MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 3502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	CAAAA	2	10	1508	1517	80 %	0 %	0 %	20 %	172034919
2	NC_010546	CCATA	2	10	3213	3222	40 %	20 %	0 %	40 %	172034921
3	NC_010546	AACGA	2	10	4066	4075	60 %	0 %	20 %	20 %	172034921
4	NC_010546	TAAAT	2	10	7147	7156	60 %	40 %	0 %	0 %	172034923
5	NC_010546	TTGGG	2	10	7202	7211	0 %	40 %	60 %	0 %	172034923
6	NC_010546	TTTTG	2	10	10097	10106	0 %	80 %	20 %	0 %	172034931
7	NC_010546	GCCAA	2	10	10275	10284	40 %	0 %	20 %	40 %	172034931
8	NC_010546	TCATT	2	10	10366	10375	20 %	60 %	0 %	20 %	172034931
9	NC_010546	AATGA	2	10	11180	11189	60 %	20 %	20 %	0 %	172034932
10	NC_010546	AGAAA	2	10	14090	14099	80 %	0 %	20 %	0 %	172034934
11	NC_010546	AGAAA	2	10	16263	16272	80 %	0 %	20 %	0 %	172034936
12	NC_010546	GATAG	2	10	17149	17158	40 %	20 %	40 %	0 %	172034937
13	NC_010546	AACTT	2	10	22321	22330	40 %	40 %	0 %	20 %	172034944
14	NC_010546	TAAAG	2	10	22514	22523	60 %	20 %	20 %	0 %	172034945
15	NC_010546	GCATC	2	10	23725	23734	20 %	20 %	20 %	40 %	172034946
16	NC_010546	TAAAA	2	10	25069	25078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010546	CTTGA	2	10	27662	27671	20 %	40 %	20 %	20 %	172034949
18	NC_010546	CTAAT	2	10	27676	27685	40 %	40 %	0 %	20 %	172034949
19	NC_010546	GGTTA	2	10	28059	28068	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010546	CTTTC	2	10	28326	28335	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010546	AATCA	2	10	29817	29826	60 %	20 %	0 %	20 %	172034952
22	NC_010546	TCATT	2	10	30279	30288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010546	TGAGA	2	10	31052	31061	40 %	20 %	40 %	0 %	172034953
24	NC_010546	AACCC	2	10	31328	31337	40 %	0 %	0 %	60 %	172034953
25	NC_010546	AAACC	2	10	32566	32575	60 %	0 %	0 %	40 %	172034956
26	NC_010546	AATAT	2	10	33009	33018	60 %	40 %	0 %	0 %	172034956
27	NC_010546	CTGCT	2	10	33461	33470	0 %	40 %	20 %	40 %	172034957
28	NC_010546	TTTAT	2	10	34654	34663	20 %	80 %	0 %	0 %	172034958
29	NC_010546	TACTC	2	10	38670	38679	20 %	40 %	0 %	40 %	172034962
30	NC_010546	ATGGC	2	10	40768	40777	20 %	20 %	40 %	20 %	172034968
31	NC_010546	TCTAG	2	10	42123	42132	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010546	TTTAA	2	10	42153	42162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010546	TGTTA	2	10	43154	43163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010546	TAAAG	2	10	43271	43280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010546	CCGTC	2	10	43823	43832	0 %	20 %	20 %	60 %	172034971
36	NC_010546	TTGGG	3	15	45427	45441	0 %	40 %	60 %	0 %	172034972
37	NC_010546	CTTTA	2	10	45824	45833	20 %	60 %	0 %	20 %	172034972
38	NC_010546	ATTAG	2	10	47448	47457	40 %	40 %	20 %	0 %	172034973
39	NC_010546	TAAAA	2	10	49318	49327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010546	TAAAT	2	10	50848	50857	60 %	40 %	0 %	0 %	172034977
41	NC_010546	CAGAA	2	10	50937	50946	60 %	0 %	20 %	20 %	172034977
42	NC_010546	GGAAT	2	10	51774	51783	40 %	20 %	40 %	0 %	172034978
43	NC_010546	CAGCG	2	10	53396	53405	20 %	0 %	40 %	40 %	172034979
44	NC_010546	TCCCA	2	10	54344	54353	20 %	20 %	0 %	60 %	172034981
45	NC_010546	TCCAA	2	10	56069	56078	40 %	20 %	0 %	40 %	172034982
46	NC_010546	TCTAT	2	10	62804	62813	20 %	60 %	0 %	20 %	172034987
47	NC_010546	GTCCT	2	10	67716	67725	0 %	40 %	20 %	40 %	172034994
48	NC_010546	ATTTA	2	10	69462	69471	40 %	60 %	0 %	0 %	172034994
49	NC_010546	CAGGA	2	10	72952	72961	40 %	0 %	40 %	20 %	172034995
50	NC_010546	AAAAC	2	10	73496	73505	80 %	0 %	0 %	20 %	172034995
51	NC_010546	CATCG	2	10	75704	75713	20 %	20 %	20 %	40 %	172034997
52	NC_010546	TAAAA	2	10	82361	82370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010546	GTTTA	2	10	82975	82984	20 %	60 %	20 %	0 %	172035006
54	NC_010546	TTTGT	2	10	84751	84760	0 %	80 %	20 %	0 %	172035008
55	NC_010546	CTTTT	2	10	85496	85505	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010546	TTAAT	2	10	85616	85625	40 %	60 %	0 %	0 %	172035009
57	NC_010546	TCCTT	2	10	89579	89588	0 %	60 %	0 %	40 %	172035012
58	NC_010546	AGGAA	2	10	89885	89894	60 %	0 %	40 %	0 %	172035013
59	NC_010546	TTACG	2	10	91222	91231	20 %	40 %	20 %	20 %	172035015
60	NC_010546	CATCA	2	10	94355	94364	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010546	AAAAC	2	10	94570	94579	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010546	TACCA	2	10	96622	96631	40 %	20 %	0 %	40 %	172035024
63	NC_010546	AATTA	2	10	97238	97247	60 %	40 %	0 %	0 %	172035025
64	NC_010546	CCCGT	2	10	99433	99442	0 %	20 %	20 %	60 %	172035026
65	NC_010546	TAAGC	2	10	103866	103875	40 %	20 %	20 %	20 %	172035030
66	NC_010546	CCTAC	2	10	104217	104226	20 %	20 %	0 %	60 %	172035030
67	NC_010546	TGGGA	2	10	107712	107721	20 %	20 %	60 %	0 %	172035031
68	NC_010546	CTTAA	2	10	109035	109044	40 %	40 %	0 %	20 %	172035032
69	NC_010546	TCGTT	2	10	109746	109755	0 %	60 %	20 %	20 %	172035033
70	NC_010546	ATTTT	2	10	110718	110727	20 %	80 %	0 %	0 %	172035034
71	NC_010546	ATATT	2	10	114209	114218	40 %	60 %	0 %	0 %	172035039
72	NC_010546	TTTAT	2	10	117260	117269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010546	TGGGG	2	10	117751	117760	0 %	20 %	80 %	0 %	172035043
74	NC_010546	GATGG	2	10	118633	118642	20 %	20 %	60 %	0 %	172035043
75	NC_010546	GCCAA	2	10	118648	118657	40 %	0 %	20 %	40 %	172035043
76	NC_010546	AATTT	2	10	121616	121625	40 %	60 %	0 %	0 %	172035048
77	NC_010546	AAAAG	2	10	122593	122602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010546	ATCTT	2	10	123418	123427	20 %	60 %	0 %	20 %	172035050
79	NC_010546	ATTTT	2	10	124103	124112	20 %	80 %	0 %	0 %	172035051
80	NC_010546	AACGT	2	10	124908	124917	40 %	20 %	20 %	20 %	172035052
81	NC_010546	AGAAA	2	10	125683	125692	80 %	0 %	20 %	0 %	172035053
82	NC_010546	CTTCT	2	10	129742	129751	0 %	60 %	0 %	40 %	172035058
83	NC_010546	AAGAT	2	10	129789	129798	60 %	20 %	20 %	0 %	172035058
84	NC_010546	CTAAG	2	10	130202	130211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010546	GTAGG	2	10	130221	130230	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010546	TTTAC	2	10	130270	130279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010546	AAAGG	2	10	130718	130727	60 %	0 %	40 %	0 %	172035059
88	NC_010546	AGGTA	2	10	131098	131107	40 %	20 %	40 %	0 %	172035059
89	NC_010546	TTAGA	2	10	133486	133495	40 %	40 %	20 %	0 %	172035061
90	NC_010546	AAAAG	2	10	134112	134121	80 %	0 %	20 %	0 %	172035061
91	NC_010546	CTTTC	2	10	134340	134349	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010546	AGTTT	2	10	134521	134530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010546	AGGAA	2	10	135448	135457	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010546	TAAAA	2	10	136100	136109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010546	ATTAT	2	10	136209	136218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010546	TTTTG	2	10	138295	138304	0 %	80 %	20 %	0 %	172035065
97	NC_010546	CTTAG	2	10	139780	139789	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010546	TAAAA	2	10	143035	143044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010546	TTAGA	2	10	144453	144462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010546	TTGAT	2	10	145270	145279	20 %	60 %	20 %	0 %	172035071
101	NC_010546	TGTTA	2	10	148792	148801	20 %	60 %	20 %	0 %	172035075
102	NC_010546	AGTAT	2	10	148910	148919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010546	GAAAA	2	10	150039	150048	80 %	0 %	20 %	0 %	172035076
104	NC_010546	TTTCT	2	10	150211	150220	0 %	80 %	0 %	20 %	172035077
105	NC_010546	TTGTT	2	10	152581	152590	0 %	80 %	20 %	0 %	172035081
106	NC_010546	AGAAT	2	10	152592	152601	60 %	20 %	20 %	0 %	172035081
107	NC_010546	AATTG	2	10	152794	152803	40 %	40 %	20 %	0 %	172035081
108	NC_010546	AAGAG	2	10	153098	153107	60 %	0 %	40 %	0 %	172035081
109	NC_010546	TATCA	2	10	154524	154533	40 %	40 %	0 %	20 %	172035082
110	NC_010546	AAAAT	2	10	155321	155330	80 %	20 %	0 %	0 %	172035083
111	NC_010546	TAAAT	2	10	156108	156117	60 %	40 %	0 %	0 %	172035083
112	NC_010546	GCTAA	2	10	156150	156159	40 %	20 %	20 %	20 %	172035083
113	NC_010546	AGATT	2	10	156828	156837	40 %	40 %	20 %	0 %	172035084
114	NC_010546	CAATT	2	10	157398	157407	40 %	40 %	0 %	20 %	172035085
115	NC_010546	TGGTA	2	10	158060	158069	20 %	40 %	40 %	0 %	172035086
116	NC_010546	TGATG	2	10	159587	159596	20 %	40 %	40 %	0 %	172035088
117	NC_010546	TTGTT	2	10	162538	162547	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010546	CCTTT	2	10	162717	162726	0 %	60 %	0 %	40 %	172035091
119	NC_010546	GTGAC	2	10	163937	163946	20 %	20 %	40 %	20 %	172035092
120	NC_010546	TTCTC	2	10	165556	165565	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010546	TCAAC	2	10	167986	167995	40 %	20 %	0 %	40 %	172035097
122	NC_010546	GGATT	2	10	168228	168237	20 %	40 %	40 %	0 %	172035097
123	NC_010546	TAACT	2	10	171463	171472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010546	CTCGC	2	10	172787	172796	0 %	20 %	20 %	60 %	172035103
125	NC_010546	GCACG	2	10	173207	173216	20 %	0 %	40 %	40 %	172035103
126	NC_010546	TCAAC	2	10	174017	174026	40 %	20 %	0 %	40 %	172035104
127	NC_010546	ACTTA	2	10	177228	177237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010546	CTTCC	2	10	177471	177480	0 %	40 %	0 %	60 %	172035110
129	NC_010546	CTTAA	2	10	178046	178055	40 %	40 %	0 %	20 %	172035110
130	NC_010546	ATTTT	2	10	179333	179342	20 %	80 %	0 %	0 %	172035111
131	NC_010546	TTGTC	2	10	182011	182020	0 %	60 %	20 %	20 %	172035112
132	NC_010546	ATTAA	2	10	183203	183212	60 %	40 %	0 %	0 %	172035113
133	NC_010546	ATAAG	2	10	183405	183414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010546	AGGGA	2	10	185042	185051	40 %	0 %	60 %	0 %	172035115
135	NC_010546	TAAAA	2	10	186061	186070	80 %	20 %	0 %	0 %	172035116
136	NC_010546	TAAAT	2	10	186331	186340	60 %	40 %	0 %	0 %	172035116
137	NC_010546	GAATT	2	10	186397	186406	40 %	40 %	20 %	0 %	172035116
138	NC_010546	AATAG	2	10	189051	189060	60 %	20 %	20 %	0 %	172035118
139	NC_010546	GAGTT	2	10	191274	191283	20 %	40 %	40 %	0 %	172035120
140	NC_010546	TAAAT	2	10	195867	195876	60 %	40 %	0 %	0 %	172035124
141	NC_010546	CAACA	2	10	197212	197221	60 %	0 %	0 %	40 %	172035125
142	NC_010546	TAATA	2	10	197751	197760	60 %	40 %	0 %	0 %	172035125
143	NC_010546	AGGCA	2	10	198513	198522	40 %	0 %	40 %	20 %	172035126
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146	NC_010546	AGAAT	2	10	202696	202705	60 %	20 %	20 %	0 %	172035129
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148	NC_010546	AAAAT	2	10	205149	205158	80 %	20 %	0 %	0 %	172035130
149	NC_010546	TGATA	2	10	206453	206462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010546	TCTCA	2	10	208437	208446	20 %	40 %	0 %	40 %	172035136
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152	NC_010546	TTTAG	2	10	209451	209460	20 %	60 %	20 %	0 %	172035136
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154	NC_010546	GGATG	2	10	210042	210051	20 %	20 %	60 %	0 %	172035136
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156	NC_010546	GCTAT	2	10	211945	211954	20 %	40 %	20 %	20 %	172035138
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158	NC_010546	AGCTT	2	10	214334	214343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_010546	TTGGG	2	10	214521	214530	0 %	40 %	60 %	0 %	172035142
160	NC_010546	CTATA	2	10	216970	216979	40 %	40 %	0 %	20 %	172035146
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169	NC_010546	TAAAA	2	10	233240	233249	80 %	20 %	0 %	0 %	172035159
170	NC_010546	ATAAA	2	10	233843	233852	80 %	20 %	0 %	0 %	172035159
171	NC_010546	TAAAA	2	10	234207	234216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010546	TAGGG	2	10	234710	234719	20 %	20 %	60 %	0 %	172035160
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176	NC_010546	ACTCG	2	10	240294	240303	20 %	20 %	20 %	40 %	172035164
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181	NC_010546	ACTCG	2	10	245726	245735	20 %	20 %	20 %	40 %	172035168
182	NC_010546	CTAAA	2	10	246038	246047	60 %	20 %	0 %	20 %	172035168
183	NC_010546	GTTTG	2	10	246708	246717	0 %	60 %	40 %	0 %	172035169
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186	NC_010546	TCAAC	2	10	252085	252094	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
187	NC_010546	CCTAT	2	10	253374	253383	20 %	40 %	0 %	40 %	172035176
188	NC_010546	TTTAT	2	10	253899	253908	20 %	80 %	0 %	0 %	172035176
189	NC_010546	TGACT	2	10	255726	255735	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
190	NC_010546	TAAAA	3	15	255860	255874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_010546	GTAAG	2	10	260378	260387	40 %	20 %	40 %	0 %	172035186
192	NC_010546	CGTAA	2	10	262870	262879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_010546	TAAGT	2	10	263460	263469	40 %	40 %	20 %	0 %	172035189
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195	NC_010546	ATTAA	2	10	264362	264371	60 %	40 %	0 %	0 %	172035190
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198	NC_010546	TTGTT	2	10	268191	268200	0 %	80 %	20 %	0 %	172035192
199	NC_010546	TCAAG	2	10	270402	270411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_010546	CATAA	2	10	275720	275729	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
201	NC_010546	AATTA	2	10	276894	276903	60 %	40 %	0 %	0 %	172035202
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203	NC_010546	TCATT	2	10	279876	279885	20 %	60 %	0 %	20 %	172035204
204	NC_010546	GAACA	2	10	286023	286032	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
205	NC_010546	AATTT	2	10	290459	290468	40 %	60 %	0 %	0 %	172035212
206	NC_010546	TTATC	2	10	292974	292983	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
207	NC_010546	TTAAT	2	10	294156	294165	40 %	60 %	0 %	0 %	172035215
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214	NC_010546	CCTTT	2	10	306755	306764	0 %	60 %	0 %	40 %	172035225
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223	NC_010546	ATCAA	2	10	325221	325230	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
224	NC_010546	ATTAA	2	10	326278	326287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_010546	TGATT	2	10	328146	328155	20 %	60 %	20 %	0 %	172035243
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233	NC_010546	TTTTG	2	10	344959	344968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
234	NC_010546	TAACA	2	10	346671	346680	60 %	20 %	0 %	20 %	172035264
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241	NC_010546	TAACT	2	10	359315	359324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_010546	TAAAA	2	10	359528	359537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_010546	CCAGG	2	10	359962	359971	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
244	NC_010546	AAATG	2	10	361793	361802	60 %	20 %	20 %	0 %	172035276
245	NC_010546	TAAAA	2	10	362180	362189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_010546	TATTT	2	10	363158	363167	20 %	80 %	0 %	0 %	172035278
247	NC_010546	TCTAT	2	10	365841	365850	20 %	60 %	0 %	20 %	172035280
248	NC_010546	ATTTA	2	10	372043	372052	40 %	60 %	0 %	0 %	172035287
249	NC_010546	ATCTC	2	10	372744	372753	20 %	40 %	0 %	40 %	172035287
250	NC_010546	AGATA	2	10	375666	375675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010546	CGTAG	2	10	378516	378525	20 %	20 %	40 %	20 %	172035291
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254	NC_010546	GATAG	2	10	379952	379961	40 %	20 %	40 %	0 %	172035292
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256	NC_010546	TACCT	2	10	382517	382526	20 %	40 %	0 %	40 %	172035293
257	NC_010546	TATTT	2	10	383547	383556	20 %	80 %	0 %	0 %	172035294
258	NC_010546	GAATT	2	10	384959	384968	40 %	40 %	20 %	0 %	172035295
259	NC_010546	CAAAA	2	10	387512	387521	80 %	0 %	0 %	20 %	172035299
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261	NC_010546	ATTAA	2	10	388294	388303	60 %	40 %	0 %	0 %	172035300
262	NC_010546	ATAAG	2	10	389502	389511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010546	TATCA	2	10	393975	393984	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_010546	AAATG	2	10	396470	396479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010546	GTCTT	2	10	396520	396529	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_010546	AAACC	2	10	401063	401072	60 %	0 %	0 %	40 %	172035313
267	NC_010546	AGCAA	2	10	401396	401405	60 %	0 %	20 %	20 %	172035313
268	NC_010546	ACCCC	2	10	403361	403370	20 %	0 %	0 %	80 %	172035315
269	NC_010546	GGGTT	2	10	403886	403895	0 %	40 %	60 %	0 %	172035315
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399	NC_010546	ATCAA	2	10	583441	583450	60 %	20 %	0 %	20 %	172035494
400	NC_010546	GGTTG	2	10	584522	584531	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
401	NC_010546	TTAAA	2	10	584612	584621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_010546	GGTTG	2	10	585281	585290	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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