MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011026	ACT	2	6	178682	178687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213870
3502	NC_011026	CTG	2	6	178703	178708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213870
3503	NC_011026	ATT	2	6	178849	178854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213870
3504	NC_011026	CTT	2	6	178891	178896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213870
3505	NC_011026	AGC	2	6	178921	178926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213870
3506	NC_011026	TGGT	2	8	178961	178968	0 %	50 %	50 %	0 %	193213870
3507	NC_011026	ATT	2	6	178975	178980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213870
3508	NC_011026	CGGCAT	2	12	179022	179033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193213870
3509	NC_011026	A	6	6	179053	179058	100 %	0 %	0 %	0 %	193213870
3510	NC_011026	TGA	2	6	179132	179137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213870
3511	NC_011026	GTCGAC	2	12	179266	179277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193213870
3512	NC_011026	GCTT	2	8	179375	179382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_011026	T	6	6	179396	179401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011026	T	7	7	179430	179436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011026	A	7	7	179498	179504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011026	TTA	2	6	179566	179571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011026	TG	3	6	179578	179583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_011026	CCT	2	6	179661	179666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_011026	TAA	2	6	179697	179702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011026	CAG	2	6	179709	179714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_011026	TTAG	2	8	179761	179768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_011026	TGCT	2	8	179794	179801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_011026	CAAA	2	8	179828	179835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_011026	ACTT	2	8	179866	179873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_011026	ATTT	2	8	179882	179889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011026	ATT	2	6	180025	180030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213871
3527	NC_011026	AAC	2	6	180033	180038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213871
3528	NC_011026	TAT	2	6	180064	180069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213871
3529	NC_011026	GATG	2	8	180112	180119	25 %	25 %	50 %	0 %	193213871
3530	NC_011026	GAA	2	6	180171	180176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213871
3531	NC_011026	GC	3	6	180194	180199	0 %	0 %	50 %	50 %	193213871
3532	NC_011026	TAAA	2	8	180227	180234	75 %	25 %	0 %	0 %	193213871
3533	NC_011026	A	8	8	180284	180291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_011026	AG	3	6	180293	180298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_011026	T	6	6	180302	180307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011026	GGT	2	6	180373	180378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_011026	TGT	3	9	180437	180445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213872
3538	NC_011026	CCAACC	2	12	180459	180470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213872
3539	NC_011026	CGT	2	6	180640	180645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3540	NC_011026	CAATGC	2	12	180646	180657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193213872
3541	NC_011026	ATC	2	6	180663	180668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213872
3542	NC_011026	TGA	2	6	180685	180690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213872
3543	NC_011026	TTCCA	2	10	180698	180707	20 %	40 %	0 %	40 %	193213872
3544	NC_011026	ATC	2	6	180726	180731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213872
3545	NC_011026	AGC	2	6	180828	180833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3546	NC_011026	T	6	6	180840	180845	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3547	NC_011026	TTCAA	2	10	181047	181056	40 %	40 %	0 %	20 %	193213872
3548	NC_011026	TTGT	2	8	181196	181203	0 %	75 %	25 %	0 %	193213872
3549	NC_011026	TTA	2	6	181339	181344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213872
3550	NC_011026	GCGAC	2	10	181360	181369	20 %	0 %	40 %	40 %	193213872
3551	NC_011026	T	7	7	181384	181390	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3552	NC_011026	CGCT	2	8	181406	181413	0 %	25 %	25 %	50 %	193213872
3553	NC_011026	GCAG	2	8	181425	181432	25 %	0 %	50 %	25 %	193213872
3554	NC_011026	TGC	2	6	181465	181470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3555	NC_011026	T	6	6	181472	181477	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3556	NC_011026	TCAAA	2	10	181543	181552	60 %	20 %	0 %	20 %	193213872
3557	NC_011026	CCG	2	6	181675	181680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213872
3558	NC_011026	TTC	2	6	181699	181704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213872
3559	NC_011026	TGAA	2	8	181735	181742	50 %	25 %	25 %	0 %	193213872
3560	NC_011026	T	8	8	181764	181771	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3561	NC_011026	ATC	2	6	181848	181853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213872
3562	NC_011026	CTG	2	6	181902	181907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3563	NC_011026	GTT	2	6	181935	181940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213872
3564	NC_011026	TGA	2	6	181951	181956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213872
3565	NC_011026	A	6	6	181974	181979	100 %	0 %	0 %	0 %	193213872
3566	NC_011026	CGAA	2	8	182015	182022	50 %	0 %	25 %	25 %	193213872
3567	NC_011026	AATG	2	8	182044	182051	50 %	25 %	25 %	0 %	193213872
3568	NC_011026	CAT	2	6	182087	182092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213872
3569	NC_011026	CGA	2	6	182116	182121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3570	NC_011026	GCC	2	6	182127	182132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213872
3571	NC_011026	ATC	2	6	182157	182162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213872
3572	NC_011026	GCGCAG	2	12	182179	182190	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193213872
3573	NC_011026	A	7	7	182220	182226	100 %	0 %	0 %	0 %	193213872
3574	NC_011026	CGA	2	6	182230	182235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3575	NC_011026	CT	3	6	182262	182267	0 %	50 %	0 %	50 %	193213872
3576	NC_011026	TCG	2	6	182283	182288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3577	NC_011026	GGCC	2	8	182314	182321	0 %	0 %	50 %	50 %	193213872
3578	NC_011026	T	8	8	182338	182345	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3579	NC_011026	CTGC	2	8	182359	182366	0 %	25 %	25 %	50 %	193213872
3580	NC_011026	CGC	2	6	182377	182382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213872
3581	NC_011026	T	6	6	182441	182446	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3582	NC_011026	CATT	2	8	182520	182527	25 %	50 %	0 %	25 %	193213872
3583	NC_011026	A	7	7	182555	182561	100 %	0 %	0 %	0 %	193213872
3584	NC_011026	TCT	2	6	182592	182597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213872
3585	NC_011026	TAT	2	6	182650	182655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213872
3586	NC_011026	CGG	2	6	182806	182811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213872
3587	NC_011026	CCT	2	6	182869	182874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213872
3588	NC_011026	AAAGT	2	10	183016	183025	60 %	20 %	20 %	0 %	193213872
3589	NC_011026	GCA	2	6	183088	183093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213872
3590	NC_011026	T	6	6	183094	183099	0 %	100 %	0 %	0 %	193213872
3591	NC_011026	A	7	7	183124	183130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_011026	A	6	6	183154	183159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011026	CCG	2	6	183217	183222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213873
3594	NC_011026	TAA	2	6	183378	183383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213873
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3596	NC_011026	TGT	2	6	183506	183511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213873
3597	NC_011026	ACC	2	6	183537	183542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213873
3598	NC_011026	CG	3	6	183590	183595	0 %	0 %	50 %	50 %	193213873
3599	NC_011026	CAG	2	6	183636	183641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213873
3600	NC_011026	A	6	6	183778	183783	100 %	0 %	0 %	0 %	193213873
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3602	NC_011026	CGAA	2	8	183953	183960	50 %	0 %	25 %	25 %	193213873
3603	NC_011026	GCT	2	6	183962	183967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213873
3604	NC_011026	A	7	7	184024	184030	100 %	0 %	0 %	0 %	193213873
3605	NC_011026	TTTG	2	8	184079	184086	0 %	75 %	25 %	0 %	193213873
3606	NC_011026	TTTG	2	8	184123	184130	0 %	75 %	25 %	0 %	193213873
3607	NC_011026	CCG	2	6	184159	184164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213873
3608	NC_011026	T	6	6	184233	184238	0 %	100 %	0 %	0 %	193213873
3609	NC_011026	ATC	2	6	184252	184257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213873
3610	NC_011026	A	6	6	184338	184343	100 %	0 %	0 %	0 %	193213873
3611	NC_011026	A	7	7	184376	184382	100 %	0 %	0 %	0 %	193213873
3612	NC_011026	GC	3	6	184390	184395	0 %	0 %	50 %	50 %	193213873
3613	NC_011026	T	9	9	184400	184408	0 %	100 %	0 %	0 %	193213873
3614	NC_011026	T	6	6	184444	184449	0 %	100 %	0 %	0 %	193213874
3615	NC_011026	CGT	2	6	184600	184605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213874
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3620	NC_011026	CGGT	2	8	184860	184867	0 %	25 %	50 %	25 %	193213874
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3624	NC_011026	CAG	2	6	185066	185071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213874
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