MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	GATG	2	8	130	137	25 %	25 %	50 %	0 %	190571921
2	NC_010935	TCGT	2	8	700	707	0 %	50 %	25 %	25 %	190571922
3	NC_010935	GCGA	2	8	1155	1162	25 %	0 %	50 %	25 %	190571923
4	NC_010935	CCTT	2	8	1997	2004	0 %	50 %	0 %	50 %	190571924
5	NC_010935	CGGC	2	8	2393	2400	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
6	NC_010935	GGTG	2	8	2401	2408	0 %	25 %	75 %	0 %	190571924
7	NC_010935	ACCG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010935	GCCG	2	8	3037	3044	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
9	NC_010935	CTGG	2	8	3071	3078	0 %	25 %	50 %	25 %	190571926
10	NC_010935	GCTC	2	8	3312	3319	0 %	25 %	25 %	50 %	190571926
11	NC_010935	CGCT	2	8	3534	3541	0 %	25 %	25 %	50 %	190571926
12	NC_010935	TGGC	2	8	3837	3844	0 %	25 %	50 %	25 %	190571926
13	NC_010935	CGGC	2	8	4286	4293	0 %	0 %	50 %	50 %	190571927
14	NC_010935	GCCA	2	8	4564	4571	25 %	0 %	25 %	50 %	190571927
15	NC_010935	TTGC	2	8	5513	5520	0 %	50 %	25 %	25 %	190571929
16	NC_010935	GGCC	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
17	NC_010935	CGAA	2	8	6646	6653	50 %	0 %	25 %	25 %	190571931
18	NC_010935	GGCC	2	8	7058	7065	0 %	0 %	50 %	50 %	190571932
19	NC_010935	GTCG	2	8	7565	7572	0 %	25 %	50 %	25 %	190571933
20	NC_010935	CGGT	2	8	7973	7980	0 %	25 %	50 %	25 %	190571934
21	NC_010935	CGGC	2	8	7994	8001	0 %	0 %	50 %	50 %	190571934
22	NC_010935	TTCG	2	8	8039	8046	0 %	50 %	25 %	25 %	190571934
23	NC_010935	CGCT	2	8	8346	8353	0 %	25 %	25 %	50 %	190571935
24	NC_010935	GCCC	2	8	8382	8389	0 %	0 %	25 %	75 %	190571935
25	NC_010935	GGCC	2	8	8652	8659	0 %	0 %	50 %	50 %	190571935
26	NC_010935	CGGC	2	8	9265	9272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010935	CGGC	2	8	9386	9393	0 %	0 %	50 %	50 %	190571936
28	NC_010935	CCGT	2	8	9442	9449	0 %	25 %	25 %	50 %	190571936
29	NC_010935	TGGC	2	8	9576	9583	0 %	25 %	50 %	25 %	190571937
30	NC_010935	GAAG	2	8	10325	10332	50 %	0 %	50 %	0 %	190571938
31	NC_010935	CCTT	2	8	10755	10762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010935	GCCG	2	8	11510	11517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010935	CTTG	2	8	12324	12331	0 %	50 %	25 %	25 %	190571940
34	NC_010935	CCTG	2	8	12682	12689	0 %	25 %	25 %	50 %	190571940
35	NC_010935	GTCC	2	8	12756	12763	0 %	25 %	25 %	50 %	190571940
36	NC_010935	GCTC	2	8	13245	13252	0 %	25 %	25 %	50 %	190571940
37	NC_010935	GTCG	2	8	13437	13444	0 %	25 %	50 %	25 %	190571940
38	NC_010935	GCCA	2	8	14174	14181	25 %	0 %	25 %	50 %	190571940
39	NC_010935	TCAA	2	8	14360	14367	50 %	25 %	0 %	25 %	190571940
40	NC_010935	TCAG	2	8	14411	14418	25 %	25 %	25 %	25 %	190571940
41	NC_010935	CGCC	2	8	14876	14883	0 %	0 %	25 %	75 %	190571941
42	NC_010935	GTCA	2	8	15809	15816	25 %	25 %	25 %	25 %	190571942
43	NC_010935	TGAC	2	8	16441	16448	25 %	25 %	25 %	25 %	190571943
44	NC_010935	TAGG	2	8	16454	16461	25 %	25 %	50 %	0 %	190571943
45	NC_010935	AGCC	2	8	16763	16770	25 %	0 %	25 %	50 %	190571943
46	NC_010935	AAGA	2	8	16986	16993	75 %	0 %	25 %	0 %	190571943
47	NC_010935	CTTA	2	8	17167	17174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010935	CTCA	2	8	18640	18647	25 %	25 %	0 %	50 %	190571944
49	NC_010935	TCCT	2	8	19295	19302	0 %	50 %	0 %	50 %	190571946
50	NC_010935	CGAG	2	8	19471	19478	25 %	0 %	50 %	25 %	190571946
51	NC_010935	AAGA	2	8	19565	19572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010935	TGCT	2	8	19777	19784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010935	TGCG	2	8	19825	19832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010935	GTGC	2	8	20308	20315	0 %	25 %	50 %	25 %	190571947
55	NC_010935	CCGA	2	8	20404	20411	25 %	0 %	25 %	50 %	190571947
56	NC_010935	GCCG	2	8	21972	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
57	NC_010935	GATG	2	8	22786	22793	25 %	25 %	50 %	0 %	190571950
58	NC_010935	GTCG	2	8	22825	22832	0 %	25 %	50 %	25 %	190571950
59	NC_010935	GCCG	2	8	22935	22942	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
60	NC_010935	CAAT	2	8	23247	23254	50 %	25 %	0 %	25 %	190571950
61	NC_010935	GCCG	2	8	23704	23711	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
62	NC_010935	CTGG	2	8	24151	24158	0 %	25 %	50 %	25 %	190571950
63	NC_010935	ATGA	2	8	24694	24701	50 %	25 %	25 %	0 %	190571951
64	NC_010935	CCGC	2	8	24824	24831	0 %	0 %	25 %	75 %	190571951
65	NC_010935	GATG	2	8	25397	25404	25 %	25 %	50 %	0 %	190571952
66	NC_010935	ACCG	2	8	25566	25573	25 %	0 %	25 %	50 %	190571952
67	NC_010935	CCCG	2	8	26298	26305	0 %	0 %	25 %	75 %	190571953
68	NC_010935	GTGG	2	8	27029	27036	0 %	25 %	75 %	0 %	190571954
69	NC_010935	CGCC	2	8	28165	28172	0 %	0 %	25 %	75 %	190571955
70	NC_010935	GCGA	2	8	28206	28213	25 %	0 %	50 %	25 %	190571955
71	NC_010935	GCCA	2	8	28786	28793	25 %	0 %	25 %	50 %	190571957
72	NC_010935	TGGC	2	8	28823	28830	0 %	25 %	50 %	25 %	190571957
73	NC_010935	GGCC	2	8	30079	30086	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
74	NC_010935	GGCC	2	8	30190	30197	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
75	NC_010935	TCGG	2	8	30563	30570	0 %	25 %	50 %	25 %	190571958
76	NC_010935	CCCG	2	8	30648	30655	0 %	0 %	25 %	75 %	190571958
77	NC_010935	ACCA	2	8	30920	30927	50 %	0 %	0 %	50 %	190571958
78	NC_010935	AACG	2	8	31034	31041	50 %	0 %	25 %	25 %	190571958
79	NC_010935	GAAG	2	8	31205	31212	50 %	0 %	50 %	0 %	190571959
80	NC_010935	GCTG	2	8	31338	31345	0 %	25 %	50 %	25 %	190571959
81	NC_010935	CACG	2	8	31435	31442	25 %	0 %	25 %	50 %	190571959
82	NC_010935	TCCA	2	8	31652	31659	25 %	25 %	0 %	50 %	190571959
83	NC_010935	GGGC	2	8	31730	31737	0 %	0 %	75 %	25 %	190571959
84	NC_010935	GGCC	2	8	32148	32155	0 %	0 %	50 %	50 %	190571961
85	NC_010935	CCGG	2	8	32895	32902	0 %	0 %	50 %	50 %	190571962
86	NC_010935	CGCT	2	8	33188	33195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010935	AACC	2	8	33263	33270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010935	ACCT	2	8	33939	33946	25 %	25 %	0 %	50 %	190571964
89	NC_010935	CGCC	2	8	34034	34041	0 %	0 %	25 %	75 %	190571964
90	NC_010935	CAAA	2	8	34583	34590	75 %	0 %	0 %	25 %	190571964
91	NC_010935	CCTC	2	8	34704	34711	0 %	25 %	0 %	75 %	190571964
92	NC_010935	GCTG	2	8	34904	34911	0 %	25 %	50 %	25 %	190571964
93	NC_010935	GCCA	2	8	34977	34984	25 %	0 %	25 %	50 %	190571964
94	NC_010935	GTTT	2	8	35026	35033	0 %	75 %	25 %	0 %	190571964
95	NC_010935	GCCA	2	8	35405	35412	25 %	0 %	25 %	50 %	190571964
96	NC_010935	CAGG	2	8	36051	36058	25 %	0 %	50 %	25 %	190571964
97	NC_010935	CCAG	2	8	36100	36107	25 %	0 %	25 %	50 %	190571964
98	NC_010935	TTGA	2	8	36282	36289	25 %	50 %	25 %	0 %	190571964
99	NC_010935	AGGC	2	8	37328	37335	25 %	0 %	50 %	25 %	190571965
100	NC_010935	CGGT	2	8	37487	37494	0 %	25 %	50 %	25 %	190571965
101	NC_010935	GGCG	2	8	37686	37693	0 %	0 %	75 %	25 %	190571965
102	NC_010935	GTTG	2	8	37713	37720	0 %	50 %	50 %	0 %	190571965
103	NC_010935	TGGT	2	8	38393	38400	0 %	50 %	50 %	0 %	190572011
104	NC_010935	CGAG	2	8	38529	38536	25 %	0 %	50 %	25 %	190572011
105	NC_010935	GCCG	2	8	38851	38858	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
106	NC_010935	GGCG	2	8	39123	39130	0 %	0 %	75 %	25 %	190572011
107	NC_010935	GCCA	2	8	40903	40910	25 %	0 %	25 %	50 %	190571969
108	NC_010935	CGGT	2	8	41452	41459	0 %	25 %	50 %	25 %	190571969
109	NC_010935	GATC	2	8	41635	41642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010935	CGAA	2	8	42454	42461	50 %	0 %	25 %	25 %	190571970
111	NC_010935	CGCC	2	8	42565	42572	0 %	0 %	25 %	75 %	190571970
112	NC_010935	TGAT	2	8	43231	43238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010935	GGCG	2	8	43489	43496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010935	ACAT	2	8	43580	43587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010935	GTTT	2	8	44713	44720	0 %	75 %	25 %	0 %	190571971
116	NC_010935	AACC	2	8	44794	44801	50 %	0 %	0 %	50 %	190571971
117	NC_010935	TGCA	2	8	44839	44846	25 %	25 %	25 %	25 %	190571971
118	NC_010935	AGCC	2	8	45511	45518	25 %	0 %	25 %	50 %	190571972
119	NC_010935	CATC	2	8	45661	45668	25 %	25 %	0 %	50 %	190571972
120	NC_010935	AGGG	2	8	46192	46199	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010935	TTGA	2	8	46202	46209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010935	CGGC	2	8	46249	46256	0 %	0 %	50 %	50 %	190571973
123	NC_010935	GATT	2	8	46369	46376	25 %	50 %	25 %	0 %	190571973
124	NC_010935	AGGC	2	8	46604	46611	25 %	0 %	50 %	25 %	190571973
125	NC_010935	GCGA	2	8	47042	47049	25 %	0 %	50 %	25 %	190571974
126	NC_010935	GAGC	2	8	47714	47721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010935	GCCC	2	8	48475	48482	0 %	0 %	25 %	75 %	190571975
128	NC_010935	GTTC	2	8	48743	48750	0 %	50 %	25 %	25 %	190571975
129	NC_010935	TGCG	2	8	49290	49297	0 %	25 %	50 %	25 %	190571977
130	NC_010935	CCGC	2	8	49399	49406	0 %	0 %	25 %	75 %	190571977
131	NC_010935	ATTG	2	8	50247	50254	25 %	50 %	25 %	0 %	190571978
132	NC_010935	CCAT	2	8	52065	52072	25 %	25 %	0 %	50 %	190571979
133	NC_010935	AGGA	2	8	52636	52643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010935	CATC	2	8	52669	52676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010935	CCGG	2	8	53361	53368	0 %	0 %	50 %	50 %	190571980
136	NC_010935	GCTG	2	8	53801	53808	0 %	25 %	50 %	25 %	190571980
137	NC_010935	CGCC	2	8	53849	53856	0 %	0 %	25 %	75 %	190571980
138	NC_010935	GGCG	2	8	54736	54743	0 %	0 %	75 %	25 %	190571982
139	NC_010935	TCGG	2	8	55058	55065	0 %	25 %	50 %	25 %	190571982
140	NC_010935	GCGT	2	8	55088	55095	0 %	25 %	50 %	25 %	190571982
141	NC_010935	CGTA	2	8	55383	55390	25 %	25 %	25 %	25 %	190571982
142	NC_010935	TGAA	2	8	55911	55918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010935	GCCT	2	8	55940	55947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.