MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 2137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010935	CGG	2	6	21104	21109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571948
502	NC_010935	CTT	2	6	21122	21127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571948
503	NC_010935	CTG	2	6	21162	21167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571948
504	NC_010935	GC	3	6	21172	21177	0 %	0 %	50 %	50 %	190571948
505	NC_010935	ATG	2	6	21183	21188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571948
506	NC_010935	CTT	2	6	21194	21199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571948
507	NC_010935	CGC	2	6	21218	21223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571948
508	NC_010935	TGC	2	6	21238	21243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571948
509	NC_010935	GC	3	6	21344	21349	0 %	0 %	50 %	50 %	190571949
510	NC_010935	CTG	2	6	21426	21431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571949
511	NC_010935	AAG	2	6	21457	21462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571949
512	NC_010935	TGC	2	6	21511	21516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571949
513	NC_010935	CCG	2	6	21566	21571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571949
514	NC_010935	TAC	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571949
515	NC_010935	GCA	2	6	21595	21600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571949
516	NC_010935	AAG	2	6	21743	21748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571950
517	NC_010935	GCC	2	6	21791	21796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
518	NC_010935	GCC	2	6	21842	21847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
519	NC_010935	CAG	2	6	21874	21879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571950
520	NC_010935	AGC	2	6	21888	21893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571950
521	NC_010935	GCCG	2	8	21972	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
522	NC_010935	ACT	2	6	21987	21992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571950
523	NC_010935	GCG	2	6	21999	22004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
524	NC_010935	GCC	2	6	22031	22036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
525	NC_010935	TGA	2	6	22039	22044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571950
526	NC_010935	CGG	2	6	22052	22057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
527	NC_010935	GAC	2	6	22325	22330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571950
528	NC_010935	CGG	2	6	22417	22422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
529	NC_010935	GCG	2	6	22437	22442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
530	NC_010935	GGT	2	6	22474	22479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571950
531	NC_010935	GCCTG	2	10	22510	22519	0 %	20 %	40 %	40 %	190571950
532	NC_010935	CTTCAT	2	12	22567	22578	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190571950
533	NC_010935	AAG	2	6	22619	22624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571950
534	NC_010935	AGA	2	6	22632	22637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571950
535	NC_010935	CTT	2	6	22645	22650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571950
536	NC_010935	CAACAC	2	12	22663	22674	50 %	0 %	0 %	50 %	190571950
537	NC_010935	TGG	2	6	22704	22709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571950
538	NC_010935	GGC	2	6	22720	22725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
539	NC_010935	TGG	2	6	22749	22754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571950
540	NC_010935	CCG	2	6	22755	22760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
541	NC_010935	GATG	2	8	22786	22793	25 %	25 %	50 %	0 %	190571950
542	NC_010935	GGC	2	6	22810	22815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
543	NC_010935	CGC	2	6	22816	22821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
544	NC_010935	GTCG	2	8	22825	22832	0 %	25 %	50 %	25 %	190571950
545	NC_010935	GC	3	6	22862	22867	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
546	NC_010935	GCCG	2	8	22935	22942	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
547	NC_010935	TCA	2	6	22944	22949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571950
548	NC_010935	CTG	2	6	22970	22975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571950
549	NC_010935	CGC	2	6	23028	23033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
550	NC_010935	CAT	2	6	23161	23166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571950
551	NC_010935	CGC	2	6	23167	23172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
552	NC_010935	CAAT	2	8	23247	23254	50 %	25 %	0 %	25 %	190571950
553	NC_010935	GCC	2	6	23294	23299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
554	NC_010935	GCG	2	6	23463	23468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
555	NC_010935	CG	3	6	23467	23472	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
556	NC_010935	TGA	2	6	23625	23630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571950
557	NC_010935	TGC	2	6	23658	23663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571950
558	NC_010935	CCG	2	6	23674	23679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
559	NC_010935	GCCG	2	8	23704	23711	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
560	NC_010935	TCA	2	6	23712	23717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571950
561	NC_010935	CGA	2	6	23917	23922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571950
562	NC_010935	CGG	2	6	23928	23933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
563	NC_010935	CGC	2	6	23942	23947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
564	NC_010935	CAA	2	6	23956	23961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571950
565	NC_010935	CGG	2	6	23985	23990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571950
566	NC_010935	TAC	3	9	24005	24013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571950
567	NC_010935	GCC	3	9	24027	24035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
568	NC_010935	CTGGCC	2	12	24059	24070	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571950
569	NC_010935	TCG	2	6	24072	24077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571950
570	NC_010935	CGC	2	6	24100	24105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571950
571	NC_010935	CTGG	2	8	24151	24158	0 %	25 %	50 %	25 %	190571950
572	NC_010935	AAG	2	6	24235	24240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571951
573	NC_010935	GGC	2	6	24301	24306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571951
574	NC_010935	TCG	2	6	24345	24350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571951
575	NC_010935	GCG	2	6	24371	24376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571951
576	NC_010935	GTC	2	6	24381	24386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571951
577	NC_010935	CGG	2	6	24444	24449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571951
578	NC_010935	GTG	2	6	24490	24495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571951
579	NC_010935	GCC	2	6	24523	24528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571951
580	NC_010935	TCA	2	6	24590	24595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571951
581	NC_010935	ATGA	2	8	24694	24701	50 %	25 %	25 %	0 %	190571951
582	NC_010935	GAA	2	6	24817	24822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571951
583	NC_010935	CCGC	2	8	24824	24831	0 %	0 %	25 %	75 %	190571951
584	NC_010935	CGC	2	6	24905	24910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571951
585	NC_010935	AAC	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571951
586	NC_010935	ACT	2	6	24962	24967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571951
587	NC_010935	CG	3	6	24974	24979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571951
588	NC_010935	GAA	2	6	25007	25012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571952
589	NC_010935	GCGCT	2	10	25036	25045	0 %	20 %	40 %	40 %	190571952
590	NC_010935	CCCTGG	2	12	25057	25068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571952
591	NC_010935	CCG	2	6	25069	25074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571952
592	NC_010935	GC	3	6	25130	25135	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
593	NC_010935	GC	3	6	25228	25233	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
594	NC_010935	AGC	2	6	25234	25239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
595	NC_010935	GCA	2	6	25376	25381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
596	NC_010935	TCA	3	9	25384	25392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571952
597	NC_010935	GATG	2	8	25397	25404	25 %	25 %	50 %	0 %	190571952
598	NC_010935	GAC	2	6	25430	25435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
599	NC_010935	CCG	2	6	25439	25444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571952
600	NC_010935	CCTGCG	2	12	25454	25465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571952
601	NC_010935	TCGCA	2	10	25467	25476	20 %	20 %	20 %	40 %	190571952
602	NC_010935	ACCG	2	8	25566	25573	25 %	0 %	25 %	50 %	190571952
603	NC_010935	GT	3	6	25657	25662	0 %	50 %	50 %	0 %	190571952
604	NC_010935	CAT	2	6	25682	25687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571952
605	NC_010935	GGC	2	6	25749	25754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571952
606	NC_010935	CGA	2	6	25763	25768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571952
607	NC_010935	CG	3	6	25833	25838	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
608	NC_010935	TGG	2	6	25856	25861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571952
609	NC_010935	GGA	2	6	25888	25893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190571952
610	NC_010935	ATC	2	6	25910	25915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571953
611	NC_010935	TGC	2	6	25918	25923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571953
612	NC_010935	GGC	2	6	25943	25948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571953
613	NC_010935	ACC	2	6	25955	25960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190571953
614	NC_010935	CCG	2	6	25982	25987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571953
615	NC_010935	CAG	3	9	26003	26011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571953
616	NC_010935	GCA	2	6	26029	26034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571953
617	NC_010935	GCTGT	2	10	26039	26048	0 %	40 %	40 %	20 %	190571953
618	NC_010935	CCG	2	6	26051	26056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571953
619	NC_010935	CGG	2	6	26184	26189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571953
620	NC_010935	CGG	2	6	26208	26213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571953
621	NC_010935	CCCG	2	8	26298	26305	0 %	0 %	25 %	75 %	190571953
622	NC_010935	GAA	2	6	26419	26424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571954
623	NC_010935	GCG	2	6	26434	26439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571954
624	NC_010935	CAA	2	6	26443	26448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571954
625	NC_010935	CTG	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571954
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