MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 44489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010830	TA	3	6	170986	170991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010830	T	7	7	171042	171048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_010830	CAA	2	6	171067	171072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_010830	TA	3	6	171180	171185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010830	TTAC	2	8	171189	171196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_010830	TTAA	2	8	171204	171211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010830	TTC	2	6	171243	171248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_010830	T	6	6	171273	171278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010830	AGC	2	6	171310	171315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010830	ATA	2	6	171372	171377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010830	TCC	2	6	171385	171390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_010830	T	7	7	171396	171402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_010830	TAA	2	6	171428	171433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010830	TCT	2	6	171436	171441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_010830	A	6	6	171447	171452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010830	AAG	2	6	171466	171471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_010830	ATA	2	6	171486	171491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010830	GTA	2	6	171499	171504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_010830	TAA	2	6	171554	171559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010830	T	6	6	171564	171569	0 %	100 %	0 %	0 %	189501609
4021	NC_010830	AGC	2	6	171622	171627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501609
4022	NC_010830	TCTG	2	8	171645	171652	0 %	50 %	25 %	25 %	189501609
4023	NC_010830	TCT	2	6	171721	171726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501609
4024	NC_010830	ATA	2	6	171748	171753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501609
4025	NC_010830	CTT	2	6	171768	171773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501609
4026	NC_010830	TAA	2	6	171827	171832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501609
4027	NC_010830	GTC	2	6	171897	171902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501609
4028	NC_010830	CTA	2	6	171905	171910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501609
4029	NC_010830	TCT	2	6	171964	171969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501609
4030	NC_010830	GATA	2	8	171984	171991	50 %	25 %	25 %	0 %	189501609
4031	NC_010830	CTA	2	6	172028	172033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501609
4032	NC_010830	AAGT	2	8	172043	172050	50 %	25 %	25 %	0 %	189501609
4033	NC_010830	CTT	2	6	172082	172087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501609
4034	NC_010830	GCA	2	6	172114	172119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501609
4035	NC_010830	TCT	2	6	172138	172143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501609
4036	NC_010830	GAAG	2	8	172204	172211	50 %	0 %	50 %	0 %	189501609
4037	NC_010830	TCA	2	6	172231	172236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501609
4038	NC_010830	AG	3	6	172248	172253	50 %	0 %	50 %	0 %	189501609
4039	NC_010830	TGA	2	6	172282	172287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501609
4040	NC_010830	AT	3	6	172423	172428	50 %	50 %	0 %	0 %	189501609
4041	NC_010830	TA	3	6	172443	172448	50 %	50 %	0 %	0 %	189501609
4042	NC_010830	AGC	2	6	172476	172481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501609
4043	NC_010830	TTA	2	6	172537	172542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501609
4044	NC_010830	TTG	2	6	172581	172586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501609
4045	NC_010830	TAT	2	6	172620	172625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501609
4046	NC_010830	TAAA	2	8	172665	172672	75 %	25 %	0 %	0 %	189501609
4047	NC_010830	CAG	2	6	172736	172741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501609
4048	NC_010830	TAA	2	6	172832	172837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501609
4049	NC_010830	T	6	6	172877	172882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010830	ATT	2	6	172896	172901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010830	TA	3	6	172925	172930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010830	TAG	2	6	172951	172956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010830	AC	3	6	173011	173016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_010830	ACCA	2	8	173028	173035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_010830	CTT	2	6	173099	173104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_010830	CTT	2	6	173106	173111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_010830	TCT	2	6	173154	173159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501610
4058	NC_010830	CTT	2	6	173164	173169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501610
4059	NC_010830	ATG	2	6	173181	173186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501610
4060	NC_010830	CTG	2	6	173188	173193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501610
4061	NC_010830	TTG	2	6	173196	173201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501610
4062	NC_010830	TCA	2	6	173226	173231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501610
4063	NC_010830	GTT	2	6	173240	173245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501610
4064	NC_010830	TCAA	2	8	173253	173260	50 %	25 %	0 %	25 %	189501610
4065	NC_010830	TA	4	8	173416	173423	50 %	50 %	0 %	0 %	189501610
4066	NC_010830	ATA	3	9	173421	173429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501610
4067	NC_010830	TAA	2	6	173444	173449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501610
4068	NC_010830	TCA	2	6	173520	173525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501610
4069	NC_010830	ATT	2	6	173570	173575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501610
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4071	NC_010830	TAT	2	6	173683	173688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501610
4072	NC_010830	TCT	2	6	173742	173747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501610
4073	NC_010830	AAT	2	6	173804	173809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501610
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4075	NC_010830	CCAG	2	8	173907	173914	25 %	0 %	25 %	50 %	189501610
4076	NC_010830	TA	3	6	173950	173955	50 %	50 %	0 %	0 %	189501610
4077	NC_010830	TA	3	6	173966	173971	50 %	50 %	0 %	0 %	189501610
4078	NC_010830	TAA	2	6	174011	174016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501610
4079	NC_010830	TCTAGC	2	12	174057	174068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189501610
4080	NC_010830	TAA	2	6	174073	174078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501610
4081	NC_010830	AAG	2	6	174135	174140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501610
4082	NC_010830	TA	3	6	174202	174207	50 %	50 %	0 %	0 %	189501610
4083	NC_010830	AGA	2	6	174212	174217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501610
4084	NC_010830	TTTC	2	8	174273	174280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_010830	AGT	2	6	174292	174297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_010830	TAA	2	6	174360	174365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_010830	AAAT	2	8	174423	174430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_010830	TAA	2	6	174452	174457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_010830	A	6	6	174456	174461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010830	TA	3	6	174465	174470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010830	CAA	2	6	174489	174494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_010830	ATC	2	6	174559	174564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_010830	ATT	2	6	174570	174575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010830	TAAC	2	8	174578	174585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_010830	TTC	2	6	174610	174615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501611
4096	NC_010830	TTA	2	6	174623	174628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501611
4097	NC_010830	GAA	2	6	174656	174661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501611
4098	NC_010830	AG	3	6	174762	174767	50 %	0 %	50 %	0 %	189501611
4099	NC_010830	CTC	2	6	174775	174780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189501611
4100	NC_010830	CT	3	6	174912	174917	0 %	50 %	0 %	50 %	189501611
4101	NC_010830	AAT	2	6	175057	175062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501611
4102	NC_010830	AGC	2	6	175105	175110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501611
4103	NC_010830	TTC	2	6	175135	175140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501611
4104	NC_010830	AAT	2	6	175207	175212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501611
4105	NC_010830	C	6	6	175219	175224	0 %	0 %	0 %	100 %	189501611
4106	NC_010830	AAT	2	6	175289	175294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501611
4107	NC_010830	T	6	6	175323	175328	0 %	100 %	0 %	0 %	189501611
4108	NC_010830	ATC	2	6	175384	175389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501611
4109	NC_010830	AGA	2	6	175435	175440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501611
4110	NC_010830	TC	3	6	175452	175457	0 %	50 %	0 %	50 %	189501611
4111	NC_010830	CTT	2	6	175554	175559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501611
4112	NC_010830	CTG	2	6	175566	175571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501611
4113	NC_010830	TAA	3	9	175578	175586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501611
4114	NC_010830	AGA	2	6	175609	175614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501611
4115	NC_010830	TAA	2	6	175624	175629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501611
4116	NC_010830	CTGC	2	8	175706	175713	0 %	25 %	25 %	50 %	189501611
4117	NC_010830	CAGA	2	8	175728	175735	50 %	0 %	25 %	25 %	189501611
4118	NC_010830	TTA	2	6	175745	175750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501611
4119	NC_010830	GAA	2	6	175941	175946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501611
4120	NC_010830	T	6	6	175954	175959	0 %	100 %	0 %	0 %	189501611
4121	NC_010830	TAA	2	6	176124	176129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501611
4122	NC_010830	CAT	2	6	176222	176227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_010830	CTT	3	9	176237	176245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_010830	T	7	7	176266	176272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_010830	TTTTCT	2	12	176300	176311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4126	NC_010830	A	6	6	176329	176334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_010830	TAT	2	6	176404	176409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_010830	TC	4	8	181509	181516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_010830	A	6	6	181617	181622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_010830	ACAAA	2	10	181633	181642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4262	NC_010830	A	6	6	181640	181645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_010830	AAG	2	6	181700	181705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_010830	CAA	2	6	181765	181770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_010830	AAATA	2	10	181792	181801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4267	NC_010830	TATTTT	2	12	181869	181880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_010830	TA	3	6	181888	181893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_010830	TACA	2	8	181897	181904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4270	NC_010830	TA	4	8	181977	181984	50 %	50 %	0 %	0 %	189501617
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4275	NC_010830	ACT	2	6	182313	182318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501617
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4293	NC_010830	AAT	2	6	183368	183373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501617
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4342	NC_010830	ATC	2	6	185430	185435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501617
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4357	NC_010830	ATGCTG	2	12	186192	186203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189501617
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4367	NC_010830	AT	3	6	186408	186413	50 %	50 %	0 %	0 %	294661110
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4371	NC_010830	A	6	6	186555	186560	100 %	0 %	0 %	0 %	294661110
4372	NC_010830	CTG	2	6	186659	186664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294661110
4373	NC_010830	GCTT	2	8	186671	186678	0 %	50 %	25 %	25 %	294661110
4374	NC_010830	CATG	2	8	186730	186737	25 %	25 %	25 %	25 %	294661110
4375	NC_010830	TGCT	2	8	186744	186751	0 %	50 %	25 %	25 %	294661110
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