MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 3221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011295	TATG	2	8	6	13	25 %	50 %	25 %	0 %	206895191
2	NC_011295	GGAG	2	8	382	389	25 %	0 %	75 %	0 %	206895191
3	NC_011295	AGCT	2	8	1002	1009	25 %	25 %	25 %	25 %	206896538
4	NC_011295	CAGA	2	8	1031	1038	50 %	0 %	25 %	25 %	206896538
5	NC_011295	GGCT	2	8	1189	1196	0 %	25 %	50 %	25 %	206896538
6	NC_011295	TGTA	2	8	1277	1284	25 %	50 %	25 %	0 %	206896538
7	NC_011295	AAAG	2	8	1395	1402	75 %	0 %	25 %	0 %	206896538
8	NC_011295	AGTA	2	8	1659	1666	50 %	25 %	25 %	0 %	206896538
9	NC_011295	AGCA	2	8	2372	2379	50 %	0 %	25 %	25 %	206895125
10	NC_011295	AGCA	2	8	3509	3516	50 %	0 %	25 %	25 %	206895113
11	NC_011295	CTGC	2	8	4051	4058	0 %	25 %	25 %	50 %	206895113
12	NC_011295	TAAG	2	8	5387	5394	50 %	25 %	25 %	0 %	206896391
13	NC_011295	CAAG	2	8	5715	5722	50 %	0 %	25 %	25 %	206896391
14	NC_011295	AAGG	2	8	5942	5949	50 %	0 %	50 %	0 %	206896391
15	NC_011295	GAAA	2	8	6142	6149	75 %	0 %	25 %	0 %	206896391
16	NC_011295	TCTA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	0 %	25 %	206896391
17	NC_011295	ATGA	2	8	6433	6440	50 %	25 %	25 %	0 %	206896391
18	NC_011295	CAAA	2	8	6760	6767	75 %	0 %	0 %	25 %	206896391
19	NC_011295	TTGT	2	8	6793	6800	0 %	75 %	25 %	0 %	206896391
20	NC_011295	TGAT	2	8	7114	7121	25 %	50 %	25 %	0 %	206895496
21	NC_011295	ACTT	2	8	7408	7415	25 %	50 %	0 %	25 %	206895496
22	NC_011295	ACTT	2	8	7895	7902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011295	ATTG	2	8	7975	7982	25 %	50 %	25 %	0 %	206896121
24	NC_011295	CACG	2	8	8542	8549	25 %	0 %	25 %	50 %	206896121
25	NC_011295	CCTT	2	8	8734	8741	0 %	50 %	0 %	50 %	206895327
26	NC_011295	AGGT	2	8	9169	9176	25 %	25 %	50 %	0 %	206895327
27	NC_011295	TTGG	2	8	9318	9325	0 %	50 %	50 %	0 %	206895327
28	NC_011295	GAAG	2	8	9927	9934	50 %	0 %	50 %	0 %	206895327
29	NC_011295	CTTC	2	8	10268	10275	0 %	50 %	0 %	50 %	206895327
30	NC_011295	AAAC	2	8	10277	10284	75 %	0 %	0 %	25 %	206895327
31	NC_011295	AGTG	2	8	10286	10293	25 %	25 %	50 %	0 %	206895327
32	NC_011295	GAAA	2	8	10697	10704	75 %	0 %	25 %	0 %	206895106
33	NC_011295	TTTC	2	8	10953	10960	0 %	75 %	0 %	25 %	206895106
34	NC_011295	AAAT	2	8	11514	11521	75 %	25 %	0 %	0 %	206895509
35	NC_011295	GCAA	2	8	12303	12310	50 %	0 %	25 %	25 %	206895509
36	NC_011295	GAAA	2	8	13568	13575	75 %	0 %	25 %	0 %	206895509
37	NC_011295	TAAC	2	8	13718	13725	50 %	25 %	0 %	25 %	206895847
38	NC_011295	TTTC	2	8	14483	14490	0 %	75 %	0 %	25 %	206895847
39	NC_011295	CTTA	2	8	14751	14758	25 %	50 %	0 %	25 %	206895847
40	NC_011295	ATTT	2	8	14851	14858	25 %	75 %	0 %	0 %	206895847
41	NC_011295	CCAT	2	8	14897	14904	25 %	25 %	0 %	50 %	206895847
42	NC_011295	GGAA	2	8	16076	16083	50 %	0 %	50 %	0 %	206895204
43	NC_011295	TCTT	2	8	16581	16588	0 %	75 %	0 %	25 %	206896015
44	NC_011295	GCTC	2	8	16804	16811	0 %	25 %	25 %	50 %	206896015
45	NC_011295	AGCA	2	8	17390	17397	50 %	0 %	25 %	25 %	206895362
46	NC_011295	AGAA	2	8	17481	17488	75 %	0 %	25 %	0 %	206895362
47	NC_011295	AAGT	2	8	17908	17915	50 %	25 %	25 %	0 %	206895362
48	NC_011295	TTAC	2	8	18819	18826	25 %	50 %	0 %	25 %	206895542
49	NC_011295	ATAG	2	8	19401	19408	50 %	25 %	25 %	0 %	206895670
50	NC_011295	ACAG	2	8	19710	19717	50 %	0 %	25 %	25 %	206895670
51	NC_011295	AGAA	2	8	20028	20035	75 %	0 %	25 %	0 %	206895088
52	NC_011295	TGCG	2	8	20100	20107	0 %	25 %	50 %	25 %	206895088
53	NC_011295	ACGA	2	8	21163	21170	50 %	0 %	25 %	25 %	206895080
54	NC_011295	TTCT	2	8	21187	21194	0 %	75 %	0 %	25 %	206895080
55	NC_011295	AAGG	2	8	21279	21286	50 %	0 %	50 %	0 %	206895080
56	NC_011295	CCTT	2	8	21486	21493	0 %	50 %	0 %	50 %	206895080
57	NC_011295	GAAC	2	8	21937	21944	50 %	0 %	25 %	25 %	206895881
58	NC_011295	GATA	2	8	22030	22037	50 %	25 %	25 %	0 %	206895881
59	NC_011295	TTAC	2	8	22136	22143	25 %	50 %	0 %	25 %	206895881
60	NC_011295	TATT	2	8	22587	22594	25 %	75 %	0 %	0 %	206895881
61	NC_011295	ATTG	2	8	22782	22789	25 %	50 %	25 %	0 %	206895172
62	NC_011295	TTTG	2	8	23598	23605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011295	ATTG	2	8	24604	24611	25 %	50 %	25 %	0 %	206896490
64	NC_011295	CCAT	2	8	25172	25179	25 %	25 %	0 %	50 %	206896490
65	NC_011295	AATG	2	8	25435	25442	50 %	25 %	25 %	0 %	206896341
66	NC_011295	GTTT	2	8	25856	25863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011295	ATTT	2	8	26105	26112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011295	TACA	2	8	26401	26408	50 %	25 %	0 %	25 %	206895448
69	NC_011295	TGTA	2	8	26685	26692	25 %	50 %	25 %	0 %	206895448
70	NC_011295	TAAG	2	8	27238	27245	50 %	25 %	25 %	0 %	206895448
71	NC_011295	GGTA	2	8	27314	27321	25 %	25 %	50 %	0 %	206895448
72	NC_011295	AAAG	2	8	27518	27525	75 %	0 %	25 %	0 %	206895448
73	NC_011295	TACA	2	8	27566	27573	50 %	25 %	0 %	25 %	206895448
74	NC_011295	GAGG	2	8	28315	28322	25 %	0 %	75 %	0 %	206895448
75	NC_011295	GAAT	2	8	28765	28772	50 %	25 %	25 %	0 %	206896405
76	NC_011295	TTGT	2	8	28796	28803	0 %	75 %	25 %	0 %	206895579
77	NC_011295	TTTC	2	8	28866	28873	0 %	75 %	0 %	25 %	206895579
78	NC_011295	AAGA	2	8	29175	29182	75 %	0 %	25 %	0 %	206895579
79	NC_011295	GAAG	2	8	29255	29262	50 %	0 %	50 %	0 %	206895579
80	NC_011295	GAAG	2	8	29314	29321	50 %	0 %	50 %	0 %	206895579
81	NC_011295	TTAC	2	8	30871	30878	25 %	50 %	0 %	25 %	206896272
82	NC_011295	GAAA	2	8	31038	31045	75 %	0 %	25 %	0 %	206896272
83	NC_011295	TCAT	2	8	31566	31573	25 %	50 %	0 %	25 %	206896272
84	NC_011295	CTAT	2	8	31585	31592	25 %	50 %	0 %	25 %	206896272
85	NC_011295	AAGC	2	8	32314	32321	50 %	0 %	25 %	25 %	206895910
86	NC_011295	CCTC	2	8	32749	32756	0 %	25 %	0 %	75 %	206895910
87	NC_011295	ATGA	2	8	33085	33092	50 %	25 %	25 %	0 %	206895272
88	NC_011295	TGGT	2	8	33822	33829	0 %	50 %	50 %	0 %	206896053
89	NC_011295	CTTT	2	8	34058	34065	0 %	75 %	0 %	25 %	206896053
90	NC_011295	CAAA	2	8	34855	34862	75 %	0 %	0 %	25 %	206895395
91	NC_011295	AGCA	2	8	35189	35196	50 %	0 %	25 %	25 %	206895395
92	NC_011295	TCCT	2	8	35659	35666	0 %	50 %	0 %	50 %	206895395
93	NC_011295	AATA	2	8	36591	36598	75 %	25 %	0 %	0 %	206895489
94	NC_011295	AAAG	2	8	37093	37100	75 %	0 %	25 %	0 %	206896382
95	NC_011295	GGAA	2	8	38121	38128	50 %	0 %	50 %	0 %	206895638
96	NC_011295	TGGC	2	8	38185	38192	0 %	25 %	50 %	25 %	206895638
97	NC_011295	AGAA	2	8	38303	38310	75 %	0 %	25 %	0 %	206895638
98	NC_011295	GCAG	2	8	38517	38524	25 %	0 %	50 %	25 %	206895806
99	NC_011295	GAGG	2	8	39574	39581	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011295	AAGG	2	8	41155	41162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011295	GAAA	2	8	41278	41285	75 %	0 %	25 %	0 %	206895547
102	NC_011295	AGGA	2	8	42309	42316	50 %	0 %	50 %	0 %	206896367
103	NC_011295	TGCG	2	8	43189	43196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011295	CTGC	2	8	43265	43272	0 %	25 %	25 %	50 %	206895719
105	NC_011295	TGAA	2	8	44519	44526	50 %	25 %	25 %	0 %	206896531
106	NC_011295	TAAA	2	8	44759	44766	75 %	25 %	0 %	0 %	206896531
107	NC_011295	CAGC	2	8	44826	44833	25 %	0 %	25 %	50 %	206896531
108	NC_011295	AGGA	2	8	44858	44865	50 %	0 %	50 %	0 %	206896531
109	NC_011295	CCAG	2	8	44908	44915	25 %	0 %	25 %	50 %	206896531
110	NC_011295	GCTG	2	8	45590	45597	0 %	25 %	50 %	25 %	206895207
111	NC_011295	GGCA	2	8	45743	45750	25 %	0 %	50 %	25 %	206895207
112	NC_011295	AGAA	2	8	45802	45809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011295	TTAC	2	8	46132	46139	25 %	50 %	0 %	25 %	206896042
114	NC_011295	GTGA	2	8	46212	46219	25 %	25 %	50 %	0 %	206896042
115	NC_011295	CGAT	2	8	46388	46395	25 %	25 %	25 %	25 %	206896042
116	NC_011295	TAAG	2	8	46736	46743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011295	CTGC	2	8	47156	47163	0 %	25 %	25 %	50 %	206896055
118	NC_011295	CAGG	2	8	47526	47533	25 %	0 %	50 %	25 %	206896055
119	NC_011295	CCTA	2	8	47780	47787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011295	GTAT	2	8	48554	48561	25 %	50 %	25 %	0 %	206895845
121	NC_011295	GCTG	2	8	48721	48728	0 %	25 %	50 %	25 %	206895845
122	NC_011295	AAAC	3	12	48974	48985	75 %	0 %	0 %	25 %	206895845
123	NC_011295	GGTA	2	8	49478	49485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011295	AGCA	2	8	50482	50489	50 %	0 %	25 %	25 %	206896426
125	NC_011295	TTAA	2	8	51351	51358	50 %	50 %	0 %	0 %	206896426
126	NC_011295	GAAA	2	8	51381	51388	75 %	0 %	25 %	0 %	206896426
127	NC_011295	CTTT	2	8	51610	51617	0 %	75 %	0 %	25 %	206896426
128	NC_011295	AGGA	2	8	52545	52552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011295	CCTT	2	8	52660	52667	0 %	50 %	0 %	50 %	206895798
130	NC_011295	TTTC	2	8	52829	52836	0 %	75 %	0 %	25 %	206895798
131	NC_011295	TTCC	2	8	53316	53323	0 %	50 %	0 %	50 %	206895812
132	NC_011295	ATCC	2	8	53710	53717	25 %	25 %	0 %	50 %	206895812
133	NC_011295	GTCT	2	8	53733	53740	0 %	50 %	25 %	25 %	206895812
134	NC_011295	GTCG	2	8	54198	54205	0 %	25 %	50 %	25 %	206895812
135	NC_011295	TACC	2	8	56053	56060	25 %	25 %	0 %	50 %	206896259
136	NC_011295	CATC	2	8	56233	56240	25 %	25 %	0 %	50 %	206896259
137	NC_011295	ACCT	2	8	56254	56261	25 %	25 %	0 %	50 %	206896049
138	NC_011295	TTTA	2	8	56521	56528	25 %	75 %	0 %	0 %	206896049
139	NC_011295	GCCA	2	8	56548	56555	25 %	0 %	25 %	50 %	206896049
140	NC_011295	CCTT	2	8	56717	56724	0 %	50 %	0 %	50 %	206896049
141	NC_011295	CCAA	2	8	56764	56771	50 %	0 %	0 %	50 %	206896049
142	NC_011295	CAGC	2	8	57077	57084	25 %	0 %	25 %	50 %	206896049
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