MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 53279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010831	TGA	2	6	48706	48711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499045
1002	NC_010831	T	6	6	48737	48742	0 %	100 %	0 %	0 %	189499045
1003	NC_010831	GCT	2	6	48746	48751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499045
1004	NC_010831	AT	3	6	48957	48962	50 %	50 %	0 %	0 %	189499046
1005	NC_010831	CAG	2	6	48975	48980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499046
1006	NC_010831	GT	3	6	49007	49012	0 %	50 %	50 %	0 %	189499046
1007	NC_010831	TGGT	2	8	49155	49162	0 %	50 %	50 %	0 %	189499046
1008	NC_010831	ATG	2	6	49181	49186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499046
1009	NC_010831	TAA	2	6	49221	49226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499046
1010	NC_010831	GTT	2	6	49261	49266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499046
1011	NC_010831	AGA	2	6	49281	49286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499046
1012	NC_010831	TAAGTG	2	12	49295	49306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499046
1013	NC_010831	AAG	2	6	49346	49351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499046
1014	NC_010831	ACA	2	6	49378	49383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499046
1015	NC_010831	GTT	2	6	49386	49391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499046
1016	NC_010831	TGAA	2	8	49397	49404	50 %	25 %	25 %	0 %	189499046
1017	NC_010831	AGTA	2	8	49426	49433	50 %	25 %	25 %	0 %	189499046
1018	NC_010831	TA	3	6	49447	49452	50 %	50 %	0 %	0 %	189499046
1019	NC_010831	TTG	2	6	49517	49522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499046
1020	NC_010831	A	6	6	49534	49539	100 %	0 %	0 %	0 %	189499046
1021	NC_010831	GAT	2	6	49597	49602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499046
1022	NC_010831	TTG	2	6	49607	49612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499046
1023	NC_010831	GATGGT	2	12	49627	49638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	189499046
1024	NC_010831	GTT	2	6	49651	49656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499046
1025	NC_010831	GGAAGT	2	12	49678	49689	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189499046
1026	NC_010831	AAGG	2	8	49721	49728	50 %	0 %	50 %	0 %	189499046
1027	NC_010831	TTTA	2	8	49808	49815	25 %	75 %	0 %	0 %	189499046
1028	NC_010831	TGT	2	6	49840	49845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499046
1029	NC_010831	A	6	6	49886	49891	100 %	0 %	0 %	0 %	189499046
1030	NC_010831	T	6	6	49924	49929	0 %	100 %	0 %	0 %	189499047
1031	NC_010831	GA	3	6	49951	49956	50 %	0 %	50 %	0 %	189499047
1032	NC_010831	TGG	2	6	50001	50006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499047
1033	NC_010831	T	6	6	50008	50013	0 %	100 %	0 %	0 %	189499047
1034	NC_010831	TCA	2	6	50015	50020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499047
1035	NC_010831	GAAAA	2	10	50024	50033	80 %	0 %	20 %	0 %	189499047
1036	NC_010831	AAT	2	6	50161	50166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499047
1037	NC_010831	ACATC	2	10	50192	50201	40 %	20 %	0 %	40 %	189499047
1038	NC_010831	TTATA	2	10	50282	50291	40 %	60 %	0 %	0 %	189499047
1039	NC_010831	A	6	6	50340	50345	100 %	0 %	0 %	0 %	189499047
1040	NC_010831	ATGG	2	8	50355	50362	25 %	25 %	50 %	0 %	189499047
1041	NC_010831	ACT	2	6	50366	50371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499047
1042	NC_010831	A	6	6	50402	50407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010831	A	6	6	50428	50433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010831	TGC	2	6	50556	50561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499048
1045	NC_010831	GGC	2	6	50577	50582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499048
1046	NC_010831	GCA	2	6	50624	50629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010831	CTT	2	6	50766	50771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_010831	TC	3	6	50798	50803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_010831	T	6	6	50832	50837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010831	CAC	2	6	50844	50849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_010831	CAA	2	6	50855	50860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010831	TGA	2	6	50998	51003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010831	TAT	2	6	51030	51035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010831	TCAT	2	8	51142	51149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_010831	CGA	2	6	51157	51162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010831	TTG	2	6	51356	51361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010831	AAC	2	6	51496	51501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010831	TCTTT	2	10	51586	51595	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_010831	CAC	2	6	51617	51622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_010831	TGAT	2	8	51627	51634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010831	CAA	2	6	51641	51646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010831	ATC	2	6	51726	51731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010831	GAC	2	6	51841	51846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010831	T	6	6	51876	51881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010831	AC	3	6	51913	51918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_010831	ATC	2	6	51977	51982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010831	AT	3	6	52010	52015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010831	CAT	2	6	52029	52034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010831	ATG	2	6	52112	52117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010831	A	6	6	52129	52134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010831	ACT	2	6	52248	52253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499049
1072	NC_010831	GTGA	2	8	52266	52273	25 %	25 %	50 %	0 %	189499049
1073	NC_010831	AAT	2	6	52368	52373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499049
1074	NC_010831	GAAA	2	8	52413	52420	75 %	0 %	25 %	0 %	189499049
1075	NC_010831	GA	3	6	52455	52460	50 %	0 %	50 %	0 %	189499049
1076	NC_010831	GAA	2	6	52467	52472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499049
1077	NC_010831	GTAT	2	8	52507	52514	25 %	50 %	25 %	0 %	189499049
1078	NC_010831	GAA	2	6	52602	52607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499049
1079	NC_010831	A	6	6	52613	52618	100 %	0 %	0 %	0 %	189499049
1080	NC_010831	A	6	6	52627	52632	100 %	0 %	0 %	0 %	189499049
1081	NC_010831	ATA	2	6	52639	52644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499049
1082	NC_010831	GAATT	2	10	52695	52704	40 %	40 %	20 %	0 %	189499049
1083	NC_010831	GATA	2	8	52799	52806	50 %	25 %	25 %	0 %	189499049
1084	NC_010831	AT	3	6	52898	52903	50 %	50 %	0 %	0 %	189499049
1085	NC_010831	ATA	2	6	52925	52930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499049
1086	NC_010831	A	6	6	52939	52944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010831	TAA	2	6	52964	52969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010831	A	7	7	52968	52974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010831	TCA	2	6	52986	52991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_010831	GTC	2	6	53013	53018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010831	T	6	6	53095	53100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010831	AAT	2	6	53111	53116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010831	GCG	2	6	53149	53154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010831	TGA	2	6	53274	53279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010831	ATT	2	6	53320	53325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010831	CTG	3	9	53353	53361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499050
1097	NC_010831	GAT	2	6	53381	53386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499050
1098	NC_010831	ACC	2	6	53529	53534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189499050
1099	NC_010831	ACC	2	6	53577	53582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_010831	CAAA	2	8	53649	53656	75 %	0 %	0 %	25 %	189499051
1101	NC_010831	ACA	2	6	53671	53676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499051
1102	NC_010831	CTT	2	6	53810	53815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499051
1103	NC_010831	GCTGA	2	10	53837	53846	20 %	20 %	40 %	20 %	189499051
1104	NC_010831	CGCCA	2	10	53853	53862	20 %	0 %	20 %	60 %	189499051
1105	NC_010831	GAC	2	6	53876	53881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1106	NC_010831	TC	3	6	53893	53898	0 %	50 %	0 %	50 %	189499051
1107	NC_010831	GAA	2	6	53963	53968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499051
1108	NC_010831	AAC	3	9	53976	53984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499051
1109	NC_010831	CTGC	2	8	54010	54017	0 %	25 %	25 %	50 %	189499051
1110	NC_010831	CAG	2	6	54035	54040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1111	NC_010831	CAT	2	6	54065	54070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499051
1112	NC_010831	TAT	2	6	54116	54121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499051
1113	NC_010831	CCCTG	2	10	54168	54177	0 %	20 %	20 %	60 %	189499051
1114	NC_010831	GGC	2	6	54263	54268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499051
1115	NC_010831	ATA	2	6	54291	54296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499051
1116	NC_010831	GTC	2	6	54305	54310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1117	NC_010831	CCAAA	2	10	54402	54411	60 %	0 %	0 %	40 %	189499051
1118	NC_010831	CAG	2	6	54452	54457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1119	NC_010831	TGC	2	6	54463	54468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1120	NC_010831	AACG	2	8	54539	54546	50 %	0 %	25 %	25 %	189499051
1121	NC_010831	AAG	2	6	54665	54670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499051
1122	NC_010831	ATG	2	6	54753	54758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499051
1123	NC_010831	TCT	2	6	54774	54779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499051
1124	NC_010831	GCGT	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	189499051
1125	NC_010831	CCT	2	6	54874	54879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189499051
1126	NC_010831	GTC	2	6	54947	54952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1127	NC_010831	ATG	2	6	54993	54998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499051
1128	NC_010831	GCT	2	6	55009	55014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499051
1129	NC_010831	CGTAT	2	10	55089	55098	20 %	40 %	20 %	20 %	189499051
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1131	NC_010831	AGA	2	6	55147	55152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499051
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1252	NC_010831	TGCA	2	8	60676	60683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1261	NC_010831	CAC	2	6	61102	61107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_010831	CGC	2	6	61123	61128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1264	NC_010831	TCA	2	6	61207	61212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1394	NC_010831	GTA	2	6	68102	68107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499066
1395	NC_010831	TGG	2	6	68185	68190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499066
1396	NC_010831	CGA	2	6	68191	68196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1397	NC_010831	CCT	2	6	68224	68229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189499066
1398	NC_010831	TTC	2	6	68243	68248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499066
1399	NC_010831	CAG	2	6	68297	68302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1400	NC_010831	AGC	2	6	68303	68308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1401	NC_010831	GAT	2	6	68342	68347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499066
1402	NC_010831	AGA	2	6	68422	68427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499066
1403	NC_010831	AG	4	8	68472	68479	50 %	0 %	50 %	0 %	189499066
1404	NC_010831	CTG	2	6	68495	68500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1405	NC_010831	AGC	2	6	68528	68533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1406	NC_010831	AGC	2	6	68661	68666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1407	NC_010831	AGC	2	6	68730	68735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499066
1408	NC_010831	CTG	2	6	68738	68743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499066
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1413	NC_010831	GCC	3	9	68909	68917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189499066
1414	NC_010831	TCCC	2	8	68940	68947	0 %	25 %	0 %	75 %	189499066
1415	NC_010831	GTTC	2	8	69055	69062	0 %	50 %	25 %	25 %	189499066
1416	NC_010831	TTTC	2	8	69071	69078	0 %	75 %	0 %	25 %	189499066
1417	NC_010831	TGTCTT	2	12	69121	69132	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189499066
1418	NC_010831	ATT	2	6	69158	69163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499066
1419	NC_010831	CTT	2	6	69176	69181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499066
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1422	NC_010831	GTC	2	6	69526	69531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499067
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1424	NC_010831	AGC	2	6	69615	69620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499067
1425	NC_010831	GGA	2	6	69645	69650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499067
1426	NC_010831	TCGA	2	8	69879	69886	25 %	25 %	25 %	25 %	189499067
1427	NC_010831	CAG	2	6	70079	70084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499067
1428	NC_010831	TGA	2	6	70103	70108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499067
1429	NC_010831	GCA	2	6	70183	70188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499067
1430	NC_010831	TCGG	2	8	70194	70201	0 %	25 %	50 %	25 %	189499067
1431	NC_010831	TGC	2	6	70240	70245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499067
1432	NC_010831	CT	3	6	70257	70262	0 %	50 %	0 %	50 %	189499067
1433	NC_010831	GTG	2	6	70415	70420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_010831	GTTA	2	8	70547	70554	25 %	50 %	25 %	0 %	189499068
1435	NC_010831	GTG	2	6	70626	70631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499068
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1438	NC_010831	CTTTT	2	10	70736	70745	0 %	80 %	0 %	20 %	189499068
1439	NC_010831	ATC	2	6	70779	70784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499068
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1441	NC_010831	CAT	2	6	70980	70985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499068
1442	NC_010831	AGG	2	6	70987	70992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499068
1443	NC_010831	GCT	2	6	71048	71053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499068
1444	NC_010831	TATGA	2	10	71109	71118	40 %	40 %	20 %	0 %	189499068
1445	NC_010831	GTT	2	6	71157	71162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499068
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1448	NC_010831	GACC	2	8	71405	71412	25 %	0 %	25 %	50 %	189499068
1449	NC_010831	A	6	6	71415	71420	100 %	0 %	0 %	0 %	189499068
1450	NC_010831	TTGC	2	8	71421	71428	0 %	50 %	25 %	25 %	189499068
1451	NC_010831	CTGT	2	8	71439	71446	0 %	50 %	25 %	25 %	189499068
1452	NC_010831	TGC	2	6	71464	71469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499068
1453	NC_010831	T	6	6	71502	71507	0 %	100 %	0 %	0 %	189499068
1454	NC_010831	CAT	2	6	71513	71518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499068
1455	NC_010831	G	6	6	71604	71609	0 %	0 %	100 %	0 %	189499068
1456	NC_010831	CGT	2	6	71653	71658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499068
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1459	NC_010831	TGT	2	6	71783	71788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499068
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1461	NC_010831	GCT	2	6	71798	71803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499068
1462	NC_010831	G	6	6	71824	71829	0 %	0 %	100 %	0 %	189499068
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1465	NC_010831	T	6	6	71934	71939	0 %	100 %	0 %	0 %	189499068
1466	NC_010831	TGC	3	9	72028	72036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499068
1467	NC_010831	TCA	2	6	72127	72132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499068
1468	NC_010831	ATG	2	6	72148	72153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499068
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1477	NC_010831	CGT	2	6	72637	72642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499068
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1481	NC_010831	CTG	2	6	72884	72889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499069
1482	NC_010831	TCT	2	6	72904	72909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499069
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1484	NC_010831	CGCTGC	2	12	72958	72969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189499069
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1492	NC_010831	GGA	2	6	73560	73565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499070
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1496	NC_010831	GT	3	6	73735	73740	0 %	50 %	50 %	0 %	189499071
1497	NC_010831	TCAG	2	8	73763	73770	25 %	25 %	25 %	25 %	189499071
1498	NC_010831	TC	3	6	73778	73783	0 %	50 %	0 %	50 %	189499071
1499	NC_010831	CT	3	6	73839	73844	0 %	50 %	0 %	50 %	189499071
1500	NC_010831	TGG	2	6	73852	73857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499071

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