MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011527	TTCA	2	8	249608	249615	25 %	50 %	0 %	25 %	212211913
5502	NC_011527	A	7	7	249623	249629	100 %	0 %	0 %	0 %	212211913
5503	NC_011527	ATT	2	6	249634	249639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211913
5504	NC_011527	TTCA	2	8	249682	249689	25 %	50 %	0 %	25 %	212211913
5505	NC_011527	CG	4	8	249704	249711	0 %	0 %	50 %	50 %	212211913
5506	NC_011527	TCAC	2	8	249733	249740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_011527	TGC	2	6	249743	249748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_011527	T	6	6	249768	249773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_011527	ACA	2	6	249827	249832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_011527	A	7	7	249890	249896	100 %	0 %	0 %	0 %	212211914
5511	NC_011527	GAT	2	6	249912	249917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211914
5512	NC_011527	TAA	2	6	249925	249930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211914
5513	NC_011527	A	7	7	249987	249993	100 %	0 %	0 %	0 %	212211914
5514	NC_011527	AATTT	2	10	250024	250033	40 %	60 %	0 %	0 %	212211914
5515	NC_011527	T	6	6	250049	250054	0 %	100 %	0 %	0 %	212211914
5516	NC_011527	T	6	6	250067	250072	0 %	100 %	0 %	0 %	212211914
5517	NC_011527	A	7	7	250073	250079	100 %	0 %	0 %	0 %	212211914
5518	NC_011527	CTTA	2	8	250203	250210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_011527	GCC	2	6	250270	250275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_011527	ATTA	2	8	250284	250291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011527	AGC	2	6	250323	250328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_011527	A	7	7	250342	250348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_011527	CGC	3	9	250374	250382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_011527	GAG	2	6	250414	250419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011527	TTAA	2	8	250483	250490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011527	ATAA	2	8	250555	250562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011527	AGA	2	6	250587	250592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011527	AAG	2	6	250691	250696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011527	AAT	2	6	250735	250740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011527	CAT	2	6	250752	250757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_011527	A	6	6	250787	250792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_011527	GGCAA	2	10	250796	250805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5533	NC_011527	A	6	6	250822	250827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011527	GGT	2	6	250854	250859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011527	ACC	2	6	250959	250964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_011527	TAA	2	6	250976	250981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011527	GCA	2	6	251002	251007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_011527	AGGC	2	8	251035	251042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_011527	ATT	2	6	251078	251083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011527	TCT	2	6	251100	251105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011527	ATT	2	6	251117	251122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_011527	A	8	8	251158	251165	100 %	0 %	0 %	0 %	212211915
5543	NC_011527	ATTT	2	8	251176	251183	25 %	75 %	0 %	0 %	212211915
5544	NC_011527	ATA	2	6	251378	251383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211915
5545	NC_011527	GTGTT	2	10	251405	251414	0 %	60 %	40 %	0 %	212211915
5546	NC_011527	A	7	7	251420	251426	100 %	0 %	0 %	0 %	212211915
5547	NC_011527	TTA	2	6	251531	251536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211915
5548	NC_011527	AAT	2	6	251539	251544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211915
5549	NC_011527	ACA	2	6	251559	251564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211915
5550	NC_011527	GACG	2	8	251619	251626	25 %	0 %	50 %	25 %	212211915
5551	NC_011527	AAAC	2	8	251671	251678	75 %	0 %	0 %	25 %	212211915
5552	NC_011527	AAC	2	6	251721	251726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211916
5553	NC_011527	ACCCT	2	10	251729	251738	20 %	20 %	0 %	60 %	212211916
5554	NC_011527	TCT	2	6	251756	251761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211916
5555	NC_011527	GAC	2	6	251797	251802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
5556	NC_011527	TGA	2	6	251806	251811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211916
5557	NC_011527	TTC	2	6	251941	251946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211916
5558	NC_011527	ACC	2	6	251965	251970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211916
5559	NC_011527	ACG	2	6	251979	251984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
5560	NC_011527	GCC	2	6	252033	252038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211916
5561	NC_011527	CGA	2	6	252073	252078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
5562	NC_011527	CGG	2	6	252107	252112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211916
5563	NC_011527	ATC	2	6	252127	252132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211916
5564	NC_011527	A	6	6	252140	252145	100 %	0 %	0 %	0 %	212211916
5565	NC_011527	TCA	2	6	252161	252166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211916
5566	NC_011527	TTA	2	6	252178	252183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211916
5567	NC_011527	AGC	2	6	252251	252256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211916
5568	NC_011527	TTA	2	6	252259	252264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211916
5569	NC_011527	T	6	6	252276	252281	0 %	100 %	0 %	0 %	212211916
5570	NC_011527	TGC	2	6	252310	252315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211916
5571	NC_011527	TTA	2	6	252343	252348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211916
5572	NC_011527	GC	3	6	252350	252355	0 %	0 %	50 %	50 %	212211916
5573	NC_011527	AGAA	2	8	252395	252402	75 %	0 %	25 %	0 %	212211916
5574	NC_011527	CGC	2	6	252515	252520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211916
5575	NC_011527	ACTT	2	8	252541	252548	25 %	50 %	0 %	25 %	212211916
5576	NC_011527	GTC	2	6	252574	252579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211916
5577	NC_011527	ATT	2	6	252635	252640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211916
5578	NC_011527	AACG	2	8	252672	252679	50 %	0 %	25 %	25 %	212211916
5579	NC_011527	GGA	2	6	252698	252703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211916
5580	NC_011527	GAT	2	6	252735	252740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211916
5581	NC_011527	AGT	2	6	252920	252925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211917
5582	NC_011527	CGT	2	6	252938	252943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211917
5583	NC_011527	GAA	2	6	253029	253034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211917
5584	NC_011527	C	6	6	253071	253076	0 %	0 %	0 %	100 %	212211918
5585	NC_011527	TTC	2	6	253100	253105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211918
5586	NC_011527	TAC	2	6	253108	253113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211918
5587	NC_011527	GAC	2	6	253134	253139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211918
5588	NC_011527	CAC	2	6	253162	253167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211918
5589	NC_011527	GGGT	2	8	253168	253175	0 %	25 %	75 %	0 %	212211918
5590	NC_011527	GGA	2	6	253185	253190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211918
5591	NC_011527	ATA	2	6	253241	253246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_011527	GAA	2	6	253320	253325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011527	CGT	2	6	253347	253352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_011527	ACA	2	6	253357	253362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_011527	TAT	2	6	253410	253415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211919
5596	NC_011527	A	7	7	253424	253430	100 %	0 %	0 %	0 %	212211919
5597	NC_011527	A	6	6	253528	253533	100 %	0 %	0 %	0 %	212211919
5598	NC_011527	T	6	6	253567	253572	0 %	100 %	0 %	0 %	212211920
5599	NC_011527	AGCA	2	8	253615	253622	50 %	0 %	25 %	25 %	212211920
5600	NC_011527	AATA	2	8	253679	253686	75 %	25 %	0 %	0 %	212211920
5601	NC_011527	TGC	2	6	253763	253768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211920
5602	NC_011527	CAAAC	2	10	253852	253861	60 %	0 %	0 %	40 %	212211920
5603	NC_011527	A	7	7	253940	253946	100 %	0 %	0 %	0 %	212211920
5604	NC_011527	CCA	2	6	253949	253954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211920
5605	NC_011527	AT	3	6	254016	254021	50 %	50 %	0 %	0 %	212211920
5606	NC_011527	TAA	2	6	254038	254043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211920
5607	NC_011527	AATA	2	8	254088	254095	75 %	25 %	0 %	0 %	212211920
5608	NC_011527	TAGCC	2	10	254123	254132	20 %	20 %	20 %	40 %	212211920
5609	NC_011527	AAT	2	6	254149	254154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211920
5610	NC_011527	AAT	2	6	254236	254241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211920
5611	NC_011527	GTG	2	6	254258	254263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211920
5612	NC_011527	TCG	2	6	254340	254345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211920
5613	NC_011527	TC	3	6	254379	254384	0 %	50 %	0 %	50 %	212211920
5614	NC_011527	AAC	2	6	254432	254437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211920
5615	NC_011527	TCA	2	6	254439	254444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211920
5616	NC_011527	AGAT	2	8	254447	254454	50 %	25 %	25 %	0 %	212211920
5617	NC_011527	TGG	2	6	254474	254479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211920
5618	NC_011527	CCG	2	6	254525	254530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211920
5619	NC_011527	ACA	2	6	254610	254615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211920
5620	NC_011527	CGG	2	6	254628	254633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211920
5621	NC_011527	ATC	2	6	254641	254646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211920
5622	NC_011527	CAAC	2	8	254659	254666	50 %	0 %	0 %	50 %	212211920
5623	NC_011527	ACC	2	6	254724	254729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211920
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5625	NC_011527	TAA	2	6	254746	254751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211920
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5879	NC_011527	A	6	6	265479	265484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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