MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 4376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	ATTCA	2	10	796	805	40 %	40 %	0 %	20 %	188589439
2	NC_010723	TTTAA	2	10	1249	1258	40 %	60 %	0 %	0 %	188589439
3	NC_010723	TCTAT	2	10	1706	1715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010723	TTAAA	2	10	1716	1725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010723	AGATA	2	10	3765	3774	60 %	20 %	20 %	0 %	188590699
6	NC_010723	CTATG	2	10	6569	6578	20 %	40 %	20 %	20 %	188587904
7	NC_010723	ATATT	2	10	6642	6651	40 %	60 %	0 %	0 %	188587904
8	NC_010723	GAAAT	2	10	7770	7779	60 %	20 %	20 %	0 %	188587904
9	NC_010723	TAATG	2	10	8468	8477	40 %	40 %	20 %	0 %	188587904
10	NC_010723	ATAGA	2	10	9042	9051	60 %	20 %	20 %	0 %	188587904
11	NC_010723	TTTTA	2	10	9112	9121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010723	AAATT	2	10	9361	9370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010723	GGTAA	2	10	9813	9822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010723	TCGTG	2	10	10604	10613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010723	TTTAA	2	10	11145	11154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010723	CCAAA	2	10	11571	11580	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010723	GGGAG	2	10	11827	11836	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010723	TAAGT	2	10	12356	12365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010723	AGGAT	2	10	12779	12788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010723	CGGGA	2	10	14043	14052	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010723	ATATT	2	10	15041	15050	40 %	60 %	0 %	0 %	188588820
22	NC_010723	ATGAT	2	10	15869	15878	40 %	40 %	20 %	0 %	188588637
23	NC_010723	AAGAA	2	10	16021	16030	80 %	0 %	20 %	0 %	188588637
24	NC_010723	AATAC	2	10	16297	16306	60 %	20 %	0 %	20 %	188588637
25	NC_010723	TAGTT	2	10	17133	17142	20 %	60 %	20 %	0 %	188587965
26	NC_010723	TAATA	2	10	17382	17391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010723	AGAAT	2	10	17953	17962	60 %	20 %	20 %	0 %	188588464
28	NC_010723	TAAAA	2	10	19994	20003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010723	ATTTA	2	10	20024	20033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010723	AAAAG	2	10	20418	20427	80 %	0 %	20 %	0 %	188588138
31	NC_010723	AAAGA	2	10	20750	20759	80 %	0 %	20 %	0 %	188588138
32	NC_010723	AAAGA	2	10	20888	20897	80 %	0 %	20 %	0 %	188588814
33	NC_010723	TATAA	2	10	21194	21203	60 %	40 %	0 %	0 %	188588814
34	NC_010723	ATTAG	2	10	21779	21788	40 %	40 %	20 %	0 %	188588814
35	NC_010723	TGATA	2	10	23305	23314	40 %	40 %	20 %	0 %	188588814
36	NC_010723	ATAGA	2	10	23583	23592	60 %	20 %	20 %	0 %	188588814
37	NC_010723	TTTAC	2	10	24008	24017	20 %	60 %	0 %	20 %	188588814
38	NC_010723	AAAGA	2	10	25356	25365	80 %	0 %	20 %	0 %	188589987
39	NC_010723	TTTAA	2	10	26760	26769	40 %	60 %	0 %	0 %	188589987
40	NC_010723	TATAA	2	10	28162	28171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010723	ATTTA	2	10	29168	29177	40 %	60 %	0 %	0 %	188590689
42	NC_010723	TATAT	2	10	29703	29712	40 %	60 %	0 %	0 %	188588427
43	NC_010723	TATTT	2	10	30066	30075	20 %	80 %	0 %	0 %	188588427
44	NC_010723	TAAAT	2	10	30393	30402	60 %	40 %	0 %	0 %	188588427
45	NC_010723	TAAAA	2	10	31870	31879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010723	CAAAA	2	10	32390	32399	80 %	0 %	0 %	20 %	188590164
47	NC_010723	ATTGG	2	10	32677	32686	20 %	40 %	40 %	0 %	188590164
48	NC_010723	TTTAA	2	10	33201	33210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010723	AAAGT	2	10	34177	34186	60 %	20 %	20 %	0 %	188587836
50	NC_010723	ATAGT	2	10	34719	34728	40 %	40 %	20 %	0 %	188587735
51	NC_010723	GAATT	2	10	34908	34917	40 %	40 %	20 %	0 %	188587735
52	NC_010723	TATAA	2	10	35619	35628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010723	ATTAA	2	10	36798	36807	60 %	40 %	0 %	0 %	188588322
54	NC_010723	AATAT	2	10	37945	37954	60 %	40 %	0 %	0 %	188588322
55	NC_010723	TCATT	2	10	38024	38033	20 %	60 %	0 %	20 %	188588322
56	NC_010723	TGTCC	2	10	38041	38050	0 %	40 %	20 %	40 %	188588322
57	NC_010723	GAAAA	2	10	38165	38174	80 %	0 %	20 %	0 %	188588322
58	NC_010723	TAATT	4	20	38334	38353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010723	TATAA	2	10	39367	39376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010723	TATAA	2	10	39430	39439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010723	TCATT	2	10	41098	41107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010723	ATTTA	2	10	42399	42408	40 %	60 %	0 %	0 %	188589253
63	NC_010723	GTAAG	2	10	42898	42907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010723	AATAA	2	10	43332	43341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010723	TTTAT	2	10	43665	43674	20 %	80 %	0 %	0 %	188589054
66	NC_010723	AGATA	2	10	44392	44401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010723	TAGAA	2	10	45407	45416	60 %	20 %	20 %	0 %	188587858
68	NC_010723	TATAG	2	10	48117	48126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010723	TAATA	2	10	48151	48160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010723	TCATT	2	10	48556	48565	20 %	60 %	0 %	20 %	188590111
71	NC_010723	ATATT	2	10	49842	49851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010723	ATATA	2	10	49913	49922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010723	TAATT	2	10	50332	50341	40 %	60 %	0 %	0 %	188587949
74	NC_010723	CAAAT	2	10	51369	51378	60 %	20 %	0 %	20 %	188587949
75	NC_010723	GATAA	2	10	51787	51796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010723	AATAG	2	10	51882	51891	60 %	20 %	20 %	0 %	188589662
77	NC_010723	AAAAG	2	10	52055	52064	80 %	0 %	20 %	0 %	188589662
78	NC_010723	AAAAT	2	10	52246	52255	80 %	20 %	0 %	0 %	188589662
79	NC_010723	ATTAT	2	10	52802	52811	40 %	60 %	0 %	0 %	188590471
80	NC_010723	ATGCT	2	10	52838	52847	20 %	40 %	20 %	20 %	188590471
81	NC_010723	AAATG	2	10	53235	53244	60 %	20 %	20 %	0 %	188590471
82	NC_010723	GTAAT	2	10	53546	53555	40 %	40 %	20 %	0 %	188590471
83	NC_010723	AAAAG	2	10	55299	55308	80 %	0 %	20 %	0 %	188588024
84	NC_010723	AATAT	2	10	56304	56313	60 %	40 %	0 %	0 %	188588362
85	NC_010723	TAAAA	2	10	56855	56864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010723	CGGAA	2	10	57002	57011	40 %	0 %	40 %	20 %	188589300
87	NC_010723	TAATT	2	10	59517	59526	40 %	60 %	0 %	0 %	188590375
88	NC_010723	TTTTA	2	10	60815	60824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010723	AAAGC	2	10	60871	60880	60 %	0 %	20 %	20 %	188587992
90	NC_010723	ATGGT	2	10	60893	60902	20 %	40 %	40 %	0 %	188587992
91	NC_010723	AAAAC	2	10	61401	61410	80 %	0 %	0 %	20 %	188587992
92	NC_010723	ATAGT	2	10	62668	62677	40 %	40 %	20 %	0 %	188588895
93	NC_010723	GAATT	2	10	63640	63649	40 %	40 %	20 %	0 %	188588895
94	NC_010723	TAACC	2	10	65573	65582	40 %	20 %	0 %	40 %	188588943
95	NC_010723	TAATA	2	10	65722	65731	60 %	40 %	0 %	0 %	188588943
96	NC_010723	ATGAA	2	10	66022	66031	60 %	20 %	20 %	0 %	188588943
97	NC_010723	TAAAT	2	10	66544	66553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010723	CATTA	2	10	66928	66937	40 %	40 %	0 %	20 %	188590299
99	NC_010723	AGTTT	2	10	67737	67746	20 %	60 %	20 %	0 %	188590299
100	NC_010723	AATTT	2	10	68381	68390	40 %	60 %	0 %	0 %	188590299
101	NC_010723	TATAC	2	10	68613	68622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010723	AAAAG	2	10	69287	69296	80 %	0 %	20 %	0 %	188587547
103	NC_010723	AATGG	2	10	69890	69899	40 %	20 %	40 %	0 %	188588453
104	NC_010723	TAGAA	2	10	72013	72022	60 %	20 %	20 %	0 %	188588216
105	NC_010723	TAATA	2	10	72973	72982	60 %	40 %	0 %	0 %	188588216
106	NC_010723	TAAAA	2	10	77747	77756	80 %	20 %	0 %	0 %	188588722
107	NC_010723	CAAAG	2	10	78088	78097	60 %	0 %	20 %	20 %	188588722
108	NC_010723	ATAGT	2	10	78209	78218	40 %	40 %	20 %	0 %	188588722
109	NC_010723	AATCA	2	10	78558	78567	60 %	20 %	0 %	20 %	188588722
110	NC_010723	TGGAA	2	10	80092	80101	40 %	20 %	40 %	0 %	188590566
111	NC_010723	GATAA	2	10	81715	81724	60 %	20 %	20 %	0 %	188588175
112	NC_010723	GTTTT	2	10	81765	81774	0 %	80 %	20 %	0 %	188589114
113	NC_010723	TTTCT	2	10	82087	82096	0 %	80 %	0 %	20 %	188589114
114	NC_010723	AATTG	2	10	83726	83735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010723	ATTAA	2	10	83743	83752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010723	TAATT	2	10	85178	85187	40 %	60 %	0 %	0 %	188590055
117	NC_010723	TATTT	2	10	85412	85421	20 %	80 %	0 %	0 %	188590055
118	NC_010723	AGGTA	2	10	85571	85580	40 %	20 %	40 %	0 %	188590055
119	NC_010723	TTTAG	2	10	85734	85743	20 %	60 %	20 %	0 %	188590055
120	NC_010723	ATAAA	2	10	85855	85864	80 %	20 %	0 %	0 %	188590055
121	NC_010723	TAAAA	2	10	86249	86258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010723	TAAAT	2	10	87834	87843	60 %	40 %	0 %	0 %	188589557
123	NC_010723	AGGGA	2	10	89303	89312	40 %	0 %	60 %	0 %	188589185
124	NC_010723	AATTC	2	10	89571	89580	40 %	40 %	0 %	20 %	188589185
125	NC_010723	AATAC	2	10	90650	90659	60 %	20 %	0 %	20 %	188588720
126	NC_010723	AATAG	2	10	91967	91976	60 %	20 %	20 %	0 %	188588720
127	NC_010723	TAATT	2	10	92441	92450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010723	AAAAG	2	10	92867	92876	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010723	AGAAA	2	10	93470	93479	80 %	0 %	20 %	0 %	188589689
130	NC_010723	TAGTT	2	10	94160	94169	20 %	60 %	20 %	0 %	188589689
131	NC_010723	AGAAA	2	10	95835	95844	80 %	0 %	20 %	0 %	188589689
132	NC_010723	ATAAA	2	10	96115	96124	80 %	20 %	0 %	0 %	188589689
133	NC_010723	TAATA	2	10	96543	96552	60 %	40 %	0 %	0 %	188588416
134	NC_010723	ATCAA	2	10	96609	96618	60 %	20 %	0 %	20 %	188588416
135	NC_010723	TTACT	2	10	98885	98894	20 %	60 %	0 %	20 %	188589856
136	NC_010723	TAAAA	2	10	98912	98921	80 %	20 %	0 %	0 %	188589856
137	NC_010723	TAGTT	2	10	99086	99095	20 %	60 %	20 %	0 %	188589856
138	NC_010723	ATTTT	2	10	99665	99674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010723	TTAAT	2	10	101147	101156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010723	AAAGG	2	10	101291	101300	60 %	0 %	40 %	0 %	188588730
141	NC_010723	GTTTT	2	10	101540	101549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010723	GAATT	2	10	106245	106254	40 %	40 %	20 %	0 %	188590364
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