MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 47786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011027	GAC	2	6	47156	47161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211716
1002	NC_011027	AGG	2	6	47163	47168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211716
1003	NC_011027	GACA	2	8	47245	47252	50 %	0 %	25 %	25 %	193211716
1004	NC_011027	GGA	2	6	47332	47337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211716
1005	NC_011027	TGCGT	2	10	47338	47347	0 %	40 %	40 %	20 %	193211716
1006	NC_011027	CTT	2	6	47444	47449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211716
1007	NC_011027	CTGT	2	8	47451	47458	0 %	50 %	25 %	25 %	193211716
1008	NC_011027	AAG	2	6	47468	47473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211716
1009	NC_011027	AGC	2	6	47572	47577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211716
1010	NC_011027	GC	3	6	47644	47649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_011027	GTT	2	6	47661	47666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011027	TGA	2	6	47706	47711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011027	T	7	7	47792	47798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011027	GGT	2	6	47906	47911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011027	T	7	7	48055	48061	0 %	100 %	0 %	0 %	193211717
1016	NC_011027	TGA	2	6	48092	48097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211717
1017	NC_011027	TCG	2	6	48112	48117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211717
1018	NC_011027	TCA	2	6	48130	48135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211717
1019	NC_011027	CAC	2	6	48144	48149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211717
1020	NC_011027	CAA	2	6	48179	48184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211717
1021	NC_011027	TTCGG	2	10	48189	48198	0 %	40 %	40 %	20 %	193211717
1022	NC_011027	AAT	2	6	48257	48262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193211717
1023	NC_011027	TCA	2	6	48395	48400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211718
1024	NC_011027	TCA	2	6	48431	48436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211718
1025	NC_011027	GTA	2	6	48465	48470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211718
1026	NC_011027	TCG	2	6	48505	48510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211718
1027	NC_011027	TGC	2	6	48638	48643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211718
1028	NC_011027	GAG	2	6	48679	48684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211718
1029	NC_011027	GCC	2	6	48699	48704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211718
1030	NC_011027	GCT	2	6	48825	48830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211718
1031	NC_011027	GGC	2	6	48849	48854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211718
1032	NC_011027	CGA	2	6	48929	48934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211718
1033	NC_011027	CCG	2	6	49000	49005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211718
1034	NC_011027	GCAG	2	8	49007	49014	25 %	0 %	50 %	25 %	193211718
1035	NC_011027	CGGT	2	8	49072	49079	0 %	25 %	50 %	25 %	193211718
1036	NC_011027	AGGT	2	8	49147	49154	25 %	25 %	50 %	0 %	193211718
1037	NC_011027	GA	3	6	49199	49204	50 %	0 %	50 %	0 %	193211718
1038	NC_011027	CTG	2	6	49289	49294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011027	GCC	2	6	49315	49320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_011027	CAG	2	6	49344	49349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211719
1041	NC_011027	TTG	3	9	49357	49365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211719
1042	NC_011027	AAG	2	6	49375	49380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211719
1043	NC_011027	CAGG	2	8	49415	49422	25 %	0 %	50 %	25 %	193211719
1044	NC_011027	AAC	2	6	49537	49542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211719
1045	NC_011027	GCG	2	6	49547	49552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211719
1046	NC_011027	T	6	6	49603	49608	0 %	100 %	0 %	0 %	193211720
1047	NC_011027	CAGG	2	8	49658	49665	25 %	0 %	50 %	25 %	193211720
1048	NC_011027	GAT	2	6	49683	49688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211720
1049	NC_011027	GAA	2	6	49761	49766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211720
1050	NC_011027	TCG	2	6	49822	49827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211720
1051	NC_011027	GAT	2	6	49854	49859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211720
1052	NC_011027	GGA	2	6	49883	49888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211720
1053	NC_011027	GAT	2	6	49929	49934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211720
1054	NC_011027	TCA	2	6	50071	50076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211720
1055	NC_011027	ATAG	2	8	50085	50092	50 %	25 %	25 %	0 %	193211720
1056	NC_011027	TGT	2	6	50246	50251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211720
1057	NC_011027	CAG	2	6	50259	50264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211720
1058	NC_011027	TCA	2	6	50281	50286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211720
1059	NC_011027	CGGGCA	2	12	50326	50337	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193211720
1060	NC_011027	CAT	2	6	50397	50402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211720
1061	NC_011027	TTG	2	6	50485	50490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211720
1062	NC_011027	ATG	2	6	50500	50505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211720
1063	NC_011027	CAC	2	6	50528	50533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211720
1064	NC_011027	ACC	2	6	50550	50555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211720
1065	NC_011027	TCG	2	6	50626	50631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211720
1066	NC_011027	CTC	2	6	50832	50837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211720
1067	NC_011027	TGT	2	6	50848	50853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193211720
1068	NC_011027	TCAACG	2	12	50935	50946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193211720
1069	NC_011027	GAT	2	6	50955	50960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211720
1070	NC_011027	CTT	2	6	50975	50980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193211720
1071	NC_011027	CTA	2	6	51126	51131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011027	A	6	6	51272	51277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011027	TCAT	2	8	51337	51344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_011027	CAG	2	6	51346	51351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011027	TAT	2	6	51352	51357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011027	A	6	6	51381	51386	100 %	0 %	0 %	0 %	193211721
1077	NC_011027	GCC	2	6	51402	51407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211721
1078	NC_011027	TCTG	2	8	51409	51416	0 %	50 %	25 %	25 %	193211721
1079	NC_011027	CCGC	2	8	51457	51464	0 %	0 %	25 %	75 %	193211721
1080	NC_011027	GCCC	2	8	51577	51584	0 %	0 %	25 %	75 %	193211721
1081	NC_011027	TGCCG	2	10	51585	51594	0 %	20 %	40 %	40 %	193211721
1082	NC_011027	GAA	2	6	51632	51637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193211721
1083	NC_011027	AGC	2	6	51702	51707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211721
1084	NC_011027	TCGT	2	8	51798	51805	0 %	50 %	25 %	25 %	193211721
1085	NC_011027	GTC	2	6	51837	51842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211721
1086	NC_011027	GGA	2	6	51843	51848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211721
1087	NC_011027	AGG	2	6	51856	51861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211721
1088	NC_011027	TGC	2	6	51930	51935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011027	CTT	2	6	51957	51962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011027	GGA	2	6	51987	51992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011027	GC	3	6	52007	52012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011027	T	6	6	52037	52042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011027	ATC	2	6	52049	52054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011027	CAAT	2	8	52075	52082	50 %	25 %	0 %	25 %	193211722
1095	NC_011027	CT	3	6	52236	52241	0 %	50 %	0 %	50 %	193211722
1096	NC_011027	GCA	2	6	52321	52326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1097	NC_011027	CGC	2	6	52329	52334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211722
1098	NC_011027	CAA	2	6	52352	52357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211722
1099	NC_011027	GCTCG	2	10	52457	52466	0 %	20 %	40 %	40 %	193211722
1100	NC_011027	GTG	2	6	52509	52514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193211722
1101	NC_011027	CAT	2	6	52526	52531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211722
1102	NC_011027	GAG	2	6	52569	52574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211722
1103	NC_011027	CGTGC	2	10	52583	52592	0 %	20 %	40 %	40 %	193211722
1104	NC_011027	TCGG	2	8	52599	52606	0 %	25 %	50 %	25 %	193211722
1105	NC_011027	CAG	2	6	52626	52631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1106	NC_011027	GC	3	6	52685	52690	0 %	0 %	50 %	50 %	193211722
1107	NC_011027	GGC	2	6	52716	52721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211722
1108	NC_011027	A	6	6	52737	52742	100 %	0 %	0 %	0 %	193211722
1109	NC_011027	CCT	2	6	52762	52767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211722
1110	NC_011027	ATG	2	6	52893	52898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211722
1111	NC_011027	CAC	2	6	52931	52936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193211722
1112	NC_011027	CGA	2	6	52943	52948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1113	NC_011027	CGT	2	6	53062	53067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1114	NC_011027	TG	3	6	53117	53122	0 %	50 %	50 %	0 %	193211722
1115	NC_011027	GCC	2	6	53205	53210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211722
1116	NC_011027	CGA	2	6	53258	53263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1117	NC_011027	CGG	2	6	53309	53314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211722
1118	NC_011027	CGGCG	2	10	53316	53325	0 %	0 %	60 %	40 %	193211722
1119	NC_011027	TAC	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211722
1120	NC_011027	GCC	2	6	53379	53384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211722
1121	NC_011027	CCG	5	15	53404	53418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211722
1122	NC_011027	TGC	2	6	53455	53460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1123	NC_011027	ACT	2	6	53485	53490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211722
1124	NC_011027	CCG	2	6	53529	53534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211722
1125	NC_011027	ATT	2	6	53625	53630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193211722
1126	NC_011027	ATCG	2	8	53693	53700	25 %	25 %	25 %	25 %	193211722
1127	NC_011027	CGA	2	6	53714	53719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211722
1128	NC_011027	GAG	2	6	53793	53798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193211722
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1130	NC_011027	T	8	8	53985	53992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011027	TGTTTT	2	12	54012	54023	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011027	AT	3	6	54051	54056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011027	TA	3	6	54066	54071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011027	CGA	2	6	54079	54084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_011027	TTGA	2	8	54145	54152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011027	TGT	2	6	54211	54216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_011027	CT	4	8	54219	54226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_011027	GTC	2	6	54345	54350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_011027	AGG	2	6	54360	54365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1146	NC_011027	TGCT	2	8	54776	54783	0 %	50 %	25 %	25 %	193211723
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1247	NC_011027	TACC	2	8	59815	59822	25 %	25 %	0 %	50 %	193211727
1248	NC_011027	TGG	2	6	59894	59899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_011027	GCC	2	6	60006	60011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1250	NC_011027	AGC	2	6	60015	60020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211728
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1252	NC_011027	GC	3	6	60123	60128	0 %	0 %	50 %	50 %	193211728
1253	NC_011027	CTA	2	6	60188	60193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211728
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1255	NC_011027	CGC	2	6	60388	60393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193211728
1256	NC_011027	CGCC	2	8	60562	60569	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1257	NC_011027	GAA	2	6	60653	60658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_011027	TGC	2	6	60668	60673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_011027	CGA	2	6	60690	60695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211729
1260	NC_011027	TGA	2	6	60725	60730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193211729
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1262	NC_011027	ATC	2	6	60769	60774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193211729
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1358	NC_011027	TCGT	2	8	65217	65224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1359	NC_011027	TCT	2	6	65245	65250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1360	NC_011027	CTT	2	6	65263	65268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1361	NC_011027	TCA	2	6	65307	65312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1362	NC_011027	TTAT	2	8	65372	65379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1363	NC_011027	CTTC	2	8	65417	65424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1364	NC_011027	CGG	2	6	65580	65585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193211733
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1374	NC_011027	GCT	2	6	65914	65919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193211733
1375	NC_011027	CTC	2	6	65932	65937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193211733
1376	NC_011027	CATCGC	2	12	65938	65949	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	193211733
1377	NC_011027	ACG	2	6	65970	65975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211733
1378	NC_011027	CAA	2	6	66019	66024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193211733
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1383	NC_011027	GCA	2	6	66174	66179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193211733
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