MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011527	CGAG	2	8	135567	135574	25 %	0 %	50 %	25 %	212211805
3002	NC_011527	AGAA	2	8	135597	135604	75 %	0 %	25 %	0 %	212211805
3003	NC_011527	A	6	6	135603	135608	100 %	0 %	0 %	0 %	212211805
3004	NC_011527	A	7	7	135644	135650	100 %	0 %	0 %	0 %	212211804
3005	NC_011527	CAT	3	9	135657	135665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211804
3006	NC_011527	CAA	2	6	135745	135750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211804
3007	NC_011527	GAA	2	6	135934	135939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211804
3008	NC_011527	A	6	6	135942	135947	100 %	0 %	0 %	0 %	212211804
3009	NC_011527	TCGCT	2	10	136014	136023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_011527	AAT	2	6	136056	136061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_011527	CCAC	2	8	136078	136085	25 %	0 %	0 %	75 %	212211806
3012	NC_011527	CGG	2	6	136138	136143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211806
3013	NC_011527	AGC	2	6	136192	136197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211806
3014	NC_011527	TTGC	2	8	136211	136218	0 %	50 %	25 %	25 %	212211806
3015	NC_011527	ATA	2	6	136282	136287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211806
3016	NC_011527	T	7	7	136309	136315	0 %	100 %	0 %	0 %	212211807
3017	NC_011527	TTTC	2	8	136343	136350	0 %	75 %	0 %	25 %	212211807
3018	NC_011527	GAGAG	2	10	136399	136408	40 %	0 %	60 %	0 %	212211807
3019	NC_011527	CAA	2	6	136509	136514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211807
3020	NC_011527	CAGC	2	8	136539	136546	25 %	0 %	25 %	50 %	212211807
3021	NC_011527	ATA	2	6	136569	136574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3022	NC_011527	CGC	2	6	136615	136620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211807
3023	NC_011527	AATAA	2	10	136646	136655	80 %	20 %	0 %	0 %	212211807
3024	NC_011527	CTTT	2	8	136677	136684	0 %	75 %	0 %	25 %	212211807
3025	NC_011527	TCATG	2	10	136725	136734	20 %	40 %	20 %	20 %	212211807
3026	NC_011527	GCTG	2	8	136744	136751	0 %	25 %	50 %	25 %	212211807
3027	NC_011527	TTG	2	6	136852	136857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211807
3028	NC_011527	CAC	3	9	136900	136908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211807
3029	NC_011527	T	6	6	136960	136965	0 %	100 %	0 %	0 %	212211807
3030	NC_011527	GCG	2	6	136974	136979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211807
3031	NC_011527	CGAC	2	8	137000	137007	25 %	0 %	25 %	50 %	212211807
3032	NC_011527	CCA	2	6	137040	137045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211807
3033	NC_011527	AC	3	6	137073	137078	50 %	0 %	0 %	50 %	212211807
3034	NC_011527	AAT	2	6	137098	137103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3035	NC_011527	T	6	6	137129	137134	0 %	100 %	0 %	0 %	212211807
3036	NC_011527	CGG	2	6	137185	137190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211807
3037	NC_011527	TTC	2	6	137232	137237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211807
3038	NC_011527	TAAA	2	8	137278	137285	75 %	25 %	0 %	0 %	212211807
3039	NC_011527	ATA	2	6	137294	137299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3040	NC_011527	CCT	2	6	137306	137311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211807
3041	NC_011527	A	7	7	137317	137323	100 %	0 %	0 %	0 %	212211807
3042	NC_011527	CAT	3	9	137377	137385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211807
3043	NC_011527	AC	3	6	137394	137399	50 %	0 %	0 %	50 %	212211807
3044	NC_011527	CCG	2	6	137404	137409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211807
3045	NC_011527	CGTG	2	8	137419	137426	0 %	25 %	50 %	25 %	212211807
3046	NC_011527	CGGC	2	8	137436	137443	0 %	0 %	50 %	50 %	212211807
3047	NC_011527	ATC	2	6	137465	137470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211807
3048	NC_011527	TGC	2	6	137527	137532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211807
3049	NC_011527	GC	4	8	137531	137538	0 %	0 %	50 %	50 %	212211807
3050	NC_011527	A	6	6	137558	137563	100 %	0 %	0 %	0 %	212211807
3051	NC_011527	TAA	2	6	137680	137685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3052	NC_011527	CTG	2	6	137717	137722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211807
3053	NC_011527	A	6	6	137728	137733	100 %	0 %	0 %	0 %	212211807
3054	NC_011527	GCC	2	6	137746	137751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211807
3055	NC_011527	A	7	7	137792	137798	100 %	0 %	0 %	0 %	212211807
3056	NC_011527	TTC	2	6	137941	137946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211807
3057	NC_011527	TAA	2	6	138037	138042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3058	NC_011527	TCG	2	6	138074	138079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211807
3059	NC_011527	TCA	2	6	138084	138089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211807
3060	NC_011527	GCAG	2	8	138125	138132	25 %	0 %	50 %	25 %	212211807
3061	NC_011527	AAAT	2	8	138138	138145	75 %	25 %	0 %	0 %	212211807
3062	NC_011527	GC	3	6	138181	138186	0 %	0 %	50 %	50 %	212211807
3063	NC_011527	CG	3	6	138189	138194	0 %	0 %	50 %	50 %	212211807
3064	NC_011527	CTA	2	6	138291	138296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211807
3065	NC_011527	AACC	2	8	138297	138304	50 %	0 %	0 %	50 %	212211807
3066	NC_011527	GTT	2	6	138357	138362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211807
3067	NC_011527	CAT	2	6	138373	138378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211807
3068	NC_011527	TGG	2	6	138393	138398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211807
3069	NC_011527	TAA	2	6	138412	138417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3070	NC_011527	GAT	2	6	138472	138477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211807
3071	NC_011527	CGCA	2	8	138504	138511	25 %	0 %	25 %	50 %	212211807
3072	NC_011527	T	6	6	138513	138518	0 %	100 %	0 %	0 %	212211807
3073	NC_011527	CCA	2	6	138573	138578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211807
3074	NC_011527	ACCC	2	8	138646	138653	25 %	0 %	0 %	75 %	212211807
3075	NC_011527	GGC	2	6	138657	138662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211807
3076	NC_011527	AAC	2	6	138682	138687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211807
3077	NC_011527	AAT	2	6	138721	138726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211807
3078	NC_011527	CACG	2	8	138807	138814	25 %	0 %	25 %	50 %	212211808
3079	NC_011527	GCG	2	6	138837	138842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211808
3080	NC_011527	CGG	2	6	138845	138850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211808
3081	NC_011527	CAA	2	6	138889	138894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211808
3082	NC_011527	AG	3	6	138964	138969	50 %	0 %	50 %	0 %	212211808
3083	NC_011527	AATGAG	2	12	138994	139005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212211808
3084	NC_011527	TAC	2	6	139013	139018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_011527	GTCA	2	8	139019	139026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_011527	ATCG	2	8	139029	139036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_011527	TTAT	2	8	139073	139080	25 %	75 %	0 %	0 %	212211809
3088	NC_011527	GCC	2	6	139101	139106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211809
3089	NC_011527	TAA	2	6	139206	139211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211809
3090	NC_011527	GGC	2	6	139287	139292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211809
3091	NC_011527	GTAA	2	8	139466	139473	50 %	25 %	25 %	0 %	212211809
3092	NC_011527	ATT	2	6	139555	139560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011527	AAT	2	6	139616	139621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211810
3094	NC_011527	TCAA	2	8	139631	139638	50 %	25 %	0 %	25 %	212211810
3095	NC_011527	A	7	7	139648	139654	100 %	0 %	0 %	0 %	212211810
3096	NC_011527	ACT	2	6	139733	139738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211810
3097	NC_011527	CGAAG	2	10	139789	139798	40 %	0 %	40 %	20 %	212211810
3098	NC_011527	A	6	6	139806	139811	100 %	0 %	0 %	0 %	212211810
3099	NC_011527	AGG	2	6	139813	139818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211810
3100	NC_011527	GTG	2	6	139921	139926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211810
3101	NC_011527	GAA	2	6	139938	139943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211810
3102	NC_011527	TATCG	2	10	139977	139986	20 %	40 %	20 %	20 %	212211810
3103	NC_011527	CCACG	2	10	140001	140010	20 %	0 %	20 %	60 %	212211810
3104	NC_011527	GGT	2	6	140062	140067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211810
3105	NC_011527	ACC	2	6	140069	140074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211810
3106	NC_011527	CCA	2	6	140090	140095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211810
3107	NC_011527	AAT	2	6	140116	140121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211810
3108	NC_011527	A	6	6	140195	140200	100 %	0 %	0 %	0 %	212211810
3109	NC_011527	T	6	6	140214	140219	0 %	100 %	0 %	0 %	212211810
3110	NC_011527	T	6	6	140229	140234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011527	AGCGA	2	10	140257	140266	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_011527	GGT	2	6	140396	140401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211811
3113	NC_011527	TCG	2	6	140409	140414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211811
3114	NC_011527	AAT	2	6	140431	140436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211811
3115	NC_011527	TTC	2	6	140459	140464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211811
3116	NC_011527	CCA	2	6	140578	140583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211811
3117	NC_011527	CAGC	2	8	140698	140705	25 %	0 %	25 %	50 %	212211811
3118	NC_011527	T	8	8	140720	140727	0 %	100 %	0 %	0 %	212211811
3119	NC_011527	A	6	6	140751	140756	100 %	0 %	0 %	0 %	212211811
3120	NC_011527	CAT	2	6	140759	140764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211811
3121	NC_011527	ATCG	2	8	140801	140808	25 %	25 %	25 %	25 %	212211811
3122	NC_011527	ATC	2	6	140870	140875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211811
3123	NC_011527	ACG	2	6	140882	140887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211811
3124	NC_011527	A	6	6	140965	140970	100 %	0 %	0 %	0 %	212211811
3125	NC_011527	CTT	2	6	140998	141003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211811
3126	NC_011527	AT	3	6	141058	141063	50 %	50 %	0 %	0 %	212211811
3127	NC_011527	CATC	2	8	141121	141128	25 %	25 %	0 %	50 %	212211811
3128	NC_011527	AAT	2	6	141129	141134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211811
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3133	NC_011527	CG	4	8	141258	141265	0 %	0 %	50 %	50 %	212211811
3134	NC_011527	TTC	2	6	141269	141274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211811
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3143	NC_011527	A	8	8	141649	141656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_011527	A	6	6	141676	141681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_011527	CTC	2	6	141690	141695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3161	NC_011527	A	7	7	142414	142420	100 %	0 %	0 %	0 %	212211812
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3251	NC_011527	CTTT	2	8	147087	147094	0 %	75 %	0 %	25 %	212211817
3252	NC_011527	TCA	2	6	147095	147100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211817
3253	NC_011527	TTG	2	6	147108	147113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211817
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3260	NC_011527	TGAT	2	8	147282	147289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_011527	TCA	2	6	147371	147376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3282	NC_011527	GCA	2	6	148277	148282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3283	NC_011527	A	7	7	148315	148321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3284	NC_011527	AGCA	2	8	148441	148448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3285	NC_011527	GA	3	6	148451	148456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_011527	GTC	2	6	151569	151574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3370	NC_011527	TCCA	2	8	151928	151935	25 %	25 %	0 %	50 %	212211820
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3375	NC_011527	TCA	2	6	152169	152174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211820
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3378	NC_011527	T	6	6	152252	152257	0 %	100 %	0 %	0 %	212211820
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3382	NC_011527	GC	3	6	152550	152555	0 %	0 %	50 %	50 %	212211820
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3492	NC_011527	TTTA	2	8	158044	158051	25 %	75 %	0 %	0 %	212211824
3493	NC_011527	A	6	6	158113	158118	100 %	0 %	0 %	0 %	212211824
3494	NC_011527	CAACG	2	10	158157	158166	40 %	0 %	20 %	40 %	212211824
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3497	NC_011527	TGCG	2	8	158331	158338	0 %	25 %	50 %	25 %	212211824
3498	NC_011527	GCT	2	6	158353	158358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211824
3499	NC_011527	TAG	2	6	158360	158365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211824
3500	NC_011527	TTGG	2	8	158373	158380	0 %	50 %	50 %	0 %	212211824

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