MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011026	TAAAAA	2	12	276285	276296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_011026	A	7	7	276292	276298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011026	AACA	2	8	276301	276308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_011026	CGA	2	6	276414	276419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_011026	TGGA	2	8	276430	276437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_011026	TTC	2	6	276484	276489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_011026	T	6	6	276578	276583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011026	TCG	2	6	276611	276616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_011026	A	8	8	276623	276630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011026	TGC	3	9	276650	276658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213951
5511	NC_011026	AAT	2	6	276762	276767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213951
5512	NC_011026	A	6	6	276781	276786	100 %	0 %	0 %	0 %	193213951
5513	NC_011026	TCG	2	6	276827	276832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213951
5514	NC_011026	AAT	2	6	276857	276862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213951
5515	NC_011026	AAT	2	6	276881	276886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213951
5516	NC_011026	T	7	7	277030	277036	0 %	100 %	0 %	0 %	193213951
5517	NC_011026	TGT	2	6	277052	277057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213951
5518	NC_011026	TGA	2	6	277130	277135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213951
5519	NC_011026	CAT	2	6	277154	277159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213951
5520	NC_011026	ATTT	2	8	277298	277305	25 %	75 %	0 %	0 %	193213951
5521	NC_011026	CCG	2	6	277378	277383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213951
5522	NC_011026	CGG	2	6	277418	277423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213951
5523	NC_011026	CGCC	2	8	277487	277494	0 %	0 %	25 %	75 %	193213951
5524	NC_011026	TCA	2	6	277514	277519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213951
5525	NC_011026	GAC	2	6	277525	277530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213951
5526	NC_011026	T	6	6	277586	277591	0 %	100 %	0 %	0 %	193213951
5527	NC_011026	A	7	7	277622	277628	100 %	0 %	0 %	0 %	193213951
5528	NC_011026	CCG	2	6	277670	277675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213951
5529	NC_011026	ATG	2	6	277684	277689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213951
5530	NC_011026	CG	3	6	277719	277724	0 %	0 %	50 %	50 %	193213951
5531	NC_011026	TCG	2	6	277801	277806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213951
5532	NC_011026	T	6	6	277844	277849	0 %	100 %	0 %	0 %	193213951
5533	NC_011026	GCC	2	6	277905	277910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213951
5534	NC_011026	TAAT	2	8	277915	277922	50 %	50 %	0 %	0 %	193213951
5535	NC_011026	A	6	6	277958	277963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011026	A	6	6	278012	278017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011026	GTAAC	2	10	278019	278028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5538	NC_011026	CAA	2	6	278091	278096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213952
5539	NC_011026	T	7	7	278138	278144	0 %	100 %	0 %	0 %	193213952
5540	NC_011026	T	6	6	278159	278164	0 %	100 %	0 %	0 %	193213952
5541	NC_011026	A	6	6	278167	278172	100 %	0 %	0 %	0 %	193213952
5542	NC_011026	CGC	3	9	278173	278181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213952
5543	NC_011026	GAAA	2	8	278205	278212	75 %	0 %	25 %	0 %	193213952
5544	NC_011026	GAGC	2	8	278377	278384	25 %	0 %	50 %	25 %	193213952
5545	NC_011026	GCG	2	6	278418	278423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213952
5546	NC_011026	CGGCTA	2	12	278428	278439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193213952
5547	NC_011026	CGA	2	6	278443	278448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213952
5548	NC_011026	GCC	2	6	278473	278478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213952
5549	NC_011026	ATT	2	6	278484	278489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213952
5550	NC_011026	A	6	6	278495	278500	100 %	0 %	0 %	0 %	193213952
5551	NC_011026	AGCTG	2	10	278520	278529	20 %	20 %	40 %	20 %	193213952
5552	NC_011026	GGCGAA	2	12	278558	278569	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	193213952
5553	NC_011026	ACA	2	6	278826	278831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213952
5554	NC_011026	TTCC	2	8	278836	278843	0 %	50 %	0 %	50 %	193213952
5555	NC_011026	GCT	2	6	278890	278895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213952
5556	NC_011026	GCTT	2	8	278952	278959	0 %	50 %	25 %	25 %	193213952
5557	NC_011026	GAT	2	6	278960	278965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213952
5558	NC_011026	GCGA	2	8	278982	278989	25 %	0 %	50 %	25 %	193213952
5559	NC_011026	CGC	2	6	279000	279005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213952
5560	NC_011026	GAT	2	6	279010	279015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213952
5561	NC_011026	GGGC	2	8	279034	279041	0 %	0 %	75 %	25 %	193213952
5562	NC_011026	CAT	2	6	279052	279057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213952
5563	NC_011026	CGTG	2	8	279060	279067	0 %	25 %	50 %	25 %	193213952
5564	NC_011026	TTTCAA	2	12	279239	279250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193213952
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5566	NC_011026	TCGCC	2	10	279324	279333	0 %	20 %	20 %	60 %	193213952
5567	NC_011026	GCC	2	6	279366	279371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213952
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5570	NC_011026	CAAG	2	8	279604	279611	50 %	0 %	25 %	25 %	193213952
5571	NC_011026	TGGTT	2	10	279639	279648	0 %	60 %	40 %	0 %	193213952
5572	NC_011026	TGC	2	6	279705	279710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213952
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5574	NC_011026	CTTG	2	8	279802	279809	0 %	50 %	25 %	25 %	193213952
5575	NC_011026	TTA	2	6	279820	279825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213952
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5580	NC_011026	TGC	2	6	280023	280028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213952
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5582	NC_011026	ACG	2	6	280101	280106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213952
5583	NC_011026	A	6	6	280124	280129	100 %	0 %	0 %	0 %	193213952
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5587	NC_011026	AAT	2	6	280307	280312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_011026	CGG	2	6	280418	280423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213953
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5591	NC_011026	CGT	2	6	280548	280553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213953
5592	NC_011026	GTC	2	6	280585	280590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213953
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5594	NC_011026	CCA	2	6	280670	280675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213953
5595	NC_011026	CCG	2	6	280700	280705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213953
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5600	NC_011026	AGA	2	6	281013	281018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011026	T	8	8	281069	281076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011026	TTCT	2	8	281147	281154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_011026	CTG	2	6	281171	281176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213954
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5605	NC_011026	GCA	3	9	281285	281293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213954
5606	NC_011026	ATGAA	2	10	281303	281312	60 %	20 %	20 %	0 %	193213954
5607	NC_011026	A	6	6	281324	281329	100 %	0 %	0 %	0 %	193213954
5608	NC_011026	CAC	2	6	281367	281372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213954
5609	NC_011026	CAA	4	12	281440	281451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213954
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5614	NC_011026	TGC	2	6	281616	281621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213955
5615	NC_011026	GCCAAA	2	12	281636	281647	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193213955
5616	NC_011026	CGG	2	6	281785	281790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213955
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5619	NC_011026	TTG	2	6	281856	281861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213955
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5625	NC_011026	ATT	2	6	282269	282274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213955
5626	NC_011026	CGA	2	6	282313	282318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213955
5627	NC_011026	TGA	2	6	282457	282462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213955
5628	NC_011026	GCA	2	6	282479	282484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213955
5629	NC_011026	GGT	2	6	282530	282535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213955
5630	NC_011026	CGC	2	6	282640	282645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213955
5631	NC_011026	CGT	2	6	282768	282773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213955
5632	NC_011026	TTGA	2	8	282800	282807	25 %	50 %	25 %	0 %	193213955
5633	NC_011026	ACAA	2	8	282812	282819	75 %	0 %	0 %	25 %	193213955
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5641	NC_011026	CAC	2	6	283327	283332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213955
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5655	NC_011026	GAA	2	6	284120	284125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_011026	AAC	2	6	284126	284131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5657	NC_011026	G	6	6	284144	284149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5658	NC_011026	CTT	2	6	284178	284183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213957
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5663	NC_011026	T	7	7	284348	284354	0 %	100 %	0 %	0 %	193213957
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5739	NC_011026	A	6	6	288062	288067	100 %	0 %	0 %	0 %	193213960
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5747	NC_011026	CG	3	6	288404	288409	0 %	0 %	50 %	50 %	193213960
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5999	NC_011026	ATG	2	6	301514	301519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213974
6000	NC_011026	CAA	2	6	301528	301533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213974

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