MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011527	TGG	2	6	181156	181161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211845
4002	NC_011527	TGAG	2	8	181216	181223	25 %	25 %	50 %	0 %	212211845
4003	NC_011527	ATG	2	6	181285	181290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211845
4004	NC_011527	CTA	2	6	181292	181297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211845
4005	NC_011527	ATG	2	6	181314	181319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211845
4006	NC_011527	ATTTA	2	10	181377	181386	40 %	60 %	0 %	0 %	212211845
4007	NC_011527	T	6	6	181399	181404	0 %	100 %	0 %	0 %	212211845
4008	NC_011527	CGAT	2	8	181420	181427	25 %	25 %	25 %	25 %	212211845
4009	NC_011527	GTT	2	6	181454	181459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211845
4010	NC_011527	T	7	7	181541	181547	0 %	100 %	0 %	0 %	212211845
4011	NC_011527	GCCGC	2	10	181549	181558	0 %	0 %	40 %	60 %	212211845
4012	NC_011527	TGG	2	6	181561	181566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211845
4013	NC_011527	ATA	3	9	181685	181693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211845
4014	NC_011527	TAA	2	6	181731	181736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211845
4015	NC_011527	CTCA	2	8	181740	181747	25 %	25 %	0 %	50 %	212211845
4016	NC_011527	T	6	6	181761	181766	0 %	100 %	0 %	0 %	212211845
4017	NC_011527	CAA	2	6	181778	181783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211845
4018	NC_011527	GCTTT	2	10	181799	181808	0 %	60 %	20 %	20 %	212211845
4019	NC_011527	CGG	2	6	181843	181848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211845
4020	NC_011527	ACG	2	6	181897	181902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211845
4021	NC_011527	TTC	2	6	181989	181994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211845
4022	NC_011527	AAC	2	6	182020	182025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211845
4023	NC_011527	CAT	2	6	182082	182087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211845
4024	NC_011527	T	6	6	182103	182108	0 %	100 %	0 %	0 %	212211845
4025	NC_011527	AATT	2	8	182229	182236	50 %	50 %	0 %	0 %	212211845
4026	NC_011527	TTGA	2	8	182325	182332	25 %	50 %	25 %	0 %	212211845
4027	NC_011527	TTG	2	6	182340	182345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211845
4028	NC_011527	AGC	2	6	182373	182378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211845
4029	NC_011527	TTGA	2	8	182379	182386	25 %	50 %	25 %	0 %	212211845
4030	NC_011527	T	6	6	182396	182401	0 %	100 %	0 %	0 %	212211845
4031	NC_011527	AAT	2	6	182451	182456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211845
4032	NC_011527	GATAAT	2	12	182468	182479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212211845
4033	NC_011527	CAA	2	6	182491	182496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211845
4034	NC_011527	TCG	2	6	182533	182538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211845
4035	NC_011527	CAC	2	6	182589	182594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211845
4036	NC_011527	TC	3	6	182615	182620	0 %	50 %	0 %	50 %	212211845
4037	NC_011527	AAT	2	6	182687	182692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211845
4038	NC_011527	GCG	2	6	182708	182713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211845
4039	NC_011527	ACGA	2	8	182840	182847	50 %	0 %	25 %	25 %	212211846
4040	NC_011527	GCA	2	6	182889	182894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211846
4041	NC_011527	GCCG	2	8	183010	183017	0 %	0 %	50 %	50 %	212211846
4042	NC_011527	GTCGAA	2	12	183026	183037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212211846
4043	NC_011527	ATG	2	6	183054	183059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211846
4044	NC_011527	AAC	2	6	183096	183101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211846
4045	NC_011527	AAG	2	6	183114	183119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211846
4046	NC_011527	AGA	2	6	183148	183153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211846
4047	NC_011527	ACC	2	6	183202	183207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211846
4048	NC_011527	TTG	2	6	183213	183218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211846
4049	NC_011527	GGT	2	6	183269	183274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211846
4050	NC_011527	TCGT	2	8	183306	183313	0 %	50 %	25 %	25 %	212211846
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4052	NC_011527	TGCG	2	8	183445	183452	0 %	25 %	50 %	25 %	212211847
4053	NC_011527	ATT	2	6	183455	183460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211847
4054	NC_011527	T	6	6	183477	183482	0 %	100 %	0 %	0 %	212211847
4055	NC_011527	GCA	2	6	183524	183529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211847
4056	NC_011527	ATT	2	6	183595	183600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211847
4057	NC_011527	TGT	2	6	183637	183642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211847
4058	NC_011527	GCA	2	6	183704	183709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211847
4059	NC_011527	ATT	2	6	183785	183790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211847
4060	NC_011527	A	6	6	183810	183815	100 %	0 %	0 %	0 %	212211847
4061	NC_011527	TTAC	2	8	183826	183833	25 %	50 %	0 %	25 %	212211847
4062	NC_011527	GAA	2	6	183834	183839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211847
4063	NC_011527	CCAA	2	8	183904	183911	50 %	0 %	0 %	50 %	212211847
4064	NC_011527	AC	3	6	183949	183954	50 %	0 %	0 %	50 %	212211847
4065	NC_011527	AGTG	2	8	183972	183979	25 %	25 %	50 %	0 %	212211847
4066	NC_011527	GCG	2	6	184041	184046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211847
4067	NC_011527	GGAAT	2	10	184107	184116	40 %	20 %	40 %	0 %	212211847
4068	NC_011527	GAA	2	6	184131	184136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211847
4069	NC_011527	AAC	2	6	184153	184158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211847
4070	NC_011527	CGA	2	6	184220	184225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211847
4071	NC_011527	CGC	2	6	184235	184240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211847
4072	NC_011527	GCC	2	6	184256	184261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211847
4073	NC_011527	GAAA	2	8	184311	184318	75 %	0 %	25 %	0 %	212211847
4074	NC_011527	GAC	2	6	184326	184331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211847
4075	NC_011527	AAATC	2	10	184382	184391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4076	NC_011527	CAAAA	2	10	184404	184413	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4077	NC_011527	AAT	2	6	184441	184446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011527	TAAA	2	8	184456	184463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011527	ATAA	2	8	184471	184478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011527	A	6	6	184477	184482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011527	TTAT	2	8	184483	184490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011527	ATTTT	2	10	184491	184500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011527	TTTA	2	8	184501	184508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011527	TTAA	2	8	184512	184519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_011527	TAT	2	6	184527	184532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011527	T	6	6	184549	184554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011527	AAAT	2	8	184561	184568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_011527	CTT	2	6	184614	184619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211848
4089	NC_011527	GAA	2	6	184751	184756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211848
4090	NC_011527	GAATTA	2	12	184763	184774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212211848
4091	NC_011527	AT	3	6	184778	184783	50 %	50 %	0 %	0 %	212211848
4092	NC_011527	CGA	2	6	184843	184848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211848
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4094	NC_011527	A	6	6	185020	185025	100 %	0 %	0 %	0 %	212211848
4095	NC_011527	AAC	2	6	185089	185094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211848
4096	NC_011527	GGA	2	6	185123	185128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211848
4097	NC_011527	GCG	2	6	185168	185173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211848
4098	NC_011527	T	6	6	185208	185213	0 %	100 %	0 %	0 %	212211848
4099	NC_011527	AAC	2	6	185227	185232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211848
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4101	NC_011527	A	8	8	185249	185256	100 %	0 %	0 %	0 %	212211848
4102	NC_011527	ATA	2	6	185303	185308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211848
4103	NC_011527	AGTT	2	8	185310	185317	25 %	50 %	25 %	0 %	212211848
4104	NC_011527	AT	3	6	185427	185432	50 %	50 %	0 %	0 %	212211848
4105	NC_011527	ATA	2	6	185436	185441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211848
4106	NC_011527	TAA	2	6	185557	185562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211848
4107	NC_011527	GAA	2	6	185624	185629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211848
4108	NC_011527	TGT	2	6	185638	185643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211848
4109	NC_011527	GCT	2	6	185654	185659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211848
4110	NC_011527	AGT	2	6	185758	185763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211848
4111	NC_011527	ATT	2	6	185947	185952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211848
4112	NC_011527	CTCTT	2	10	185953	185962	0 %	60 %	0 %	40 %	212211848
4113	NC_011527	TTA	2	6	186061	186066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011527	GAA	2	6	186105	186110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211849
4115	NC_011527	TTAAT	2	10	186124	186133	40 %	60 %	0 %	0 %	212211849
4116	NC_011527	ATTT	2	8	186141	186148	25 %	75 %	0 %	0 %	212211849
4117	NC_011527	AT	3	6	186179	186184	50 %	50 %	0 %	0 %	212211849
4118	NC_011527	A	9	9	186208	186216	100 %	0 %	0 %	0 %	212211849
4119	NC_011527	AGC	2	6	186220	186225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211849
4120	NC_011527	CTAAAG	2	12	186256	186267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211849
4121	NC_011527	AAC	2	6	186279	186284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211849
4122	NC_011527	ATA	2	6	186291	186296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211849
4123	NC_011527	CAAA	2	8	186375	186382	75 %	0 %	0 %	25 %	212211849
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4125	NC_011527	T	7	7	186567	186573	0 %	100 %	0 %	0 %	212211849
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