	231682	231687	0 %	100 %	0 %	0 %	212217924
5151	NC_011528	GGA	2	6	231688	231693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217924
5152	NC_011528	TCTT	2	8	231716	231723	0 %	75 %	0 %	25 %	212217924
5153	NC_011528	GCT	2	6	231814	231819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217924
5154	NC_011528	TGCT	2	8	231824	231831	0 %	50 %	25 %	25 %	212217924
5155	NC_011528	CCA	2	6	231858	231863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217924
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5158	NC_011528	CG	3	6	232033	232038	0 %	0 %	50 %	50 %	212217924
5159	NC_011528	T	6	6	232091	232096	0 %	100 %	0 %	0 %	212217924
5160	NC_011528	TA	3	6	232156	232161	50 %	50 %	0 %	0 %	212217924
5161	NC_011528	TTA	2	6	232185	232190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217924
5162	NC_011528	TTAG	2	8	232197	232204	25 %	50 %	25 %	0 %	212217924
5163	NC_011528	ATT	2	6	232277	232282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217924
5164	NC_011528	TTCAGC	2	12	232385	232396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212217924
5165	NC_011528	TCC	2	6	232414	232419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217924
5166	NC_011528	GTG	2	6	232511	232516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217924
5167	NC_011528	AG	3	6	232546	232551	50 %	0 %	50 %	0 %	212217924
5168	NC_011528	T	7	7	232621	232627	0 %	100 %	0 %	0 %	212217924
5169	NC_011528	G	9	9	232654	232662	0 %	0 %	100 %	0 %	212217924
5170	NC_011528	TC	5	10	232705	232714	0 %	50 %	0 %	50 %	212217924
5171	NC_011528	TTTTC	2	10	232738	232747	0 %	80 %	0 %	20 %	212217924
5172	NC_011528	TTG	2	6	232772	232777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217924
5173	NC_011528	TGA	2	6	232821	232826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217924
5174	NC_011528	TAA	2	6	232916	232921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_011528	GTA	2	6	232961	232966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_011528	GA	3	6	232973	232978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_011528	TTTC	2	8	232998	233005	0 %	75 %	0 %	25 %	212217925
5178	NC_011528	CG	3	6	233017	233022	0 %	0 %	50 %	50 %	212217925
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5185	NC_011528	T	6	6	233275	233280	0 %	100 %	0 %	0 %	212217926
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5189	NC_011528	TCT	2	6	233537	233542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5190	NC_011528	CTT	2	6	233635	233640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5191	NC_011528	GTT	2	6	233710	233715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217927
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5208	NC_011528	GGT	2	6	234568	234573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217929
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5216	NC_011528	GTT	2	6	235072	235077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217929
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5223	NC_011528	GAAGAT	2	12	235527	235538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212217930
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5227	NC_011528	A	7	7	235595	235601	100 %	0 %	0 %	0 %	212217930
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5229	NC_011528	GCC	2	6	235639	235644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5230	NC_011528	CAA	2	6	235727	235732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217931
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5237	NC_011528	CCGGTT	2	12	235959	235970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217931
5238	NC_011528	ATTT	2	8	236038	236045	25 %	75 %	0 %	0 %	212217931
5239	NC_011528	TGG	2	6	236055	236060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217931
5240	NC_011528	GCT	2	6	236061	236066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217931
5241	NC_011528	T	7	7	236131	236137	0 %	100 %	0 %	0 %	212217931
5242	NC_011528	ATTA	2	8	236162	236169	50 %	50 %	0 %	0 %	212217931
5243	NC_011528	TTA	2	6	236184	236189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217931
5244	NC_011528	TGGA	2	8	236212	236219	25 %	25 %	50 %	0 %	212217931
5245	NC_011528	GCC	2	6	236243	236248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217931
5246	NC_011528	TTG	2	6	236322	236327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217931
5247	NC_011528	GCT	2	6	236333	236338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217931
5248	NC_011528	TGA	2	6	236359	236364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217931
5249	NC_011528	T	6	6	236404	236409	0 %	100 %	0 %	0 %	212217931
5250	NC_011528	A	6	6	236410	236415	100 %	0 %	0 %	0 %	212217931
5251	NC_011528	TC	3	6	236516	236521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_011528	GC	3	6	236613	236618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_011528	GC	3	6	236624	236629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_011528	GAC	2	6	236666	236671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_011528	TGT	2	6	236707	236712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_011528	CGAA	2	8	236760	236767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5257	NC_011528	GTTT	2	8	236825	236832	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_011528	TAG	2	6	236929	236934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5372	NC_011528	TTTG	2	8	242562	242569	0 %	75 %	25 %	0 %	212217940
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5374	NC_011528	A	6	6	242611	242616	100 %	0 %	0 %	0 %	212217940
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5378	NC_011528	CCA	2	6	242795	242800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217940
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5494	NC_011528	CAA	2	6	248462	248467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5498	NC_011528	A	8	8	248585	248592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_011528	ACC	2	6	248696	248701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5500	NC_011528	TAA	2	6	248722	248727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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