MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 12986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	AAAG	2	8	815	822	75 %	0 %	25 %	0 %	172034918
2	NC_010546	TTTG	2	8	1025	1032	0 %	75 %	25 %	0 %	172034919
3	NC_010546	TCGC	2	8	1892	1899	0 %	25 %	25 %	50 %	172034919
4	NC_010546	ATTT	2	8	2315	2322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010546	CAGA	2	8	2378	2385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010546	GTTT	2	8	2493	2500	0 %	75 %	25 %	0 %	172034921
7	NC_010546	TAAA	2	8	2607	2614	75 %	25 %	0 %	0 %	172034921
8	NC_010546	ACCG	2	8	3325	3332	25 %	0 %	25 %	50 %	172034921
9	NC_010546	AATT	2	8	3340	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	172034921
10	NC_010546	ACTC	2	8	3763	3770	25 %	25 %	0 %	50 %	172034921
11	NC_010546	AATG	2	8	4078	4085	50 %	25 %	25 %	0 %	172034921
12	NC_010546	AATA	2	8	4178	4185	75 %	25 %	0 %	0 %	172034921
13	NC_010546	ATTT	2	8	5795	5802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010546	AACT	2	8	7313	7320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010546	CAAA	2	8	7569	7576	75 %	0 %	0 %	25 %	172034924
16	NC_010546	TGAT	2	8	8119	8126	25 %	50 %	25 %	0 %	172034925
17	NC_010546	AATT	2	8	8281	8288	50 %	50 %	0 %	0 %	172034926
18	NC_010546	TATT	2	8	8351	8358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010546	CTAA	2	8	8452	8459	50 %	25 %	0 %	25 %	172034927
20	NC_010546	TAGT	2	8	9380	9387	25 %	50 %	25 %	0 %	172034929
21	NC_010546	CAAT	2	8	9444	9451	50 %	25 %	0 %	25 %	172034929
22	NC_010546	CAAT	2	8	9864	9871	50 %	25 %	0 %	25 %	172034929
23	NC_010546	ACTA	2	8	10956	10963	50 %	25 %	0 %	25 %	172034931
24	NC_010546	AAAT	2	8	11020	11027	75 %	25 %	0 %	0 %	172034931
25	NC_010546	ATAA	2	8	11159	11166	75 %	25 %	0 %	0 %	172034932
26	NC_010546	GGAT	2	8	12008	12015	25 %	25 %	50 %	0 %	172034932
27	NC_010546	TACT	2	8	12625	12632	25 %	50 %	0 %	25 %	172034933
28	NC_010546	ATCA	2	8	12966	12973	50 %	25 %	0 %	25 %	172034933
29	NC_010546	TAGT	2	8	13224	13231	25 %	50 %	25 %	0 %	172034933
30	NC_010546	AGCC	2	8	14004	14011	25 %	0 %	25 %	50 %	172034934
31	NC_010546	AAGA	2	8	14302	14309	75 %	0 %	25 %	0 %	172034934
32	NC_010546	TTTC	2	8	14460	14467	0 %	75 %	0 %	25 %	172034934
33	NC_010546	GTAA	2	8	14775	14782	50 %	25 %	25 %	0 %	172034934
34	NC_010546	TAAT	2	8	15153	15160	50 %	50 %	0 %	0 %	172034934
35	NC_010546	ACCC	2	8	15583	15590	25 %	0 %	0 %	75 %	172034935
36	NC_010546	TCCT	2	8	15726	15733	0 %	50 %	0 %	50 %	172034935
37	NC_010546	TTCT	2	8	16589	16596	0 %	75 %	0 %	25 %	172034937
38	NC_010546	ACCA	2	8	16789	16796	50 %	0 %	0 %	50 %	172034937
39	NC_010546	TAAT	2	8	17442	17449	50 %	50 %	0 %	0 %	172034937
40	NC_010546	ATAA	2	8	17666	17673	75 %	25 %	0 %	0 %	172034937
41	NC_010546	AGAA	2	8	17751	17758	75 %	0 %	25 %	0 %	172034937
42	NC_010546	CAAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	172034939
43	NC_010546	GTGA	2	8	19015	19022	25 %	25 %	50 %	0 %	304570680
44	NC_010546	AATC	2	8	19940	19947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010546	CTTT	2	8	20933	20940	0 %	75 %	0 %	25 %	172034942
46	NC_010546	TTCG	2	8	21582	21589	0 %	50 %	25 %	25 %	172034944
47	NC_010546	TTTC	2	8	21771	21778	0 %	75 %	0 %	25 %	172034944
48	NC_010546	TAAC	2	8	22069	22076	50 %	25 %	0 %	25 %	172034944
49	NC_010546	TGTC	2	8	22501	22508	0 %	50 %	25 %	25 %	172034945
50	NC_010546	ATTA	2	8	22619	22626	50 %	50 %	0 %	0 %	172034945
51	NC_010546	TAAC	2	8	23515	23522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010546	AAGA	2	8	24268	24275	75 %	0 %	25 %	0 %	172034946
53	NC_010546	CCAT	2	8	24492	24499	25 %	25 %	0 %	50 %	172034946
54	NC_010546	ATCC	2	8	25396	25403	25 %	25 %	0 %	50 %	172034947
55	NC_010546	AAGA	2	8	25788	25795	75 %	0 %	25 %	0 %	172034947
56	NC_010546	TCCA	2	8	27143	27150	25 %	25 %	0 %	50 %	172034949
57	NC_010546	CACT	2	8	27541	27548	25 %	25 %	0 %	50 %	172034949
58	NC_010546	TGGC	2	8	28808	28815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010546	TCCT	2	8	30508	30515	0 %	50 %	0 %	50 %	172034953
60	NC_010546	TAGG	2	8	30521	30528	25 %	25 %	50 %	0 %	172034953
61	NC_010546	TAAT	2	8	31396	31403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010546	AACC	2	8	31506	31513	50 %	0 %	0 %	50 %	172034954
63	NC_010546	GTTA	2	8	31730	31737	25 %	50 %	25 %	0 %	172034954
64	NC_010546	GTTA	2	8	31772	31779	25 %	50 %	25 %	0 %	172034954
65	NC_010546	GTTA	2	8	31814	31821	25 %	50 %	25 %	0 %	172034954
66	NC_010546	GTTA	2	8	31856	31863	25 %	50 %	25 %	0 %	172034954
67	NC_010546	ATTA	2	8	32306	32313	50 %	50 %	0 %	0 %	172034956
68	NC_010546	TTAA	2	8	32470	32477	50 %	50 %	0 %	0 %	172034956
69	NC_010546	AAGG	2	8	32584	32591	50 %	0 %	50 %	0 %	172034956
70	NC_010546	AGGT	2	8	33287	33294	25 %	25 %	50 %	0 %	172034956
71	NC_010546	TGAT	2	8	33387	33394	25 %	50 %	25 %	0 %	172034956
72	NC_010546	ATTC	2	8	33396	33403	25 %	50 %	0 %	25 %	172034956
73	NC_010546	GATA	2	8	33685	33692	50 %	25 %	25 %	0 %	172034957
74	NC_010546	TTTG	2	8	33856	33863	0 %	75 %	25 %	0 %	172034957
75	NC_010546	CTTG	2	8	34014	34021	0 %	50 %	25 %	25 %	172034957
76	NC_010546	ATAA	2	8	34031	34038	75 %	25 %	0 %	0 %	172034957
77	NC_010546	AAAT	2	8	34431	34438	75 %	25 %	0 %	0 %	172034957
78	NC_010546	TGAT	2	8	34591	34598	25 %	50 %	25 %	0 %	172034958
79	NC_010546	CAAT	2	8	34726	34733	50 %	25 %	0 %	25 %	172034958
80	NC_010546	AATT	2	8	34734	34741	50 %	50 %	0 %	0 %	172034958
81	NC_010546	CCAT	2	8	34772	34779	25 %	25 %	0 %	50 %	172034958
82	NC_010546	AATT	2	8	34935	34942	50 %	50 %	0 %	0 %	172034958
83	NC_010546	TGAT	2	8	35640	35647	25 %	50 %	25 %	0 %	172034958
84	NC_010546	TGTC	2	8	35715	35722	0 %	50 %	25 %	25 %	172034958
85	NC_010546	TTCC	2	8	36923	36930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010546	ATAG	2	8	37409	37416	50 %	25 %	25 %	0 %	172034961
87	NC_010546	AAAT	2	8	37571	37578	75 %	25 %	0 %	0 %	172034961
88	NC_010546	TTGA	2	8	37632	37639	25 %	50 %	25 %	0 %	172034961
89	NC_010546	ACAA	2	8	37664	37671	75 %	0 %	0 %	25 %	172034961
90	NC_010546	TAAA	2	8	38020	38027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010546	TAAA	2	8	38095	38102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010546	AATT	2	8	38952	38959	50 %	50 %	0 %	0 %	172034963
93	NC_010546	ATTT	2	8	39616	39623	25 %	75 %	0 %	0 %	172034965
94	NC_010546	ATTG	2	8	39647	39654	25 %	50 %	25 %	0 %	172034965
95	NC_010546	GTAT	2	8	40023	40030	25 %	50 %	25 %	0 %	172034966
96	NC_010546	TTTA	2	8	40102	40109	25 %	75 %	0 %	0 %	172034966
97	NC_010546	TCTT	2	8	40500	40507	0 %	75 %	0 %	25 %	172034967
98	NC_010546	AACA	2	8	40738	40745	75 %	0 %	0 %	25 %	172034968
99	NC_010546	CAAT	2	8	40894	40901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010546	TATC	2	8	40967	40974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010546	ATTG	2	8	41053	41060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010546	TTGT	2	8	41401	41408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010546	CATT	2	8	41627	41634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010546	GAAA	2	8	41722	41729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010546	TCAA	2	8	41840	41847	50 %	25 %	0 %	25 %	172034969
106	NC_010546	TGGT	2	8	42202	42209	0 %	50 %	50 %	0 %	172034970
107	NC_010546	TTAT	2	8	42345	42352	25 %	75 %	0 %	0 %	172034970
108	NC_010546	ATGA	2	8	42353	42360	50 %	25 %	25 %	0 %	172034970
109	NC_010546	ATTT	2	8	42857	42864	25 %	75 %	0 %	0 %	172034970
110	NC_010546	ATTA	2	8	42952	42959	50 %	50 %	0 %	0 %	172034970
111	NC_010546	ATTT	2	8	42987	42994	25 %	75 %	0 %	0 %	172034970
112	NC_010546	GTTA	2	8	43508	43515	25 %	50 %	25 %	0 %	172034971
113	NC_010546	TGAG	2	8	44167	44174	25 %	25 %	50 %	0 %	172034972
114	NC_010546	CACC	2	8	44450	44457	25 %	0 %	0 %	75 %	172034972
115	NC_010546	AACC	2	8	44516	44523	50 %	0 %	0 %	50 %	172034972
116	NC_010546	CTTT	2	8	47138	47145	0 %	75 %	0 %	25 %	172034973
117	NC_010546	TAAT	2	8	47371	47378	50 %	50 %	0 %	0 %	172034973
118	NC_010546	TCCG	2	8	47587	47594	0 %	25 %	25 %	50 %	172034973
119	NC_010546	TATC	2	8	47902	47909	25 %	50 %	0 %	25 %	172034973
120	NC_010546	ATTA	2	8	48683	48690	50 %	50 %	0 %	0 %	172034974
121	NC_010546	ACTA	2	8	49364	49371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010546	AAAG	2	8	49481	49488	75 %	0 %	25 %	0 %	172034975
123	NC_010546	ATTT	2	8	49943	49950	25 %	75 %	0 %	0 %	172034976
124	NC_010546	TAAT	2	8	50047	50054	50 %	50 %	0 %	0 %	172034976
125	NC_010546	GTAG	2	8	50285	50292	25 %	25 %	50 %	0 %	172034976
126	NC_010546	AATT	2	8	50442	50449	50 %	50 %	0 %	0 %	172034977
127	NC_010546	TAAT	2	8	50648	50655	50 %	50 %	0 %	0 %	172034977
128	NC_010546	ATTA	2	8	50955	50962	50 %	50 %	0 %	0 %	172034977
129	NC_010546	ATAA	2	8	51355	51362	75 %	25 %	0 %	0 %	172034977
130	NC_010546	TGAT	2	8	52980	52987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010546	GGTT	2	8	53831	53838	0 %	50 %	50 %	0 %	172034980
132	NC_010546	TAAT	2	8	54090	54097	50 %	50 %	0 %	0 %	172034980
133	NC_010546	AATC	2	8	54844	54851	50 %	25 %	0 %	25 %	172034981
134	NC_010546	TAAA	2	8	55252	55259	75 %	25 %	0 %	0 %	172034981
135	NC_010546	ATAA	2	8	56977	56984	75 %	25 %	0 %	0 %	172034983
136	NC_010546	TGTT	2	8	57053	57060	0 %	75 %	25 %	0 %	172034983
137	NC_010546	CTAA	2	8	57658	57665	50 %	25 %	0 %	25 %	172034983
138	NC_010546	TTTG	2	8	58016	58023	0 %	75 %	25 %	0 %	172034983
139	NC_010546	TTAA	2	8	58723	58730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010546	CAAA	2	8	58794	58801	75 %	0 %	0 %	25 %	172034984
141	NC_010546	CAAA	2	8	61839	61846	75 %	0 %	0 %	25 %	172034985
142	NC_010546	ATCA	2	8	62227	62234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010546	TGAA	2	8	62484	62491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_010546	ATCA	2	8	62906	62913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_010546	TAAT	2	8	71490	71497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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