MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 53629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010803	AGAA	2	8	262307	262314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_010803	CT	3	6	262375	262380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_010803	CGT	2	6	262463	262468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345780
5004	NC_010803	GCC	2	6	262536	262541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345780
5005	NC_010803	GCA	2	6	262554	262559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345780
5006	NC_010803	TCC	2	6	262567	262572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345780
5007	NC_010803	CCTGGC	2	12	262622	262633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189345780
5008	NC_010803	TGC	2	6	262669	262674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345780
5009	NC_010803	GCT	2	6	262739	262744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345780
5010	NC_010803	AAT	2	6	262835	262840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010803	GAG	2	6	262845	262850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010803	GAA	2	6	262890	262895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_010803	CATCT	2	10	262996	263005	20 %	40 %	0 %	40 %	189345781
5014	NC_010803	TGC	2	6	263174	263179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345781
5015	NC_010803	CTG	2	6	263199	263204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345781
5016	NC_010803	TTGC	2	8	263217	263224	0 %	50 %	25 %	25 %	189345781
5017	NC_010803	CAG	2	6	263250	263255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345781
5018	NC_010803	GCA	2	6	263265	263270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345781
5019	NC_010803	ATG	2	6	263420	263425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345782
5020	NC_010803	TGC	2	6	263436	263441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345782
5021	NC_010803	TCC	2	6	263496	263501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345782
5022	NC_010803	CGT	2	6	263569	263574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345782
5023	NC_010803	CTG	2	6	263638	263643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345782
5024	NC_010803	AG	3	6	263718	263723	50 %	0 %	50 %	0 %	189345782
5025	NC_010803	AG	3	6	263790	263795	50 %	0 %	50 %	0 %	189345782
5026	NC_010803	TGA	2	6	263796	263801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345782
5027	NC_010803	CCT	2	6	263805	263810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345782
5028	NC_010803	GAT	2	6	263811	263816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345782
5029	NC_010803	TCA	2	6	263830	263835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345782
5030	NC_010803	TGC	2	6	263958	263963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345782
5031	NC_010803	TGG	2	6	264051	264056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345782
5032	NC_010803	GAGG	2	8	264106	264113	25 %	0 %	75 %	0 %	189345782
5033	NC_010803	TTG	2	6	264128	264133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345782
5034	NC_010803	CGGA	2	8	264163	264170	25 %	0 %	50 %	25 %	189345782
5035	NC_010803	GTT	2	6	264180	264185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345782
5036	NC_010803	TGA	2	6	264251	264256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345782
5037	NC_010803	TC	3	6	264330	264335	0 %	50 %	0 %	50 %	189345782
5038	NC_010803	T	6	6	264396	264401	0 %	100 %	0 %	0 %	189345782
5039	NC_010803	TCC	2	6	264582	264587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_010803	T	6	6	264634	264639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010803	AAT	2	6	264645	264650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_010803	TAA	2	6	264682	264687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_010803	ACAGC	2	10	264701	264710	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5044	NC_010803	TCA	4	12	264837	264848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345783
5045	NC_010803	GA	3	6	264943	264948	50 %	0 %	50 %	0 %	189345783
5046	NC_010803	AAC	2	6	264982	264987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345783
5047	NC_010803	GAG	2	6	265034	265039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345783
5048	NC_010803	TGC	2	6	265041	265046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5049	NC_010803	TGC	2	6	265094	265099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5050	NC_010803	CTC	2	6	265147	265152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345783
5051	NC_010803	TCC	2	6	265294	265299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345783
5052	NC_010803	ATCTT	2	10	265323	265332	20 %	60 %	0 %	20 %	189345783
5053	NC_010803	TCC	2	6	265408	265413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345783
5054	NC_010803	TGC	2	6	265458	265463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5055	NC_010803	GGA	2	6	265467	265472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345783
5056	NC_010803	CAA	2	6	265495	265500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345783
5057	NC_010803	GGC	2	6	265555	265560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345783
5058	NC_010803	TC	3	6	265562	265567	0 %	50 %	0 %	50 %	189345783
5059	NC_010803	AACA	2	8	265580	265587	75 %	0 %	0 %	25 %	189345783
5060	NC_010803	TTC	2	6	265659	265664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345783
5061	NC_010803	AGA	2	6	265710	265715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345783
5062	NC_010803	GCC	2	6	265724	265729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345783
5063	NC_010803	CAG	2	6	265736	265741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5064	NC_010803	CGA	2	6	265801	265806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5065	NC_010803	CTGG	2	8	265867	265874	0 %	25 %	50 %	25 %	189345783
5066	NC_010803	GAA	2	6	265948	265953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345783
5067	NC_010803	TGGAA	2	10	265975	265984	40 %	20 %	40 %	0 %	189345783
5068	NC_010803	CTG	2	6	266156	266161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5069	NC_010803	ACA	2	6	266184	266189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345783
5070	NC_010803	CAT	2	6	266284	266289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345783
5071	NC_010803	GCG	2	6	266361	266366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345783
5072	NC_010803	CAG	2	6	266450	266455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5073	NC_010803	TACGA	2	10	266472	266481	40 %	20 %	20 %	20 %	189345783
5074	NC_010803	TGG	2	6	266623	266628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345783
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5076	NC_010803	GC	3	6	266705	266710	0 %	0 %	50 %	50 %	189345783
5077	NC_010803	GGC	2	6	266818	266823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345783
5078	NC_010803	TCT	2	6	266834	266839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345783
5079	NC_010803	GAGATC	2	12	266852	266863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189345783
5080	NC_010803	AAT	2	6	266902	266907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345783
5081	NC_010803	TCG	2	6	266940	266945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5082	NC_010803	CTG	2	6	266957	266962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5083	NC_010803	CG	3	6	266978	266983	0 %	0 %	50 %	50 %	189345783
5084	NC_010803	ACA	2	6	267066	267071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345783
5085	NC_010803	GTTC	2	8	267095	267102	0 %	50 %	25 %	25 %	189345783
5086	NC_010803	TCT	2	6	267112	267117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345783
5087	NC_010803	GA	3	6	267227	267232	50 %	0 %	50 %	0 %	189345783
5088	NC_010803	ACC	2	6	267302	267307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345783
5089	NC_010803	GAA	2	6	267308	267313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345783
5090	NC_010803	CCAT	2	8	267328	267335	25 %	25 %	0 %	50 %	189345783
5091	NC_010803	AAG	2	6	267536	267541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345783
5092	NC_010803	GGA	2	6	267544	267549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345783
5093	NC_010803	GAC	2	6	267553	267558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345783
5094	NC_010803	TGT	2	6	267592	267597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_010803	T	6	6	267603	267608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010803	TTCA	2	8	267660	267667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_010803	GAAC	2	8	267766	267773	50 %	0 %	25 %	25 %	189345784
5098	NC_010803	TTC	2	6	267811	267816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345784
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5100	NC_010803	AAT	2	6	267892	267897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010803	T	6	6	267923	267928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_010803	TA	5	10	267943	267952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_010803	AGG	2	6	267964	267969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010803	CAA	2	6	267998	268003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345785
5105	NC_010803	AAAC	2	8	268070	268077	75 %	0 %	0 %	25 %	189345785
5106	NC_010803	GATC	2	8	268094	268101	25 %	25 %	25 %	25 %	189345785
5107	NC_010803	GC	3	6	268240	268245	0 %	0 %	50 %	50 %	189345785
5108	NC_010803	CATGGC	2	12	268283	268294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189345785
5109	NC_010803	CAGC	2	8	268382	268389	25 %	0 %	25 %	50 %	189345785
5110	NC_010803	TTGC	2	8	268401	268408	0 %	50 %	25 %	25 %	189345785
5111	NC_010803	ACCG	2	8	268419	268426	25 %	0 %	25 %	50 %	189345785
5112	NC_010803	CTT	2	6	268436	268441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345785
5113	NC_010803	TGA	2	6	268550	268555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345785
5114	NC_010803	TGT	2	6	268585	268590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345785
5115	NC_010803	ATG	2	6	268645	268650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345785
5116	NC_010803	AAG	2	6	268737	268742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345785
5117	NC_010803	GAT	2	6	268749	268754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345785
5118	NC_010803	CATC	2	8	268829	268836	25 %	25 %	0 %	50 %	189345785
5119	NC_010803	TAC	2	6	268947	268952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345785
5120	NC_010803	CCA	2	6	268957	268962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345785
5121	NC_010803	GTT	2	6	268997	269002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345785
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5123	NC_010803	CCA	2	6	269045	269050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345785
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5370	NC_010803	ATG	2	6	280991	280996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345794
5371	NC_010803	CCGGT	2	10	281009	281018	0 %	20 %	40 %	40 %	189345794
5372	NC_010803	GAG	2	6	281205	281210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345794
5373	NC_010803	CCT	2	6	281221	281226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345794
5374	NC_010803	GA	3	6	281272	281277	50 %	0 %	50 %	0 %	189345794
5375	NC_010803	TCAA	2	8	281356	281363	50 %	25 %	0 %	25 %	189345794
5376	NC_010803	GCA	2	6	281388	281393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345794
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5378	NC_010803	GA	3	6	281428	281433	50 %	0 %	50 %	0 %	189345794
5379	NC_010803	A	7	7	281471	281477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_010803	TCA	2	6	281485	281490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5381	NC_010803	TCA	2	6	281609	281614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345795
5382	NC_010803	GCT	2	6	281697	281702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345795
5383	NC_010803	GTC	2	6	281703	281708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345795
5384	NC_010803	ATA	2	6	281799	281804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345795
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5386	NC_010803	CGC	2	6	281916	281921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345795
5387	NC_010803	CAT	2	6	281997	282002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345795
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5389	NC_010803	GCTGTT	2	12	282046	282057	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189345795
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5391	NC_010803	TACA	2	8	282169	282176	50 %	25 %	0 %	25 %	189345795
5392	NC_010803	T	6	6	282197	282202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_010803	ACCG	2	8	282325	282332	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_010803	AATAA	2	10	282353	282362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_010803	GGCT	2	8	282496	282503	0 %	25 %	50 %	25 %	189345796
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5480	NC_010803	AT	3	6	286785	286790	50 %	50 %	0 %	0 %	189345800
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5487	NC_010803	TCGA	2	8	287147	287154	25 %	25 %	25 %	25 %	189345800
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5491	NC_010803	GGA	2	6	287272	287277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345800
5492	NC_010803	ATG	2	6	287336	287341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345800
5493	NC_010803	GGT	2	6	287353	287358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345800
5494	NC_010803	A	7	7	287444	287450	100 %	0 %	0 %	0 %	189345800
5495	NC_010803	GTC	2	6	287643	287648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345800
5496	NC_010803	GGA	2	6	287687	287692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345800
5497	NC_010803	CGA	2	6	287740	287745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
5498	NC_010803	CGA	2	6	287794	287799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345800
5499	NC_010803	CAT	4	12	287848	287859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345800
5500	NC_010803	CCG	2	6	287924	287929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345800

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