MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 53629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010803	GA	3	6	185661	185666	50 %	0 %	50 %	0 %	189345715
3502	NC_010803	TTG	2	6	185716	185721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345715
3503	NC_010803	AAT	2	6	185739	185744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345715
3504	NC_010803	TTGTT	2	10	185780	185789	0 %	80 %	20 %	0 %	189345715
3505	NC_010803	TGAT	2	8	185794	185801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_010803	A	6	6	185816	185821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_010803	AAT	2	6	185834	185839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010803	GCC	2	6	185878	185883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345716
3509	NC_010803	GGC	2	6	185914	185919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345716
3510	NC_010803	TCG	2	6	185921	185926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345716
3511	NC_010803	TCC	2	6	185957	185962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345716
3512	NC_010803	ACC	2	6	186127	186132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345716
3513	NC_010803	GCT	2	6	186213	186218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345716
3514	NC_010803	TCA	2	6	186219	186224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345716
3515	NC_010803	TCA	2	6	186309	186314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345716
3516	NC_010803	GTT	2	6	186340	186345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345716
3517	NC_010803	TTC	2	6	186360	186365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345716
3518	NC_010803	A	6	6	186387	186392	100 %	0 %	0 %	0 %	189345716
3519	NC_010803	TTC	2	6	186475	186480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345716
3520	NC_010803	TTC	2	6	186487	186492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345716
3521	NC_010803	TGC	2	6	186526	186531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345716
3522	NC_010803	TTC	3	9	186610	186618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_010803	CT	3	6	186639	186644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_010803	CTGA	2	8	186704	186711	25 %	25 %	25 %	25 %	189345717
3525	NC_010803	GAA	2	6	186738	186743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345717
3526	NC_010803	CGA	2	6	186762	186767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345717
3527	NC_010803	T	6	6	186845	186850	0 %	100 %	0 %	0 %	189345717
3528	NC_010803	GCA	3	9	186860	186868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345717
3529	NC_010803	GCA	2	6	186941	186946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345717
3530	NC_010803	CCG	2	6	186957	186962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345717
3531	NC_010803	GTGA	2	8	186975	186982	25 %	25 %	50 %	0 %	189345717
3532	NC_010803	T	7	7	187048	187054	0 %	100 %	0 %	0 %	189345717
3533	NC_010803	ACG	2	6	187115	187120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345717
3534	NC_010803	GCT	2	6	187130	187135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345717
3535	NC_010803	CAG	2	6	187141	187146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345717
3536	NC_010803	TGC	2	6	187214	187219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345717
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3538	NC_010803	ATGG	2	8	187246	187253	25 %	25 %	50 %	0 %	189345717
3539	NC_010803	GC	3	6	187287	187292	0 %	0 %	50 %	50 %	189345717
3540	NC_010803	CCG	2	6	187314	187319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345717
3541	NC_010803	ACG	2	6	187347	187352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345717
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3543	NC_010803	CAT	2	6	187474	187479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345717
3544	NC_010803	AT	3	6	187506	187511	50 %	50 %	0 %	0 %	189345717
3545	NC_010803	TCA	2	6	187688	187693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345718
3546	NC_010803	TGA	2	6	187800	187805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345718
3547	NC_010803	CCAG	2	8	187830	187837	25 %	0 %	25 %	50 %	189345718
3548	NC_010803	TCA	2	6	188001	188006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345718
3549	NC_010803	GAT	2	6	188010	188015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345718
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3551	NC_010803	CGGT	2	8	188129	188136	0 %	25 %	50 %	25 %	189345718
3552	NC_010803	CGA	2	6	188142	188147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345718
3553	NC_010803	TCC	2	6	188164	188169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345718
3554	NC_010803	CTGCG	2	10	188209	188218	0 %	20 %	40 %	40 %	189345718
3555	NC_010803	AAAT	2	8	188232	188239	75 %	25 %	0 %	0 %	189345718
3556	NC_010803	TGC	2	6	188248	188253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345718
3557	NC_010803	TAA	3	9	188349	188357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345718
3558	NC_010803	GCT	2	6	188397	188402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345718
3559	NC_010803	CGC	2	6	188412	188417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345718
3560	NC_010803	CGC	2	6	188456	188461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345718
3561	NC_010803	CGAA	2	8	188479	188486	50 %	0 %	25 %	25 %	189345718
3562	NC_010803	GTT	2	6	188611	188616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010803	GCA	2	6	188625	188630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_010803	TGC	2	6	188644	188649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_010803	ATGCTT	2	12	188677	188688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189345719
3566	NC_010803	T	7	7	188721	188727	0 %	100 %	0 %	0 %	189345719
3567	NC_010803	GAA	2	6	188775	188780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345719
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3569	NC_010803	CTC	2	6	188827	188832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345719
3570	NC_010803	TGCAG	2	10	188931	188940	20 %	20 %	40 %	20 %	189345719
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3573	NC_010803	ACC	2	6	189174	189179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345719
3574	NC_010803	TCG	2	6	189325	189330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345719
3575	NC_010803	CTT	2	6	189418	189423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345719
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3578	NC_010803	ACT	2	6	189507	189512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345719
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3582	NC_010803	CAGG	2	8	189657	189664	25 %	0 %	50 %	25 %	189345719
3583	NC_010803	AAC	2	6	189756	189761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345720
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3587	NC_010803	CAG	2	6	190096	190101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345721
3588	NC_010803	GATC	2	8	190146	190153	25 %	25 %	25 %	25 %	189345721
3589	NC_010803	GGT	2	6	190158	190163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345721
3590	NC_010803	CAT	2	6	190164	190169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345721
3591	NC_010803	TTCTT	2	10	190184	190193	0 %	80 %	0 %	20 %	189345721
3592	NC_010803	TA	4	8	190202	190209	50 %	50 %	0 %	0 %	189345721
3593	NC_010803	T	6	6	190320	190325	0 %	100 %	0 %	0 %	189345721
3594	NC_010803	ATT	2	6	190519	190524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_010803	A	8	8	190569	190576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_010803	A	6	6	190593	190598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_010803	ATT	2	6	190637	190642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_010803	A	6	6	190716	190721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010803	T	6	6	190750	190755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_010803	GCA	2	6	190760	190765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_010803	GTT	2	6	190802	190807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_010803	TTCCG	2	10	190857	190866	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3603	NC_010803	T	8	8	190892	190899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_010803	AT	3	6	190900	190905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_010803	TTC	2	6	190936	190941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_010803	CAA	2	6	191035	191040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345722
3607	NC_010803	A	6	6	191045	191050	100 %	0 %	0 %	0 %	189345722
3608	NC_010803	AGT	2	6	191105	191110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345722
3609	NC_010803	CCCTTG	2	12	191178	191189	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189345722
3610	NC_010803	GAA	2	6	191194	191199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345722
3611	NC_010803	TTC	2	6	191220	191225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345722
3612	NC_010803	ACT	2	6	191235	191240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345722
3613	NC_010803	AGG	2	6	191258	191263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345722
3614	NC_010803	GAG	2	6	191267	191272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345722
3615	NC_010803	TCGG	2	8	191294	191301	0 %	25 %	50 %	25 %	189345722
3616	NC_010803	CGA	2	6	191305	191310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345722
3617	NC_010803	CTA	2	6	191367	191372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345722
3618	NC_010803	A	6	6	191521	191526	100 %	0 %	0 %	0 %	189345722
3619	NC_010803	CGA	2	6	191557	191562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345722
3620	NC_010803	CA	4	8	191677	191684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_010803	CTC	2	6	191731	191736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_010803	CTG	2	6	191740	191745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3624	NC_010803	ATC	2	6	191844	191849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345723
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3872	NC_010803	GGC	2	6	204048	204053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345734
3873	NC_010803	TGA	2	6	204090	204095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345734
3874	NC_010803	TCT	2	6	204140	204145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345734
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3879	NC_010803	T	6	6	204387	204392	0 %	100 %	0 %	0 %	189345734
3880	NC_010803	TCGT	2	8	204544	204551	0 %	50 %	25 %	25 %	189345734
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3884	NC_010803	TCAG	2	8	204728	204735	25 %	25 %	25 %	25 %	189345734
3885	NC_010803	TCA	2	6	204759	204764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345734
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3903	NC_010803	TTG	2	6	205528	205533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3986	NC_010803	T	7	7	210370	210376	0 %	100 %	0 %	0 %	189345738
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3989	NC_010803	T	8	8	210458	210465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_010803	T	6	6	210506	210511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_010803	GCT	2	6	210519	210524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_010803	AGC	2	6	210544	210549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_010803	CAG	2	6	210561	210566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_010803	TCC	2	6	210675	210680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3995	NC_010803	GTT	2	6	210692	210697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_010803	T	6	6	210703	210708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_010803	ATC	2	6	210778	210783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_010803	AGC	2	6	210834	210839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_010803	CCT	2	6	210873	210878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4000	NC_010803	AATA	2	8	210935	210942	75 %	25 %	0 %	0 %	189345739

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