MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 53629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010803	GAT	2	6	287930	287935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345800
5502	NC_010803	CCA	2	6	287964	287969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345800
5503	NC_010803	CGA	2	6	288019	288024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
5504	NC_010803	AGC	2	6	288051	288056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
5505	NC_010803	ATC	2	6	288068	288073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345800
5506	NC_010803	AG	3	6	288201	288206	50 %	0 %	50 %	0 %	189345800
5507	NC_010803	CGA	2	6	288292	288297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
5508	NC_010803	GAA	3	9	288396	288404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010803	GAT	2	6	288472	288477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345801
5510	NC_010803	TCC	2	6	288510	288515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345801
5511	NC_010803	CGT	2	6	288553	288558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345801
5512	NC_010803	CTC	2	6	288620	288625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345801
5513	NC_010803	T	6	6	288632	288637	0 %	100 %	0 %	0 %	189345801
5514	NC_010803	GCA	2	6	288868	288873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345801
5515	NC_010803	CAC	2	6	289046	289051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345801
5516	NC_010803	GAT	2	6	289100	289105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345801
5517	NC_010803	GCA	2	6	289114	289119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345801
5518	NC_010803	ATC	2	6	289157	289162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345801
5519	NC_010803	CTG	2	6	289249	289254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345801
5520	NC_010803	TCA	2	6	289300	289305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345801
5521	NC_010803	GTA	2	6	289523	289528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345801
5522	NC_010803	ATC	2	6	289691	289696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345801
5523	NC_010803	GAAG	2	8	289743	289750	50 %	0 %	50 %	0 %	189345801
5524	NC_010803	TGT	2	6	289762	289767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345801
5525	NC_010803	TGT	2	6	289829	289834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345802
5526	NC_010803	A	7	7	289846	289852	100 %	0 %	0 %	0 %	189345802
5527	NC_010803	TG	3	6	289869	289874	0 %	50 %	50 %	0 %	189345802
5528	NC_010803	GGGA	2	8	290001	290008	25 %	0 %	75 %	0 %	189345802
5529	NC_010803	GAA	2	6	290098	290103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345802
5530	NC_010803	AGA	2	6	290165	290170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345802
5531	NC_010803	CGGA	2	8	290197	290204	25 %	0 %	50 %	25 %	189345802
5532	NC_010803	ACCG	2	8	290207	290214	25 %	0 %	25 %	50 %	189345802
5533	NC_010803	TTTC	2	8	290259	290266	0 %	75 %	0 %	25 %	189345802
5534	NC_010803	CAGGA	2	10	290367	290376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5535	NC_010803	GA	3	6	290391	290396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_010803	GCA	2	6	290502	290507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_010803	A	7	7	290555	290561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_010803	CAG	2	6	290684	290689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345803
5539	NC_010803	TC	3	6	290713	290718	0 %	50 %	0 %	50 %	189345803
5540	NC_010803	AT	3	6	290728	290733	50 %	50 %	0 %	0 %	189345803
5541	NC_010803	TC	3	6	290754	290759	0 %	50 %	0 %	50 %	189345803
5542	NC_010803	TCT	2	6	290793	290798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345803
5543	NC_010803	GATC	2	8	290953	290960	25 %	25 %	25 %	25 %	189345803
5544	NC_010803	GCA	2	6	291015	291020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345803
5545	NC_010803	GCA	2	6	291022	291027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345803
5546	NC_010803	ATG	2	6	291114	291119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345803
5547	NC_010803	T	7	7	291120	291126	0 %	100 %	0 %	0 %	189345803
5548	NC_010803	CCG	2	6	291159	291164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345803
5549	NC_010803	CAGAT	2	10	291180	291189	40 %	20 %	20 %	20 %	189345803
5550	NC_010803	GTC	2	6	291231	291236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345803
5551	NC_010803	TCC	2	6	291290	291295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345803
5552	NC_010803	AGG	2	6	291370	291375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345803
5553	NC_010803	TGC	2	6	291457	291462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345803
5554	NC_010803	CGGAG	2	10	291471	291480	20 %	0 %	60 %	20 %	189345803
5555	NC_010803	GGTC	2	8	291517	291524	0 %	25 %	50 %	25 %	189345803
5556	NC_010803	AGGG	2	8	291591	291598	25 %	0 %	75 %	0 %	189345803
5557	NC_010803	TGC	2	6	291721	291726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_010803	TGC	2	6	291737	291742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_010803	GCA	2	6	291869	291874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_010803	CCG	2	6	291921	291926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_010803	T	6	6	291984	291989	0 %	100 %	0 %	0 %	189345804
5562	NC_010803	TCA	2	6	292064	292069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345804
5563	NC_010803	CGA	2	6	292089	292094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
5564	NC_010803	GAA	2	6	292105	292110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345804
5565	NC_010803	ACC	2	6	292150	292155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345804
5566	NC_010803	TTG	2	6	292163	292168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345804
5567	NC_010803	A	7	7	292188	292194	100 %	0 %	0 %	0 %	189345804
5568	NC_010803	GAG	2	6	292213	292218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345804
5569	NC_010803	GGA	2	6	292236	292241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345804
5570	NC_010803	CTC	2	6	292255	292260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345804
5571	NC_010803	CA	3	6	292376	292381	50 %	0 %	0 %	50 %	189345804
5572	NC_010803	ATT	2	6	292408	292413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345804
5573	NC_010803	GGTCAG	2	12	292492	292503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189345804
5574	NC_010803	GGT	2	6	292521	292526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345804
5575	NC_010803	CGG	2	6	292583	292588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345804
5576	NC_010803	GGA	2	6	292617	292622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345804
5577	NC_010803	AAG	2	6	292651	292656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345804
5578	NC_010803	CAG	2	6	292720	292725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
5579	NC_010803	CT	3	6	292807	292812	0 %	50 %	0 %	50 %	189345804
5580	NC_010803	AT	3	6	292842	292847	50 %	50 %	0 %	0 %	189345804
5581	NC_010803	GA	3	6	292856	292861	50 %	0 %	50 %	0 %	189345804
5582	NC_010803	CGA	2	6	292866	292871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
5583	NC_010803	CAG	2	6	292921	292926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345804
5584	NC_010803	GAG	2	6	292968	292973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345805
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5586	NC_010803	GTGC	2	8	293013	293020	0 %	25 %	50 %	25 %	189345805
5587	NC_010803	TGA	2	6	293123	293128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345805
5588	NC_010803	T	8	8	293190	293197	0 %	100 %	0 %	0 %	189345805
5589	NC_010803	T	6	6	293233	293238	0 %	100 %	0 %	0 %	189345805
5590	NC_010803	TG	3	6	293298	293303	0 %	50 %	50 %	0 %	189345805
5591	NC_010803	AGC	3	9	293386	293394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345805
5592	NC_010803	AGGT	2	8	293458	293465	25 %	25 %	50 %	0 %	189345805
5593	NC_010803	CTG	2	6	293499	293504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345805
5594	NC_010803	T	6	6	293516	293521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_010803	GTT	2	6	293522	293527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_010803	AAGAT	2	10	293584	293593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010803	TAT	2	6	293636	293641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345806
5598	NC_010803	CAGA	2	8	293650	293657	50 %	0 %	25 %	25 %	189345806
5599	NC_010803	CGATG	2	10	293729	293738	20 %	20 %	40 %	20 %	189345806
5600	NC_010803	GCT	2	6	293864	293869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345806
5601	NC_010803	TCC	2	6	293882	293887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345806
5602	NC_010803	GTT	2	6	294008	294013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345806
5603	NC_010803	GAG	3	9	294069	294077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345806
5604	NC_010803	GCA	2	6	294105	294110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345806
5605	NC_010803	ATA	2	6	294184	294189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345806
5606	NC_010803	GCA	2	6	294191	294196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345806
5607	NC_010803	TCA	2	6	294245	294250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345806
5608	NC_010803	T	10	10	294296	294305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_010803	ATAAAT	2	12	294306	294317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_010803	GAT	2	6	294322	294327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_010803	ATT	2	6	294369	294374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345807
5612	NC_010803	A	6	6	294450	294455	100 %	0 %	0 %	0 %	189345807
5613	NC_010803	GCC	2	6	294462	294467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345807
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5615	NC_010803	TTG	2	6	294613	294618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345807
5616	NC_010803	CTTG	2	8	294626	294633	0 %	50 %	25 %	25 %	189345807
5617	NC_010803	TCA	2	6	294715	294720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345807
5618	NC_010803	CCG	2	6	294779	294784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345807
5619	NC_010803	TAC	2	6	295017	295022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345807
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5621	NC_010803	CAG	2	6	295106	295111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345807
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5742	NC_010803	CGG	2	6	301093	301098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345811
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5746	NC_010803	GCAG	2	8	301364	301371	25 %	0 %	50 %	25 %	189345811
5747	NC_010803	AG	3	6	301370	301375	50 %	0 %	50 %	0 %	189345811
5748	NC_010803	TCG	2	6	301380	301385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345811
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5750	NC_010803	TCC	2	6	301574	301579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345811
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5753	NC_010803	T	7	7	301681	301687	0 %	100 %	0 %	0 %	189345811
5754	NC_010803	AAAAC	2	10	301740	301749	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5755	NC_010803	TCT	2	6	301758	301763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345812
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5757	NC_010803	ACATTG	2	12	302102	302113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189345812
5758	NC_010803	CTG	2	6	302225	302230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345812
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5762	NC_010803	AGC	2	6	302408	302413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345812
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5780	NC_010803	TCC	2	6	303277	303282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345812
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5803	NC_010803	TGC	2	6	304740	304745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345812
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5846	NC_010803	GTAAC	2	10	306920	306929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5847	NC_010803	TTTTA	2	10	306933	306942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5848	NC_010803	ATC	2	6	306959	306964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5850	NC_010803	AC	3	6	306986	306991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5851	NC_010803	CAA	2	6	306995	307000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5852	NC_010803	GAT	2	6	307073	307078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345814
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5854	NC_010803	AAG	2	6	307283	307288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345815
5855	NC_010803	GAT	2	6	307305	307310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345815
5856	NC_010803	GGCA	2	8	307328	307335	25 %	0 %	50 %	25 %	189345815
5857	NC_010803	AAT	2	6	307350	307355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345815
5858	NC_010803	A	6	6	307409	307414	100 %	0 %	0 %	0 %	189345815
5859	NC_010803	CGT	2	6	307415	307420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345815
5860	NC_010803	A	8	8	307446	307453	100 %	0 %	0 %	0 %	189345816
5861	NC_010803	ATC	2	6	307468	307473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345816
5862	NC_010803	CTG	2	6	307575	307580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345816
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5864	NC_010803	GAG	2	6	307641	307646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345816
5865	NC_010803	TCA	2	6	307717	307722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345816
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5994	NC_010803	A	6	6	315372	315377	100 %	0 %	0 %	0 %	189345822
5995	NC_010803	TTG	2	6	315398	315403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345822
5996	NC_010803	GAT	2	6	315427	315432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345822
5997	NC_010803	A	6	6	315490	315495	100 %	0 %	0 %	0 %	189345822
5998	NC_010803	CAAAA	2	10	315527	315536	80 %	0 %	0 %	20 %	189345822
5999	NC_010803	GTA	2	6	315560	315565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345822
6000	NC_010803	ATT	2	6	315618	315623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345822

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