MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	GGGT	2	8	166	173	0 %	25 %	75 %	0 %	212208406
2	NC_011526	GAAC	2	8	412	419	50 %	0 %	25 %	25 %	212208406
3	NC_011526	GGTA	2	8	804	811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011526	GCTG	2	8	885	892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011526	CAGG	2	8	1215	1222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011526	ATTG	2	8	1290	1297	25 %	50 %	25 %	0 %	212208407
7	NC_011526	TTCA	2	8	1721	1728	25 %	50 %	0 %	25 %	212208408
8	NC_011526	AGCA	2	8	2051	2058	50 %	0 %	25 %	25 %	212208408
9	NC_011526	TTTA	2	8	2838	2845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011526	AAAT	2	8	2903	2910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011526	TTTC	2	8	3146	3153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011526	TTGG	2	8	3502	3509	0 %	50 %	50 %	0 %	212208410
13	NC_011526	CCTG	2	8	3898	3905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011526	TCTG	2	8	4053	4060	0 %	50 %	25 %	25 %	212208411
15	NC_011526	ATTT	3	12	4854	4865	25 %	75 %	0 %	0 %	212208412
16	NC_011526	CATT	2	8	4930	4937	25 %	50 %	0 %	25 %	212208412
17	NC_011526	TCAA	2	8	5315	5322	50 %	25 %	0 %	25 %	212208412
18	NC_011526	TTCA	2	8	5743	5750	25 %	50 %	0 %	25 %	212208413
19	NC_011526	AGCA	2	8	6073	6080	50 %	0 %	25 %	25 %	212208413
20	NC_011526	GTTT	2	8	6623	6630	0 %	75 %	25 %	0 %	212208414
21	NC_011526	AATT	2	8	6989	6996	50 %	50 %	0 %	0 %	212208414
22	NC_011526	TGAT	2	8	7115	7122	25 %	50 %	25 %	0 %	212208414
23	NC_011526	CCGG	2	8	7360	7367	0 %	0 %	50 %	50 %	212208414
24	NC_011526	CTTG	2	8	8323	8330	0 %	50 %	25 %	25 %	212208415
25	NC_011526	TTGA	2	8	8649	8656	25 %	50 %	25 %	0 %	212208415
26	NC_011526	TTCT	2	8	8686	8693	0 %	75 %	0 %	25 %	212208415
27	NC_011526	ATTT	2	8	9242	9249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011526	TCGA	2	8	9361	9368	25 %	25 %	25 %	25 %	212208417
29	NC_011526	TCAT	2	8	9452	9459	25 %	50 %	0 %	25 %	212208417
30	NC_011526	TTTA	2	8	9714	9721	25 %	75 %	0 %	0 %	212208417
31	NC_011526	AAAT	2	8	9913	9920	75 %	25 %	0 %	0 %	212208417
32	NC_011526	GAAA	2	8	10024	10031	75 %	0 %	25 %	0 %	212208417
33	NC_011526	ACCA	2	8	10181	10188	50 %	0 %	0 %	50 %	212208418
34	NC_011526	TGGG	2	8	11107	11114	0 %	25 %	75 %	0 %	212208418
35	NC_011526	ATGA	2	8	11198	11205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011526	GCGA	2	8	11454	11461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011526	CCGT	2	8	11996	12003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011526	AATA	2	8	12721	12728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011526	GAAA	2	8	12812	12819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011526	AGGT	2	8	13315	13322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011526	GGCG	2	8	13815	13822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011526	CCAT	2	8	14536	14543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011526	GAAA	2	8	14690	14697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011526	GGAT	2	8	15546	15553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011526	TCTA	2	8	15695	15702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011526	GCTC	2	8	15820	15827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011526	TTCA	2	8	16431	16438	25 %	50 %	0 %	25 %	212208419
48	NC_011526	TCTT	2	8	16665	16672	0 %	75 %	0 %	25 %	212208419
49	NC_011526	ATAA	2	8	17217	17224	75 %	25 %	0 %	0 %	212208419
50	NC_011526	CGAG	2	8	18058	18065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011526	AAAT	2	8	19152	19159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011526	TTAA	2	8	19212	19219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011526	TATT	2	8	19413	19420	25 %	75 %	0 %	0 %	212208422
54	NC_011526	CAAA	2	8	20550	20557	75 %	0 %	0 %	25 %	212208424
55	NC_011526	GAAT	2	8	20756	20763	50 %	25 %	25 %	0 %	212208424
56	NC_011526	ACGT	2	8	20765	20772	25 %	25 %	25 %	25 %	212208424
57	NC_011526	AGGC	2	8	20828	20835	25 %	0 %	50 %	25 %	212208424
58	NC_011526	ATTG	2	8	20922	20929	25 %	50 %	25 %	0 %	212208424
59	NC_011526	CCGT	2	8	21304	21311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011526	ATTT	2	8	21344	21351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011526	ATTT	2	8	21556	21563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011526	TTAA	2	8	21573	21580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011526	GATG	2	8	21785	21792	25 %	25 %	50 %	0 %	212208425
64	NC_011526	TCCA	2	8	21942	21949	25 %	25 %	0 %	50 %	212208425
65	NC_011526	ATTT	2	8	22067	22074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011526	GTTT	2	8	22346	22353	0 %	75 %	25 %	0 %	212208426
67	NC_011526	GTCA	2	8	22382	22389	25 %	25 %	25 %	25 %	212208426
68	NC_011526	CAGG	2	8	22444	22451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011526	TGGC	2	8	22472	22479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011526	ATTT	2	8	23347	23354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011526	AAGT	2	8	23400	23407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011526	AAAT	2	8	23430	23437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011526	TTAC	2	8	24041	24048	25 %	50 %	0 %	25 %	212208429
74	NC_011526	AGAT	2	8	24205	24212	50 %	25 %	25 %	0 %	212208429
75	NC_011526	AGAT	2	8	25745	25752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011526	TTAA	2	8	25815	25822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011526	CTTG	2	8	27412	27419	0 %	50 %	25 %	25 %	212208435
78	NC_011526	TAAG	2	8	27694	27701	50 %	25 %	25 %	0 %	212208436
79	NC_011526	ATCC	2	8	28248	28255	25 %	25 %	0 %	50 %	212208436
80	NC_011526	TGGC	2	8	28289	28296	0 %	25 %	50 %	25 %	212208436
81	NC_011526	GGTT	2	8	28631	28638	0 %	50 %	50 %	0 %	212208436
82	NC_011526	GTGA	2	8	28705	28712	25 %	25 %	50 %	0 %	212208436
83	NC_011526	CTTT	2	8	28742	28749	0 %	75 %	0 %	25 %	212208436
84	NC_011526	TTTG	2	8	28860	28867	0 %	75 %	25 %	0 %	212208436
85	NC_011526	GTTT	2	8	28903	28910	0 %	75 %	25 %	0 %	212208436
86	NC_011526	TTTC	2	8	29925	29932	0 %	75 %	0 %	25 %	212208436
87	NC_011526	GCAA	2	8	29936	29943	50 %	0 %	25 %	25 %	212208436
88	NC_011526	CTTA	2	8	31194	31201	25 %	50 %	0 %	25 %	212208438
89	NC_011526	AACT	2	8	31541	31548	50 %	25 %	0 %	25 %	212208438
90	NC_011526	TTCT	2	8	31725	31732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011526	GTTG	2	8	32405	32412	0 %	50 %	50 %	0 %	212208440
92	NC_011526	CAAA	2	8	32491	32498	75 %	0 %	0 %	25 %	212208440
93	NC_011526	ACCC	2	8	32962	32969	25 %	0 %	0 %	75 %	212208441
94	NC_011526	CTTC	2	8	33020	33027	0 %	50 %	0 %	50 %	212208441
95	NC_011526	ATTG	2	8	33649	33656	25 %	50 %	25 %	0 %	212208442
96	NC_011526	TTTC	2	8	33697	33704	0 %	75 %	0 %	25 %	212208442
97	NC_011526	GTTT	2	8	34310	34317	0 %	75 %	25 %	0 %	212208442
98	NC_011526	GGAA	2	8	35001	35008	50 %	0 %	50 %	0 %	212208444
99	NC_011526	ATTG	2	8	35496	35503	25 %	50 %	25 %	0 %	212208444
100	NC_011526	ATGA	2	8	35580	35587	50 %	25 %	25 %	0 %	212208444
101	NC_011526	TTCT	2	8	35749	35756	0 %	75 %	0 %	25 %	212208444
102	NC_011526	TAAT	2	8	35893	35900	50 %	50 %	0 %	0 %	212208444
103	NC_011526	TAAA	2	8	36077	36084	75 %	25 %	0 %	0 %	212208445
104	NC_011526	CAGC	2	8	36253	36260	25 %	0 %	25 %	50 %	212208445
105	NC_011526	GAAT	2	8	37019	37026	50 %	25 %	25 %	0 %	212208446
106	NC_011526	AAAG	2	8	37109	37116	75 %	0 %	25 %	0 %	212208446
107	NC_011526	TTTA	2	8	37131	37138	25 %	75 %	0 %	0 %	212208446
108	NC_011526	TAAT	2	8	37745	37752	50 %	50 %	0 %	0 %	212208446
109	NC_011526	GAAA	2	8	38013	38020	75 %	0 %	25 %	0 %	212208446
110	NC_011526	GCTT	2	8	38212	38219	0 %	50 %	25 %	25 %	212208446
111	NC_011526	TTCT	2	8	38425	38432	0 %	75 %	0 %	25 %	212208447
112	NC_011526	CGAA	2	8	38596	38603	50 %	0 %	25 %	25 %	212208447
113	NC_011526	TGTT	2	8	39131	39138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011526	TTTA	2	8	39142	39149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011526	TAGT	2	8	39160	39167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011526	TTTA	2	8	39172	39179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.