MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011026	T	6	6	496541	496546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_011026	TTGCT	2	10	496578	496587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10003	NC_011026	T	6	6	496613	496618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_011026	AACTA	2	10	496676	496685	60 %	20 %	0 %	20 %	193214146
10005	NC_011026	AGA	2	6	496843	496848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214146
10006	NC_011026	A	8	8	496955	496962	100 %	0 %	0 %	0 %	193214146
10007	NC_011026	CG	3	6	496976	496981	0 %	0 %	50 %	50 %	193214146
10008	NC_011026	TGA	2	6	496995	497000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214146
10009	NC_011026	AAG	2	6	497001	497006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214146
10010	NC_011026	CGT	2	6	497032	497037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214146
10011	NC_011026	TGC	2	6	497070	497075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214146
10012	NC_011026	TCTT	2	8	497223	497230	0 %	75 %	0 %	25 %	193214146
10013	NC_011026	CAC	2	6	497233	497238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193214146
10014	NC_011026	ATG	2	6	497289	497294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214146
10015	NC_011026	GC	3	6	497361	497366	0 %	0 %	50 %	50 %	193214146
10016	NC_011026	GAA	2	6	497387	497392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193214146
10017	NC_011026	GGC	2	6	497393	497398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214146
10018	NC_011026	TCG	2	6	497416	497421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214146
10019	NC_011026	TGC	2	6	497439	497444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214146
10020	NC_011026	CGA	2	6	497500	497505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214146
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10026	NC_011026	TTTGA	2	10	497663	497672	20 %	60 %	20 %	0 %	193214146
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10029	NC_011026	GC	4	8	497877	497884	0 %	0 %	50 %	50 %	193214146
10030	NC_011026	AT	3	6	497908	497913	50 %	50 %	0 %	0 %	193214146
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10032	NC_011026	CAA	2	6	498024	498029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_011026	A	6	6	498040	498045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_011026	TTC	2	6	498083	498088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_011026	CTT	2	6	498098	498103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_011026	T	6	6	498138	498143	0 %	100 %	0 %	0 %	193214147
10037	NC_011026	CAC	2	6	498165	498170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193214147
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10041	NC_011026	AAT	2	6	498550	498555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214147
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10043	NC_011026	TCT	2	6	498690	498695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214147
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10045	NC_011026	CAAA	2	8	498851	498858	75 %	0 %	0 %	25 %	193214147
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10054	NC_011026	GACC	2	8	499266	499273	25 %	0 %	25 %	50 %	193214147
10055	NC_011026	TCA	2	6	499290	499295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214147
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10059	NC_011026	ACC	2	6	499447	499452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193214147
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10065	NC_011026	T	8	8	499781	499788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10071	NC_011026	A	7	7	499898	499904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10107	NC_011026	GTT	2	6	501399	501404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214148
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10109	NC_011026	TTTC	2	8	501547	501554	0 %	75 %	0 %	25 %	193214148
10110	NC_011026	CTT	2	6	501559	501564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214148
10111	NC_011026	GCAA	2	8	501587	501594	50 %	0 %	25 %	25 %	193214148
10112	NC_011026	GGC	2	6	501688	501693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214148
10113	NC_011026	ATA	2	6	501785	501790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214148
10114	NC_011026	CATGGC	2	12	501824	501835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193214148
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10118	NC_011026	TGC	2	6	502194	502199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214149
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10121	NC_011026	GAT	2	6	502289	502294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214149
10122	NC_011026	CCG	2	6	502296	502301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214149
10123	NC_011026	AGCC	2	8	502331	502338	25 %	0 %	25 %	50 %	193214149
10124	NC_011026	ACGC	2	8	502364	502371	25 %	0 %	25 %	50 %	193214149
10125	NC_011026	TTCG	2	8	502441	502448	0 %	50 %	25 %	25 %	193214149
10126	NC_011026	GCA	2	6	502468	502473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214149
10127	NC_011026	AAT	2	6	502478	502483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214149
10128	NC_011026	CCT	2	6	502486	502491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193214149
10129	NC_011026	TAAA	2	8	502520	502527	75 %	25 %	0 %	0 %	193214149
10130	NC_011026	CAA	2	6	502555	502560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214149
10131	NC_011026	TCGA	2	8	502595	502602	25 %	25 %	25 %	25 %	193214149
10132	NC_011026	AGC	2	6	502647	502652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214149
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10134	NC_011026	CGAT	2	8	502795	502802	25 %	25 %	25 %	25 %	193214149
10135	NC_011026	GCGT	2	8	502853	502860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10136	NC_011026	T	6	6	502864	502869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_011026	AGC	2	6	502886	502891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10138	NC_011026	A	6	6	502932	502937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_011026	AACAT	2	10	502969	502978	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10140	NC_011026	A	6	6	503000	503005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_011026	CCT	2	6	503053	503058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10142	NC_011026	AGA	2	6	503102	503107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_011026	CAT	2	6	503112	503117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10144	NC_011026	T	7	7	503129	503135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_011026	CCG	2	6	503183	503188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10146	NC_011026	CTT	2	6	503193	503198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_011026	ATG	2	6	503268	503273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_011026	TGA	2	6	503353	503358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214150
10149	NC_011026	AAGA	2	8	503412	503419	75 %	0 %	25 %	0 %	193214150
10150	NC_011026	GC	3	6	503698	503703	0 %	0 %	50 %	50 %	193214150
10151	NC_011026	CGTG	2	8	503714	503721	0 %	25 %	50 %	25 %	193214150
10152	NC_011026	GAAAAA	2	12	503723	503734	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	193214150
10153	NC_011026	CGC	2	6	503764	503769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214150
10154	NC_011026	GT	3	6	503803	503808	0 %	50 %	50 %	0 %	193214150
10155	NC_011026	CGA	2	6	503810	503815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214150
10156	NC_011026	AGCAA	2	10	503820	503829	60 %	0 %	20 %	20 %	193214150
10157	NC_011026	ATA	2	6	503902	503907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193214150
10158	NC_011026	A	7	7	503946	503952	100 %	0 %	0 %	0 %	193214150
10159	NC_011026	TTG	2	6	503953	503958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214150
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10162	NC_011026	TGA	2	6	504025	504030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193214150
10163	NC_011026	TGC	2	6	504061	504066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214150
10164	NC_011026	CGG	2	6	504068	504073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214150
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10199	NC_011026	AAC	2	6	505563	505568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193214151
10200	NC_011026	CAC	2	6	505594	505599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10201	NC_011026	AC	3	6	505607	505612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10202	NC_011026	ACAA	2	8	505632	505639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10203	NC_011026	GCT	2	6	505704	505709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10205	NC_011026	TTC	2	6	505740	505745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214152
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10229	NC_011026	TCT	2	6	506755	506760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214152
10230	NC_011026	TCGC	2	8	506761	506768	0 %	25 %	25 %	50 %	193214152
10231	NC_011026	CTT	2	6	506771	506776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193214152
10232	NC_011026	TGG	2	6	506777	506782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193214152
10233	NC_011026	ACG	2	6	506848	506853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193214152
10234	NC_011026	CG	3	6	506862	506867	0 %	0 %	50 %	50 %	193214152
10235	NC_011026	GCGAC	2	10	506936	506945	20 %	0 %	40 %	40 %	193214152
10236	NC_011026	GAAA	2	8	506989	506996	75 %	0 %	25 %	0 %	193214152
10237	NC_011026	TCC	2	6	507142	507147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193214152
10238	NC_011026	ACCG	2	8	507198	507205	25 %	0 %	25 %	50 %	193214152
10239	NC_011026	GCT	2	6	507239	507244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214152
10240	NC_011026	TTG	2	6	507297	507302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193214152
10241	NC_011026	CG	3	6	507379	507384	0 %	0 %	50 %	50 %	193214152
10242	NC_011026	GGCTTC	2	12	507408	507419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214152
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10244	NC_011026	CGT	2	6	507486	507491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214152
10245	NC_011026	CGG	2	6	507590	507595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214152
10246	NC_011026	CTG	2	6	507672	507677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193214152
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10350	NC_011026	TC	3	6	512870	512875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10351	NC_011026	T	8	8	512883	512890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10352	NC_011026	GATGA	2	10	512897	512906	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10357	NC_011026	TGT	2	6	512972	512977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10358	NC_011026	CAAAA	2	10	512978	512987	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10359	NC_011026	CCG	2	6	513031	513036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214157
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10361	NC_011026	CCG	2	6	513129	513134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214157
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10492	NC_011026	CG	3	6	519751	519756	0 %	0 %	50 %	50 %	193214160
10493	NC_011026	GGA	2	6	519791	519796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193214160
10494	NC_011026	CGG	2	6	519815	519820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193214160
10495	NC_011026	GGA	2	6	519851	519856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193214160
10496	NC_011026	AATGG	2	10	519894	519903	40 %	20 %	40 %	0 %	193214160
10497	NC_011026	TCA	2	6	519990	519995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193214160
10498	NC_011026	GCC	2	6	520037	520042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193214160
10499	NC_011026	AT	3	6	520057	520062	50 %	50 %	0 %	0 %	193214160
10500	NC_011026	TTGG	2	8	520064	520071	0 %	50 %	50 %	0 %	193214160

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