MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 66787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011026	TGAA	2	8	250074	250081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011026	A	6	6	250084	250089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011026	T	6	6	250108	250113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011026	T	6	6	250155	250160	0 %	100 %	0 %	0 %	193213933
5005	NC_011026	GCAC	2	8	250177	250184	25 %	0 %	25 %	50 %	193213933
5006	NC_011026	GGC	2	6	250291	250296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213933
5007	NC_011026	T	6	6	250344	250349	0 %	100 %	0 %	0 %	193213933
5008	NC_011026	CAA	2	6	250397	250402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213933
5009	NC_011026	CGG	2	6	250418	250423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213933
5010	NC_011026	CTG	2	6	250462	250467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213933
5011	NC_011026	TAA	2	6	250598	250603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213933
5012	NC_011026	CTT	2	6	250787	250792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213933
5013	NC_011026	TCAA	2	8	250858	250865	50 %	25 %	0 %	25 %	193213933
5014	NC_011026	CAC	2	6	250883	250888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213933
5015	NC_011026	CTT	2	6	251003	251008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213933
5016	NC_011026	TTA	2	6	251026	251031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213933
5017	NC_011026	TCG	2	6	251051	251056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213933
5018	NC_011026	GAAG	2	8	251074	251081	50 %	0 %	50 %	0 %	193213933
5019	NC_011026	T	6	6	251271	251276	0 %	100 %	0 %	0 %	193213933
5020	NC_011026	CGG	2	6	251379	251384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213933
5021	NC_011026	TG	3	6	251390	251395	0 %	50 %	50 %	0 %	193213933
5022	NC_011026	GCG	2	6	251414	251419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213933
5023	NC_011026	TTA	2	6	251584	251589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213933
5024	NC_011026	GCACC	2	10	251681	251690	20 %	0 %	20 %	60 %	193213933
5025	NC_011026	CGC	2	6	251720	251725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213933
5026	NC_011026	A	7	7	251777	251783	100 %	0 %	0 %	0 %	193213933
5027	NC_011026	TGTT	2	8	251883	251890	0 %	75 %	25 %	0 %	193213933
5028	NC_011026	CAA	2	6	251903	251908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213933
5029	NC_011026	CGT	2	6	251910	251915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213933
5030	NC_011026	AAT	2	6	251937	251942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213933
5031	NC_011026	T	6	6	252089	252094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011026	GAC	2	6	252126	252131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_011026	TCT	2	6	252189	252194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213934
5034	NC_011026	AAAT	2	8	252272	252279	75 %	25 %	0 %	0 %	193213934
5035	NC_011026	TTA	2	6	252309	252314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5036	NC_011026	TGA	2	6	252315	252320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213934
5037	NC_011026	ATTT	2	8	252337	252344	25 %	75 %	0 %	0 %	193213934
5038	NC_011026	ATA	2	6	252355	252360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213934
5039	NC_011026	TAT	2	6	252373	252378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5040	NC_011026	AACA	2	8	252379	252386	75 %	0 %	0 %	25 %	193213934
5041	NC_011026	CAA	2	6	252452	252457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213934
5042	NC_011026	GATTT	2	10	252461	252470	20 %	60 %	20 %	0 %	193213934
5043	NC_011026	GCA	2	6	252473	252478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213934
5044	NC_011026	T	7	7	252566	252572	0 %	100 %	0 %	0 %	193213934
5045	NC_011026	TCA	2	6	252582	252587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213934
5046	NC_011026	TAA	2	6	252617	252622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213934
5047	NC_011026	AGAA	2	8	252628	252635	75 %	0 %	25 %	0 %	193213934
5048	NC_011026	ATT	2	6	252716	252721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5049	NC_011026	T	6	6	252720	252725	0 %	100 %	0 %	0 %	193213934
5050	NC_011026	CAAT	2	8	252729	252736	50 %	25 %	0 %	25 %	193213934
5051	NC_011026	ATCAAT	2	12	252764	252775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193213934
5052	NC_011026	ATT	3	9	252779	252787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5053	NC_011026	CAAC	2	8	252835	252842	50 %	0 %	0 %	50 %	193213934
5054	NC_011026	TGAC	2	8	252848	252855	25 %	25 %	25 %	25 %	193213934
5055	NC_011026	TTA	2	6	252909	252914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5056	NC_011026	ATT	2	6	253067	253072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5057	NC_011026	CAA	2	6	253088	253093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213934
5058	NC_011026	ATT	3	9	253094	253102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5059	NC_011026	TAA	2	6	253124	253129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213934
5060	NC_011026	ATT	2	6	253160	253165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213934
5061	NC_011026	TTTG	2	8	253415	253422	0 %	75 %	25 %	0 %	193213934
5062	NC_011026	CCG	2	6	253477	253482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213934
5063	NC_011026	A	7	7	253610	253616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011026	ATA	2	6	253619	253624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011026	TG	3	6	253639	253644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011026	T	8	8	253700	253707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011026	T	6	6	253722	253727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011026	CAT	2	6	253728	253733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_011026	TCAT	2	8	253737	253744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_011026	AT	3	6	253743	253748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011026	CAAA	2	8	253773	253780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_011026	ATC	2	6	253782	253787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_011026	AGA	2	6	253832	253837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213935
5074	NC_011026	CT	3	6	253849	253854	0 %	50 %	0 %	50 %	193213935
5075	NC_011026	GGC	2	6	253889	253894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213935
5076	NC_011026	GCT	2	6	253967	253972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213935
5077	NC_011026	GAA	2	6	254055	254060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213935
5078	NC_011026	TTA	2	6	254122	254127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213935
5079	NC_011026	CAG	3	9	254183	254191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213935
5080	NC_011026	GAA	2	6	254367	254372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011026	GAG	2	6	254423	254428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011026	T	6	6	254446	254451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011026	CAA	2	6	254525	254530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_011026	TCT	2	6	254558	254563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_011026	CAA	2	6	254569	254574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213936
5086	NC_011026	TTG	2	6	254731	254736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213936
5087	NC_011026	ACT	2	6	254749	254754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213936
5088	NC_011026	CCG	2	6	254773	254778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213936
5089	NC_011026	TGTTT	2	10	254786	254795	0 %	80 %	20 %	0 %	193213936
5090	NC_011026	TTG	2	6	254808	254813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213936
5091	NC_011026	A	6	6	254820	254825	100 %	0 %	0 %	0 %	193213936
5092	NC_011026	GGCT	2	8	254826	254833	0 %	25 %	50 %	25 %	193213936
5093	NC_011026	CAA	2	6	254843	254848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193213936
5094	NC_011026	CAT	2	6	254868	254873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213936
5095	NC_011026	CT	3	6	254905	254910	0 %	50 %	0 %	50 %	193213936
5096	NC_011026	GCT	2	6	254927	254932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213936
5097	NC_011026	CTT	2	6	255045	255050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213936
5098	NC_011026	ATT	2	6	255102	255107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213936
5099	NC_011026	GGT	2	6	255170	255175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213936
5100	NC_011026	ATTC	2	8	255251	255258	25 %	50 %	0 %	25 %	193213936
5101	NC_011026	TATT	2	8	255273	255280	25 %	75 %	0 %	0 %	193213936
5102	NC_011026	AAAC	2	8	255292	255299	75 %	0 %	0 %	25 %	193213936
5103	NC_011026	TTC	2	6	255322	255327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213936
5104	NC_011026	GCG	2	6	255439	255444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213936
5105	NC_011026	CT	3	6	255480	255485	0 %	50 %	0 %	50 %	193213936
5106	NC_011026	A	8	8	255516	255523	100 %	0 %	0 %	0 %	193213936
5107	NC_011026	CGG	2	6	255581	255586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213936
5108	NC_011026	TGGA	2	8	255590	255597	25 %	25 %	50 %	0 %	193213936
5109	NC_011026	ACGA	2	8	255621	255628	50 %	0 %	25 %	25 %	193213936
5110	NC_011026	GAT	2	6	255704	255709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213936
5111	NC_011026	GGC	2	6	255768	255773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213936
5112	NC_011026	T	6	6	255801	255806	0 %	100 %	0 %	0 %	193213936
5113	NC_011026	GC	3	6	255808	255813	0 %	0 %	50 %	50 %	193213936
5114	NC_011026	GGC	2	6	255909	255914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213936
5115	NC_011026	A	6	6	255975	255980	100 %	0 %	0 %	0 %	193213936
5116	NC_011026	CA	4	8	255992	255999	50 %	0 %	0 %	50 %	193213936
5117	NC_011026	GCA	2	6	256005	256010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213936
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5119	NC_011026	TCA	2	6	256036	256041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213936
5120	NC_011026	ATT	2	6	256053	256058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213936
5121	NC_011026	GTT	2	6	256100	256105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213936
5122	NC_011026	T	6	6	256160	256165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011026	A	6	6	256199	256204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011026	TGC	2	6	256245	256250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_011026	CAA	2	6	256257	256262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_011026	A	6	6	256276	256281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011026	T	6	6	256294	256299	0 %	100 %	0 %	0 %	193213937
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5244	NC_011026	ATTT	2	8	263275	263282	25 %	75 %	0 %	0 %	193213942
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5248	NC_011026	GCTGG	2	10	263427	263436	0 %	20 %	60 %	20 %	193213942
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5250	NC_011026	CAAC	2	8	263549	263556	50 %	0 %	0 %	50 %	193213942
5251	NC_011026	ATT	2	6	263572	263577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213942
5252	NC_011026	GCA	2	6	263610	263615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
5253	NC_011026	A	8	8	263624	263631	100 %	0 %	0 %	0 %	193213942
5254	NC_011026	GAT	2	6	263647	263652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213942
5255	NC_011026	CCG	2	6	263686	263691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213942
5256	NC_011026	ATT	2	6	263803	263808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213942
5257	NC_011026	TCA	2	6	263858	263863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213942
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5262	NC_011026	GAC	2	6	264082	264087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
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5265	NC_011026	A	6	6	264264	264269	100 %	0 %	0 %	0 %	193213942
5266	NC_011026	GCTT	2	8	264281	264288	0 %	50 %	25 %	25 %	193213942
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5269	NC_011026	GAC	2	6	264652	264657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213942
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5271	NC_011026	ATT	2	6	264807	264812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_011026	A	6	6	264913	264918	100 %	0 %	0 %	0 %	193213943
5273	NC_011026	GGC	3	9	265036	265044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213943
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5277	NC_011026	TTA	2	6	265196	265201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_011026	ATGA	2	8	265222	265229	50 %	25 %	25 %	0 %	193213944
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5281	NC_011026	AAT	2	6	265341	265346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213944
5282	NC_011026	TGA	2	6	265356	265361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213944
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5284	NC_011026	CGA	2	6	265461	265466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213944
5285	NC_011026	CGG	2	6	265539	265544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213944
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5290	NC_011026	AGA	2	6	265732	265737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213945
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5322	NC_011026	CTG	2	6	267043	267048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213945
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5328	NC_011026	TTA	2	6	267475	267480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5329	NC_011026	T	7	7	267501	267507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5330	NC_011026	G	6	6	267538	267543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5331	NC_011026	AAC	2	6	267571	267576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5332	NC_011026	ACC	2	6	267581	267586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5333	NC_011026	GCG	2	6	267628	267633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213946
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5345	NC_011026	TCG	2	6	268080	268085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213947
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5347	NC_011026	GTC	2	6	268136	268141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213947
5348	NC_011026	A	6	6	268356	268361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5349	NC_011026	AGT	2	6	268372	268377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5351	NC_011026	A	6	6	268394	268399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5352	NC_011026	T	9	9	268438	268446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_011026	CGCC	2	8	268510	268517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5354	NC_011026	T	8	8	268619	268626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_011026	TAT	2	6	268653	268658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_011026	AGC	2	6	268737	268742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213948
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5361	NC_011026	CGC	2	6	269291	269296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213948
5362	NC_011026	CCTCAA	2	12	269305	269316	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	193213948
5363	NC_011026	TGA	2	6	269326	269331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213948
5364	NC_011026	CCAT	2	8	269348	269355	25 %	25 %	0 %	50 %	193213948
5365	NC_011026	TGG	2	6	269420	269425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213948
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5369	NC_011026	TTGG	2	8	269634	269641	0 %	50 %	50 %	0 %	193213948
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5372	NC_011026	TC	3	6	269842	269847	0 %	50 %	0 %	50 %	193213948
5373	NC_011026	TTCGC	2	10	269848	269857	0 %	40 %	20 %	40 %	193213948
5374	NC_011026	TGG	2	6	269951	269956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213948
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5376	NC_011026	TGT	2	6	270055	270060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213948
5377	NC_011026	GCCAA	2	10	270081	270090	40 %	0 %	20 %	40 %	193213948
5378	NC_011026	TGG	2	6	270105	270110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213948
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5380	NC_011026	TGA	2	6	270262	270267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213948
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5391	NC_011026	T	6	6	270729	270734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_011026	AT	3	6	270783	270788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_011026	TTAG	2	8	270794	270801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5450	NC_011026	ATCA	2	8	273742	273749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5451	NC_011026	CCAT	2	8	273760	273767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5452	NC_011026	T	8	8	273833	273840	0 %	100 %	0 %	0 %	193213950
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5481	NC_011026	ATA	2	6	275277	275282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193213950
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5489	NC_011026	TA	3	6	275994	275999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5490	NC_011026	ACAA	2	8	276007	276014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5491	NC_011026	TGTTA	2	10	276045	276054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_011026	AAT	2	6	276055	276060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_011026	TTG	2	6	276068	276073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_011026	AAGGA	2	10	276075	276084	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_011026	TCG	2	6	276103	276108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5496	NC_011026	CT	4	8	276130	276137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5497	NC_011026	T	6	6	276170	276175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_011026	ATTAA	2	10	276226	276235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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