MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 53279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010831	CTGT	2	8	203704	203711	0 %	50 %	25 %	25 %	189499192
4003	NC_010831	ATG	2	6	203825	203830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499192
4004	NC_010831	GAA	2	6	203938	203943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499192
4005	NC_010831	GGGA	2	8	204000	204007	25 %	0 %	75 %	0 %	189499192
4006	NC_010831	AG	3	6	204040	204045	50 %	0 %	50 %	0 %	189499192
4007	NC_010831	ACGA	2	8	204113	204120	50 %	0 %	25 %	25 %	189499192
4008	NC_010831	GAT	2	6	204133	204138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499192
4009	NC_010831	TTCA	2	8	204163	204170	25 %	50 %	0 %	25 %	189499192
4010	NC_010831	GCC	2	6	204176	204181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189499192
4011	NC_010831	ATCCCC	2	12	204188	204199	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189499192
4012	NC_010831	GCAC	2	8	204300	204307	25 %	0 %	25 %	50 %	189499192
4013	NC_010831	TCT	2	6	204345	204350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499192
4014	NC_010831	ACA	2	6	204483	204488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499192
4015	NC_010831	A	6	6	204526	204531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010831	ATG	2	6	204534	204539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_010831	CAA	2	6	204593	204598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_010831	TAC	2	6	204632	204637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_010831	CAT	2	6	204682	204687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499193
4020	NC_010831	AT	3	6	204912	204917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_010831	AGG	2	6	204944	204949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010831	GCG	2	6	205027	205032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499194
4023	NC_010831	T	7	7	205069	205075	0 %	100 %	0 %	0 %	189499194
4024	NC_010831	TCAC	2	8	205080	205087	25 %	25 %	0 %	50 %	189499194
4025	NC_010831	CT	3	6	205095	205100	0 %	50 %	0 %	50 %	189499194
4026	NC_010831	ACT	2	6	205106	205111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499194
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4029	NC_010831	CTT	2	6	205312	205317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499194
4030	NC_010831	TC	3	6	205353	205358	0 %	50 %	0 %	50 %	189499194
4031	NC_010831	GGA	2	6	205381	205386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499194
4032	NC_010831	AGG	2	6	205400	205405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499194
4033	NC_010831	TGA	2	6	205478	205483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499194
4034	NC_010831	TGC	2	6	205607	205612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499194
4035	NC_010831	TCA	2	6	205613	205618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499194
4036	NC_010831	GTC	2	6	205637	205642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499194
4037	NC_010831	AGAA	2	8	205673	205680	75 %	0 %	25 %	0 %	189499194
4038	NC_010831	TTCC	2	8	205785	205792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_010831	TAT	2	6	205809	205814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010831	CTTT	2	8	205841	205848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_010831	TGT	2	6	205858	205863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_010831	TGT	2	6	205868	205873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010831	TTG	2	6	205878	205883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010831	CAA	2	6	205909	205914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_010831	AGC	2	6	205919	205924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_010831	T	6	6	205938	205943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010831	TTG	2	6	206009	206014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010831	GCGGAA	2	12	206068	206079	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189499195
4049	NC_010831	GAC	2	6	206195	206200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499195
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4053	NC_010831	TTA	2	6	206563	206568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499195
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4055	NC_010831	GC	3	6	206642	206647	0 %	0 %	50 %	50 %	189499195
4056	NC_010831	CA	3	6	206661	206666	50 %	0 %	0 %	50 %	189499195
4057	NC_010831	CGA	2	6	206686	206691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499195
4058	NC_010831	CTTG	2	8	206754	206761	0 %	50 %	25 %	25 %	189499195
4059	NC_010831	CAG	2	6	206846	206851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499195
4060	NC_010831	CAG	2	6	206885	206890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499195
4061	NC_010831	TGA	2	6	206923	206928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499195
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4063	NC_010831	AGGC	2	8	206997	207004	25 %	0 %	50 %	25 %	189499195
4064	NC_010831	TTCA	2	8	207024	207031	25 %	50 %	0 %	25 %	189499195
4065	NC_010831	GACA	2	8	207070	207077	50 %	0 %	25 %	25 %	189499195
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4071	NC_010831	T	6	6	207695	207700	0 %	100 %	0 %	0 %	189499196
4072	NC_010831	ATGA	2	8	207766	207773	50 %	25 %	25 %	0 %	189499196
4073	NC_010831	CA	3	6	207791	207796	50 %	0 %	0 %	50 %	189499196
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4076	NC_010831	TTGCCG	2	12	207940	207951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499197
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4081	NC_010831	ACTTTT	2	12	208131	208142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189499197
4082	NC_010831	GAATT	2	10	208171	208180	40 %	40 %	20 %	0 %	189499197
4083	NC_010831	CAG	2	6	208205	208210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499197
4084	NC_010831	GAC	2	6	208254	208259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499197
4085	NC_010831	GAAT	2	8	208279	208286	50 %	25 %	25 %	0 %	189499197
4086	NC_010831	GACA	2	8	208298	208305	50 %	0 %	25 %	25 %	189499197
4087	NC_010831	A	6	6	208400	208405	100 %	0 %	0 %	0 %	189499197
4088	NC_010831	ACA	2	6	208454	208459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_010831	AGCG	2	8	208594	208601	25 %	0 %	50 %	25 %	189499198
4090	NC_010831	C	6	6	208634	208639	0 %	0 %	0 %	100 %	189499198
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4092	NC_010831	GA	3	6	208703	208708	50 %	0 %	50 %	0 %	189499198
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4096	NC_010831	TCA	2	6	208858	208863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499198
4097	NC_010831	ACT	2	6	208941	208946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499198
4098	NC_010831	AT	3	6	209005	209010	50 %	50 %	0 %	0 %	189499198
4099	NC_010831	A	7	7	209048	209054	100 %	0 %	0 %	0 %	189499198
4100	NC_010831	GAT	2	6	209070	209075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499198
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4102	NC_010831	A	8	8	209130	209137	100 %	0 %	0 %	0 %	189499198
4103	NC_010831	CTAA	2	8	209154	209161	50 %	25 %	0 %	25 %	189499198
4104	NC_010831	AAT	2	6	209226	209231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499198
4105	NC_010831	AAT	2	6	209326	209331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499198
4106	NC_010831	T	6	6	209366	209371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010831	TTCCT	2	10	209376	209385	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4108	NC_010831	CAA	2	6	209403	209408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_010831	CAA	2	6	209471	209476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499199
4110	NC_010831	GCT	2	6	209538	209543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499199
4111	NC_010831	CTT	2	6	209544	209549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499199
4112	NC_010831	GCT	2	6	209663	209668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499199
4113	NC_010831	CCG	2	6	209686	209691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189499199
4114	NC_010831	TCAC	2	8	209713	209720	25 %	25 %	0 %	50 %	189499199
4115	NC_010831	AAAAGC	2	12	209754	209765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189499200
4116	NC_010831	AAG	2	6	209790	209795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499200
4117	NC_010831	A	8	8	209958	209965	100 %	0 %	0 %	0 %	189499201
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4119	NC_010831	GGC	2	6	210195	210200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499201
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4121	NC_010831	GAT	2	6	210275	210280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499201
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4123	NC_010831	GCA	2	6	210397	210402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499201
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4125	NC_010831	GC	3	6	210427	210432	0 %	0 %	50 %	50 %	189499201
4126	NC_010831	GGA	2	6	210469	210474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499201
4127	NC_010831	GA	3	6	210506	210511	50 %	0 %	50 %	0 %	189499201
4128	NC_010831	CCGGAT	2	12	210518	210529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189499201
4129	NC_010831	CGG	3	9	210607	210615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499201
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4131	NC_010831	CAG	2	6	210676	210681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499201
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4133	NC_010831	AAGC	2	8	210783	210790	50 %	0 %	25 %	25 %	189499201
4134	NC_010831	CGAA	2	8	210888	210895	50 %	0 %	25 %	25 %	189499201
4135	NC_010831	GA	3	6	210901	210906	50 %	0 %	50 %	0 %	189499201
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4138	NC_010831	ATT	2	6	210944	210949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499201
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4140	NC_010831	GCACG	2	10	211097	211106	20 %	0 %	40 %	40 %	189499201
4141	NC_010831	TGA	2	6	211234	211239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499201
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4143	NC_010831	GC	3	6	211342	211347	0 %	0 %	50 %	50 %	189499201
4144	NC_010831	GAG	2	6	211352	211357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499201
4145	NC_010831	T	9	9	211404	211412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_010831	CTGCC	2	10	211469	211478	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4147	NC_010831	CAG	2	6	211482	211487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_010831	TGA	2	6	211535	211540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_010831	AG	3	6	211557	211562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_010831	GAGT	2	8	211589	211596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_010831	ACC	2	6	211619	211624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4152	NC_010831	AGC	2	6	211625	211630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4153	NC_010831	CGT	2	6	211669	211674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_010831	CAG	2	6	211690	211695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_010831	GTG	2	6	211733	211738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_010831	TCT	2	6	211828	211833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4159	NC_010831	CTT	2	6	211995	212000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_010831	GGC	2	6	212204	212209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4165	NC_010831	CGG	2	6	212332	212337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4166	NC_010831	ATG	2	6	212395	212400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4169	NC_010831	T	8	8	212653	212660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4193	NC_010831	T	7	7	213953	213959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4227	NC_010831	AACA	2	8	215729	215736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4228	NC_010831	ATG	2	6	215751	215756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_010831	AAC	2	6	215838	215843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4232	NC_010831	GAT	2	6	215912	215917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4234	NC_010831	CCGG	2	8	215992	215999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4237	NC_010831	TTG	2	6	216115	216120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_010831	AGG	2	6	216270	216275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4242	NC_010831	GGC	2	6	216358	216363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_010831	GCC	2	6	216398	216403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4245	NC_010831	A	6	6	216507	216512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_010831	TGT	2	6	216580	216585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4248	NC_010831	GGA	2	6	216693	216698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_010831	GCG	2	6	216853	216858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_010831	ATG	2	6	216876	216881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_010831	CTG	2	6	216896	216901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_010831	TTGA	2	8	216903	216910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_010831	ATG	2	6	216930	216935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_010831	ATG	2	6	216956	216961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_010831	TCG	2	6	216994	216999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499206
4256	NC_010831	TCG	2	6	217039	217044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499206
4257	NC_010831	A	6	6	217074	217079	100 %	0 %	0 %	0 %	189499206
4258	NC_010831	TG	3	6	217120	217125	0 %	50 %	50 %	0 %	189499206
4259	NC_010831	CAG	2	6	217179	217184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499206
4260	NC_010831	TCG	2	6	217351	217356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499206
4261	NC_010831	ACG	2	6	217375	217380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499206
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4268	NC_010831	TTCTGC	2	12	217775	217786	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_010831	T	7	7	217807	217813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_010831	CGGG	2	8	217862	217869	0 %	0 %	75 %	25 %	189499207
4271	NC_010831	TGT	2	6	217893	217898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499207
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4277	NC_010831	CCT	2	6	218306	218311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4278	NC_010831	TG	3	6	218400	218405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4279	NC_010831	AATA	2	8	218457	218464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_010831	CTG	2	6	218512	218517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4281	NC_010831	GAAA	2	8	218531	218538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_010831	GTT	2	6	218551	218556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4283	NC_010831	TGCC	2	8	218558	218565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4284	NC_010831	GGA	3	9	218587	218595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4290	NC_010831	CGT	2	6	219244	219249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499209
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4293	NC_010831	GCA	2	6	219425	219430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499209
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4298	NC_010831	GTT	2	6	219861	219866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_010831	TGT	2	6	219882	219887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4302	NC_010831	CCT	2	6	219975	219980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4320	NC_010831	TG	3	6	220748	220753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4321	NC_010831	TGA	2	6	220831	220836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499211
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4349	NC_010831	GAG	2	6	222155	222160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499213
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4377	NC_010831	A	6	6	223296	223301	100 %	0 %	0 %	0 %	189499213
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