MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011026	A	8	8	23949	23956	100 %	0 %	0 %	0 %	193213737
502	NC_011026	A	6	6	23988	23993	100 %	0 %	0 %	0 %	193213738
503	NC_011026	T	6	6	24017	24022	0 %	100 %	0 %	0 %	193213738
504	NC_011026	T	6	6	24031	24036	0 %	100 %	0 %	0 %	193213738
505	NC_011026	CGA	2	6	24074	24079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213738
506	NC_011026	T	6	6	24098	24103	0 %	100 %	0 %	0 %	193213738
507	NC_011026	TTA	2	6	24205	24210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213738
508	NC_011026	ATT	2	6	24256	24261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213738
509	NC_011026	GAA	2	6	24369	24374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213738
510	NC_011026	CGC	2	6	24432	24437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213738
511	NC_011026	GC	3	6	24436	24441	0 %	0 %	50 %	50 %	193213738
512	NC_011026	CAA	3	9	24497	24505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213738
513	NC_011026	ATTGGG	2	12	24532	24543	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	193213738
514	NC_011026	GCC	3	9	24639	24647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213738
515	NC_011026	CTT	2	6	24666	24671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213738
516	NC_011026	TC	3	6	24828	24833	0 %	50 %	0 %	50 %	193213738
517	NC_011026	TGC	2	6	24940	24945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213738
518	NC_011026	GC	6	12	25049	25060	0 %	0 %	50 %	50 %	193213738
519	NC_011026	GAA	2	6	25065	25070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213738
520	NC_011026	GCC	2	6	25167	25172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213738
521	NC_011026	GCG	2	6	25185	25190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213738
522	NC_011026	AAG	2	6	25225	25230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213738
523	NC_011026	GAAA	2	8	25233	25240	75 %	0 %	25 %	0 %	193213738
524	NC_011026	A	7	7	25238	25244	100 %	0 %	0 %	0 %	193213738
525	NC_011026	GCC	2	6	25296	25301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213738
526	NC_011026	AAGCCA	2	12	25303	25314	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193213738
527	NC_011026	ATT	2	6	25336	25341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213738
528	NC_011026	CGG	3	9	25418	25426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011026	AAC	2	6	25442	25447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011026	GCT	2	6	25450	25455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011026	CTGA	2	8	25485	25492	25 %	25 %	25 %	25 %	193213739
532	NC_011026	AAT	2	6	25534	25539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213739
533	NC_011026	CG	3	6	25581	25586	0 %	0 %	50 %	50 %	193213739
534	NC_011026	CTTG	2	8	25599	25606	0 %	50 %	25 %	25 %	193213739
535	NC_011026	AGC	2	6	25607	25612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213739
536	NC_011026	AT	3	6	25634	25639	50 %	50 %	0 %	0 %	193213739
537	NC_011026	GA	3	6	25649	25654	50 %	0 %	50 %	0 %	193213739
538	NC_011026	ACA	2	6	25763	25768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213739
539	NC_011026	A	6	6	25856	25861	100 %	0 %	0 %	0 %	193213739
540	NC_011026	TCG	2	6	25991	25996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213739
541	NC_011026	AAT	2	6	26023	26028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213739
542	NC_011026	GGC	3	9	26045	26053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213739
543	NC_011026	AAATC	2	10	26115	26124	60 %	20 %	0 %	20 %	193213739
544	NC_011026	GCA	2	6	26132	26137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213739
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547	NC_011026	CCA	2	6	26444	26449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213739
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554	NC_011026	TGA	2	6	26850	26855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213739
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557	NC_011026	AGC	2	6	26930	26935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213739
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559	NC_011026	T	6	6	27172	27177	0 %	100 %	0 %	0 %	193213739
560	NC_011026	AATT	2	8	27184	27191	50 %	50 %	0 %	0 %	193213739
561	NC_011026	T	6	6	27255	27260	0 %	100 %	0 %	0 %	193213739
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568	NC_011026	CTG	2	6	27745	27750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213739
569	NC_011026	TGA	2	6	27753	27758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213739
570	NC_011026	GTC	2	6	27787	27792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213739
571	NC_011026	TCT	2	6	27813	27818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213739
572	NC_011026	ATTT	2	8	27837	27844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011026	TCA	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011026	GC	3	6	27899	27904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_011026	CTT	2	6	27923	27928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011026	CT	3	6	27964	27969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_011026	CG	3	6	27977	27982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_011026	ATC	2	6	28195	28200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213740
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585	NC_011026	TCA	2	6	28425	28430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213740
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587	NC_011026	T	6	6	28487	28492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_011026	T	7	7	28604	28610	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
593	NC_011026	TCG	2	6	28645	28650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
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599	NC_011026	CTT	2	6	29060	29065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
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602	NC_011026	GCT	2	6	29216	29221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213741
603	NC_011026	T	7	7	29247	29253	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
604	NC_011026	CCAA	2	8	29278	29285	50 %	0 %	0 %	50 %	193213741
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609	NC_011026	CG	3	6	29477	29482	0 %	0 %	50 %	50 %	193213741
610	NC_011026	TCGA	2	8	29500	29507	25 %	25 %	25 %	25 %	193213741
611	NC_011026	TTC	2	6	29589	29594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
612	NC_011026	T	7	7	29619	29625	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
613	NC_011026	T	8	8	29657	29664	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
614	NC_011026	T	7	7	29867	29873	0 %	100 %	0 %	0 %	193213741
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618	NC_011026	TTCG	2	8	30176	30183	0 %	50 %	25 %	25 %	193213741
619	NC_011026	CTTC	2	8	30236	30243	0 %	50 %	0 %	50 %	193213741
620	NC_011026	ATC	2	6	30280	30285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213741
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629	NC_011026	CA	3	6	30756	30761	50 %	0 %	0 %	50 %	193213741
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631	NC_011026	TTC	2	6	30768	30773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213741
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