MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011026	GTA	2	6	49616	49621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213758
1002	NC_011026	A	6	6	49631	49636	100 %	0 %	0 %	0 %	193213758
1003	NC_011026	CCG	2	6	49813	49818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213758
1004	NC_011026	CAG	2	6	49855	49860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213758
1005	NC_011026	CAAC	2	8	49868	49875	50 %	0 %	0 %	50 %	193213758
1006	NC_011026	T	6	6	49889	49894	0 %	100 %	0 %	0 %	193213758
1007	NC_011026	GTA	2	6	49949	49954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213758
1008	NC_011026	GT	3	6	49967	49972	0 %	50 %	50 %	0 %	193213758
1009	NC_011026	GCAA	2	8	50001	50008	50 %	0 %	25 %	25 %	193213758
1010	NC_011026	CTT	2	6	50038	50043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213758
1011	NC_011026	CAG	2	6	50066	50071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213758
1012	NC_011026	ATC	2	6	50082	50087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213758
1013	NC_011026	CCA	2	6	50095	50100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213758
1014	NC_011026	ACC	2	6	50130	50135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213758
1015	NC_011026	CCA	2	6	50154	50159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213758
1016	NC_011026	ATA	2	6	50237	50242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213758
1017	NC_011026	GCAA	2	8	50343	50350	50 %	0 %	25 %	25 %	193213758
1018	NC_011026	CTT	2	6	50407	50412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213758
1019	NC_011026	T	6	6	50411	50416	0 %	100 %	0 %	0 %	193213758
1020	NC_011026	TCC	2	6	50421	50426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213758
1021	NC_011026	AAGA	2	8	50468	50475	75 %	0 %	25 %	0 %	193213758
1022	NC_011026	CCG	2	6	50481	50486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213758
1023	NC_011026	A	7	7	50500	50506	100 %	0 %	0 %	0 %	193213758
1024	NC_011026	ATG	2	6	50569	50574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213758
1025	NC_011026	T	7	7	50602	50608	0 %	100 %	0 %	0 %	193213758
1026	NC_011026	T	6	6	50636	50641	0 %	100 %	0 %	0 %	193213758
1027	NC_011026	CGGTT	2	10	50686	50695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_011026	T	6	6	50694	50699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011026	AGA	2	6	50807	50812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011026	GAG	2	6	50819	50824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011026	CGC	2	6	50840	50845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_011026	CAA	2	6	50888	50893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011026	GCC	2	6	51003	51008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213759
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1035	NC_011026	GC	3	6	51090	51095	0 %	0 %	50 %	50 %	193213759
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1038	NC_011026	GCTTCG	2	12	51414	51425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213759
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1040	NC_011026	T	6	6	51473	51478	0 %	100 %	0 %	0 %	193213759
1041	NC_011026	CCA	2	6	51508	51513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213759
1042	NC_011026	AGC	2	6	51522	51527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213759
1043	NC_011026	GAAACC	2	12	51552	51563	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193213759
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1048	NC_011026	A	6	6	51870	51875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_011026	TGC	2	6	51970	51975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213760
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1054	NC_011026	TTC	2	6	52199	52204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213760
1055	NC_011026	T	6	6	52307	52312	0 %	100 %	0 %	0 %	193213760
1056	NC_011026	T	8	8	52466	52473	0 %	100 %	0 %	0 %	193213760
1057	NC_011026	T	6	6	52483	52488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011026	ATA	2	6	52547	52552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011026	AAAAC	2	10	52572	52581	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_011026	T	6	6	52589	52594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011026	GAT	2	6	52600	52605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011026	A	6	6	52611	52616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011026	GCG	2	6	52631	52636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011026	TGC	2	6	52643	52648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011026	TTG	2	6	52669	52674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011026	T	8	8	52722	52729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011026	T	6	6	52761	52766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011026	TGAAAC	2	12	52807	52818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1069	NC_011026	A	6	6	52824	52829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011026	GA	3	6	52877	52882	50 %	0 %	50 %	0 %	193213761
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1072	NC_011026	ATCGA	2	10	52957	52966	40 %	20 %	20 %	20 %	193213761
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1078	NC_011026	CGC	2	6	53231	53236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213761
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1080	NC_011026	TTCG	2	8	53328	53335	0 %	50 %	25 %	25 %	193213761
1081	NC_011026	CGAT	2	8	53344	53351	25 %	25 %	25 %	25 %	193213761
1082	NC_011026	GC	3	6	53363	53368	0 %	0 %	50 %	50 %	193213761
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1086	NC_011026	TTGA	2	8	53475	53482	25 %	50 %	25 %	0 %	193213761
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1090	NC_011026	GTC	2	6	53841	53846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213761
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1094	NC_011026	A	6	6	54118	54123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011026	AAAG	2	8	54171	54178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_011026	GA	3	6	54284	54289	50 %	0 %	50 %	0 %	193213762
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1101	NC_011026	TGC	2	6	54487	54492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213762
1102	NC_011026	ATTGA	2	10	54543	54552	40 %	40 %	20 %	0 %	193213762
1103	NC_011026	ATCG	2	8	54581	54588	25 %	25 %	25 %	25 %	193213762
1104	NC_011026	TGT	2	6	54613	54618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213762
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1106	NC_011026	GT	3	6	54709	54714	0 %	50 %	50 %	0 %	193213762
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1110	NC_011026	TTG	2	6	54975	54980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213762
1111	NC_011026	GCTT	2	8	55076	55083	0 %	50 %	25 %	25 %	193213762
1112	NC_011026	GGC	2	6	55158	55163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213762
1113	NC_011026	CCA	2	6	55224	55229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213762
1114	NC_011026	AAG	2	6	55269	55274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213762
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1116	NC_011026	AAGT	2	8	55547	55554	50 %	25 %	25 %	0 %	193213762
1117	NC_011026	CTT	2	6	55570	55575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213762
1118	NC_011026	GCT	2	6	55627	55632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213762
1119	NC_011026	AGGT	2	8	55740	55747	25 %	25 %	50 %	0 %	193213762
1120	NC_011026	T	6	6	55754	55759	0 %	100 %	0 %	0 %	193213762
1121	NC_011026	CAAGC	2	10	55778	55787	40 %	0 %	20 %	40 %	193213762
1122	NC_011026	T	6	6	55837	55842	0 %	100 %	0 %	0 %	193213762
1123	NC_011026	TCA	2	6	55912	55917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213762
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1125	NC_011026	GCC	2	6	55979	55984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213762
1126	NC_011026	CAT	2	6	56080	56085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213762
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1128	NC_011026	AGT	2	6	56128	56133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213762
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1130	NC_011026	CTT	2	6	56245	56250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213762
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1143	NC_011026	TGA	2	6	57051	57056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_011026	ATA	2	6	63356	63361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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