MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 8927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010547	GTA	2	6	198646	198651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055056
4002	NC_010547	AACCAA	2	12	198704	198715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055057
4003	NC_010547	ATT	2	6	198795	198800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055057
4004	NC_010547	AGA	2	6	198813	198818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055057
4005	NC_010547	T	8	8	198925	198932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010547	CTT	2	6	198946	198951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_010547	ACTA	2	8	199062	199069	50 %	25 %	0 %	25 %	172055058
4008	NC_010547	ATGA	2	8	199143	199150	50 %	25 %	25 %	0 %	172055058
4009	NC_010547	TA	3	6	199187	199192	50 %	50 %	0 %	0 %	172055058
4010	NC_010547	ACG	2	6	199228	199233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055058
4011	NC_010547	CCA	2	6	199263	199268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172055058
4012	NC_010547	ACT	2	6	199346	199351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055058
4013	NC_010547	TAG	2	6	199402	199407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055058
4014	NC_010547	AAG	2	6	199469	199474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055058
4015	NC_010547	TG	3	6	199494	199499	0 %	50 %	50 %	0 %	172055058
4016	NC_010547	GCACA	2	10	199506	199515	40 %	0 %	20 %	40 %	172055058
4017	NC_010547	TAC	2	6	199518	199523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055058
4018	NC_010547	ATC	2	6	199539	199544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_010547	AG	3	6	199552	199557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010547	TCTTTT	2	12	199572	199583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4021	NC_010547	CACT	2	8	199641	199648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_010547	CCT	2	6	199696	199701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_010547	TGA	2	6	199702	199707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010547	AGCA	2	8	199708	199715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_010547	GAC	2	6	199736	199741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_010547	CA	3	6	199768	199773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_010547	CTT	2	6	199791	199796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_010547	AAT	2	6	199929	199934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010547	AG	3	6	199975	199980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_010547	T	6	6	200085	200090	0 %	100 %	0 %	0 %	172055059
4031	NC_010547	AAG	2	6	200107	200112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055059
4032	NC_010547	AGGA	2	8	200159	200166	50 %	0 %	50 %	0 %	172055059
4033	NC_010547	AGA	2	6	200172	200177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055059
4034	NC_010547	AAAAG	2	10	200265	200274	80 %	0 %	20 %	0 %	172055059
4035	NC_010547	CTTT	2	8	200312	200319	0 %	75 %	0 %	25 %	172055060
4036	NC_010547	T	7	7	200317	200323	0 %	100 %	0 %	0 %	172055060
4037	NC_010547	TGT	3	9	200329	200337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055060
4038	NC_010547	CAT	2	6	200459	200464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055060
4039	NC_010547	TTG	2	6	200853	200858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055060
4040	NC_010547	GTC	2	6	200864	200869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055060
4041	NC_010547	G	6	6	200997	201002	0 %	0 %	100 %	0 %	172055060
4042	NC_010547	TTG	2	6	201057	201062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055060
4043	NC_010547	TTG	2	6	201190	201195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055060
4044	NC_010547	ACT	2	6	201214	201219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055060
4045	NC_010547	GTTG	2	8	201224	201231	0 %	50 %	50 %	0 %	172055060
4046	NC_010547	CTT	2	6	201294	201299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4047	NC_010547	GA	3	6	201323	201328	50 %	0 %	50 %	0 %	172055060
4048	NC_010547	T	6	6	201354	201359	0 %	100 %	0 %	0 %	172055060
4049	NC_010547	GTA	2	6	201496	201501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055060
4050	NC_010547	CTT	2	6	201531	201536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4051	NC_010547	TC	3	6	201643	201648	0 %	50 %	0 %	50 %	172055060
4052	NC_010547	CTG	2	6	201672	201677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055060
4053	NC_010547	TTA	2	6	201724	201729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055060
4054	NC_010547	TGAG	2	8	201844	201851	25 %	25 %	50 %	0 %	172055060
4055	NC_010547	TCCT	2	8	201967	201974	0 %	50 %	0 %	50 %	172055060
4056	NC_010547	GCT	2	6	202009	202014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055060
4057	NC_010547	T	6	6	202233	202238	0 %	100 %	0 %	0 %	172055060
4058	NC_010547	CTC	2	6	202256	202261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172055060
4059	NC_010547	ATA	2	6	202263	202268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055060
4060	NC_010547	AGC	2	6	202272	202277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055060
4061	NC_010547	TTC	2	6	202299	202304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4062	NC_010547	CGG	2	6	202487	202492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172055060
4063	NC_010547	TAA	2	6	202637	202642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055060
4064	NC_010547	CCT	2	6	202682	202687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172055060
4065	NC_010547	TTA	2	6	202732	202737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055060
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4067	NC_010547	TTCC	2	8	202788	202795	0 %	50 %	0 %	50 %	172055060
4068	NC_010547	TAG	2	6	202878	202883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055060
4069	NC_010547	CTT	2	6	202895	202900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4070	NC_010547	TTC	3	9	202920	202928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4071	NC_010547	AAT	2	6	202939	202944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055060
4072	NC_010547	TTC	2	6	202959	202964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4073	NC_010547	GTGGCT	2	12	202969	202980	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	172055060
4074	NC_010547	GA	3	6	203043	203048	50 %	0 %	50 %	0 %	172055060
4075	NC_010547	CTTT	2	8	203066	203073	0 %	75 %	0 %	25 %	172055060
4076	NC_010547	CTT	2	6	203402	203407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055060
4077	NC_010547	TAT	2	6	203441	203446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055060
4078	NC_010547	CAC	2	6	203540	203545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172055060
4079	NC_010547	TTA	2	6	203602	203607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055060
4080	NC_010547	CG	3	6	203637	203642	0 %	0 %	50 %	50 %	172055060
4081	NC_010547	GATC	2	8	203722	203729	25 %	25 %	25 %	25 %	172055060
4082	NC_010547	TCA	2	6	203836	203841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055060
4083	NC_010547	ATG	2	6	203893	203898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055060
4084	NC_010547	AT	3	6	203901	203906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_010547	ATT	2	6	204023	204028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055061
4086	NC_010547	AAAG	2	8	204029	204036	75 %	0 %	25 %	0 %	172055061
4087	NC_010547	AGA	3	9	204044	204052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055061
4088	NC_010547	AGA	2	6	204089	204094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055061
4089	NC_010547	AAC	2	6	204160	204165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055061
4090	NC_010547	AT	3	6	204176	204181	50 %	50 %	0 %	0 %	172055061
4091	NC_010547	GCA	2	6	204235	204240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_010547	TGC	2	6	204271	204276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_010547	AGT	2	6	204289	204294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010547	GAA	2	6	204393	204398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010547	ACCA	2	8	204433	204440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_010547	ATT	2	6	204463	204468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010547	T	6	6	204493	204498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_010547	GAT	2	6	204598	204603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055062
4099	NC_010547	TGAGT	2	10	204612	204621	20 %	40 %	40 %	0 %	172055062
4100	NC_010547	TCG	2	6	204626	204631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055062
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4105	NC_010547	TTG	2	6	204729	204734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055062
4106	NC_010547	TC	3	6	204740	204745	0 %	50 %	0 %	50 %	172055062
4107	NC_010547	ATC	2	6	204763	204768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055062
4108	NC_010547	TTG	2	6	204858	204863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055062
4109	NC_010547	CTA	2	6	204883	204888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055062
4110	NC_010547	AGT	2	6	204917	204922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055062
4111	NC_010547	CTT	2	6	204974	204979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055062
4112	NC_010547	TTCT	2	8	204993	205000	0 %	75 %	0 %	25 %	172055062
4113	NC_010547	GA	4	8	205022	205029	50 %	0 %	50 %	0 %	172055062
4114	NC_010547	ATC	2	6	205062	205067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055062
4115	NC_010547	T	7	7	205080	205086	0 %	100 %	0 %	0 %	172055062
4116	NC_010547	TAAT	2	8	205109	205116	50 %	50 %	0 %	0 %	172055062
4117	NC_010547	TCT	2	6	205156	205161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055063
4118	NC_010547	TCG	2	6	205162	205167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055063
4119	NC_010547	CTG	2	6	205214	205219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055063
4120	NC_010547	AG	3	6	205250	205255	50 %	0 %	50 %	0 %	172055063
4121	NC_010547	GGA	2	6	205261	205266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172055063
4122	NC_010547	AGT	2	6	205312	205317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055063
4123	NC_010547	GATGT	2	10	205320	205329	20 %	40 %	40 %	0 %	172055063
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4125	NC_010547	CTT	2	6	205367	205372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055063
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4401	NC_010547	CAAA	2	8	219310	219317	75 %	0 %	0 %	25 %	172055078
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4492	NC_010547	TTA	2	6	224045	224050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055081
4493	NC_010547	AGG	2	6	224071	224076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172055081
4494	NC_010547	ATACTC	2	12	224080	224091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055081
4495	NC_010547	GGTTG	2	10	224151	224160	0 %	40 %	60 %	0 %	172055081
4496	NC_010547	TTCT	2	8	224186	224193	0 %	75 %	0 %	25 %	172055081
4497	NC_010547	GTT	2	6	224229	224234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055081
4498	NC_010547	TCT	2	6	224300	224305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055081
4499	NC_010547	AAT	2	6	224327	224332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055081
4500	NC_010547	TCAA	2	8	224399	224406	50 %	25 %	0 %	25 %	172055081

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