MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 53279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010831	TCC	2	6	179755	179760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189499168
3502	NC_010831	T	7	7	179826	179832	0 %	100 %	0 %	0 %	189499169
3503	NC_010831	GCT	2	6	179923	179928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499169
3504	NC_010831	TGC	2	6	179930	179935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499169
3505	NC_010831	CTT	2	6	179965	179970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499169
3506	NC_010831	CTT	2	6	180025	180030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_010831	TTA	2	6	180032	180037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499170
3508	NC_010831	TCAG	2	8	180198	180205	25 %	25 %	25 %	25 %	189499170
3509	NC_010831	TCA	2	6	180246	180251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499170
3510	NC_010831	CAAA	2	8	180286	180293	75 %	0 %	0 %	25 %	189499170
3511	NC_010831	T	6	6	180317	180322	0 %	100 %	0 %	0 %	189499170
3512	NC_010831	TTTCG	2	10	180365	180374	0 %	60 %	20 %	20 %	189499170
3513	NC_010831	CTG	2	6	180406	180411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499170
3514	NC_010831	A	7	7	180620	180626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_010831	TCT	2	6	180633	180638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_010831	T	8	8	180642	180649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_010831	TAT	2	6	180706	180711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_010831	GTT	2	6	180786	180791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_010831	A	6	6	180823	180828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_010831	GCA	3	9	180829	180837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_010831	T	6	6	180854	180859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_010831	T	6	6	180892	180897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_010831	AAT	3	9	180912	180920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_010831	CTCCG	2	10	180940	180949	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3525	NC_010831	CAAAA	2	10	180956	180965	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3526	NC_010831	T	6	6	180985	180990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010831	T	6	6	180993	180998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010831	T	7	7	181007	181013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_010831	TTCC	2	8	181107	181114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_010831	C	6	6	181113	181118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3531	NC_010831	CCTT	2	8	181124	181131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_010831	CGG	2	6	181149	181154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010831	T	7	7	181184	181190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010831	GC	3	6	181223	181228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_010831	TTTTA	2	10	181233	181242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_010831	TCA	2	6	181299	181304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499171
3537	NC_010831	ATA	2	6	181385	181390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499171
3538	NC_010831	A	6	6	181424	181429	100 %	0 %	0 %	0 %	189499171
3539	NC_010831	AG	3	6	181474	181479	50 %	0 %	50 %	0 %	189499171
3540	NC_010831	T	6	6	181630	181635	0 %	100 %	0 %	0 %	189499171
3541	NC_010831	TAC	2	6	181638	181643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499171
3542	NC_010831	CGT	2	6	181647	181652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499171
3543	NC_010831	CCG	2	6	181653	181658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189499171
3544	NC_010831	A	6	6	181676	181681	100 %	0 %	0 %	0 %	189499171
3545	NC_010831	A	6	6	181703	181708	100 %	0 %	0 %	0 %	189499171
3546	NC_010831	GTC	2	6	181769	181774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499171
3547	NC_010831	TA	3	6	181808	181813	50 %	50 %	0 %	0 %	189499171
3548	NC_010831	AGT	2	6	181952	181957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499171
3549	NC_010831	GAT	2	6	181974	181979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499171
3550	NC_010831	TA	3	6	181981	181986	50 %	50 %	0 %	0 %	189499171
3551	NC_010831	CATA	2	8	182046	182053	50 %	25 %	0 %	25 %	189499171
3552	NC_010831	TTC	2	6	182058	182063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499172
3553	NC_010831	ACGGCG	2	12	182073	182084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189499172
3554	NC_010831	AGT	2	6	182149	182154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499172
3555	NC_010831	GA	3	6	182170	182175	50 %	0 %	50 %	0 %	189499172
3556	NC_010831	TCAA	2	8	182197	182204	50 %	25 %	0 %	25 %	189499172
3557	NC_010831	TAT	2	6	182207	182212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499172
3558	NC_010831	TCA	2	6	182236	182241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499172
3559	NC_010831	CG	3	6	182298	182303	0 %	0 %	50 %	50 %	189499172
3560	NC_010831	GC	3	6	182310	182315	0 %	0 %	50 %	50 %	189499172
3561	NC_010831	TTGA	2	8	182316	182323	25 %	50 %	25 %	0 %	189499172
3562	NC_010831	TCT	2	6	182335	182340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499172
3563	NC_010831	CT	3	6	182344	182349	0 %	50 %	0 %	50 %	189499172
3564	NC_010831	CCA	2	6	182402	182407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189499172
3565	NC_010831	A	6	6	182427	182432	100 %	0 %	0 %	0 %	189499172
3566	NC_010831	ACGC	2	8	182445	182452	25 %	0 %	25 %	50 %	189499172
3567	NC_010831	AGCG	2	8	182557	182564	25 %	0 %	50 %	25 %	189499172
3568	NC_010831	AGTT	2	8	182579	182586	25 %	50 %	25 %	0 %	189499172
3569	NC_010831	TGA	2	6	182624	182629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499172
3570	NC_010831	ATT	2	6	182662	182667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010831	T	6	6	182698	182703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010831	TCAA	2	8	182715	182722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_010831	TCCA	2	8	182732	182739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_010831	T	7	7	182761	182767	0 %	100 %	0 %	0 %	189499173
3575	NC_010831	T	7	7	182929	182935	0 %	100 %	0 %	0 %	189499173
3576	NC_010831	CCA	2	6	183116	183121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189499173
3577	NC_010831	TCA	2	6	183122	183127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499173
3578	NC_010831	CT	3	6	183158	183163	0 %	50 %	0 %	50 %	189499173
3579	NC_010831	TCAATT	2	12	183251	183262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189499173
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3584	NC_010831	CTT	2	6	183438	183443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499173
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3591	NC_010831	CCA	2	6	183726	183731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189499173
3592	NC_010831	GTCG	2	8	183754	183761	0 %	25 %	50 %	25 %	189499173
3593	NC_010831	TACA	2	8	183823	183830	50 %	25 %	0 %	25 %	189499173
3594	NC_010831	TTG	2	6	183869	183874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499173
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3597	NC_010831	AAT	2	6	184129	184134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499173
3598	NC_010831	GAT	2	6	184147	184152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499173
3599	NC_010831	GAT	2	6	184176	184181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499173
3600	NC_010831	TA	3	6	184186	184191	50 %	50 %	0 %	0 %	189499173
3601	NC_010831	TGGA	2	8	184218	184225	25 %	25 %	50 %	0 %	189499173
3602	NC_010831	TG	3	6	184239	184244	0 %	50 %	50 %	0 %	189499173
3603	NC_010831	GGA	2	6	184274	184279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499173
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3607	NC_010831	T	6	6	184474	184479	0 %	100 %	0 %	0 %	189499173
3608	NC_010831	CGT	2	6	184497	184502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499173
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3610	NC_010831	AAT	2	6	184612	184617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499173
3611	NC_010831	GAC	2	6	184655	184660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499173
3612	NC_010831	AGAA	2	8	184666	184673	75 %	0 %	25 %	0 %	189499173
3613	NC_010831	TTC	2	6	184696	184701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499173
3614	NC_010831	AAT	2	6	184719	184724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499173
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3616	NC_010831	GCTTG	2	10	184815	184824	0 %	40 %	40 %	20 %	189499173
3617	NC_010831	TCA	2	6	184919	184924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499173
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3619	NC_010831	CCA	2	6	184943	184948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189499173
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3622	NC_010831	ACCA	2	8	185041	185048	50 %	0 %	0 %	50 %	189499173
3623	NC_010831	CTT	2	6	185244	185249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_010831	AT	3	6	185258	185263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_010831	T	6	6	185276	185281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_010831	ATC	2	6	185350	185355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3997	NC_010831	GTT	2	6	203421	203426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_010831	CAGA	2	8	203439	203446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3999	NC_010831	TAC	2	6	203475	203480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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