MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	CCAG	2	8	24	31	25 %	0 %	25 %	50 %	193213721
2	NC_011026	A	6	6	82	87	100 %	0 %	0 %	0 %	193213721
3	NC_011026	T	7	7	205	211	0 %	100 %	0 %	0 %	193213721
4	NC_011026	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213721
5	NC_011026	GC	3	6	249	254	0 %	0 %	50 %	50 %	193213721
6	NC_011026	GGC	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
7	NC_011026	CGT	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213721
8	NC_011026	A	6	6	352	357	100 %	0 %	0 %	0 %	193213721
9	NC_011026	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
10	NC_011026	AAG	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
11	NC_011026	GCG	2	6	529	534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
12	NC_011026	CGG	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
13	NC_011026	ATGT	2	8	673	680	25 %	50 %	25 %	0 %	193213721
14	NC_011026	AAC	2	6	724	729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213721
15	NC_011026	CCT	2	6	768	773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213721
16	NC_011026	CAT	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213721
17	NC_011026	A	6	6	809	814	100 %	0 %	0 %	0 %	193213721
18	NC_011026	CAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213721
19	NC_011026	GAA	2	6	1009	1014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
20	NC_011026	CCA	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213721
21	NC_011026	CT	3	6	1119	1124	0 %	50 %	0 %	50 %	193213721
22	NC_011026	A	6	6	1155	1160	100 %	0 %	0 %	0 %	193213721
23	NC_011026	A	7	7	1320	1326	100 %	0 %	0 %	0 %	193213721
24	NC_011026	GATTG	2	10	1350	1359	20 %	40 %	40 %	0 %	193213721
25	NC_011026	CGG	2	6	1365	1370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213721
26	NC_011026	GAA	2	6	1432	1437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
27	NC_011026	GAA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213721
28	NC_011026	ACATT	2	10	1491	1500	40 %	40 %	0 %	20 %	193213721
29	NC_011026	CTTT	2	8	1520	1527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011026	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011026	A	6	6	1563	1568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011026	T	6	6	1570	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011026	ATA	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213722
34	NC_011026	CATT	2	8	1701	1708	25 %	50 %	0 %	25 %	193213722
35	NC_011026	GAACGA	2	12	1785	1796	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	193213722
36	NC_011026	CATC	2	8	1894	1901	25 %	25 %	0 %	50 %	193213722
37	NC_011026	ATC	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213722
38	NC_011026	CG	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	193213723
39	NC_011026	CTT	2	6	2132	2137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213723
40	NC_011026	TTC	2	6	2151	2156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213723
41	NC_011026	ACG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213723
42	NC_011026	GTG	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213723
43	NC_011026	GCG	2	6	2385	2390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213723
44	NC_011026	T	6	6	2456	2461	0 %	100 %	0 %	0 %	193213723
45	NC_011026	AAT	3	9	2477	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213723
46	NC_011026	GCG	2	6	2519	2524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213723
47	NC_011026	CG	4	8	2538	2545	0 %	0 %	50 %	50 %	193213723
48	NC_011026	CAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213723
49	NC_011026	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213723
50	NC_011026	AGG	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213723
51	NC_011026	CGT	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213723
52	NC_011026	CG	4	8	2882	2889	0 %	0 %	50 %	50 %	193213723
53	NC_011026	GCG	3	9	2887	2895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213723
54	NC_011026	T	7	7	2923	2929	0 %	100 %	0 %	0 %	193213723
55	NC_011026	CGGA	2	8	2955	2962	25 %	0 %	50 %	25 %	193213723
56	NC_011026	CTC	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213723
57	NC_011026	CACCCG	2	12	2984	2995	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	193213723
58	NC_011026	CGA	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213723
59	NC_011026	AATG	2	8	3040	3047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011026	CA	3	6	3058	3063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011026	TAA	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011026	CAAA	2	8	3120	3127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011026	ATC	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213724
64	NC_011026	CAG	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213724
65	NC_011026	GCG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213724
66	NC_011026	AGC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213724
67	NC_011026	ACC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213724
68	NC_011026	TAA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011026	ATA	2	6	3396	3401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213725
70	NC_011026	T	6	6	3450	3455	0 %	100 %	0 %	0 %	193213725
71	NC_011026	CCT	2	6	3457	3462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213725
72	NC_011026	GTAA	2	8	3591	3598	50 %	25 %	25 %	0 %	193213725
73	NC_011026	GCC	3	9	3698	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213725
74	NC_011026	CAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213725
75	NC_011026	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213725
76	NC_011026	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213725
77	NC_011026	CCG	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213725
78	NC_011026	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213725
79	NC_011026	CAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213725
80	NC_011026	CAAAGC	2	12	4085	4096	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193213725
81	NC_011026	T	7	7	4121	4127	0 %	100 %	0 %	0 %	193213725
82	NC_011026	ATA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011026	ATT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011026	ATTGA	2	10	4245	4254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011026	TAA	2	6	4269	4274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011026	ATA	2	6	4386	4391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011026	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011026	CGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011026	AGA	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011026	GAT	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011026	T	6	6	4523	4528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011026	A	6	6	4585	4590	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
93	NC_011026	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
94	NC_011026	CGG	2	6	4704	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
95	NC_011026	A	6	6	4758	4763	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
96	NC_011026	GC	3	6	4767	4772	0 %	0 %	50 %	50 %	193213726
97	NC_011026	ATC	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
98	NC_011026	CGG	2	6	4816	4821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
99	NC_011026	TCGT	2	8	4834	4841	0 %	50 %	25 %	25 %	193213726
100	NC_011026	GGAC	2	8	4877	4884	25 %	0 %	50 %	25 %	193213726
101	NC_011026	GCG	2	6	4920	4925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
102	NC_011026	ATG	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213726
103	NC_011026	CGAT	2	8	4993	5000	25 %	25 %	25 %	25 %	193213726
104	NC_011026	CGA	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
105	NC_011026	CCA	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213726
106	NC_011026	AAT	2	6	5163	5168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213726
107	NC_011026	GAA	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
108	NC_011026	TGA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213726
109	NC_011026	ATT	2	6	5232	5237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
110	NC_011026	A	6	6	5324	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
111	NC_011026	CAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
112	NC_011026	A	6	6	5392	5397	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
113	NC_011026	CAG	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
114	NC_011026	CGA	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
115	NC_011026	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
116	NC_011026	GTG	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213726
117	NC_011026	GGC	2	6	5583	5588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
118	NC_011026	GAAA	2	8	5609	5616	75 %	0 %	25 %	0 %	193213726
119	NC_011026	ATC	2	6	5635	5640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
120	NC_011026	GCG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
121	NC_011026	CG	3	6	5694	5699	0 %	0 %	50 %	50 %	193213726
122	NC_011026	ATC	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
123	NC_011026	CGC	2	6	6015	6020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213726
124	NC_011026	GAA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
125	NC_011026	TTCAC	2	10	6243	6252	20 %	40 %	0 %	40 %	193213726
126	NC_011026	CCGCA	2	10	6299	6308	20 %	0 %	20 %	60 %	193213726
127	NC_011026	A	6	6	6352	6357	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
128	NC_011026	GAA	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213726
129	NC_011026	A	7	7	6432	6438	100 %	0 %	0 %	0 %	193213726
130	NC_011026	CAC	2	6	6439	6444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213726
131	NC_011026	CGC	2	6	6465	6470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213726
132	NC_011026	CAT	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213726
133	NC_011026	ACG	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
134	NC_011026	TGGT	2	8	6511	6518	0 %	50 %	50 %	0 %	193213726
135	NC_011026	CCA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213726
136	NC_011026	GCG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
137	NC_011026	ATT	2	6	6660	6665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
138	NC_011026	ACG	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213726
139	NC_011026	GCT	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213726
140	NC_011026	GCG	2	6	6766	6771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213726
141	NC_011026	ATG	2	6	6838	6843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213726
142	NC_011026	ATT	3	9	6852	6860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213726
143	NC_011026	CGTT	2	8	6932	6939	0 %	50 %	25 %	25 %	193213726
144	NC_011026	AGACGA	2	12	6950	6961	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	193213726
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146	NC_011026	GGAAGA	2	12	7001	7012	50 %	0 %	50 %	0 %	193213726
147	NC_011026	GGA	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213726
148	NC_011026	AATCA	2	10	7032	7041	60 %	20 %	0 %	20 %	193213726
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150	NC_011026	TACC	2	8	7111	7118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011026	T	8	8	7148	7155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011026	CCGC	2	8	7177	7184	0 %	0 %	25 %	75 %	193213727
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156	NC_011026	TTG	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213727
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160	NC_011026	GGGCT	2	10	7396	7405	0 %	20 %	60 %	20 %	193213727
161	NC_011026	AAAT	2	8	7411	7418	75 %	25 %	0 %	0 %	193213727
162	NC_011026	T	6	6	7448	7453	0 %	100 %	0 %	0 %	193213727
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240	NC_011026	TGACT	2	10	10799	10808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
241	NC_011026	AAC	2	6	10840	10845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_011026	CATC	2	8	10913	10920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
243	NC_011026	TTC	2	6	10939	10944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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245	NC_011026	A	7	7	10992	10998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_011026	CAT	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_011026	GGT	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213728
263	NC_011026	TTCA	2	8	11792	11799	25 %	50 %	0 %	25 %	193213728
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272	NC_011026	CT	3	6	12482	12487	0 %	50 %	0 %	50 %	193213728
273	NC_011026	CTT	2	6	12619	12624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213728
274	NC_011026	CGG	2	6	12745	12750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213728
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390	NC_011026	T	6	6	18829	18834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_011026	CGA	2	6	18930	18935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213735
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393	NC_011026	CTT	2	6	18949	18954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213735
394	NC_011026	ACGC	2	8	18997	19004	25 %	0 %	25 %	50 %	193213735
395	NC_011026	CACGC	2	10	19019	19028	20 %	0 %	20 %	60 %	193213735
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397	NC_011026	CTG	2	6	19048	19053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213735
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399	NC_011026	GAA	2	6	19089	19094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213735
400	NC_011026	CAA	2	6	19114	19119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213735
401	NC_011026	GGC	2	6	19263	19268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213735
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403	NC_011026	ACG	2	6	19293	19298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213735
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