MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011026	TGT	2	6	203855	203860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213892
4002	NC_011026	GCT	2	6	203873	203878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213892
4003	NC_011026	GCG	2	6	203971	203976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011026	T	6	6	203998	204003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011026	ATTT	2	8	204017	204024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011026	CGA	2	6	204076	204081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213893
4007	NC_011026	TCC	2	6	204260	204265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213893
4008	NC_011026	TTC	2	6	204278	204283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213893
4009	NC_011026	ATCG	2	8	204335	204342	25 %	25 %	25 %	25 %	193213893
4010	NC_011026	CAA	2	6	204364	204369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213893
4011	NC_011026	GCG	2	6	204370	204375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213893
4012	NC_011026	TCA	2	6	204424	204429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213893
4013	NC_011026	AGC	2	6	204582	204587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213893
4014	NC_011026	TG	3	6	204675	204680	0 %	50 %	50 %	0 %	193213893
4015	NC_011026	ACCA	2	8	204692	204699	50 %	0 %	0 %	50 %	193213893
4016	NC_011026	CGAT	2	8	204708	204715	25 %	25 %	25 %	25 %	193213893
4017	NC_011026	GC	3	6	204771	204776	0 %	0 %	50 %	50 %	193213893
4018	NC_011026	CGC	2	6	204833	204838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213893
4019	NC_011026	CGC	2	6	204932	204937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213893
4020	NC_011026	T	6	6	205031	205036	0 %	100 %	0 %	0 %	193213893
4021	NC_011026	CCG	2	6	205102	205107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213893
4022	NC_011026	CTTTC	2	10	205118	205127	0 %	60 %	0 %	40 %	193213893
4023	NC_011026	TCT	2	6	205284	205289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213893
4024	NC_011026	TCG	2	6	205304	205309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213893
4025	NC_011026	GTCA	2	8	205397	205404	25 %	25 %	25 %	25 %	193213893
4026	NC_011026	GAT	2	6	205492	205497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213893
4027	NC_011026	CCA	2	6	205549	205554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213893
4028	NC_011026	TTGAAG	2	12	205612	205623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213893
4029	NC_011026	CGT	2	6	205642	205647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213893
4030	NC_011026	AGC	2	6	205648	205653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213893
4031	NC_011026	ACC	2	6	205682	205687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213893
4032	NC_011026	TGG	2	6	205749	205754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213893
4033	NC_011026	AAT	2	6	205766	205771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213893
4034	NC_011026	TAT	2	6	205786	205791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213893
4035	NC_011026	ACC	2	6	205847	205852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213893
4036	NC_011026	T	6	6	205854	205859	0 %	100 %	0 %	0 %	193213893
4037	NC_011026	TCT	2	6	205935	205940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213893
4038	NC_011026	A	7	7	206033	206039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011026	A	8	8	206064	206071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011026	GACC	2	8	206093	206100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_011026	T	7	7	206171	206177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011026	A	8	8	206183	206190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011026	GCAA	2	8	206286	206293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_011026	A	7	7	206292	206298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011026	T	7	7	206310	206316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011026	GC	3	6	206328	206333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_011026	TCA	2	6	206375	206380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213894
4048	NC_011026	CGG	2	6	206387	206392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213894
4049	NC_011026	CGCC	2	8	206411	206418	0 %	0 %	25 %	75 %	193213894
4050	NC_011026	TCT	2	6	206461	206466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213894
4051	NC_011026	GCT	2	6	206521	206526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213894
4052	NC_011026	CTG	2	6	206552	206557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213894
4053	NC_011026	AAAT	2	8	206562	206569	75 %	25 %	0 %	0 %	193213894
4054	NC_011026	TCC	2	6	206592	206597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213894
4055	NC_011026	TGG	2	6	206666	206671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213894
4056	NC_011026	GAA	2	6	206787	206792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213894
4057	NC_011026	GAT	2	6	206850	206855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213894
4058	NC_011026	CTTTTT	2	12	206867	206878	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193213894
4059	NC_011026	GCG	2	6	206891	206896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213894
4060	NC_011026	GTG	2	6	206926	206931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213894
4061	NC_011026	CGG	2	6	206946	206951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213894
4062	NC_011026	CGC	2	6	206985	206990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213894
4063	NC_011026	CGA	2	6	207027	207032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213894
4064	NC_011026	ATA	2	6	207067	207072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213894
4065	NC_011026	GCG	2	6	207230	207235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213894
4066	NC_011026	TCA	2	6	207272	207277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213894
4067	NC_011026	TAAA	2	8	207403	207410	75 %	25 %	0 %	0 %	193213894
4068	NC_011026	ATC	2	6	207427	207432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213894
4069	NC_011026	T	7	7	207502	207508	0 %	100 %	0 %	0 %	193213895
4070	NC_011026	AAG	2	6	207519	207524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213895
4071	NC_011026	AG	3	6	207591	207596	50 %	0 %	50 %	0 %	193213895
4072	NC_011026	TGT	2	6	207599	207604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213895
4073	NC_011026	T	6	6	207645	207650	0 %	100 %	0 %	0 %	193213895
4074	NC_011026	GGC	3	9	207751	207759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213895
4075	NC_011026	GC	3	6	207764	207769	0 %	0 %	50 %	50 %	193213895
4076	NC_011026	TGA	2	6	207943	207948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213896
4077	NC_011026	T	6	6	207992	207997	0 %	100 %	0 %	0 %	193213896
4078	NC_011026	CGTGT	2	10	208019	208028	0 %	40 %	40 %	20 %	193213896
4079	NC_011026	T	6	6	208100	208105	0 %	100 %	0 %	0 %	193213896
4080	NC_011026	CTTT	2	8	208123	208130	0 %	75 %	0 %	25 %	193213896
4081	NC_011026	AAATTG	2	12	208146	208157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	193213896
4082	NC_011026	A	7	7	208204	208210	100 %	0 %	0 %	0 %	193213896
4083	NC_011026	CGA	2	6	208225	208230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213896
4084	NC_011026	ATG	2	6	208239	208244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213896
4085	NC_011026	ATC	2	6	208293	208298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213896
4086	NC_011026	T	6	6	208324	208329	0 %	100 %	0 %	0 %	193213897
4087	NC_011026	CGG	2	6	208330	208335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213897
4088	NC_011026	TCTT	2	8	208343	208350	0 %	75 %	0 %	25 %	193213897
4089	NC_011026	GAT	2	6	208405	208410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213897
4090	NC_011026	TCA	2	6	208412	208417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213897
4091	NC_011026	AGC	2	6	208432	208437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213897
4092	NC_011026	GC	3	6	208496	208501	0 %	0 %	50 %	50 %	193213897
4093	NC_011026	TCT	2	6	208502	208507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213897
4094	NC_011026	CG	3	6	208557	208562	0 %	0 %	50 %	50 %	193213897
4095	NC_011026	GAT	2	6	208583	208588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213897
4096	NC_011026	TCA	2	6	208629	208634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213897
4097	NC_011026	GCC	2	6	208645	208650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213897
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4099	NC_011026	CCG	2	6	208736	208741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213897
4100	NC_011026	GC	3	6	208942	208947	0 %	0 %	50 %	50 %	193213897
4101	NC_011026	ATG	2	6	208997	209002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213897
4102	NC_011026	CGT	2	6	209010	209015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213897
4103	NC_011026	AAT	2	6	209038	209043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213897
4104	NC_011026	GTC	2	6	209077	209082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213897
4105	NC_011026	CGA	2	6	209088	209093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213897
4106	NC_011026	TTC	2	6	209101	209106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213897
4107	NC_011026	ATT	2	6	209110	209115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213897
4108	NC_011026	CAA	2	6	209146	209151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213897
4109	NC_011026	CAA	2	6	209175	209180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213897
4110	NC_011026	CGC	2	6	209217	209222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213897
4111	NC_011026	TCT	2	6	209228	209233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213897
4112	NC_011026	CAT	2	6	209308	209313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213897
4113	NC_011026	GCC	2	6	209347	209352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213897
4114	NC_011026	GCC	2	6	209467	209472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213897
4115	NC_011026	AAT	2	6	209488	209493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213897
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4117	NC_011026	GA	3	6	209586	209591	50 %	0 %	50 %	0 %	193213897
4118	NC_011026	ATCG	2	8	209611	209618	25 %	25 %	25 %	25 %	193213897
4119	NC_011026	GA	3	6	209645	209650	50 %	0 %	50 %	0 %	193213897
4120	NC_011026	GGT	2	6	209677	209682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213897
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4122	NC_011026	TGC	2	6	209774	209779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213897
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4124	NC_011026	TCTT	2	8	209821	209828	0 %	75 %	0 %	25 %	193213897
4125	NC_011026	AGG	2	6	209877	209882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011026	TCA	2	6	209883	209888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4128	NC_011026	ACT	2	6	209901	209906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4130	NC_011026	TAC	2	6	209914	209919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_011026	G	6	6	209960	209965	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011026	ACG	2	6	209980	209985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4135	NC_011026	T	6	6	210034	210039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_011026	T	6	6	214772	214777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_011026	T	6	6	214783	214788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_011026	CTTG	2	8	214800	214807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4242	NC_011026	A	9	9	214808	214816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_011026	TAT	2	6	214836	214841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213902
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4245	NC_011026	CTTGG	2	10	214914	214923	0 %	40 %	40 %	20 %	193213902
4246	NC_011026	CCG	2	6	214930	214935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213902
4247	NC_011026	ATG	2	6	214968	214973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213902
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4249	NC_011026	TCA	2	6	215011	215016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213902
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4372	NC_011026	AAT	2	6	221410	221415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_011026	AAAG	2	8	221526	221533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4375	NC_011026	AGC	2	6	221584	221589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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