MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011026	CGA	2	6	101140	101145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213806
2002	NC_011026	CG	3	6	101146	101151	0 %	0 %	50 %	50 %	193213806
2003	NC_011026	CAT	2	6	101299	101304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213806
2004	NC_011026	T	7	7	101317	101323	0 %	100 %	0 %	0 %	193213806
2005	NC_011026	CG	3	6	101346	101351	0 %	0 %	50 %	50 %	193213806
2006	NC_011026	TTC	2	6	101527	101532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213806
2007	NC_011026	CAAAA	2	10	101550	101559	80 %	0 %	0 %	20 %	193213806
2008	NC_011026	A	7	7	101565	101571	100 %	0 %	0 %	0 %	193213806
2009	NC_011026	T	6	6	101593	101598	0 %	100 %	0 %	0 %	193213806
2010	NC_011026	TCC	2	6	101668	101673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213806
2011	NC_011026	A	6	6	101772	101777	100 %	0 %	0 %	0 %	193213806
2012	NC_011026	A	9	9	101869	101877	100 %	0 %	0 %	0 %	193213806
2013	NC_011026	AATTGC	2	12	101926	101937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193213806
2014	NC_011026	ATT	2	6	101975	101980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213807
2015	NC_011026	AGT	2	6	101999	102004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213807
2016	NC_011026	GCA	2	6	102079	102084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213807
2017	NC_011026	GCA	2	6	102121	102126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213807
2018	NC_011026	TCT	2	6	102203	102208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213807
2019	NC_011026	GAA	2	6	102247	102252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213807
2020	NC_011026	A	6	6	102251	102256	100 %	0 %	0 %	0 %	193213807
2021	NC_011026	TCA	3	9	102385	102393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213807
2022	NC_011026	CG	3	6	102441	102446	0 %	0 %	50 %	50 %	193213807
2023	NC_011026	AAG	2	6	102489	102494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213807
2024	NC_011026	T	6	6	102548	102553	0 %	100 %	0 %	0 %	193213807
2025	NC_011026	GAA	2	6	102575	102580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213807
2026	NC_011026	CGG	2	6	102625	102630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213807
2027	NC_011026	T	6	6	102713	102718	0 %	100 %	0 %	0 %	193213807
2028	NC_011026	CCCA	2	8	102737	102744	25 %	0 %	0 %	75 %	193213807
2029	NC_011026	TGA	2	6	102747	102752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213807
2030	NC_011026	A	6	6	102781	102786	100 %	0 %	0 %	0 %	193213807
2031	NC_011026	CAA	2	6	102845	102850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213807
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2033	NC_011026	T	6	6	102875	102880	0 %	100 %	0 %	0 %	193213807
2034	NC_011026	AAGC	2	8	102911	102918	50 %	0 %	25 %	25 %	193213807
2035	NC_011026	ATC	2	6	102932	102937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213807
2036	NC_011026	T	6	6	102960	102965	0 %	100 %	0 %	0 %	193213807
2037	NC_011026	CGA	2	6	103114	103119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213807
2038	NC_011026	CAA	2	6	103197	103202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_011026	A	6	6	103201	103206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_011026	TGG	2	6	103215	103220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_011026	A	6	6	103251	103256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_011026	CCG	2	6	103375	103380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213808
2043	NC_011026	ATG	2	6	103381	103386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213808
2044	NC_011026	CAT	2	6	103401	103406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213808
2045	NC_011026	GTG	2	6	103474	103479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213808
2046	NC_011026	CCA	3	9	103484	103492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213808
2047	NC_011026	TGTT	2	8	103495	103502	0 %	75 %	25 %	0 %	193213808
2048	NC_011026	AGC	2	6	103516	103521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213808
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2050	NC_011026	AGC	2	6	103567	103572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213808
2051	NC_011026	TTC	2	6	103608	103613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213808
2052	NC_011026	CGC	2	6	103631	103636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213808
2053	NC_011026	CATC	2	8	103667	103674	25 %	25 %	0 %	50 %	193213808
2054	NC_011026	ACAA	2	8	103675	103682	75 %	0 %	0 %	25 %	193213808
2055	NC_011026	GCC	2	6	103686	103691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213808
2056	NC_011026	ATA	2	6	103693	103698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213808
2057	NC_011026	CGATAC	2	12	103784	103795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193213808
2058	NC_011026	CTG	2	6	103832	103837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213808
2059	NC_011026	A	9	9	104062	104070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_011026	ACA	2	6	104155	104160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_011026	AC	3	6	104202	104207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2062	NC_011026	CGC	2	6	104229	104234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213809
2063	NC_011026	GCC	2	6	104311	104316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213809
2064	NC_011026	CGA	3	9	104331	104339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213809
2065	NC_011026	GCC	2	6	104374	104379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213809
2066	NC_011026	TGC	2	6	104395	104400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213809
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2069	NC_011026	GCG	2	6	104466	104471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213809
2070	NC_011026	T	6	6	104482	104487	0 %	100 %	0 %	0 %	193213809
2071	NC_011026	GCCC	2	8	104506	104513	0 %	0 %	25 %	75 %	193213809
2072	NC_011026	TCC	2	6	104594	104599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213809
2073	NC_011026	TCGG	2	8	104653	104660	0 %	25 %	50 %	25 %	193213809
2074	NC_011026	CGAC	2	8	104681	104688	25 %	0 %	25 %	50 %	193213809
2075	NC_011026	CGAG	2	8	104725	104732	25 %	0 %	50 %	25 %	193213809
2076	NC_011026	T	6	6	104808	104813	0 %	100 %	0 %	0 %	193213809
2077	NC_011026	ATAAA	2	10	104816	104825	80 %	20 %	0 %	0 %	193213809
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2080	NC_011026	AAT	2	6	104970	104975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213809
2081	NC_011026	GCG	2	6	105003	105008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213809
2082	NC_011026	ACG	2	6	105015	105020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213809
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2085	NC_011026	CGA	2	6	105081	105086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213809
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2091	NC_011026	TCGC	2	8	105520	105527	0 %	25 %	25 %	50 %	193213809
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2095	NC_011026	CG	3	6	105600	105605	0 %	0 %	50 %	50 %	193213809
2096	NC_011026	TGT	2	6	105611	105616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213809
2097	NC_011026	CGG	2	6	105627	105632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213809
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2106	NC_011026	CGC	2	6	106080	106085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213809
2107	NC_011026	CAG	2	6	106156	106161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213809
2108	NC_011026	TAA	2	6	106205	106210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213809
2109	NC_011026	GCTTCA	2	12	106256	106267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193213809
2110	NC_011026	GCG	2	6	106283	106288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_011026	T	6	6	106297	106302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_011026	TTG	2	6	106362	106367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_011026	AACGC	2	10	106415	106424	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2114	NC_011026	GCT	2	6	106461	106466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213810
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2116	NC_011026	GCT	2	6	106537	106542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213810
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2118	NC_011026	T	6	6	106585	106590	0 %	100 %	0 %	0 %	193213810
2119	NC_011026	T	6	6	106631	106636	0 %	100 %	0 %	0 %	193213810
2120	NC_011026	TTTC	2	8	106664	106671	0 %	75 %	0 %	25 %	193213810
2121	NC_011026	ATC	2	6	106801	106806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213810
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2124	NC_011026	AAAT	2	8	107030	107037	75 %	25 %	0 %	0 %	193213810
2125	NC_011026	CGA	2	6	107127	107132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213810
2126	NC_011026	TCA	2	6	107141	107146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213810
2127	NC_011026	ATT	2	6	107253	107258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213810
2128	NC_011026	GGT	2	6	107316	107321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213810
2129	NC_011026	TGCTTT	2	12	107342	107353	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	193213810
2130	NC_011026	CGC	2	6	107355	107360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213810
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2133	NC_011026	CGG	2	6	107537	107542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213810
2134	NC_011026	TTTAC	2	10	107556	107565	20 %	60 %	0 %	20 %	193213810
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2137	NC_011026	CGC	2	6	107835	107840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213810
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2142	NC_011026	AATC	2	8	108149	108156	50 %	25 %	0 %	25 %	193213810
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2145	NC_011026	ATC	2	6	108265	108270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213810
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2147	NC_011026	AAGAA	2	10	108300	108309	80 %	0 %	20 %	0 %	193213810
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2149	NC_011026	TGA	2	6	108368	108373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213810
2150	NC_011026	GCA	2	6	108381	108386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213810
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2152	NC_011026	GTT	2	6	108529	108534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213810
2153	NC_011026	T	6	6	108533	108538	0 %	100 %	0 %	0 %	193213810
2154	NC_011026	GC	3	6	108601	108606	0 %	0 %	50 %	50 %	193213810
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2157	NC_011026	GCC	2	6	108694	108699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213811
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2164	NC_011026	A	9	9	108814	108822	100 %	0 %	0 %	0 %	193213811
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2170	NC_011026	A	6	6	109030	109035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2242	NC_011026	GAC	2	6	112536	112541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213813
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2244	NC_011026	CGG	2	6	112661	112666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213813
2245	NC_011026	CGT	2	6	112724	112729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213813
2246	NC_011026	A	6	6	112731	112736	100 %	0 %	0 %	0 %	193213813
2247	NC_011026	ATTTT	2	10	112790	112799	20 %	80 %	0 %	0 %	193213813
2248	NC_011026	CAT	2	6	112812	112817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213813
2249	NC_011026	T	6	6	112830	112835	0 %	100 %	0 %	0 %	193213813
2250	NC_011026	T	6	6	112864	112869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_011026	A	7	7	112960	112966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_011026	TGG	2	6	113054	113059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213814
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2254	NC_011026	GATGT	2	10	113176	113185	20 %	40 %	40 %	0 %	193213814
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2257	NC_011026	A	6	6	113353	113358	100 %	0 %	0 %	0 %	193213814
2258	NC_011026	TGC	2	6	113402	113407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213814
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2260	NC_011026	TTA	2	6	113485	113490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2261	NC_011026	ATA	2	6	113524	113529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2262	NC_011026	T	6	6	113568	113573	0 %	100 %	0 %	0 %	193213815
2263	NC_011026	AAGCAG	2	12	113611	113622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	193213815
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2268	NC_011026	ATTT	2	8	113839	113846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2269	NC_011026	A	6	6	113876	113881	100 %	0 %	0 %	0 %	193213816
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2279	NC_011026	T	9	9	114191	114199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2280	NC_011026	CCTT	2	8	114207	114214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2281	NC_011026	T	7	7	114213	114219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_011026	TGC	2	6	114224	114229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2284	NC_011026	T	6	6	114277	114282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_011026	ATGA	2	8	114295	114302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2286	NC_011026	CTTT	2	8	114342	114349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2287	NC_011026	ATGTT	2	10	114350	114359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2288	NC_011026	T	7	7	114358	114364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2289	NC_011026	T	6	6	114398	114403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2362	NC_011026	CG	5	10	117770	117779	0 %	0 %	50 %	50 %	193213819
2363	NC_011026	CA	3	6	118039	118044	50 %	0 %	0 %	50 %	193213819
2364	NC_011026	GCA	2	6	118129	118134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213819
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2368	NC_011026	GCTT	2	8	118273	118280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2369	NC_011026	TAT	2	6	118347	118352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_011026	TCAA	2	8	118447	118454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2371	NC_011026	T	6	6	118463	118468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2372	NC_011026	A	8	8	118494	118501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_011026	T	7	7	118523	118529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_011026	CAACC	2	10	118530	118539	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2375	NC_011026	T	7	7	118567	118573	0 %	100 %	0 %	0 %	193213820
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2383	NC_011026	ACC	2	6	118830	118835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213820
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2399	NC_011026	T	6	6	119847	119852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_011026	ATTT	2	8	119868	119875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2499	NC_011026	T	6	6	124560	124565	0 %	100 %	0 %	0 %	193213825
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