MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 485

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	CT	4	8	3199	3206	0 %	50 %	0 %	50 %	172054859
2	NC_010547	TA	3	6	5331	5336	50 %	50 %	0 %	0 %	172054863
3	NC_010547	AG	3	6	5375	5380	50 %	0 %	50 %	0 %	172054863
4	NC_010547	CT	3	6	5641	5646	0 %	50 %	0 %	50 %	172054863
5	NC_010547	GA	3	6	6101	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	172054864
6	NC_010547	CA	3	6	6619	6624	50 %	0 %	0 %	50 %	172054864
7	NC_010547	AC	3	6	7066	7071	50 %	0 %	0 %	50 %	172054864
8	NC_010547	TC	3	6	7780	7785	0 %	50 %	0 %	50 %	172054865
9	NC_010547	TA	3	6	8123	8128	50 %	50 %	0 %	0 %	172054865
10	NC_010547	TA	3	6	9236	9241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010547	GA	3	6	10677	10682	50 %	0 %	50 %	0 %	172054868
12	NC_010547	CT	3	6	13328	13333	0 %	50 %	0 %	50 %	172054873
13	NC_010547	GA	3	6	13873	13878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010547	TC	3	6	14858	14863	0 %	50 %	0 %	50 %	172054875
15	NC_010547	GA	3	6	16410	16415	50 %	0 %	50 %	0 %	172054878
16	NC_010547	TG	3	6	17273	17278	0 %	50 %	50 %	0 %	172054879
17	NC_010547	AT	3	6	17758	17763	50 %	50 %	0 %	0 %	172054879
18	NC_010547	TA	3	6	18788	18793	50 %	50 %	0 %	0 %	172054880
19	NC_010547	GA	3	6	21836	21841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010547	GA	3	6	22723	22728	50 %	0 %	50 %	0 %	172054881
21	NC_010547	GA	3	6	23547	23552	50 %	0 %	50 %	0 %	172054882
22	NC_010547	GA	3	6	24324	24329	50 %	0 %	50 %	0 %	172054882
23	NC_010547	AT	3	6	24769	24774	50 %	50 %	0 %	0 %	172054883
24	NC_010547	AC	3	6	27351	27356	50 %	0 %	0 %	50 %	172054883
25	NC_010547	AT	3	6	27978	27983	50 %	50 %	0 %	0 %	172054884
26	NC_010547	AT	3	6	28527	28532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010547	CT	3	6	29036	29041	0 %	50 %	0 %	50 %	172054886
28	NC_010547	GA	3	6	31321	31326	50 %	0 %	50 %	0 %	172054886
29	NC_010547	AT	3	6	32928	32933	50 %	50 %	0 %	0 %	172054888
30	NC_010547	TA	3	6	33830	33835	50 %	50 %	0 %	0 %	172054889
31	NC_010547	TC	3	6	33898	33903	0 %	50 %	0 %	50 %	172054889
32	NC_010547	AT	3	6	34633	34638	50 %	50 %	0 %	0 %	172054889
33	NC_010547	AT	3	6	36226	36231	50 %	50 %	0 %	0 %	172054889
34	NC_010547	AC	3	6	36433	36438	50 %	0 %	0 %	50 %	172054889
35	NC_010547	AT	3	6	36604	36609	50 %	50 %	0 %	0 %	172054889
36	NC_010547	AC	3	6	37917	37922	50 %	0 %	0 %	50 %	172054890
37	NC_010547	CT	3	6	38278	38283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010547	GA	3	6	38304	38309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010547	AG	3	6	39436	39441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010547	GT	3	6	39808	39813	0 %	50 %	50 %	0 %	172054893
41	NC_010547	AC	3	6	41071	41076	50 %	0 %	0 %	50 %	172054893
42	NC_010547	AT	3	6	41828	41833	50 %	50 %	0 %	0 %	172054893
43	NC_010547	GA	3	6	43938	43943	50 %	0 %	50 %	0 %	172054894
44	NC_010547	TC	3	6	44225	44230	0 %	50 %	0 %	50 %	172054894
45	NC_010547	TA	3	6	45141	45146	50 %	50 %	0 %	0 %	172054895
46	NC_010547	GA	3	6	45832	45837	50 %	0 %	50 %	0 %	172054895
47	NC_010547	AG	3	6	46100	46105	50 %	0 %	50 %	0 %	172054895
48	NC_010547	GA	3	6	47177	47182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010547	TC	3	6	47207	47212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010547	CG	3	6	47765	47770	0 %	0 %	50 %	50 %	172054896
51	NC_010547	AC	3	6	52486	52491	50 %	0 %	0 %	50 %	172054901
52	NC_010547	AC	3	6	52872	52877	50 %	0 %	0 %	50 %	172054901
53	NC_010547	CA	3	6	53247	53252	50 %	0 %	0 %	50 %	172054901
54	NC_010547	TG	3	6	55608	55613	0 %	50 %	50 %	0 %	172054904
55	NC_010547	GT	3	6	55688	55693	0 %	50 %	50 %	0 %	172054904
56	NC_010547	AT	3	6	56029	56034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010547	AG	3	6	56391	56396	50 %	0 %	50 %	0 %	172054905
58	NC_010547	TA	3	6	57517	57522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010547	TG	3	6	61114	61119	0 %	50 %	50 %	0 %	172054909
60	NC_010547	TG	3	6	63360	63365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010547	GT	3	6	64207	64212	0 %	50 %	50 %	0 %	172054911
62	NC_010547	GA	3	6	66209	66214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010547	CT	3	6	66281	66286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010547	AG	3	6	66323	66328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010547	AT	3	6	66805	66810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010547	TA	3	6	67481	67486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010547	GA	3	6	69159	69164	50 %	0 %	50 %	0 %	172054918
68	NC_010547	GA	3	6	69429	69434	50 %	0 %	50 %	0 %	172054918
69	NC_010547	GT	3	6	72024	72029	0 %	50 %	50 %	0 %	172054919
70	NC_010547	AT	3	6	72753	72758	50 %	50 %	0 %	0 %	172054920
71	NC_010547	GA	3	6	74170	74175	50 %	0 %	50 %	0 %	172054921
72	NC_010547	CA	3	6	74780	74785	50 %	0 %	0 %	50 %	172054921
73	NC_010547	AT	3	6	74963	74968	50 %	50 %	0 %	0 %	172054921
74	NC_010547	AT	3	6	75655	75660	50 %	50 %	0 %	0 %	172054922
75	NC_010547	TG	3	6	77111	77116	0 %	50 %	50 %	0 %	172054924
76	NC_010547	TC	3	6	77513	77518	0 %	50 %	0 %	50 %	172054924
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81	NC_010547	AG	3	6	81078	81083	50 %	0 %	50 %	0 %	172054928
82	NC_010547	CT	3	6	82043	82048	0 %	50 %	0 %	50 %	172054929
83	NC_010547	TG	3	6	83530	83535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010547	AG	3	6	87644	87649	50 %	0 %	50 %	0 %	172054934
85	NC_010547	GA	3	6	91550	91555	50 %	0 %	50 %	0 %	172054938
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88	NC_010547	GA	3	6	95785	95790	50 %	0 %	50 %	0 %	172054943
89	NC_010547	AG	3	6	96094	96099	50 %	0 %	50 %	0 %	172054944
90	NC_010547	AT	3	6	96423	96428	50 %	50 %	0 %	0 %	172054944
91	NC_010547	AC	3	6	96551	96556	50 %	0 %	0 %	50 %	172054944
92	NC_010547	TC	3	6	98746	98751	0 %	50 %	0 %	50 %	172054947
93	NC_010547	GC	3	6	98927	98932	0 %	0 %	50 %	50 %	172054947
94	NC_010547	CT	3	6	99409	99414	0 %	50 %	0 %	50 %	172054948
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102	NC_010547	GA	3	6	106745	106750	50 %	0 %	50 %	0 %	172054952
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105	NC_010547	TC	3	6	110218	110223	0 %	50 %	0 %	50 %	172054957
106	NC_010547	GA	3	6	110710	110715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010547	TC	3	6	110717	110722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010547	TA	3	6	112510	112515	50 %	50 %	0 %	0 %	172054960
109	NC_010547	CT	3	6	112882	112887	0 %	50 %	0 %	50 %	172054961
110	NC_010547	AT	4	8	113012	113019	50 %	50 %	0 %	0 %	172054961
111	NC_010547	GA	3	6	114925	114930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010547	GA	3	6	116801	116806	50 %	0 %	50 %	0 %	172054965
113	NC_010547	TA	3	6	117564	117569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010547	AG	3	6	118301	118306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010547	GA	3	6	121363	121368	50 %	0 %	50 %	0 %	172054969
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119	NC_010547	AG	3	6	125165	125170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010547	AT	3	6	125642	125647	50 %	50 %	0 %	0 %	172054974
121	NC_010547	TG	3	6	126046	126051	0 %	50 %	50 %	0 %	172054974
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123	NC_010547	GA	3	6	130011	130016	50 %	0 %	50 %	0 %	172054982
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125	NC_010547	CA	4	8	131558	131565	50 %	0 %	0 %	50 %	172054986
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127	NC_010547	GA	3	6	132805	132810	50 %	0 %	50 %	0 %	172054987
128	NC_010547	TC	3	6	133164	133169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010547	GA	3	6	134624	134629	50 %	0 %	50 %	0 %	172054990
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131	NC_010547	GA	3	6	135618	135623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010547	AT	3	6	135635	135640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010547	AG	3	6	135686	135691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_010547	AT	3	6	143431	143436	50 %	50 %	0 %	0 %	172054999
143	NC_010547	GA	3	6	146319	146324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010547	GA	3	6	147206	147211	50 %	0 %	50 %	0 %	172055004
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