MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	TA	3	6	31	36	50 %	50 %	0 %	0 %	187935816
2	NC_010680	AT	3	6	105	110	50 %	50 %	0 %	0 %	187935816
3	NC_010680	TA	3	6	346	351	50 %	50 %	0 %	0 %	187935829
4	NC_010680	AT	3	6	398	403	50 %	50 %	0 %	0 %	187935829
5	NC_010680	AT	3	6	1022	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
6	NC_010680	AT	4	8	1561	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
7	NC_010680	TA	3	6	1996	2001	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
8	NC_010680	AT	4	8	3704	3711	50 %	50 %	0 %	0 %	187935809
9	NC_010680	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
10	NC_010680	AT	4	8	5987	5994	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
11	NC_010680	AT	4	8	6011	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
12	NC_010680	AT	3	6	6141	6146	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
13	NC_010680	CA	3	6	8083	8088	50 %	0 %	0 %	50 %	187935827
14	NC_010680	TA	4	8	8429	8436	50 %	50 %	0 %	0 %	187935822
15	NC_010680	AG	3	6	8698	8703	50 %	0 %	50 %	0 %	187935822
16	NC_010680	TG	3	6	8783	8788	0 %	50 %	50 %	0 %	187935822
17	NC_010680	TA	3	6	9487	9492	50 %	50 %	0 %	0 %	187935817
18	NC_010680	TA	3	6	10160	10165	50 %	50 %	0 %	0 %	187935817
19	NC_010680	AT	3	6	10752	10757	50 %	50 %	0 %	0 %	187935800
20	NC_010680	TG	3	6	11250	11255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010680	TA	3	6	11828	11833	50 %	50 %	0 %	0 %	187935796
22	NC_010680	GA	3	6	11973	11978	50 %	0 %	50 %	0 %	187935796
23	NC_010680	TA	3	6	12171	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
24	NC_010680	TA	3	6	12223	12228	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
25	NC_010680	TA	3	6	12861	12866	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
26	NC_010680	GA	3	6	13166	13171	50 %	0 %	50 %	0 %	187935801
27	NC_010680	AT	3	6	13241	13246	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
28	NC_010680	GA	3	6	13269	13274	50 %	0 %	50 %	0 %	187935831
29	NC_010680	TA	4	8	13785	13792	50 %	50 %	0 %	0 %	187935831
30	NC_010680	TA	3	6	14184	14189	50 %	50 %	0 %	0 %	187935831
31	NC_010680	GA	3	6	14380	14385	50 %	0 %	50 %	0 %	187935831
32	NC_010680	TA	3	6	14398	14403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010680	TA	3	6	14418	14423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010680	TA	3	6	15007	15012	50 %	50 %	0 %	0 %	187935841
35	NC_010680	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	187935841
36	NC_010680	AT	3	6	16049	16054	50 %	50 %	0 %	0 %	187935821
37	NC_010680	AT	3	6	16090	16095	50 %	50 %	0 %	0 %	187935821
38	NC_010680	AT	4	8	16166	16173	50 %	50 %	0 %	0 %	187935821
39	NC_010680	AT	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	187935823
40	NC_010680	AG	3	6	16711	16716	50 %	0 %	50 %	0 %	187935804
41	NC_010680	AT	3	6	16995	17000	50 %	50 %	0 %	0 %	187935810
42	NC_010680	AG	5	10	17161	17170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010680	GA	3	6	17576	17581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010680	CT	3	6	17752	17757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010680	AT	3	6	17782	17787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010680	TA	4	8	18074	18081	50 %	50 %	0 %	0 %	187935848
47	NC_010680	AT	3	6	18111	18116	50 %	50 %	0 %	0 %	187935848
48	NC_010680	AT	3	6	18555	18560	50 %	50 %	0 %	0 %	187935814
49	NC_010680	TA	3	6	18637	18642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010680	AT	3	6	18782	18787	50 %	50 %	0 %	0 %	187935808
51	NC_010680	TA	3	6	18939	18944	50 %	50 %	0 %	0 %	187935808
52	NC_010680	TA	3	6	18992	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010680	TC	3	6	19727	19732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010680	GA	3	6	20110	20115	50 %	0 %	50 %	0 %	187935798
55	NC_010680	AT	3	6	20877	20882	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
56	NC_010680	AT	3	6	20947	20952	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
57	NC_010680	CT	3	6	21265	21270	0 %	50 %	0 %	50 %	187935832
58	NC_010680	AT	3	6	21467	21472	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
59	NC_010680	TA	3	6	21539	21544	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
60	NC_010680	AT	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
61	NC_010680	TA	3	6	22085	22090	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
62	NC_010680	TG	3	6	22143	22148	0 %	50 %	50 %	0 %	187935832
63	NC_010680	AT	3	6	22407	22412	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
64	NC_010680	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
65	NC_010680	TA	3	6	22813	22818	50 %	50 %	0 %	0 %	187935836
66	NC_010680	AT	3	6	23068	23073	50 %	50 %	0 %	0 %	187935836
67	NC_010680	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
68	NC_010680	TA	3	6	23617	23622	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
69	NC_010680	TA	3	6	23744	23749	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
70	NC_010680	AT	3	6	23911	23916	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
71	NC_010680	AT	3	6	24002	24007	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
72	NC_010680	AT	3	6	24241	24246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010680	TA	3	6	24331	24336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010680	TA	4	8	24354	24361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76	NC_010680	AT	3	6	24472	24477	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
77	NC_010680	AG	3	6	24584	24589	50 %	0 %	50 %	0 %	187935839
78	NC_010680	AT	3	6	24590	24595	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
79	NC_010680	TA	3	6	24661	24666	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
80	NC_010680	TA	4	8	24779	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
81	NC_010680	TA	3	6	24853	24858	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
82	NC_010680	TA	4	8	24950	24957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010680	AT	3	6	24980	24985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010680	AG	3	6	25190	25195	50 %	0 %	50 %	0 %	187935807
85	NC_010680	AT	3	6	25248	25253	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
86	NC_010680	AT	3	6	25394	25399	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
87	NC_010680	AT	3	6	26050	26055	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
88	NC_010680	AG	3	6	26748	26753	50 %	0 %	50 %	0 %	187935807
89	NC_010680	AT	3	6	27018	27023	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
90	NC_010680	AT	3	6	27199	27204	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
91	NC_010680	AT	4	8	27337	27344	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
92	NC_010680	AT	3	6	27952	27957	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
93	NC_010680	AT	3	6	28092	28097	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
94	NC_010680	AT	3	6	28178	28183	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
95	NC_010680	AT	4	8	28285	28292	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
96	NC_010680	AT	3	6	28432	28437	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
97	NC_010680	AT	3	6	28507	28512	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
98	NC_010680	AT	3	6	28593	28598	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
99	NC_010680	AT	3	6	28937	28942	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
100	NC_010680	TA	3	6	29486	29491	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
101	NC_010680	AT	4	8	29633	29640	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
102	NC_010680	TA	3	6	29723	29728	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
103	NC_010680	AT	3	6	29876	29881	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
104	NC_010680	TA	3	6	29972	29977	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
105	NC_010680	TA	3	6	30121	30126	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
106	NC_010680	AT	3	6	30527	30532	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
107	NC_010680	TA	3	6	30547	30552	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
108	NC_010680	AT	3	6	30690	30695	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
109	NC_010680	TA	3	6	31105	31110	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
110	NC_010680	TA	3	6	31672	31677	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
111	NC_010680	AT	3	6	31900	31905	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
112	NC_010680	AT	3	6	32004	32009	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
113	NC_010680	TA	3	6	32077	32082	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
114	NC_010680	TA	3	6	32096	32101	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
115	NC_010680	TA	3	6	32176	32181	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
116	NC_010680	AT	3	6	32272	32277	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
117	NC_010680	TA	3	6	32585	32590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010680	AT	3	6	32692	32697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010680	TA	3	6	32717	32722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010680	AG	3	6	32962	32967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010680	AT	3	6	33473	33478	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
122	NC_010680	AT	5	10	33826	33835	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
123	NC_010680	TA	3	6	34057	34062	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
124	NC_010680	AT	3	6	34064	34069	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
125	NC_010680	TA	3	6	34229	34234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010680	AT	3	6	34268	34273	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
127	NC_010680	AT	3	6	34367	34372	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
128	NC_010680	TA	3	6	34505	34510	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
129	NC_010680	AT	3	6	34542	34547	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
130	NC_010680	TA	4	8	34839	34846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010680	TA	3	6	34906	34911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010680	AT	3	6	35101	35106	50 %	50 %	0 %	0 %	187935825
133	NC_010680	AT	3	6	35117	35122	50 %	50 %	0 %	0 %	187935825
134	NC_010680	TA	3	6	36017	36022	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
135	NC_010680	TA	3	6	36221	36226	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
136	NC_010680	AG	3	6	36261	36266	50 %	0 %	50 %	0 %	187935803
137	NC_010680	TA	3	6	36419	36424	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
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140	NC_010680	TA	3	6	36749	36754	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
141	NC_010680	AT	3	6	37459	37464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010680	AT	3	6	37488	37493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010680	AT	4	8	37646	37653	50 %	50 %	0 %	0 %	187935806
144	NC_010680	TA	3	6	38009	38014	50 %	50 %	0 %	0 %	187935806
145	NC_010680	TA	3	6	38426	38431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_010680	TA	3	6	38493	38498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_010680	TA	3	6	39089	39094	50 %	50 %	0 %	0 %	187935818
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152	NC_010680	AT	3	6	39823	39828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010680	TA	3	6	39875	39880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_010680	TA	3	6	40158	40163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010680	AT	3	6	40546	40551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.