MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 70683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	TCT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
2	NC_010546	AAT	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
3	NC_010546	TCC	2	6	253	258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
4	NC_010546	GTT	2	6	285	290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034918
5	NC_010546	TCC	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
6	NC_010546	TCT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
7	NC_010546	CCA	2	6	458	463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034918
8	NC_010546	TCA	3	9	642	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034918
9	NC_010546	AAT	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
10	NC_010546	TTC	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
11	NC_010546	AAT	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
12	NC_010546	TCC	2	6	809	814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
13	NC_010546	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034918
14	NC_010546	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
15	NC_010546	AGA	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034919
16	NC_010546	TCT	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034919
17	NC_010546	AAT	2	6	1221	1226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034919
18	NC_010546	GTC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
19	NC_010546	TGA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034919
20	NC_010546	GCA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034919
21	NC_010546	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
22	NC_010546	AAC	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034919
23	NC_010546	TCC	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034919
24	NC_010546	GTT	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034919
25	NC_010546	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
26	NC_010546	GCT	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
27	NC_010546	ATC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034919
28	NC_010546	CTG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034920
29	NC_010546	CAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034920
30	NC_010546	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034920
31	NC_010546	CAA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010546	ATA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010546	ACG	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010546	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
35	NC_010546	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
36	NC_010546	TAA	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
37	NC_010546	CCA	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
38	NC_010546	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
39	NC_010546	CTA	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
40	NC_010546	TAG	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
41	NC_010546	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
42	NC_010546	ATA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
43	NC_010546	ATT	2	6	3025	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
44	NC_010546	CCA	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
45	NC_010546	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
46	NC_010546	CCA	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
47	NC_010546	GCT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
48	NC_010546	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
49	NC_010546	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
50	NC_010546	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
51	NC_010546	CTA	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
52	NC_010546	GCA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
53	NC_010546	AAT	3	9	4255	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
54	NC_010546	GTT	2	6	4351	4356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
55	NC_010546	ATC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
56	NC_010546	CAC	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
57	NC_010546	ATC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
58	NC_010546	TCA	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
59	NC_010546	AAC	2	6	4550	4555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034921
60	NC_010546	AGC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
61	NC_010546	CTG	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
62	NC_010546	ATC	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
63	NC_010546	ACC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
64	NC_010546	TAA	2	6	4918	4923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
65	NC_010546	GCC	2	6	4930	4935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034921
66	NC_010546	GCT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
67	NC_010546	TGT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
68	NC_010546	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
69	NC_010546	GAG	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034921
70	NC_010546	TCT	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034921
71	NC_010546	AAG	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
72	NC_010546	CGT	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010546	CAT	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010546	CCA	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
75	NC_010546	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
76	NC_010546	AGC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034922
77	NC_010546	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
78	NC_010546	CTG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034922
79	NC_010546	TCA	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
80	NC_010546	CCG	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034922
81	NC_010546	GTT	2	6	6191	6196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034922
82	NC_010546	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034922
83	NC_010546	ACC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
84	NC_010546	TCA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
85	NC_010546	TCA	3	9	6428	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
86	NC_010546	GAA	2	6	6515	6520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010546	GAG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034923
88	NC_010546	CTT	2	6	6666	6671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034923
89	NC_010546	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
90	NC_010546	TGA	3	9	6716	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
91	NC_010546	GAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
92	NC_010546	TGT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034923
93	NC_010546	ACC	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034923
94	NC_010546	ATA	2	6	6967	6972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
95	NC_010546	ATG	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
96	NC_010546	CAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034923
97	NC_010546	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
98	NC_010546	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
99	NC_010546	ATA	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010546	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034924
101	NC_010546	CCT	2	6	7452	7457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034924
102	NC_010546	ATC	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034924
103	NC_010546	ATT	2	6	7528	7533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034924
104	NC_010546	ATC	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034924
105	NC_010546	ATT	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034924
106	NC_010546	TAA	2	6	7759	7764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010546	TGT	2	6	7775	7780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010546	GAC	3	9	7852	7860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010546	TGC	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034925
110	NC_010546	TAA	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034925
111	NC_010546	ATT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034925
112	NC_010546	AGA	2	6	8004	8009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034925
113	NC_010546	TGT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034925
114	NC_010546	CAA	2	6	8104	8109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034925
115	NC_010546	GTT	3	9	8130	8138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034926
116	NC_010546	AAT	2	6	8174	8179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034926
117	NC_010546	GTT	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034926
118	NC_010546	TCG	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
119	NC_010546	GCT	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
120	NC_010546	ACT	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034926
121	NC_010546	CTT	2	6	8274	8279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034926
122	NC_010546	GTC	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
123	NC_010546	TAT	2	6	8340	8345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010546	CAT	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034927
125	NC_010546	TAA	2	6	8715	8720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034927
126	NC_010546	CCT	2	6	8770	8775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_010546	GTT	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034928
128	NC_010546	CGG	2	6	9019	9024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034928
129	NC_010546	ATG	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034928
130	NC_010546	TTA	2	6	9191	9196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010546	ACT	3	9	9283	9291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010546	TAG	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034929
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256	NC_010546	CTG	2	6	18417	18422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034939
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258	NC_010546	ATA	2	6	18615	18620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034939
259	NC_010546	CAA	2	6	18704	18709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034939
260	NC_010546	ATG	2	6	18710	18715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034939
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277	NC_010546	GGC	2	6	19731	19736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_010546	TAT	2	6	19778	19783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_010546	ATT	2	6	19860	19865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_010546	TAT	2	6	19999	20004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_010546	TTA	2	6	20011	20016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010546	AAC	2	6	20209	20214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034940
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331	NC_010546	ATT	2	6	23383	23388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_010546	TGA	2	6	23542	23547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_010546	CGG	2	6	26608	26613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034949
373	NC_010546	TAA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034949
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500	NC_010546	GTA	2	6	36109	36114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034959

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