MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 12178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	GATG	2	8	126	133	25 %	25 %	50 %	0 %	188589439
2	NC_010723	TAAA	2	8	140	147	75 %	25 %	0 %	0 %	188589439
3	NC_010723	TGTT	2	8	333	340	0 %	75 %	25 %	0 %	188589439
4	NC_010723	TTTA	2	8	588	595	25 %	75 %	0 %	0 %	188589439
5	NC_010723	ATGC	2	8	631	638	25 %	25 %	25 %	25 %	188589439
6	NC_010723	ATTA	2	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	188589439
7	NC_010723	AAAT	2	8	2864	2871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010723	GAAA	2	8	3042	3049	75 %	0 %	25 %	0 %	188588344
9	NC_010723	GAAA	2	8	3363	3370	75 %	0 %	25 %	0 %	188590699
10	NC_010723	ATAA	2	8	3478	3485	75 %	25 %	0 %	0 %	188590699
11	NC_010723	TGAA	2	8	3647	3654	50 %	25 %	25 %	0 %	188590699
12	NC_010723	AAAG	2	8	3745	3752	75 %	0 %	25 %	0 %	188590699
13	NC_010723	ACAA	2	8	4161	4168	75 %	0 %	0 %	25 %	188590699
14	NC_010723	AGAA	2	8	4406	4413	75 %	0 %	25 %	0 %	188589365
15	NC_010723	ATTG	2	8	5189	5196	25 %	50 %	25 %	0 %	188588443
16	NC_010723	ATTT	2	8	5367	5374	25 %	75 %	0 %	0 %	188588443
17	NC_010723	TAGT	2	8	5628	5635	25 %	50 %	25 %	0 %	188588443
18	NC_010723	AGAA	2	8	5764	5771	75 %	0 %	25 %	0 %	188588443
19	NC_010723	AATG	2	8	5920	5927	50 %	25 %	25 %	0 %	188588443
20	NC_010723	TTTA	2	8	6166	6173	25 %	75 %	0 %	0 %	188588443
21	NC_010723	AATG	2	8	6295	6302	50 %	25 %	25 %	0 %	188588443
22	NC_010723	TTAG	2	8	6765	6772	25 %	50 %	25 %	0 %	188587904
23	NC_010723	ATGA	2	8	7965	7972	50 %	25 %	25 %	0 %	188587904
24	NC_010723	GAAG	2	8	8108	8115	50 %	0 %	50 %	0 %	188587904
25	NC_010723	TTAT	3	12	8324	8335	25 %	75 %	0 %	0 %	188587904
26	NC_010723	TGTA	2	8	8588	8595	25 %	50 %	25 %	0 %	188587904
27	NC_010723	GTGA	2	8	9963	9970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010723	TACT	2	8	11124	11131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010723	AGAA	2	8	11522	11529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010723	GCGA	2	8	11551	11558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010723	GCTA	2	8	12791	12798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010723	AGGT	2	8	12960	12967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010723	TCGT	2	8	13626	13633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010723	GACC	2	8	13988	13995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010723	CTGA	2	8	14180	14187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010723	AATA	2	8	14212	14219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010723	TTTA	2	8	14550	14557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010723	TAAA	2	8	14703	14710	75 %	25 %	0 %	0 %	188588820
39	NC_010723	TAAA	2	8	14715	14722	75 %	25 %	0 %	0 %	188588820
40	NC_010723	TTTA	2	8	14734	14741	25 %	75 %	0 %	0 %	188588820
41	NC_010723	TAAG	2	8	14748	14755	50 %	25 %	25 %	0 %	188588820
42	NC_010723	ATTC	2	8	14765	14772	25 %	50 %	0 %	25 %	188588820
43	NC_010723	TAAA	2	8	14919	14926	75 %	25 %	0 %	0 %	188588820
44	NC_010723	TAAA	2	8	15140	15147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010723	AAAT	2	8	15255	15262	75 %	25 %	0 %	0 %	188589343
46	NC_010723	TAAA	2	8	15365	15372	75 %	25 %	0 %	0 %	188589343
47	NC_010723	TAAA	2	8	15530	15537	75 %	25 %	0 %	0 %	188589343
48	NC_010723	TTAT	2	8	15842	15849	25 %	75 %	0 %	0 %	188588637
49	NC_010723	TATG	2	8	16005	16012	25 %	50 %	25 %	0 %	188588637
50	NC_010723	ACAA	2	8	16261	16268	75 %	0 %	0 %	25 %	188588637
51	NC_010723	AAAT	2	8	16269	16276	75 %	25 %	0 %	0 %	188588637
52	NC_010723	AAAT	2	8	16377	16384	75 %	25 %	0 %	0 %	188588637
53	NC_010723	CACT	2	8	16650	16657	25 %	25 %	0 %	50 %	188588637
54	NC_010723	AAAG	2	8	16792	16799	75 %	0 %	25 %	0 %	188588637
55	NC_010723	TGTA	2	8	16845	16852	25 %	50 %	25 %	0 %	188588637
56	NC_010723	TGGT	2	8	17462	17469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010723	ATTA	2	8	17569	17576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010723	AATG	2	8	17883	17890	50 %	25 %	25 %	0 %	188588464
59	NC_010723	GCGT	2	8	19236	19243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010723	ATTA	2	8	19300	19307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010723	ATGG	2	8	19542	19549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010723	TTAA	2	8	19600	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010723	GCGT	2	8	19726	19733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010723	ATTA	2	8	19790	19797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010723	ATTT	2	8	19953	19960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010723	TATG	2	8	20089	20096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010723	ATAG	2	8	20166	20173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010723	TAAT	2	8	20437	20444	50 %	50 %	0 %	0 %	188588138
69	NC_010723	TTGG	2	8	20457	20464	0 %	50 %	50 %	0 %	188588138
70	NC_010723	ATTA	2	8	20573	20580	50 %	50 %	0 %	0 %	188588138
71	NC_010723	TTTG	2	8	20585	20592	0 %	75 %	25 %	0 %	188588138
72	NC_010723	ATGG	2	8	20709	20716	25 %	25 %	50 %	0 %	188588138
73	NC_010723	TTTA	2	8	20813	20820	25 %	75 %	0 %	0 %	188588814
74	NC_010723	TTAA	2	8	21080	21087	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
75	NC_010723	AATT	2	8	21171	21178	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
76	NC_010723	AAAT	2	8	23074	23081	75 %	25 %	0 %	0 %	188588814
77	NC_010723	TTCA	2	8	23168	23175	25 %	50 %	0 %	25 %	188588814
78	NC_010723	AATT	2	8	23337	23344	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
79	NC_010723	TGAT	2	8	24042	24049	25 %	50 %	25 %	0 %	188588814
80	NC_010723	AGAA	2	8	24392	24399	75 %	0 %	25 %	0 %	188589987
81	NC_010723	ATTC	2	8	24594	24601	25 %	50 %	0 %	25 %	188589987
82	NC_010723	AAGT	2	8	24914	24921	50 %	25 %	25 %	0 %	188589987
83	NC_010723	AAAG	2	8	24936	24943	75 %	0 %	25 %	0 %	188589987
84	NC_010723	TAGA	2	8	25333	25340	50 %	25 %	25 %	0 %	188589987
85	NC_010723	GCAA	2	8	25616	25623	50 %	0 %	25 %	25 %	188589987
86	NC_010723	TAGA	2	8	25879	25886	50 %	25 %	25 %	0 %	188589987
87	NC_010723	AAGT	2	8	26012	26019	50 %	25 %	25 %	0 %	188589987
88	NC_010723	ATTT	2	8	26459	26466	25 %	75 %	0 %	0 %	188589987
89	NC_010723	ATAA	2	8	26616	26623	75 %	25 %	0 %	0 %	188589987
90	NC_010723	AGAA	2	8	27123	27130	75 %	0 %	25 %	0 %	188589987
91	NC_010723	AATA	2	8	27192	27199	75 %	25 %	0 %	0 %	188589987
92	NC_010723	TAAA	2	8	27277	27284	75 %	25 %	0 %	0 %	188589987
93	NC_010723	ATGA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	25 %	0 %	188589987
94	NC_010723	TAAA	2	8	27586	27593	75 %	25 %	0 %	0 %	188589987
95	NC_010723	GAAA	2	8	27679	27686	75 %	0 %	25 %	0 %	188589987
96	NC_010723	AGAA	2	8	28000	28007	75 %	0 %	25 %	0 %	188589987
97	NC_010723	TAAA	2	8	28214	28221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010723	AGTG	2	8	28228	28235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010723	TATT	2	8	28280	28287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010723	ACTA	2	8	28682	28689	50 %	25 %	0 %	25 %	188590689
101	NC_010723	AGTT	2	8	28999	29006	25 %	50 %	25 %	0 %	188590689
102	NC_010723	TATT	2	8	29059	29066	25 %	75 %	0 %	0 %	188590689
103	NC_010723	TATT	2	8	29131	29138	25 %	75 %	0 %	0 %	188590689
104	NC_010723	ATTT	2	8	29419	29426	25 %	75 %	0 %	0 %	188590689
105	NC_010723	TATT	2	8	29440	29447	25 %	75 %	0 %	0 %	188590689
106	NC_010723	AGAT	2	8	29768	29775	50 %	25 %	25 %	0 %	188588427
107	NC_010723	TGAA	2	8	29918	29925	50 %	25 %	25 %	0 %	188588427
108	NC_010723	AATT	2	8	30035	30042	50 %	50 %	0 %	0 %	188588427
109	NC_010723	ATGC	2	8	30251	30258	25 %	25 %	25 %	25 %	188588427
110	NC_010723	TAAA	2	8	31030	31037	75 %	25 %	0 %	0 %	188589244
111	NC_010723	CAAA	2	8	31515	31522	75 %	0 %	0 %	25 %	188589244
112	NC_010723	TAAT	2	8	31663	31670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010723	ATTA	2	8	31957	31964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010723	TAAA	2	8	32033	32040	75 %	25 %	0 %	0 %	188590164
115	NC_010723	ATAG	2	8	32464	32471	50 %	25 %	25 %	0 %	188590164
116	NC_010723	TAAT	2	8	32816	32823	50 %	50 %	0 %	0 %	188590164
117	NC_010723	AAAT	2	8	32893	32900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010723	TATT	2	8	32930	32937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010723	GTTA	2	8	33014	33021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010723	ACGG	2	8	33042	33049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010723	ATAA	2	8	33135	33142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010723	TTAG	2	8	33221	33228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010723	ATTA	2	8	33246	33253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010723	TAAT	2	8	33340	33347	50 %	50 %	0 %	0 %	188587836
125	NC_010723	AAAT	2	8	33529	33536	75 %	25 %	0 %	0 %	188587836
126	NC_010723	TAAA	2	8	33544	33551	75 %	25 %	0 %	0 %	188587836
127	NC_010723	ATTT	2	8	33880	33887	25 %	75 %	0 %	0 %	188587836
128	NC_010723	AAAG	2	8	34368	34375	75 %	0 %	25 %	0 %	188587836
129	NC_010723	TAAT	2	8	34450	34457	50 %	50 %	0 %	0 %	188587836
130	NC_010723	ATTT	3	12	34528	34539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010723	AATT	2	8	35383	35390	50 %	50 %	0 %	0 %	188587735
132	NC_010723	TATG	2	8	35930	35937	25 %	50 %	25 %	0 %	188590357
133	NC_010723	ATTT	2	8	36200	36207	25 %	75 %	0 %	0 %	188590357
134	NC_010723	ATTA	2	8	36215	36222	50 %	50 %	0 %	0 %	188590357
135	NC_010723	AAAT	2	8	36256	36263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010723	TAAA	2	8	36271	36278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010723	AATT	2	8	36384	36391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010723	ATTA	2	8	36414	36421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010723	TAGA	2	8	36976	36983	50 %	25 %	25 %	0 %	188588322
140	NC_010723	AAAT	2	8	37726	37733	75 %	25 %	0 %	0 %	188588322
141	NC_010723	AAAT	2	8	37859	37866	75 %	25 %	0 %	0 %	188588322
142	NC_010723	TTTA	2	8	38284	38291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010723	TTAA	2	8	38357	38364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010723	GTAT	2	8	38483	38490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010723	ATTA	2	8	38497	38504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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