MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 53279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_010831	CCTT	2	8	2721409	2721416	0 %	50 %	0 %	50 %	189501453
53002	NC_010831	CTT	2	6	2721426	2721431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501453
53003	NC_010831	AAAT	2	8	2721464	2721471	75 %	25 %	0 %	0 %	189501453
53004	NC_010831	TAC	2	6	2721510	2721515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501453
53005	NC_010831	TTC	2	6	2721537	2721542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501453
53006	NC_010831	CGC	2	6	2721633	2721638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189501454
53007	NC_010831	C	6	6	2721638	2721643	0 %	0 %	0 %	100 %	189501454
53008	NC_010831	CTG	2	6	2721688	2721693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501454
53009	NC_010831	CTG	2	6	2721727	2721732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501454
53010	NC_010831	CAGA	2	8	2721781	2721788	50 %	0 %	25 %	25 %	189501454
53011	NC_010831	TCA	2	6	2721842	2721847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501454
53012	NC_010831	GTT	2	6	2722023	2722028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501454
53013	NC_010831	TGA	2	6	2722062	2722067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501454
53014	NC_010831	CGTT	2	8	2722173	2722180	0 %	50 %	25 %	25 %	189501454
53015	NC_010831	T	6	6	2722179	2722184	0 %	100 %	0 %	0 %	189501454
53016	NC_010831	T	6	6	2722328	2722333	0 %	100 %	0 %	0 %	189501454
53017	NC_010831	CTTT	2	8	2722358	2722365	0 %	75 %	0 %	25 %	189501454
53018	NC_010831	CCT	2	6	2722473	2722478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53019	NC_010831	ACC	2	6	2722480	2722485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53020	NC_010831	GAA	2	6	2722559	2722564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53021	NC_010831	AAGT	2	8	2722581	2722588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53022	NC_010831	CTG	2	6	2722617	2722622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501455
53023	NC_010831	CCA	2	6	2722652	2722657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501455
53024	NC_010831	TCCTCT	2	12	2722708	2722719	0 %	50 %	0 %	50 %	189501455
53025	NC_010831	CT	3	6	2722818	2722823	0 %	50 %	0 %	50 %	189501455
53026	NC_010831	AAAC	2	8	2722883	2722890	75 %	0 %	0 %	25 %	189501455
53027	NC_010831	TTC	2	6	2723055	2723060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501455
53028	NC_010831	TCTG	2	8	2723069	2723076	0 %	50 %	25 %	25 %	189501455
53029	NC_010831	GAACA	2	10	2723100	2723109	60 %	0 %	20 %	20 %	189501455
53030	NC_010831	AAC	3	9	2723118	2723126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501455
53031	NC_010831	CCA	2	6	2723159	2723164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501455
53032	NC_010831	GGA	2	6	2723200	2723205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501455
53033	NC_010831	CGC	2	6	2723207	2723212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189501455
53034	NC_010831	ACG	2	6	2723287	2723292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501455
53035	NC_010831	TCA	2	6	2723303	2723308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501455
53036	NC_010831	CAC	2	6	2723350	2723355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501455
53037	NC_010831	CG	3	6	2723362	2723367	0 %	0 %	50 %	50 %	189501455
53038	NC_010831	CTTC	2	8	2723462	2723469	0 %	50 %	0 %	50 %	189501455
53039	NC_010831	CCG	2	6	2723488	2723493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189501455
53040	NC_010831	T	6	6	2723592	2723597	0 %	100 %	0 %	0 %	189501455
53041	NC_010831	AGAT	2	8	2723626	2723633	50 %	25 %	25 %	0 %	189501455
53042	NC_010831	CAG	2	6	2723706	2723711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501455
53043	NC_010831	CGG	2	6	2723722	2723727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189501455
53044	NC_010831	GGC	2	6	2723856	2723861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189501455
53045	NC_010831	CCT	2	6	2723915	2723920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189501455
53046	NC_010831	CAC	2	6	2723952	2723957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501455
53047	NC_010831	GCG	2	6	2723988	2723993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189501455
53048	NC_010831	ATC	3	9	2724003	2724011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501455
53049	NC_010831	TTC	2	6	2724030	2724035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501455
53050	NC_010831	CGCTG	2	10	2724147	2724156	0 %	20 %	40 %	40 %	189501455
53051	NC_010831	T	7	7	2724197	2724203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53052	NC_010831	T	6	6	2724232	2724237	0 %	100 %	0 %	0 %	189501456
53053	NC_010831	AAT	2	6	2724319	2724324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501456
53054	NC_010831	GAC	2	6	2724398	2724403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501456
53055	NC_010831	TGC	2	6	2724420	2724425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501456
53056	NC_010831	C	6	6	2724639	2724644	0 %	0 %	0 %	100 %	189501457
53057	NC_010831	CTG	2	6	2724648	2724653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501457
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53059	NC_010831	TC	3	6	2724728	2724733	0 %	50 %	0 %	50 %	189501457
53060	NC_010831	CAGCC	2	10	2724739	2724748	20 %	0 %	20 %	60 %	189501457
53061	NC_010831	CGA	2	6	2724753	2724758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501457
53062	NC_010831	CTG	2	6	2724848	2724853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501457
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53070	NC_010831	CA	3	6	2725228	2725233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53071	NC_010831	GTA	2	6	2725265	2725270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_010831	AAC	2	6	2725282	2725287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53073	NC_010831	ATT	2	6	2725319	2725324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_010831	AAAAC	2	10	2725339	2725348	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53075	NC_010831	GTG	2	6	2725398	2725403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53085	NC_010831	CT	3	6	2726031	2726036	0 %	50 %	0 %	50 %	189501459
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53094	NC_010831	CAA	2	6	2726369	2726374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501459
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53099	NC_010831	TGA	2	6	2726711	2726716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501459
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53103	NC_010831	ATG	2	6	2726833	2726838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501459
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53106	NC_010831	GAT	2	6	2727087	2727092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501459
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53118	NC_010831	CGA	2	6	2727929	2727934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501460
53119	NC_010831	TCG	2	6	2728141	2728146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501460
53120	NC_010831	ACGC	2	8	2728155	2728162	25 %	0 %	25 %	50 %	189501460
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53123	NC_010831	CTGC	2	8	2728384	2728391	0 %	25 %	25 %	50 %	189501460
53124	NC_010831	TCCC	2	8	2728402	2728409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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53132	NC_010831	GCAA	2	8	2728877	2728884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53133	NC_010831	AAT	2	6	2728889	2728894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53135	NC_010831	TGT	2	6	2728946	2728951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53143	NC_010831	TGA	2	6	2729467	2729472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501462
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53148	NC_010831	CCCG	2	8	2729845	2729852	0 %	0 %	25 %	75 %	189501462
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53153	NC_010831	A	6	6	2730218	2730223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53154	NC_010831	ATAG	2	8	2730252	2730259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53155	NC_010831	CAA	2	6	2730279	2730284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53156	NC_010831	GGC	2	6	2730379	2730384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189501463
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53225	NC_010831	TCC	2	6	2733780	2733785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189501466
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53233	NC_010831	TCT	2	6	2734125	2734130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501466
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53235	NC_010831	TCA	3	9	2734382	2734390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501466
53236	NC_010831	T	7	7	2734394	2734400	0 %	100 %	0 %	0 %	189501466
53237	NC_010831	CAT	2	6	2734479	2734484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501466
53238	NC_010831	T	6	6	2734533	2734538	0 %	100 %	0 %	0 %	189501466
53239	NC_010831	TTC	2	6	2734576	2734581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501466
53240	NC_010831	TCT	2	6	2734599	2734604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501466
53241	NC_010831	A	7	7	2734667	2734673	100 %	0 %	0 %	0 %	189501466
53242	NC_010831	CT	3	6	2734717	2734722	0 %	50 %	0 %	50 %	189501466
53243	NC_010831	GAG	2	6	2734775	2734780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501466
53244	NC_010831	TTC	2	6	2734918	2734923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501466
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53254	NC_010831	AGC	2	6	2735232	2735237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501467
53255	NC_010831	GA	3	6	2735239	2735244	50 %	0 %	50 %	0 %	189501467
53256	NC_010831	TTCG	2	8	2735432	2735439	0 %	50 %	25 %	25 %	189501468
53257	NC_010831	CT	3	6	2735536	2735541	0 %	50 %	0 %	50 %	189501468
53258	NC_010831	CAA	2	6	2735595	2735600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501468
53259	NC_010831	TGC	2	6	2735628	2735633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501468
53260	NC_010831	GCTCAA	2	12	2735637	2735648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189501468
53261	NC_010831	GCG	2	6	2735649	2735654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189501468
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53263	NC_010831	CTGC	2	8	2735806	2735813	0 %	25 %	25 %	50 %	189501469
53264	NC_010831	CTG	2	6	2735828	2735833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501469
53265	NC_010831	GGA	2	6	2735866	2735871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501469
53266	NC_010831	AAT	2	6	2735872	2735877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501469
53267	NC_010831	CTC	2	6	2735974	2735979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53268	NC_010831	ATC	2	6	2736029	2736034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53269	NC_010831	T	6	6	2736071	2736076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53270	NC_010831	TTG	2	6	2736127	2736132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53272	NC_010831	C	8	8	2736146	2736153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53273	NC_010831	ACAA	2	8	2736199	2736206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53274	NC_010831	ATCA	2	8	2736223	2736230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53275	NC_010831	ACA	2	6	2736236	2736241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53276	NC_010831	CTT	2	6	2736264	2736269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53277	NC_010831	GA	4	8	2736283	2736290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53278	NC_010831	T	6	6	2736291	2736296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53279	NC_010831	TGA	2	6	2736353	2736358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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