MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 26607

< Previous12...89101112131415161718...5354Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011295	GTG	3	9	319458	319466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895866
6002	NC_011295	ATA	2	6	319475	319480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895866
6003	NC_011295	CTG	2	6	319488	319493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895866
6004	NC_011295	GCT	2	6	319511	319516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895866
6005	NC_011295	TCA	2	6	319614	319619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895866
6006	NC_011295	GTG	2	6	319688	319693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895866
6007	NC_011295	ATC	2	6	319719	319724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895866
6008	NC_011295	GAG	2	6	319748	319753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895866
6009	NC_011295	ATC	2	6	319754	319759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895866
6010	NC_011295	GTG	2	6	319762	319767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895866
6011	NC_011295	GTT	2	6	319794	319799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895663
6012	NC_011295	AGA	2	6	319852	319857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895663
6013	NC_011295	GAT	2	6	319924	319929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895663
6014	NC_011295	C	7	7	319989	319995	0 %	0 %	0 %	100 %	206895663
6015	NC_011295	ACT	2	6	320016	320021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895663
6016	NC_011295	GA	3	6	320167	320172	50 %	0 %	50 %	0 %	206895663
6017	NC_011295	AC	3	6	320189	320194	50 %	0 %	0 %	50 %	206895663
6018	NC_011295	AAC	2	6	320297	320302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895663
6019	NC_011295	TCT	2	6	320307	320312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895663
6020	NC_011295	TGG	2	6	320430	320435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895663
6021	NC_011295	ATC	2	6	320461	320466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895663
6022	NC_011295	ATA	2	6	320523	320528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895663
6023	NC_011295	CCGT	2	8	320577	320584	0 %	25 %	25 %	50 %	206895227
6024	NC_011295	AGA	2	6	320622	320627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895227
6025	NC_011295	CCA	2	6	320685	320690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895227
6026	NC_011295	AGTTAC	2	12	320696	320707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206895227
6027	NC_011295	CTTTT	2	10	320843	320852	0 %	80 %	0 %	20 %	206895227
6028	NC_011295	CTT	2	6	320875	320880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895227
6029	NC_011295	TAC	2	6	320975	320980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895227
6030	NC_011295	ACCT	2	8	321080	321087	25 %	25 %	0 %	50 %	206895227
6031	NC_011295	TGG	2	6	321097	321102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895227
6032	NC_011295	GCT	2	6	321112	321117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895227
6033	NC_011295	TAA	2	6	321146	321151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895227
6034	NC_011295	AAGA	2	8	321182	321189	75 %	0 %	25 %	0 %	206895227
6035	NC_011295	TCT	2	6	321201	321206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895227
6036	NC_011295	ACT	2	6	321207	321212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895227
6037	NC_011295	CATTT	2	10	321317	321326	20 %	60 %	0 %	20 %	206895227
6038	NC_011295	GTT	2	6	321416	321421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895227
6039	NC_011295	AAGC	2	8	321451	321458	50 %	0 %	25 %	25 %	206895227
6040	NC_011295	TGC	2	6	321464	321469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895227
6041	NC_011295	CAA	2	6	321520	321525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895227
6042	NC_011295	ATTTTC	2	12	321558	321569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	206895227
6043	NC_011295	CAG	2	6	321571	321576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895227
6044	NC_011295	AT	3	6	321618	321623	50 %	50 %	0 %	0 %	206895227
6045	NC_011295	CCTT	2	8	321663	321670	0 %	50 %	0 %	50 %	206895227
6046	NC_011295	CCA	2	6	321706	321711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895227
6047	NC_011295	CTT	2	6	321751	321756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895227
6048	NC_011295	GCTA	2	8	321758	321765	25 %	25 %	25 %	25 %	206895227
6049	NC_011295	A	6	6	321845	321850	100 %	0 %	0 %	0 %	206895227
6050	NC_011295	CGA	2	6	321904	321909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895227
6051	NC_011295	AAG	2	6	321950	321955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895227
6052	NC_011295	GCAA	2	8	321990	321997	50 %	0 %	25 %	25 %	206895227
6053	NC_011295	ATC	2	6	321998	322003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895227
6054	NC_011295	TCT	2	6	322008	322013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895227
6055	NC_011295	TGT	2	6	322014	322019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895227
6056	NC_011295	ATC	2	6	322235	322240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895227
6057	NC_011295	CAAA	2	8	322277	322284	75 %	0 %	0 %	25 %	206895227
6058	NC_011295	ACTTG	2	10	322344	322353	20 %	40 %	20 %	20 %	206896520
6059	NC_011295	CTTT	2	8	322467	322474	0 %	75 %	0 %	25 %	206896520
6060	NC_011295	AAG	2	6	322495	322500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896520
6061	NC_011295	T	7	7	322585	322591	0 %	100 %	0 %	0 %	206896520
6062	NC_011295	TTCTT	2	10	322615	322624	0 %	80 %	0 %	20 %	206896520
6063	NC_011295	CGTACT	2	12	322647	322658	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206896520
6064	NC_011295	CAA	2	6	322731	322736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896520
6065	NC_011295	ATT	2	6	323045	323050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896520
6066	NC_011295	TG	3	6	323083	323088	0 %	50 %	50 %	0 %	206896520
6067	NC_011295	GA	3	6	323118	323123	50 %	0 %	50 %	0 %	206896520
6068	NC_011295	CG	3	6	323133	323138	0 %	0 %	50 %	50 %	206896520
6069	NC_011295	CTT	2	6	323142	323147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896520
6070	NC_011295	TCTT	2	8	323220	323227	0 %	75 %	0 %	25 %	206896520
6071	NC_011295	AGC	2	6	323251	323256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896520
6072	NC_011295	G	6	6	323300	323305	0 %	0 %	100 %	0 %	206896520
6073	NC_011295	GAT	2	6	323353	323358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896520
6074	NC_011295	ATG	2	6	323427	323432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896520
6075	NC_011295	TTCT	2	8	323475	323482	0 %	75 %	0 %	25 %	206896520
6076	NC_011295	CAT	2	6	323511	323516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896520
6077	NC_011295	AAC	2	6	323546	323551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896520
6078	NC_011295	TCT	2	6	323561	323566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896520
6079	NC_011295	TCA	2	6	323621	323626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896520
6080	NC_011295	ATC	2	6	323639	323644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896520
6081	NC_011295	CAC	2	6	323674	323679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896520
6082	NC_011295	CAA	2	6	323706	323711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896520
6083	NC_011295	TTC	2	6	323785	323790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896520
6084	NC_011295	CAC	2	6	323814	323819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896520
6085	NC_011295	T	6	6	323839	323844	0 %	100 %	0 %	0 %	206896520
6086	NC_011295	GCT	2	6	323856	323861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_011295	CAT	2	6	323862	323867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895337
6088	NC_011295	ACA	2	6	323935	323940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895337
6089	NC_011295	GAT	2	6	323945	323950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895337
6090	NC_011295	AGTA	2	8	323975	323982	50 %	25 %	25 %	0 %	206895337
6091	NC_011295	ACTG	2	8	323983	323990	25 %	25 %	25 %	25 %	206895337
6092	NC_011295	TAAG	2	8	324082	324089	50 %	25 %	25 %	0 %	206895337
6093	NC_011295	ATC	2	6	324339	324344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895337
6094	NC_011295	GA	3	6	324363	324368	50 %	0 %	50 %	0 %	206895337
6095	NC_011295	TAA	2	6	324486	324491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895337
6096	NC_011295	GAAAG	2	10	324493	324502	60 %	0 %	40 %	0 %	206895337
6097	NC_011295	TTTTG	2	10	324549	324558	0 %	80 %	20 %	0 %	206895337
6098	NC_011295	TTA	2	6	324565	324570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895337
6099	NC_011295	AAAG	2	8	324599	324606	75 %	0 %	25 %	0 %	206895337
6100	NC_011295	TAG	2	6	324650	324655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895337
6101	NC_011295	TTC	2	6	324665	324670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895337
6102	NC_011295	GTA	2	6	324761	324766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_011295	GTC	2	6	324773	324778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_011295	AAG	2	6	324805	324810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895960
6105	NC_011295	GCT	2	6	324872	324877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895960
6106	NC_011295	TCG	2	6	324938	324943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895960
6107	NC_011295	A	6	6	325147	325152	100 %	0 %	0 %	0 %	206895960
6108	NC_011295	AGC	2	6	325332	325337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895960
6109	NC_011295	AAG	2	6	325480	325485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895960
6110	NC_011295	TTC	2	6	325489	325494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895960
6111	NC_011295	CAT	2	6	325495	325500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895960
6112	NC_011295	TCC	2	6	325521	325526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895960
6113	NC_011295	AGTG	2	8	325539	325546	25 %	25 %	50 %	0 %	206895960
6114	NC_011295	TGA	2	6	325554	325559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896035
6115	NC_011295	CTT	2	6	325702	325707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896035
6116	NC_011295	GAA	2	6	325759	325764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896035
6117	NC_011295	CCTTT	2	10	325821	325830	0 %	60 %	0 %	40 %	206896035
6118	NC_011295	AAAC	2	8	325869	325876	75 %	0 %	0 %	25 %	206896035
6119	NC_011295	GAT	2	6	325948	325953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896035
6120	NC_011295	GGT	2	6	325981	325986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896035
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6492	NC_011295	TGC	2	6	345645	345650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896376
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