MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 26607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_011295	CTG	2	6	1419686	1419691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895505
26503	NC_011295	ACA	2	6	1419715	1419720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895505
26504	NC_011295	CCT	2	6	1419784	1419789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26505	NC_011295	TAAT	2	8	1419866	1419873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26506	NC_011295	GAA	2	6	1419879	1419884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896378
26507	NC_011295	A	6	6	1419883	1419888	100 %	0 %	0 %	0 %	206896378
26508	NC_011295	TGC	2	6	1420054	1420059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896378
26509	NC_011295	ACA	3	9	1420130	1420138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896378
26510	NC_011295	CAT	2	6	1420175	1420180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896378
26511	NC_011295	ACTTG	2	10	1420202	1420211	20 %	40 %	20 %	20 %	206896378
26512	NC_011295	TGA	2	6	1420289	1420294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896378
26513	NC_011295	AAGG	2	8	1420302	1420309	50 %	0 %	50 %	0 %	206896378
26514	NC_011295	CTTT	2	8	1420317	1420324	0 %	75 %	0 %	25 %	206896378
26515	NC_011295	ATC	2	6	1420348	1420353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896378
26516	NC_011295	ACT	2	6	1420358	1420363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896378
26517	NC_011295	ATT	2	6	1420385	1420390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896378
26518	NC_011295	TC	3	6	1420408	1420413	0 %	50 %	0 %	50 %	206896378
26519	NC_011295	T	6	6	1420430	1420435	0 %	100 %	0 %	0 %	206896378
26520	NC_011295	ATG	2	6	1420455	1420460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896378
26521	NC_011295	GGA	2	6	1420500	1420505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896378
26522	NC_011295	TGA	2	6	1420520	1420525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896378
26523	NC_011295	GTTAA	2	10	1420536	1420545	40 %	40 %	20 %	0 %	206896378
26524	NC_011295	TTG	2	6	1420633	1420638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896378
26525	NC_011295	GCAG	2	8	1420644	1420651	25 %	0 %	50 %	25 %	206896378
26526	NC_011295	AGAAAA	2	12	1420771	1420782	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26527	NC_011295	AGA	2	6	1420785	1420790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26528	NC_011295	GTG	2	6	1420881	1420886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896070
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26533	NC_011295	ACT	2	6	1421244	1421249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896070
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26549	NC_011295	CAG	2	6	1422002	1422007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896070
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26551	NC_011295	ACT	2	6	1422089	1422094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896070
26552	NC_011295	AGATT	2	10	1422167	1422176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26553	NC_011295	ATT	2	6	1422217	1422222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26554	NC_011295	T	6	6	1422332	1422337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26555	NC_011295	ATT	2	6	1422341	1422346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26556	NC_011295	CTTTG	2	10	1422380	1422389	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26557	NC_011295	ATA	2	6	1422432	1422437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26558	NC_011295	A	6	6	1422489	1422494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26559	NC_011295	A	7	7	1422510	1422516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26560	NC_011295	ACTC	2	8	1422540	1422547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26561	NC_011295	TA	3	6	1422548	1422553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26564	NC_011295	TATAA	2	10	1422672	1422681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26565	NC_011295	TA	3	6	1422720	1422725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26592	NC_011295	TG	3	6	1424379	1424384	0 %	50 %	50 %	0 %	206895974
26593	NC_011295	ATA	2	6	1424434	1424439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895974
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26595	NC_011295	ATG	2	6	1424515	1424520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895974
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26600	NC_011295	CTT	2	6	1424780	1424785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26601	NC_011295	GTT	2	6	1424799	1424804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26603	NC_011295	AAG	2	6	1424822	1424827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26604	NC_011295	TGC	2	6	1424829	1424834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26606	NC_011295	ACA	2	6	1424866	1424871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26607	NC_011295	ACG	2	6	1424893	1424898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.