MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011026	TTGC	2	8	152433	152440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_011026	TTTGT	2	10	152513	152522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011026	TGCC	2	8	152556	152563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_011026	A	6	6	152573	152578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011026	CCG	3	9	152606	152614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_011026	A	9	9	152620	152628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011026	CTT	2	6	152642	152647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011026	GAA	2	6	152652	152657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011026	AAG	2	6	152690	152695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011026	AC	3	6	152896	152901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_011026	A	6	6	152902	152907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011026	T	6	6	152965	152970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011026	CAAAA	2	10	152977	152986	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_011026	CTT	2	6	153044	153049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213849
3015	NC_011026	T	6	6	153048	153053	0 %	100 %	0 %	0 %	193213849
3016	NC_011026	CGC	2	6	153054	153059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213849
3017	NC_011026	CGA	2	6	153107	153112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3018	NC_011026	GCT	2	6	153211	153216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3019	NC_011026	CCG	2	6	153280	153285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213849
3020	NC_011026	GCA	2	6	153294	153299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3021	NC_011026	CCA	2	6	153329	153334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213849
3022	NC_011026	CG	3	6	153362	153367	0 %	0 %	50 %	50 %	193213849
3023	NC_011026	CGT	2	6	153371	153376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3024	NC_011026	GTT	2	6	153418	153423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213849
3025	NC_011026	AGC	2	6	153478	153483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3026	NC_011026	GTG	2	6	153484	153489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213849
3027	NC_011026	GCC	2	6	153510	153515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213849
3028	NC_011026	GGT	2	6	153561	153566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213849
3029	NC_011026	GAT	2	6	153567	153572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213849
3030	NC_011026	CTT	2	6	153635	153640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213849
3031	NC_011026	CGGCG	2	10	153644	153653	0 %	0 %	60 %	40 %	193213849
3032	NC_011026	CGG	2	6	153665	153670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213849
3033	NC_011026	CGG	2	6	153707	153712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213849
3034	NC_011026	CGT	2	6	153738	153743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3035	NC_011026	CGG	2	6	153923	153928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213849
3036	NC_011026	GCG	2	6	153954	153959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213849
3037	NC_011026	CA	3	6	154008	154013	50 %	0 %	0 %	50 %	193213849
3038	NC_011026	GTG	2	6	154024	154029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213849
3039	NC_011026	TCC	2	6	154045	154050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213849
3040	NC_011026	GTT	2	6	154097	154102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213849
3041	NC_011026	TGAT	2	8	154111	154118	25 %	50 %	25 %	0 %	193213849
3042	NC_011026	TTG	2	6	154129	154134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213849
3043	NC_011026	GCG	2	6	154157	154162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213849
3044	NC_011026	TGT	2	6	154169	154174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213849
3045	NC_011026	ATG	2	6	154207	154212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213849
3046	NC_011026	GCCAA	2	10	154238	154247	40 %	0 %	20 %	40 %	193213849
3047	NC_011026	CG	3	6	154304	154309	0 %	0 %	50 %	50 %	193213849
3048	NC_011026	GCGA	2	8	154317	154324	25 %	0 %	50 %	25 %	193213849
3049	NC_011026	ATC	2	6	154345	154350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213849
3050	NC_011026	TGCT	2	8	154360	154367	0 %	50 %	25 %	25 %	193213849
3051	NC_011026	ACG	2	6	154390	154395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3052	NC_011026	GCCA	2	8	154408	154415	25 %	0 %	25 %	50 %	193213849
3053	NC_011026	GCCC	2	8	154442	154449	0 %	0 %	25 %	75 %	193213849
3054	NC_011026	GCCGTG	2	12	154500	154511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	193213849
3055	NC_011026	ACG	2	6	154590	154595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3056	NC_011026	CGC	2	6	154598	154603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213849
3057	NC_011026	CCG	2	6	154613	154618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213849
3058	NC_011026	AGC	2	6	154621	154626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3059	NC_011026	TTA	2	6	154636	154641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213849
3060	NC_011026	AAG	2	6	154681	154686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213849
3061	NC_011026	GTC	2	6	154771	154776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213849
3062	NC_011026	GAA	2	6	154839	154844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213849
3063	NC_011026	ATCA	2	8	154908	154915	50 %	25 %	0 %	25 %	193213849
3064	NC_011026	CTGC	2	8	154930	154937	0 %	25 %	25 %	50 %	193213849
3065	NC_011026	T	6	6	154967	154972	0 %	100 %	0 %	0 %	193213849
3066	NC_011026	CA	3	6	155020	155025	50 %	0 %	0 %	50 %	193213849
3067	NC_011026	AAAC	2	8	155036	155043	75 %	0 %	0 %	25 %	193213849
3068	NC_011026	TTA	2	6	155081	155086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_011026	TA	3	6	155085	155090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011026	CAA	2	6	155092	155097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_011026	GCT	2	6	155117	155122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011026	TTG	2	6	155127	155132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_011026	TTG	2	6	155150	155155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011026	TTC	2	6	155167	155172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213850
3075	NC_011026	ATG	2	6	155264	155269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213850
3076	NC_011026	CAGC	2	8	155383	155390	25 %	0 %	25 %	50 %	193213850
3077	NC_011026	TGC	2	6	155472	155477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213850
3078	NC_011026	CGAC	2	8	155486	155493	25 %	0 %	25 %	50 %	193213850
3079	NC_011026	CCA	2	6	155496	155501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213850
3080	NC_011026	TCAA	2	8	155543	155550	50 %	25 %	0 %	25 %	193213850
3081	NC_011026	CGG	2	6	155631	155636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213850
3082	NC_011026	GAAC	2	8	155638	155645	50 %	0 %	25 %	25 %	193213850
3083	NC_011026	GCT	2	6	155666	155671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213850
3084	NC_011026	CATT	2	8	155691	155698	25 %	50 %	0 %	25 %	193213850
3085	NC_011026	GCC	2	6	155701	155706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213850
3086	NC_011026	GCTG	2	8	155712	155719	0 %	25 %	50 %	25 %	193213850
3087	NC_011026	GAAA	2	8	155722	155729	75 %	0 %	25 %	0 %	193213850
3088	NC_011026	GCA	2	6	155755	155760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213850
3089	NC_011026	CGA	2	6	155766	155771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213850
3090	NC_011026	CGGCG	2	10	155797	155806	0 %	0 %	60 %	40 %	193213850
3091	NC_011026	CCG	2	6	155865	155870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213850
3092	NC_011026	CGG	2	6	155937	155942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213850
3093	NC_011026	GCC	2	6	155998	156003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213850
3094	NC_011026	TAA	2	6	156110	156115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011026	T	6	6	156116	156121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011026	ACACG	2	10	156192	156201	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3097	NC_011026	ACACG	2	10	156223	156232	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3098	NC_011026	CTCA	2	8	156327	156334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_011026	GCCTGC	2	12	156462	156473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	193213851
3100	NC_011026	AAATC	2	10	156764	156773	60 %	20 %	0 %	20 %	193213851
3101	NC_011026	TCG	2	6	156904	156909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213851
3102	NC_011026	CAC	3	9	156924	156932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213851
3103	NC_011026	CTT	2	6	156947	156952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213851
3104	NC_011026	AAAGC	2	10	156959	156968	60 %	0 %	20 %	20 %	193213851
3105	NC_011026	GTC	2	6	156984	156989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213851
3106	NC_011026	CCA	2	6	157061	157066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213851
3107	NC_011026	TGTTTT	2	12	157118	157129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	193213851
3108	NC_011026	GTT	2	6	157130	157135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213851
3109	NC_011026	TTG	2	6	157136	157141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213851
3110	NC_011026	TGTT	2	8	157168	157175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011026	GCT	2	6	157193	157198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_011026	T	6	6	157198	157203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011026	CTTTTT	2	12	157217	157228	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3114	NC_011026	CCG	2	6	157300	157305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_011026	T	6	6	157332	157337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011026	ATTTG	2	10	157425	157434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011026	T	7	7	157499	157505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011026	CCAT	2	8	157540	157547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_011026	ATG	2	6	157613	157618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213852
3120	NC_011026	CGT	2	6	157638	157643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213852
3121	NC_011026	GA	3	6	157674	157679	50 %	0 %	50 %	0 %	193213852
3122	NC_011026	GCA	2	6	157690	157695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213852
3123	NC_011026	TCG	2	6	157769	157774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213852
3124	NC_011026	GCC	2	6	157780	157785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213852
3125	NC_011026	GCC	6	18	157795	157812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213852
3126	NC_011026	GCA	2	6	157813	157818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213852
3127	NC_011026	CTTG	2	8	157827	157834	0 %	50 %	25 %	25 %	193213852
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3231	NC_011026	TGTC	2	8	163859	163866	0 %	50 %	25 %	25 %	193213859
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3236	NC_011026	TAA	2	6	164164	164169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213860
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3246	NC_011026	TGT	2	6	164553	164558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_011026	TGT	3	9	164561	164569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_011026	TTA	2	6	164620	164625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_011026	A	6	6	164644	164649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_011026	T	6	6	164767	164772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_011026	GTT	2	6	178636	178641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213870
3500	NC_011026	ACG	2	6	178664	178669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213870

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