MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 26607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011295	TGG	2	6	212732	212737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011295	TGG	2	6	212775	212780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896071
4003	NC_011295	AGT	2	6	212804	212809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896071
4004	NC_011295	ACC	2	6	212867	212872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896071
4005	NC_011295	GCACCT	2	12	212909	212920	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	206896071
4006	NC_011295	GTA	2	6	212954	212959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896071
4007	NC_011295	GCA	2	6	212973	212978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896071
4008	NC_011295	CAT	2	6	212986	212991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896071
4009	NC_011295	AGT	2	6	212998	213003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896071
4010	NC_011295	TGA	2	6	213019	213024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896071
4011	NC_011295	ATG	2	6	213068	213073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896071
4012	NC_011295	AG	3	6	213136	213141	50 %	0 %	50 %	0 %	206896071
4013	NC_011295	ACC	2	6	213157	213162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896071
4014	NC_011295	GAG	2	6	213175	213180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896071
4015	NC_011295	CCCA	2	8	213209	213216	25 %	0 %	0 %	75 %	206896071
4016	NC_011295	AGAT	2	8	213235	213242	50 %	25 %	25 %	0 %	206896071
4017	NC_011295	CAG	2	6	213262	213267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896071
4018	NC_011295	GGA	2	6	213355	213360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896071
4019	NC_011295	TAC	2	6	213382	213387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896071
4020	NC_011295	T	6	6	213421	213426	0 %	100 %	0 %	0 %	206896071
4021	NC_011295	T	6	6	213433	213438	0 %	100 %	0 %	0 %	206896071
4022	NC_011295	TCG	2	6	213443	213448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896071
4023	NC_011295	CCA	2	6	213505	213510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896071
4024	NC_011295	AGC	2	6	213523	213528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896071
4025	NC_011295	GAT	2	6	213553	213558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896071
4026	NC_011295	ACCAA	2	10	213560	213569	60 %	0 %	0 %	40 %	206896071
4027	NC_011295	GTG	2	6	213711	213716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896071
4028	NC_011295	TGC	2	6	213838	213843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896071
4029	NC_011295	AAT	2	6	213856	213861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896071
4030	NC_011295	CCAAT	2	10	213891	213900	40 %	20 %	0 %	40 %	206896071
4031	NC_011295	AGC	2	6	213995	214000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896071
4032	NC_011295	TCC	2	6	214139	214144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_011295	TA	3	6	214172	214177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011295	GAA	2	6	214235	214240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011295	TA	3	6	214265	214270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011295	AGC	2	6	214366	214371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895407
4037	NC_011295	GGA	2	6	214389	214394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895407
4038	NC_011295	AGA	2	6	214432	214437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895407
4039	NC_011295	AC	3	6	214477	214482	50 %	0 %	0 %	50 %	206895407
4040	NC_011295	GGC	2	6	214483	214488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895407
4041	NC_011295	CCT	2	6	214495	214500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895407
4042	NC_011295	TGG	2	6	214547	214552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895407
4043	NC_011295	AAG	2	6	214647	214652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895407
4044	NC_011295	AGC	2	6	214695	214700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895407
4045	NC_011295	TGG	2	6	214743	214748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895407
4046	NC_011295	CA	3	6	214764	214769	50 %	0 %	0 %	50 %	206895407
4047	NC_011295	CTT	2	6	214797	214802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895407
4048	NC_011295	GCA	2	6	214803	214808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895407
4049	NC_011295	CGA	2	6	214986	214991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895407
4050	NC_011295	ATA	2	6	215002	215007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895407
4051	NC_011295	TGA	2	6	215025	215030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895407
4052	NC_011295	AAG	2	6	215078	215083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895407
4053	NC_011295	GGC	2	6	215208	215213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895517
4054	NC_011295	TAGG	2	8	215278	215285	25 %	25 %	50 %	0 %	206895517
4055	NC_011295	AGC	2	6	215315	215320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895517
4056	NC_011295	CAGAAC	2	12	215354	215365	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	206895517
4057	NC_011295	AT	3	6	215426	215431	50 %	50 %	0 %	0 %	206895517
4058	NC_011295	AAAG	2	8	215459	215466	75 %	0 %	25 %	0 %	206895517
4059	NC_011295	CCA	2	6	215517	215522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895517
4060	NC_011295	A	7	7	215564	215570	100 %	0 %	0 %	0 %	206895517
4061	NC_011295	AG	3	6	215614	215619	50 %	0 %	50 %	0 %	206895517
4062	NC_011295	ACT	2	6	215729	215734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895517
4063	NC_011295	GTG	2	6	215751	215756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895517
4064	NC_011295	GGA	2	6	215975	215980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895517
4065	NC_011295	GGTG	2	8	216007	216014	0 %	25 %	75 %	0 %	206895517
4066	NC_011295	CCA	2	6	216159	216164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896412
4067	NC_011295	AG	3	6	216170	216175	50 %	0 %	50 %	0 %	206896412
4068	NC_011295	AGC	2	6	216240	216245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896412
4069	NC_011295	TGT	2	6	216375	216380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896412
4070	NC_011295	GAG	2	6	216398	216403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896412
4071	NC_011295	GA	3	6	216406	216411	50 %	0 %	50 %	0 %	206896412
4072	NC_011295	AGG	2	6	216438	216443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896412
4073	NC_011295	ACG	2	6	216465	216470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896412
4074	NC_011295	A	6	6	216505	216510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_011295	AGA	2	6	216701	216706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895951
4076	NC_011295	TCA	2	6	216727	216732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895951
4077	NC_011295	TGC	3	9	216734	216742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4078	NC_011295	A	6	6	216809	216814	100 %	0 %	0 %	0 %	206895951
4079	NC_011295	A	6	6	216886	216891	100 %	0 %	0 %	0 %	206895951
4080	NC_011295	GT	3	6	216946	216951	0 %	50 %	50 %	0 %	206895951
4081	NC_011295	TGG	2	6	216977	216982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895951
4082	NC_011295	TGC	2	6	217019	217024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4083	NC_011295	TGG	2	6	217064	217069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895951
4084	NC_011295	TGCT	2	8	217168	217175	0 %	50 %	25 %	25 %	206895951
4085	NC_011295	TA	3	6	217230	217235	50 %	50 %	0 %	0 %	206895951
4086	NC_011295	ACT	2	6	217307	217312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895951
4087	NC_011295	ATG	2	6	217449	217454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895951
4088	NC_011295	GCT	2	6	217508	217513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4089	NC_011295	GCT	2	6	217539	217544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4090	NC_011295	GCT	2	6	217551	217556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4091	NC_011295	CGC	2	6	217564	217569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206895951
4092	NC_011295	GAA	2	6	217620	217625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895951
4093	NC_011295	CTG	2	6	217738	217743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4094	NC_011295	TTC	2	6	217809	217814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895951
4095	NC_011295	TTA	2	6	217825	217830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895951
4096	NC_011295	AGC	2	6	217925	217930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895951
4097	NC_011295	AGT	2	6	217964	217969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_011295	AAAGG	2	10	217980	217989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_011295	A	6	6	218084	218089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011295	AAT	2	6	218096	218101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011295	CGA	2	6	218115	218120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_011295	GCT	2	6	218209	218214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895875
4103	NC_011295	A	7	7	218255	218261	100 %	0 %	0 %	0 %	206895875
4104	NC_011295	G	6	6	218268	218273	0 %	0 %	100 %	0 %	206895875
4105	NC_011295	ACTT	2	8	218283	218290	25 %	50 %	0 %	25 %	206895875
4106	NC_011295	GAA	2	6	218395	218400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895875
4107	NC_011295	GAA	2	6	218430	218435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895875
4108	NC_011295	AGT	2	6	218436	218441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895875
4109	NC_011295	CAA	2	6	218445	218450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895875
4110	NC_011295	TTC	2	6	218575	218580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895875
4111	NC_011295	TGT	2	6	218592	218597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895875
4112	NC_011295	AGG	2	6	218627	218632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895875
4113	NC_011295	AAC	2	6	218725	218730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895875
4114	NC_011295	CA	3	6	218752	218757	50 %	0 %	0 %	50 %	206895875
4115	NC_011295	GT	3	6	218849	218854	0 %	50 %	50 %	0 %	206895875
4116	NC_011295	TGG	2	6	218900	218905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895875
4117	NC_011295	TGA	2	6	218934	218939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895875
4118	NC_011295	TGC	2	6	218970	218975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895875
4119	NC_011295	GGT	2	6	219006	219011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895875
4120	NC_011295	GCT	3	9	219016	219024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895875
4121	NC_011295	GCA	2	6	219046	219051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895875
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4123	NC_011295	TTGGTG	2	12	219155	219166	0 %	50 %	50 %	0 %	206895871
4124	NC_011295	GAA	2	6	219229	219234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895871
4125	NC_011295	TGC	2	6	219268	219273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895871
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4127	NC_011295	TGA	2	6	219306	219311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895871
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4243	NC_011295	GAG	2	6	225483	225488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_011295	GAA	2	6	225507	225512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_011295	GAA	2	6	225606	225611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_011295	TGC	2	6	225656	225661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895899
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4248	NC_011295	T	6	6	225708	225713	0 %	100 %	0 %	0 %	206895899
4249	NC_011295	GGT	2	6	225719	225724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895899
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4253	NC_011295	GTG	2	6	225816	225821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895899
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4364	NC_011295	TAT	2	6	231514	231519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895506
4365	NC_011295	TAA	2	6	231538	231543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895506
4366	NC_011295	GTA	2	6	231557	231562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895506
4367	NC_011295	TGG	3	9	231570	231578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895506
4368	NC_011295	TGG	2	6	231582	231587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895506
4369	NC_011295	TCC	2	6	231701	231706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895506
4370	NC_011295	GTG	2	6	231722	231727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895506
4371	NC_011295	ATC	2	6	231755	231760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895506
4372	NC_011295	GGTG	3	12	231976	231987	0 %	25 %	75 %	0 %	206895344
4373	NC_011295	AGT	2	6	232043	232048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895344
4374	NC_011295	TAA	2	6	232118	232123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895344
4375	NC_011295	AAG	2	6	232162	232167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895344
4376	NC_011295	TAC	2	6	232238	232243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895344
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4379	NC_011295	TAGA	2	8	232558	232565	50 %	25 %	25 %	0 %	206895344
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4384	NC_011295	GGT	2	6	232817	232822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896132
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4387	NC_011295	TTTGG	2	10	232955	232964	0 %	60 %	40 %	0 %	206896132
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4399	NC_011295	GA	3	6	233880	233885	50 %	0 %	50 %	0 %	206895082
4400	NC_011295	TGA	2	6	233939	233944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895082
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4412	NC_011295	CTG	2	6	234542	234547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895927
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4427	NC_011295	GACATG	2	12	235613	235624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206896246
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4482	NC_011295	CTT	2	6	238641	238646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895330
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4486	NC_011295	ATG	2	6	238850	238855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895330
4487	NC_011295	AGC	2	6	238922	238927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895330
4488	NC_011295	GTA	2	6	238955	238960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895330
4489	NC_011295	TTG	2	6	239108	239113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895330
4490	NC_011295	ATGG	2	8	239227	239234	25 %	25 %	50 %	0 %	206895330
4491	NC_011295	CAG	2	6	239328	239333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895330
4492	NC_011295	GCT	2	6	239335	239340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895330
4493	NC_011295	ATG	2	6	239347	239352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895330
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4495	NC_011295	GAA	2	6	239501	239506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895330
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