MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010546	GAA	2	6	181833	181838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035112
4002	NC_010546	GA	3	6	181931	181936	50 %	0 %	50 %	0 %	172035112
4003	NC_010546	GA	3	6	181947	181952	50 %	0 %	50 %	0 %	172035112
4004	NC_010546	CTCC	2	8	181983	181990	0 %	25 %	0 %	75 %	172035112
4005	NC_010546	TTGTC	2	10	182011	182020	0 %	60 %	20 %	20 %	172035112
4006	NC_010546	TAT	2	6	182049	182054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035112
4007	NC_010546	ATT	2	6	182066	182071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035112
4008	NC_010546	TTG	2	6	182139	182144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035112
4009	NC_010546	TGAA	2	8	182173	182180	50 %	25 %	25 %	0 %	172035112
4010	NC_010546	TGG	2	6	182375	182380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035112
4011	NC_010546	TCAA	2	8	182383	182390	50 %	25 %	0 %	25 %	172035112
4012	NC_010546	CTC	2	6	182394	182399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035112
4013	NC_010546	CCA	2	6	182618	182623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035112
4014	NC_010546	ACA	2	6	182639	182644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035112
4015	NC_010546	ATT	2	6	182664	182669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035112
4016	NC_010546	TAT	2	6	182745	182750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035112
4017	NC_010546	TAA	2	6	182792	182797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035112
4018	NC_010546	TC	3	6	182807	182812	0 %	50 %	0 %	50 %	172035112
4019	NC_010546	CTT	2	6	182824	182829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035112
4020	NC_010546	T	6	6	182867	182872	0 %	100 %	0 %	0 %	172035112
4021	NC_010546	GTT	2	6	182929	182934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010546	A	6	6	182936	182941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010546	T	6	6	182952	182957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010546	ACA	2	6	182972	182977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035113
4025	NC_010546	TCA	2	6	183018	183023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035113
4026	NC_010546	AAT	2	6	183035	183040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035113
4027	NC_010546	A	6	6	183041	183046	100 %	0 %	0 %	0 %	172035113
4028	NC_010546	TAA	3	9	183061	183069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035113
4029	NC_010546	ATT	2	6	183070	183075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035113
4030	NC_010546	TCC	2	6	183106	183111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035113
4031	NC_010546	TAA	2	6	183127	183132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035113
4032	NC_010546	ATT	2	6	183176	183181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035113
4033	NC_010546	ATTAA	2	10	183203	183212	60 %	40 %	0 %	0 %	172035113
4034	NC_010546	TAA	2	6	183255	183260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035113
4035	NC_010546	TTA	2	6	183267	183272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035113
4036	NC_010546	ACC	2	6	183295	183300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035113
4037	NC_010546	ATT	2	6	183359	183364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010546	ATAAG	2	10	183405	183414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010546	GCA	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035114
4040	NC_010546	TTG	2	6	183633	183638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035114
4041	NC_010546	AAC	2	6	183709	183714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035114
4042	NC_010546	CATT	2	8	183734	183741	25 %	50 %	0 %	25 %	172035114
4043	NC_010546	T	6	6	183755	183760	0 %	100 %	0 %	0 %	172035114
4044	NC_010546	ACA	2	6	183773	183778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035114
4045	NC_010546	CG	3	6	183834	183839	0 %	0 %	50 %	50 %	172035114
4046	NC_010546	AAT	2	6	183885	183890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035114
4047	NC_010546	T	6	6	183893	183898	0 %	100 %	0 %	0 %	172035114
4048	NC_010546	TAT	2	6	183928	183933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035114
4049	NC_010546	GAA	2	6	183936	183941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035114
4050	NC_010546	A	6	6	183940	183945	100 %	0 %	0 %	0 %	172035114
4051	NC_010546	ATC	2	6	183967	183972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035114
4052	NC_010546	TGC	2	6	184060	184065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035114
4053	NC_010546	ATT	2	6	184158	184163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035114
4054	NC_010546	CGTT	2	8	184217	184224	0 %	50 %	25 %	25 %	172035114
4055	NC_010546	TCC	2	6	184319	184324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035114
4056	NC_010546	GTG	2	6	184406	184411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035114
4057	NC_010546	AGC	2	6	184413	184418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_010546	GA	3	6	184444	184449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010546	AAG	2	6	184578	184583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035115
4060	NC_010546	CTC	2	6	184601	184606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035115
4061	NC_010546	TGA	2	6	184635	184640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035115
4062	NC_010546	CGA	3	9	184668	184676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035115
4063	NC_010546	TGA	2	6	184758	184763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035115
4064	NC_010546	A	6	6	184817	184822	100 %	0 %	0 %	0 %	172035115
4065	NC_010546	GT	3	6	184865	184870	0 %	50 %	50 %	0 %	172035115
4066	NC_010546	CCT	2	6	184975	184980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035115
4067	NC_010546	TAG	2	6	184992	184997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035115
4068	NC_010546	TAT	2	6	185001	185006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035115
4069	NC_010546	AGGGA	2	10	185042	185051	40 %	0 %	60 %	0 %	172035115
4070	NC_010546	GAA	2	6	185102	185107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035115
4071	NC_010546	ATT	2	6	185125	185130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035115
4072	NC_010546	AAC	2	6	185199	185204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035115
4073	NC_010546	AAG	2	6	185259	185264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035115
4074	NC_010546	TGGATG	2	12	185361	185372	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	172035115
4075	NC_010546	G	6	6	185379	185384	0 %	0 %	100 %	0 %	172035115
4076	NC_010546	AACC	2	8	185392	185399	50 %	0 %	0 %	50 %	172035115
4077	NC_010546	AGC	2	6	185416	185421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035115
4078	NC_010546	GAT	2	6	185450	185455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035115
4079	NC_010546	TAT	2	6	185633	185638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010546	TTTTCT	2	12	185663	185674	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	172035116
4081	NC_010546	TAAA	2	8	185692	185699	75 %	25 %	0 %	0 %	172035116
4082	NC_010546	TAA	2	6	185707	185712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4083	NC_010546	GGA	2	6	185735	185740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035116
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4085	NC_010546	TAA	2	6	185791	185796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4086	NC_010546	GGA	2	6	185807	185812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035116
4087	NC_010546	CGA	2	6	185821	185826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035116
4088	NC_010546	AAT	2	6	185869	185874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4089	NC_010546	ATA	2	6	185880	185885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4090	NC_010546	AAAG	2	8	185962	185969	75 %	0 %	25 %	0 %	172035116
4091	NC_010546	CCTAAC	2	12	185999	186010	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	172035116
4092	NC_010546	TAAAA	2	10	186061	186070	80 %	20 %	0 %	0 %	172035116
4093	NC_010546	TAA	2	6	186076	186081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4094	NC_010546	AATT	2	8	186181	186188	50 %	50 %	0 %	0 %	172035116
4095	NC_010546	ATA	2	6	186216	186221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4096	NC_010546	CCT	2	6	186248	186253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035116
4097	NC_010546	TAAAT	2	10	186331	186340	60 %	40 %	0 %	0 %	172035116
4098	NC_010546	GAATT	2	10	186397	186406	40 %	40 %	20 %	0 %	172035116
4099	NC_010546	TA	3	6	186424	186429	50 %	50 %	0 %	0 %	172035116
4100	NC_010546	TAA	3	9	186481	186489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4101	NC_010546	TAAA	2	8	186520	186527	75 %	25 %	0 %	0 %	172035116
4102	NC_010546	AAT	3	9	186622	186630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4103	NC_010546	AAT	3	9	186650	186658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
4104	NC_010546	GCA	2	6	186668	186673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035116
4105	NC_010546	CCA	2	6	186674	186679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035116
4106	NC_010546	AAAT	2	8	186685	186692	75 %	25 %	0 %	0 %	172035116
4107	NC_010546	CAG	2	6	186760	186765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035117
4108	NC_010546	AATAAA	2	12	186787	186798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	172035117
4109	NC_010546	TAT	2	6	186823	186828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035117
4110	NC_010546	TGT	2	6	186846	186851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035117
4111	NC_010546	CAT	2	6	186908	186913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035117
4112	NC_010546	A	6	6	186956	186961	100 %	0 %	0 %	0 %	172035117
4113	NC_010546	TTTCTT	2	12	187018	187029	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	172035117
4114	NC_010546	AATT	2	8	187043	187050	50 %	50 %	0 %	0 %	172035117
4115	NC_010546	TCAC	2	8	187104	187111	25 %	25 %	0 %	50 %	172035117
4116	NC_010546	ATA	2	6	187115	187120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035117
4117	NC_010546	GCT	2	6	187158	187163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035117
4118	NC_010546	T	7	7	187284	187290	0 %	100 %	0 %	0 %	172035117
4119	NC_010546	GCT	2	6	187404	187409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035117
4120	NC_010546	TAA	2	6	187436	187441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035117
4121	NC_010546	TCA	2	6	187455	187460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035117
4122	NC_010546	GAG	2	6	187483	187488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035117
4123	NC_010546	ATA	2	6	187490	187495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035117
4124	NC_010546	TCAAAT	2	12	187609	187620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035117
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4251	NC_010546	CTTGTT	2	12	193946	193957	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	172035122
4252	NC_010546	TAA	2	6	193959	193964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035122
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4269	NC_010546	T	7	7	194872	194878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_010546	TTAA	2	8	194928	194935	50 %	50 %	0 %	0 %	172035123
4271	NC_010546	GTT	2	6	194959	194964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035123
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4283	NC_010546	AGT	2	6	195381	195386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4352	NC_010546	ATT	3	9	198245	198253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_010546	AAG	2	6	198431	198436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035126
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4359	NC_010546	GTA	2	6	198619	198624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035126
4360	NC_010546	CTG	2	6	198632	198637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035126
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4370	NC_010546	T	6	6	198991	198996	0 %	100 %	0 %	0 %	172035126
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