MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 106906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_010723	CAG	2	6	18359	18364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588464
503	NC_010723	GTG	2	6	18404	18409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588464
504	NC_010723	GCA	2	6	18430	18435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588464
505	NC_010723	ACA	2	6	18498	18503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188588464
506	NC_010723	AGA	2	6	18543	18548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588464
507	NC_010723	TAG	2	6	18572	18577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588464
508	NC_010723	GCA	2	6	18658	18663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588464
509	NC_010723	GTT	2	6	18722	18727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188588464
510	NC_010723	AGA	2	6	18751	18756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588464
511	NC_010723	AGC	2	6	18846	18851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588464
512	NC_010723	AGA	2	6	18873	18878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588464
513	NC_010723	AAT	2	6	18935	18940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588464
514	NC_010723	AT	3	6	18949	18954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010723	ATA	2	6	18957	18962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010723	TAT	3	9	18994	19002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010723	T	6	6	19002	19007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010723	ATT	3	9	19037	19045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010723	T	7	7	19130	19136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010723	ATA	2	6	19172	19177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010723	GA	3	6	19193	19198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010723	GCGT	2	8	19236	19243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_010723	TC	3	6	19272	19277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_010723	T	9	9	19284	19292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010723	ATTA	2	8	19300	19307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010723	T	6	6	19434	19439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010723	TA	3	6	19454	19459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010723	AGA	2	6	19485	19490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010723	AT	3	6	19509	19514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010723	TAT	2	6	19517	19522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010723	TAA	2	6	19523	19528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010723	ATGG	2	8	19542	19549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010723	TTA	2	6	19572	19577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010723	TTAA	2	8	19600	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010723	ATA	2	6	19610	19615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010723	TAT	4	12	19624	19635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010723	TAA	2	6	19662	19667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010723	GA	3	6	19683	19688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010723	GCGT	2	8	19726	19733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
540	NC_010723	TC	3	6	19762	19767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_010723	T	6	6	19777	19782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010723	ATTA	2	8	19790	19797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010723	T	7	7	19924	19930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010723	ATTT	2	8	19953	19960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010723	TAAAA	2	10	19994	20003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010723	ATTTA	2	10	20024	20033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010723	TATG	2	8	20089	20096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010723	ATAG	2	8	20166	20173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010723	ATG	2	6	20188	20193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010723	TTA	2	6	20202	20207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010723	TAA	3	9	20217	20225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010723	AAG	2	6	20240	20245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010723	A	7	7	20339	20345	100 %	0 %	0 %	0 %	188588138
554	NC_010723	A	7	7	20373	20379	100 %	0 %	0 %	0 %	188588138
555	NC_010723	ATA	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588138
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557	NC_010723	AAAAG	2	10	20418	20427	80 %	0 %	20 %	0 %	188588138
558	NC_010723	TAAT	2	8	20437	20444	50 %	50 %	0 %	0 %	188588138
559	NC_010723	A	8	8	20445	20452	100 %	0 %	0 %	0 %	188588138
560	NC_010723	TTGG	2	8	20457	20464	0 %	50 %	50 %	0 %	188588138
561	NC_010723	ATT	2	6	20488	20493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588138
562	NC_010723	A	6	6	20529	20534	100 %	0 %	0 %	0 %	188588138
563	NC_010723	ATTA	2	8	20573	20580	50 %	50 %	0 %	0 %	188588138
564	NC_010723	TTTG	2	8	20585	20592	0 %	75 %	25 %	0 %	188588138
565	NC_010723	GTT	2	6	20625	20630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188588138
566	NC_010723	AAG	2	6	20661	20666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588138
567	NC_010723	GAA	2	6	20679	20684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588138
568	NC_010723	A	6	6	20683	20688	100 %	0 %	0 %	0 %	188588138
569	NC_010723	ATGG	2	8	20709	20716	25 %	25 %	50 %	0 %	188588138
570	NC_010723	ATA	2	6	20730	20735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588138
571	NC_010723	AAAGA	2	10	20750	20759	80 %	0 %	20 %	0 %	188588138
572	NC_010723	ATT	2	6	20773	20778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010723	TTTA	2	8	20813	20820	25 %	75 %	0 %	0 %	188588814
574	NC_010723	A	6	6	20866	20871	100 %	0 %	0 %	0 %	188588814
575	NC_010723	AAAGA	2	10	20888	20897	80 %	0 %	20 %	0 %	188588814
576	NC_010723	ATA	2	6	20900	20905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588814
577	NC_010723	TTA	2	6	20906	20911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588814
578	NC_010723	TAC	2	6	20932	20937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188588814
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580	NC_010723	TGG	2	6	21034	21039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588814
581	NC_010723	TTAA	2	8	21080	21087	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
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586	NC_010723	AATT	2	8	21171	21178	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
587	NC_010723	A	6	6	21188	21193	100 %	0 %	0 %	0 %	188588814
588	NC_010723	TATAA	2	10	21194	21203	60 %	40 %	0 %	0 %	188588814
589	NC_010723	GAT	2	6	21239	21244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588814
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592	NC_010723	TA	3	6	21317	21322	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
593	NC_010723	TGA	3	9	21328	21336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588814
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603	NC_010723	TA	3	6	21726	21731	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
604	NC_010723	ATA	2	6	21738	21743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588814
605	NC_010723	ATTAG	2	10	21779	21788	40 %	40 %	20 %	0 %	188588814
606	NC_010723	AT	3	6	21816	21821	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
607	NC_010723	GT	3	6	21827	21832	0 %	50 %	50 %	0 %	188588814
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617	NC_010723	TTA	2	6	22268	22273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588814
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621	NC_010723	GTA	2	6	22418	22423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588814
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623	NC_010723	GAA	2	6	22469	22474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588814
624	NC_010723	TA	4	8	22554	22561	50 %	50 %	0 %	0 %	188588814
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633	NC_010723	GAG	2	6	22958	22963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188588814
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