MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 44489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010830	AT	3	6	21110	21115	50 %	50 %	0 %	0 %	189501485
502	NC_010830	CAAC	2	8	21126	21133	50 %	0 %	0 %	50 %	189501485
503	NC_010830	AGG	2	6	21152	21157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501485
504	NC_010830	AAC	2	6	21167	21172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501485
505	NC_010830	TAAT	2	8	21386	21393	50 %	50 %	0 %	0 %	189501485
506	NC_010830	TAGA	2	8	21443	21450	50 %	25 %	25 %	0 %	189501485
507	NC_010830	TAG	2	6	21500	21505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501485
508	NC_010830	GTT	2	6	21580	21585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501485
509	NC_010830	TA	3	6	21603	21608	50 %	50 %	0 %	0 %	189501485
510	NC_010830	TGC	2	6	21609	21614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501485
511	NC_010830	CTG	2	6	21617	21622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501485
512	NC_010830	ATGT	2	8	21631	21638	25 %	50 %	25 %	0 %	189501485
513	NC_010830	TGG	2	6	21672	21677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501485
514	NC_010830	ACCC	2	8	21701	21708	25 %	0 %	0 %	75 %	189501485
515	NC_010830	TAT	2	6	21749	21754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501485
516	NC_010830	CAA	2	6	21796	21801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501485
517	NC_010830	TTA	2	6	21818	21823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501485
518	NC_010830	TGG	2	6	21939	21944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501485
519	NC_010830	TAT	2	6	21978	21983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501485
520	NC_010830	TGC	2	6	22156	22161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501486
521	NC_010830	CTT	3	9	22189	22197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501486
522	NC_010830	TCT	2	6	22259	22264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501486
523	NC_010830	T	6	6	22287	22292	0 %	100 %	0 %	0 %	189501486
524	NC_010830	AAC	2	6	22314	22319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501486
525	NC_010830	TGC	2	6	22415	22420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501486
526	NC_010830	AGA	2	6	22426	22431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501486
527	NC_010830	AGA	2	6	22487	22492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501486
528	NC_010830	ATT	2	6	22493	22498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501486
529	NC_010830	CAA	2	6	22538	22543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501486
530	NC_010830	TTA	2	6	22566	22571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501486
531	NC_010830	CA	3	6	22690	22695	50 %	0 %	0 %	50 %	189501486
532	NC_010830	TAA	2	6	22733	22738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501486
533	NC_010830	CTAC	2	8	22846	22853	25 %	25 %	0 %	50 %	189501486
534	NC_010830	A	6	6	22892	22897	100 %	0 %	0 %	0 %	189501486
535	NC_010830	TAT	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501486
536	NC_010830	TGC	2	6	23054	23059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501486
537	NC_010830	CTG	2	6	23173	23178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501486
538	NC_010830	TAT	2	6	23217	23222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501486
539	NC_010830	AGA	2	6	23264	23269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010830	GAA	2	6	23309	23314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501487
541	NC_010830	TGT	2	6	23348	23353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501487
542	NC_010830	AAATT	2	10	23413	23422	60 %	40 %	0 %	0 %	189501487
543	NC_010830	TA	3	6	23553	23558	50 %	50 %	0 %	0 %	189501487
544	NC_010830	CTA	2	6	23595	23600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501487
545	NC_010830	GAG	2	6	23623	23628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501487
546	NC_010830	CTG	2	6	23629	23634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501487
547	NC_010830	GATA	2	8	23642	23649	50 %	25 %	25 %	0 %	189501487
548	NC_010830	T	6	6	23653	23658	0 %	100 %	0 %	0 %	189501487
549	NC_010830	CAG	2	6	23880	23885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501487
550	NC_010830	AGTT	2	8	23947	23954	25 %	50 %	25 %	0 %	189501487
551	NC_010830	ACC	2	6	23989	23994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501487
552	NC_010830	TAGC	2	8	24012	24019	25 %	25 %	25 %	25 %	189501487
553	NC_010830	CTT	2	6	24039	24044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010830	TA	3	6	24058	24063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010830	T	6	6	24064	24069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010830	CTT	2	6	24145	24150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010830	CAT	2	6	24154	24159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010830	CTA	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_010830	GAA	2	6	24202	24207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010830	CT	3	6	24397	24402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_010830	CTAG	2	8	24419	24426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_010830	TTAT	2	8	24443	24450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010830	ATAA	2	8	24455	24462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010830	GTTA	2	8	24463	24470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010830	TA	4	8	24474	24481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010830	AAC	2	6	24482	24487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_010830	ATT	2	6	24552	24557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010830	ATA	2	6	24576	24581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010830	ATTT	2	8	24582	24589	25 %	75 %	0 %	0 %	189501488
570	NC_010830	CTA	2	6	24610	24615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501488
571	NC_010830	TTA	2	6	24630	24635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501488
572	NC_010830	CT	3	6	24663	24668	0 %	50 %	0 %	50 %	189501488
573	NC_010830	GCA	2	6	24768	24773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501488
574	NC_010830	CTGCT	2	10	24821	24830	0 %	40 %	20 %	40 %	189501488
575	NC_010830	TAT	2	6	25030	25035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501488
576	NC_010830	CCA	2	6	25074	25079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501488
577	NC_010830	TATG	2	8	25088	25095	25 %	50 %	25 %	0 %	189501488
578	NC_010830	CAC	3	9	25109	25117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501488
579	NC_010830	TTTC	2	8	25120	25127	0 %	75 %	0 %	25 %	189501488
580	NC_010830	CTG	2	6	25183	25188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501488
581	NC_010830	TA	3	6	25192	25197	50 %	50 %	0 %	0 %	189501488
582	NC_010830	AGA	2	6	25226	25231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501488
583	NC_010830	CAG	2	6	25252	25257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501488
584	NC_010830	GGTTTA	2	12	25269	25280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189501488
585	NC_010830	AGA	2	6	25331	25336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501488
586	NC_010830	AGA	2	6	25352	25357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501488
587	NC_010830	ATC	2	6	25358	25363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501488
588	NC_010830	CAT	2	6	25388	25393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501488
589	NC_010830	TAA	2	6	25414	25419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501488
590	NC_010830	T	6	6	25425	25430	0 %	100 %	0 %	0 %	189501488
591	NC_010830	AT	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	189501488
592	NC_010830	GTT	2	6	25440	25445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010830	CTGAT	2	10	25465	25474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
594	NC_010830	TAA	2	6	25475	25480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010830	TAG	2	6	25532	25537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010830	TAA	2	6	25665	25670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501489
597	NC_010830	ATT	2	6	25745	25750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501489
598	NC_010830	TCA	2	6	25839	25844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501489
599	NC_010830	T	6	6	25897	25902	0 %	100 %	0 %	0 %	189501489
600	NC_010830	AGA	2	6	25938	25943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501489
601	NC_010830	TAA	3	9	25955	25963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501489
602	NC_010830	AT	3	6	25988	25993	50 %	50 %	0 %	0 %	189501489
603	NC_010830	AT	3	6	26150	26155	50 %	50 %	0 %	0 %	189501489
604	NC_010830	GAA	2	6	26174	26179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501489
605	NC_010830	ATT	2	6	26188	26193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501489
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609	NC_010830	ACAA	2	8	26414	26421	75 %	0 %	0 %	25 %	189501489
610	NC_010830	AGAT	2	8	26460	26467	50 %	25 %	25 %	0 %	189501489
611	NC_010830	ATT	2	6	26530	26535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010830	AT	3	6	26574	26579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010830	TTG	2	6	26598	26603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010830	TTAC	2	8	26781	26788	25 %	50 %	0 %	25 %	189501490
615	NC_010830	GAA	2	6	26939	26944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501490
616	NC_010830	A	6	6	26960	26965	100 %	0 %	0 %	0 %	189501490
617	NC_010830	A	6	6	26969	26974	100 %	0 %	0 %	0 %	189501490
618	NC_010830	AT	3	6	27016	27021	50 %	50 %	0 %	0 %	189501490
619	NC_010830	A	6	6	27029	27034	100 %	0 %	0 %	0 %	189501490
620	NC_010830	CTG	2	6	27046	27051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501490
621	NC_010830	GCAT	2	8	27098	27105	25 %	25 %	25 %	25 %	189501490
622	NC_010830	ACA	2	6	27169	27174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501490
623	NC_010830	TA	4	8	27175	27182	50 %	50 %	0 %	0 %	189501490
624	NC_010830	TTA	2	6	27306	27311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501490
625	NC_010830	AT	4	8	27322	27329	50 %	50 %	0 %	0 %	189501490
626	NC_010830	ATTAT	2	10	27391	27400	40 %	60 %	0 %	0 %	189501490
627	NC_010830	AGAA	2	8	27476	27483	75 %	0 %	25 %	0 %	189501490
628	NC_010830	TAA	2	6	27501	27506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010830	CTTA	2	8	27528	27535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_010830	T	6	6	27537	27542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010830	TTG	2	6	27607	27612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501491
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