MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011527	AGC	2	6	202897	202902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211865
4502	NC_011527	GTG	2	6	202918	202923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211865
4503	NC_011527	ATC	2	6	203085	203090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211865
4504	NC_011527	AT	3	6	203306	203311	50 %	50 %	0 %	0 %	212211865
4505	NC_011527	CAG	2	6	203333	203338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211865
4506	NC_011527	TTAA	2	8	203401	203408	50 %	50 %	0 %	0 %	212211865
4507	NC_011527	TTTA	2	8	203481	203488	25 %	75 %	0 %	0 %	212211865
4508	NC_011527	AT	3	6	203515	203520	50 %	50 %	0 %	0 %	212211865
4509	NC_011527	CGC	2	6	203606	203611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211866
4510	NC_011527	ATT	2	6	203633	203638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211866
4511	NC_011527	GTC	2	6	203669	203674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211866
4512	NC_011527	TC	3	6	203687	203692	0 %	50 %	0 %	50 %	212211866
4513	NC_011527	CTG	2	6	203710	203715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211866
4514	NC_011527	TA	3	6	203722	203727	50 %	50 %	0 %	0 %	212211866
4515	NC_011527	TCC	2	6	203742	203747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211866
4516	NC_011527	AGG	2	6	203774	203779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211866
4517	NC_011527	ATT	2	6	203795	203800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211866
4518	NC_011527	CGT	2	6	203850	203855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211866
4519	NC_011527	GTAAT	2	10	203930	203939	40 %	40 %	20 %	0 %	212211866
4520	NC_011527	TTC	2	6	203955	203960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211866
4521	NC_011527	A	6	6	204041	204046	100 %	0 %	0 %	0 %	212211866
4522	NC_011527	T	6	6	204103	204108	0 %	100 %	0 %	0 %	212211866
4523	NC_011527	TTTC	2	8	204231	204238	0 %	75 %	0 %	25 %	212211867
4524	NC_011527	CAT	2	6	204251	204256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211867
4525	NC_011527	T	6	6	204371	204376	0 %	100 %	0 %	0 %	212211867
4526	NC_011527	ATAA	2	8	204429	204436	75 %	25 %	0 %	0 %	212211867
4527	NC_011527	AAC	2	6	204486	204491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211867
4528	NC_011527	TC	3	6	204499	204504	0 %	50 %	0 %	50 %	212211867
4529	NC_011527	TAAA	2	8	204533	204540	75 %	25 %	0 %	0 %	212211867
4530	NC_011527	T	6	6	204647	204652	0 %	100 %	0 %	0 %	212211867
4531	NC_011527	AAT	2	6	204679	204684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
4532	NC_011527	GCG	2	6	204732	204737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211867
4533	NC_011527	TAA	2	6	204743	204748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
4534	NC_011527	GTT	2	6	204771	204776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211867
4535	NC_011527	ATTC	2	8	204791	204798	25 %	50 %	0 %	25 %	212211867
4536	NC_011527	AAATA	2	10	204818	204827	80 %	20 %	0 %	0 %	212211867
4537	NC_011527	CGG	2	6	205151	205156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211867
4538	NC_011527	ATA	2	6	205157	205162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
4539	NC_011527	ATA	2	6	205230	205235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
4540	NC_011527	GGC	2	6	205240	205245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211867
4541	NC_011527	TCC	3	9	205292	205300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211867
4542	NC_011527	AAT	2	6	205301	205306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211867
4543	NC_011527	TCA	2	6	205357	205362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211867
4544	NC_011527	GCG	2	6	205364	205369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_011527	T	6	6	205455	205460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011527	GCT	2	6	205513	205518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211868
4547	NC_011527	GCGCG	2	10	205565	205574	0 %	0 %	60 %	40 %	212211868
4548	NC_011527	GCG	2	6	205581	205586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211868
4549	NC_011527	C	6	6	205631	205636	0 %	0 %	0 %	100 %	212211868
4550	NC_011527	GCT	2	6	205922	205927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211868
4551	NC_011527	TGCC	2	8	206012	206019	0 %	25 %	25 %	50 %	212211868
4552	NC_011527	CGG	2	6	206036	206041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211868
4553	NC_011527	GAA	2	6	206047	206052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211868
4554	NC_011527	GAAGCC	2	12	206107	206118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211868
4555	NC_011527	GCT	2	6	206143	206148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211868
4556	NC_011527	AGC	2	6	206154	206159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211868
4557	NC_011527	GAA	2	6	206161	206166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211868
4558	NC_011527	GCG	2	6	206204	206209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211868
4559	NC_011527	CTGATA	2	12	206222	206233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211868
4560	NC_011527	AAT	2	6	206240	206245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211868
4561	NC_011527	CGGG	2	8	206255	206262	0 %	0 %	75 %	25 %	212211869
4562	NC_011527	AATC	2	8	206362	206369	50 %	25 %	0 %	25 %	212211869
4563	NC_011527	AAAT	2	8	206382	206389	75 %	25 %	0 %	0 %	212211869
4564	NC_011527	CGC	2	6	206469	206474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211869
4565	NC_011527	CCG	2	6	206540	206545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211869
4566	NC_011527	AAG	2	6	206561	206566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211869
4567	NC_011527	CGG	2	6	206577	206582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211869
4568	NC_011527	ATT	2	6	206602	206607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211869
4569	NC_011527	ATT	2	6	206909	206914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211870
4570	NC_011527	GTG	2	6	206985	206990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211870
4571	NC_011527	A	6	6	207013	207018	100 %	0 %	0 %	0 %	212211870
4572	NC_011527	TCG	2	6	207067	207072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211870
4573	NC_011527	CGT	2	6	207164	207169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211870
4574	NC_011527	GTT	2	6	207172	207177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211870
4575	NC_011527	TCAC	2	8	207193	207200	25 %	25 %	0 %	50 %	212211870
4576	NC_011527	GGT	2	6	207236	207241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211870
4577	NC_011527	TTGGCT	2	12	207252	207263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212211870
4578	NC_011527	A	6	6	207324	207329	100 %	0 %	0 %	0 %	212211870
4579	NC_011527	GAA	3	9	207414	207422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211870
4580	NC_011527	TTA	2	6	207426	207431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211870
4581	NC_011527	AAGTC	2	10	207515	207524	40 %	20 %	20 %	20 %	212211870
4582	NC_011527	GCC	2	6	207534	207539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211870
4583	NC_011527	GTC	2	6	207555	207560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211870
4584	NC_011527	ATTA	2	8	207692	207699	50 %	50 %	0 %	0 %	212211870
4585	NC_011527	CTT	2	6	207701	207706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211870
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4587	NC_011527	AGC	2	6	207767	207772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211870
4588	NC_011527	TCAT	2	8	207778	207785	25 %	50 %	0 %	25 %	212211870
4589	NC_011527	GGA	2	6	207849	207854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211870
4590	NC_011527	GAA	2	6	207959	207964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211871
4591	NC_011527	ATG	2	6	207972	207977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211871
4592	NC_011527	AAT	2	6	208032	208037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211871
4593	NC_011527	AAG	2	6	208055	208060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211871
4594	NC_011527	CAG	2	6	208098	208103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211871
4595	NC_011527	GCTAC	2	10	208130	208139	20 %	20 %	20 %	40 %	212211871
4596	NC_011527	GCAAC	2	10	208174	208183	40 %	0 %	20 %	40 %	212211871
4597	NC_011527	GCAG	2	8	208358	208365	25 %	0 %	50 %	25 %	212211871
4598	NC_011527	TTC	2	6	208401	208406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_011527	CCA	2	6	208407	208412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_011527	GGT	2	6	208473	208478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011527	TAAT	2	8	208502	208509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_011527	T	6	6	208563	208568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011527	A	6	6	208587	208592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011527	CGT	2	6	208597	208602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_011527	CT	3	6	208664	208669	0 %	50 %	0 %	50 %	212211872
4606	NC_011527	ACCC	2	8	208719	208726	25 %	0 %	0 %	75 %	212211872
4607	NC_011527	CGT	2	6	208759	208764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211872
4608	NC_011527	CTG	2	6	208781	208786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211872
4609	NC_011527	TAT	2	6	208787	208792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211872
4610	NC_011527	GGA	2	6	208824	208829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_011527	TGTC	2	8	208925	208932	0 %	50 %	25 %	25 %	212211873
4612	NC_011527	ACG	2	6	208954	208959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211873
4613	NC_011527	T	8	8	208964	208971	0 %	100 %	0 %	0 %	212211873
4614	NC_011527	CT	3	6	209001	209006	0 %	50 %	0 %	50 %	212211873
4615	NC_011527	GAT	2	6	209035	209040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211873
4616	NC_011527	ATGGT	2	10	209075	209084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_011527	TAT	2	6	209098	209103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_011527	TTC	2	6	209116	209121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_011527	TATT	2	8	209126	209133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011527	ATT	2	6	209145	209150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_011527	ATA	2	6	209152	209157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211874
4622	NC_011527	ATTGAT	2	12	209268	209279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212211874
4623	NC_011527	GGC	2	6	209349	209354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211874
4624	NC_011527	GCAATT	2	12	209418	209429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211874
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4743	NC_011527	TAT	2	6	215106	215111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211880
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