MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 1658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011027	GAAGC	2	10	443	452	40 %	0 %	40 %	20 %	193211677
2	NC_011027	AGCGG	2	10	818	827	20 %	0 %	60 %	20 %	193211677
3	NC_011027	GAAAT	2	10	1931	1940	60 %	20 %	20 %	0 %	193211678
4	NC_011027	CGACT	2	10	3077	3086	20 %	20 %	20 %	40 %	193211679
5	NC_011027	GAGAA	2	10	3350	3359	60 %	0 %	40 %	0 %	193211679
6	NC_011027	ACGAC	2	10	4417	4426	40 %	0 %	20 %	40 %	193211680
7	NC_011027	TGGCA	2	10	5080	5089	20 %	20 %	40 %	20 %	193211681
8	NC_011027	TTCTG	2	10	6307	6316	0 %	60 %	20 %	20 %	193211682
9	NC_011027	GTTCA	2	10	7570	7579	20 %	40 %	20 %	20 %	193211682
10	NC_011027	CGGAG	2	10	9456	9465	20 %	0 %	60 %	20 %	193211683
11	NC_011027	TTGAA	2	10	10405	10414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011027	ATTTC	2	10	10623	10632	20 %	60 %	0 %	20 %	193211684
13	NC_011027	GTGAT	2	10	12993	13002	20 %	40 %	40 %	0 %	193211686
14	NC_011027	TGATC	2	10	13910	13919	20 %	40 %	20 %	20 %	193211687
15	NC_011027	CTGGT	2	10	15565	15574	0 %	40 %	40 %	20 %	193211688
16	NC_011027	GGTCA	2	10	17656	17665	20 %	20 %	40 %	20 %	193211689
17	NC_011027	CCGGC	2	10	20904	20913	0 %	0 %	40 %	60 %	193211692
18	NC_011027	GAGAT	2	10	21323	21332	40 %	20 %	40 %	0 %	193211693
19	NC_011027	ATTCT	2	10	21752	21761	20 %	60 %	0 %	20 %	193211693
20	NC_011027	TTGTC	2	10	29717	29726	0 %	60 %	20 %	20 %	193211699
21	NC_011027	CGTGG	2	10	31485	31494	0 %	20 %	60 %	20 %	193211701
22	NC_011027	ACACC	2	10	32784	32793	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_011027	CGAAA	2	10	36491	36500	60 %	0 %	20 %	20 %	193211705
24	NC_011027	TTCCT	2	10	36967	36976	0 %	60 %	0 %	40 %	193211705
25	NC_011027	GAAGA	2	10	39723	39732	60 %	0 %	40 %	0 %	193211709
26	NC_011027	CCGAC	2	10	42851	42860	20 %	0 %	20 %	60 %	193211712
27	NC_011027	TGGCG	2	10	43256	43265	0 %	20 %	60 %	20 %	193211712
28	NC_011027	GATAC	2	10	46926	46935	40 %	20 %	20 %	20 %	193211716
29	NC_011027	TGCGT	2	10	47338	47347	0 %	40 %	40 %	20 %	193211716
30	NC_011027	TTCGG	2	10	48189	48198	0 %	40 %	40 %	20 %	193211717
31	NC_011027	TGCCG	2	10	51585	51594	0 %	20 %	40 %	40 %	193211721
32	NC_011027	GCTCG	2	10	52457	52466	0 %	20 %	40 %	40 %	193211722
33	NC_011027	CGTGC	2	10	52583	52592	0 %	20 %	40 %	40 %	193211722
34	NC_011027	CGGCG	2	10	53316	53325	0 %	0 %	60 %	40 %	193211722
35	NC_011027	TGGCG	2	10	55731	55740	0 %	20 %	60 %	20 %	193211723
36	NC_011027	TATAA	2	10	56446	56455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011027	CGGGG	2	10	56803	56812	0 %	0 %	80 %	20 %	193211725
38	NC_011027	TCGGT	2	10	56907	56916	0 %	40 %	40 %	20 %	193211725
39	NC_011027	CTTCG	2	10	59521	59530	0 %	40 %	20 %	40 %	193211727
40	NC_011027	TTCGG	2	10	61669	61678	0 %	40 %	40 %	20 %	193211729
41	NC_011027	CGGTG	2	10	62657	62666	0 %	20 %	60 %	20 %	193211730
42	NC_011027	CGGGG	2	10	67540	67549	0 %	0 %	80 %	20 %	193211733
43	NC_011027	GAAGA	2	10	68406	68415	60 %	0 %	40 %	0 %	193211734
44	NC_011027	GGTTG	2	10	69762	69771	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011027	TTCAG	2	10	69819	69828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011027	GTATC	2	10	71451	71460	20 %	40 %	20 %	20 %	193211736
47	NC_011027	CTCGC	2	10	73909	73918	0 %	20 %	20 %	60 %	193211740
48	NC_011027	GCCTT	2	10	74068	74077	0 %	40 %	20 %	40 %	193211740
49	NC_011027	GTCTG	2	10	74370	74379	0 %	40 %	40 %	20 %	193211741
50	NC_011027	TCGAC	2	10	74814	74823	20 %	20 %	20 %	40 %	193211741
51	NC_011027	GGTGT	2	10	74947	74956	0 %	40 %	60 %	0 %	193211742
52	NC_011027	TCGTA	2	10	76571	76580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011027	CGATG	2	10	76823	76832	20 %	20 %	40 %	20 %	193211744
54	NC_011027	GGTTC	2	10	79175	79184	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011027	GCGAG	2	10	82038	82047	20 %	0 %	60 %	20 %	193211748
56	NC_011027	CGCGC	2	10	82466	82475	0 %	0 %	40 %	60 %	193211748
57	NC_011027	CTCGA	2	10	82907	82916	20 %	20 %	20 %	40 %	193211748
58	NC_011027	CTTCG	2	10	83518	83527	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011027	GCCTG	2	10	84178	84187	0 %	20 %	40 %	40 %	193211749
60	NC_011027	AATGA	2	10	87174	87183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011027	AATGA	2	10	87249	87258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011027	AATGA	2	10	87324	87333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011027	AATGA	2	10	87395	87404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011027	AATGA	2	10	87468	87477	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011027	AATGA	2	10	87542	87551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011027	AATGA	2	10	87618	87627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011027	AATGA	2	10	87693	87702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011027	AATGA	2	10	87767	87776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011027	AATGA	2	10	87839	87848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011027	AATGA	2	10	87909	87918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011027	AATGA	2	10	87983	87992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011027	AATGA	2	10	88059	88068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011027	AATGA	2	10	88134	88143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011027	AATGA	2	10	88207	88216	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011027	AATGA	2	10	88280	88289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011027	AATGA	2	10	88354	88363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011027	CCTTG	2	10	88785	88794	0 %	40 %	20 %	40 %	193211751
78	NC_011027	AGCAA	2	10	92381	92390	60 %	0 %	20 %	20 %	193211753
79	NC_011027	AGCTG	2	10	92478	92487	20 %	20 %	40 %	20 %	193211753
80	NC_011027	TCCGT	2	10	94288	94297	0 %	40 %	20 %	40 %	193211756
81	NC_011027	ATTTT	2	10	98189	98198	20 %	80 %	0 %	0 %	193211759
82	NC_011027	CGTTT	2	10	99168	99177	0 %	60 %	20 %	20 %	193211760
83	NC_011027	TCGGT	2	10	100398	100407	0 %	40 %	40 %	20 %	193211761
84	NC_011027	GGCGA	2	10	103649	103658	20 %	0 %	60 %	20 %	193211765
85	NC_011027	TTTGC	2	10	103830	103839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011027	CCATG	2	10	104246	104255	20 %	20 %	20 %	40 %	193211766
87	NC_011027	CGCTG	2	10	105178	105187	0 %	20 %	40 %	40 %	193211767
88	NC_011027	CGGGC	2	10	106233	106242	0 %	0 %	60 %	40 %	193211768
89	NC_011027	GTTGA	2	10	106586	106595	20 %	40 %	40 %	0 %	193211768
90	NC_011027	TTCGG	2	10	108322	108331	0 %	40 %	40 %	20 %	193211771
91	NC_011027	GCGCG	2	10	110193	110202	0 %	0 %	60 %	40 %	193211771
92	NC_011027	TCGTG	2	10	113952	113961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011027	GCAAG	2	10	114424	114433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011027	CCGTA	2	10	116557	116566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011027	GGCCA	2	10	120146	120155	20 %	0 %	40 %	40 %	193211774
96	NC_011027	GCTGC	2	10	122580	122589	0 %	20 %	40 %	40 %	193211776
97	NC_011027	CGAAA	2	10	124451	124460	60 %	0 %	20 %	20 %	193211777
98	NC_011027	GCGTG	2	10	125065	125074	0 %	20 %	60 %	20 %	193211778
99	NC_011027	AGAGC	2	10	130910	130919	40 %	0 %	40 %	20 %	193211786
100	NC_011027	CGGTA	2	10	131308	131317	20 %	20 %	40 %	20 %	193211787
101	NC_011027	GAACG	2	10	133498	133507	40 %	0 %	40 %	20 %	193211790
102	NC_011027	TTCTT	2	10	133508	133517	0 %	80 %	0 %	20 %	193211790
103	NC_011027	ATCGC	2	10	135110	135119	20 %	20 %	20 %	40 %	193211793
104	NC_011027	CTCGC	2	10	135152	135161	0 %	20 %	20 %	60 %	193211793
105	NC_011027	CGCCA	2	10	135939	135948	20 %	0 %	20 %	60 %	193211793
106	NC_011027	GCGCC	2	10	137703	137712	0 %	0 %	40 %	60 %	193211794
107	NC_011027	AGAGG	2	10	143033	143042	40 %	0 %	60 %	0 %	193211797
108	NC_011027	ATTTT	2	10	143717	143726	20 %	80 %	0 %	0 %	193211798
109	NC_011027	CGCGC	2	10	146735	146744	0 %	0 %	40 %	60 %	193211802
110	NC_011027	TGATC	2	10	147723	147732	20 %	40 %	20 %	20 %	193211803
111	NC_011027	GCGAG	2	10	148179	148188	20 %	0 %	60 %	20 %	193211804
112	NC_011027	GCCTG	2	10	150973	150982	0 %	20 %	40 %	40 %	193211807
113	NC_011027	TCAGC	2	10	152320	152329	20 %	20 %	20 %	40 %	193211809
114	NC_011027	CAGGT	2	10	152355	152364	20 %	20 %	40 %	20 %	193211809
115	NC_011027	GCCTC	2	10	155851	155860	0 %	20 %	20 %	60 %	193211812
116	NC_011027	GGCGC	2	10	156792	156801	0 %	0 %	60 %	40 %	193211813
117	NC_011027	CGCTG	2	10	158668	158677	0 %	20 %	40 %	40 %	193211816
118	NC_011027	GCCGT	2	10	158970	158979	0 %	20 %	40 %	40 %	193211817
119	NC_011027	CCGAG	2	10	163156	163165	20 %	0 %	40 %	40 %	193211823
120	NC_011027	GGAGA	2	10	165149	165158	40 %	0 %	60 %	0 %	193211825
121	NC_011027	TTGCA	2	10	165531	165540	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011027	GGTTT	2	10	165551	165560	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011027	TCGTC	2	10	166534	166543	0 %	40 %	20 %	40 %	193211827
124	NC_011027	CGTTT	2	10	167093	167102	0 %	60 %	20 %	20 %	193211827
125	NC_011027	GTCAA	2	10	172884	172893	40 %	20 %	20 %	20 %	193211835
126	NC_011027	TGGCG	2	10	175849	175858	0 %	20 %	60 %	20 %	193211837
127	NC_011027	GCGGT	2	10	176097	176106	0 %	20 %	60 %	20 %	193211837
128	NC_011027	GAATC	2	10	176823	176832	40 %	20 %	20 %	20 %	193211837
129	NC_011027	TCAAT	2	10	181285	181294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011027	ATGTG	2	10	181611	181620	20 %	40 %	40 %	0 %	193211842
131	NC_011027	GGTGG	2	10	183562	183571	0 %	20 %	80 %	0 %	193211844
132	NC_011027	AGGCA	2	10	183680	183689	40 %	0 %	40 %	20 %	193211844
133	NC_011027	CGAAA	2	10	184578	184587	60 %	0 %	20 %	20 %	193211845
134	NC_011027	GGCCG	2	10	189834	189843	0 %	0 %	60 %	40 %	193211851
135	NC_011027	CGAAT	2	10	190299	190308	40 %	20 %	20 %	20 %	193211851
136	NC_011027	AGGCC	2	10	191321	191330	20 %	0 %	40 %	40 %	193211853
137	NC_011027	GCAAC	2	10	197649	197658	40 %	0 %	20 %	40 %	193211867
138	NC_011027	TACGG	2	10	199644	199653	20 %	20 %	40 %	20 %	193211871
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270	NC_011027	CTTTT	2	10	405941	405950	0 %	80 %	0 %	20 %	193212051
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384	NC_011027	GCAGC	2	10	577680	577689	20 %	0 %	40 %	40 %	193212208
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498	NC_011027	GCACC	2	10	720140	720149	20 %	0 %	20 %	60 %	193212340
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