MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010546	A	6	6	23369	23374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010546	ATT	2	6	23383	23388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010546	ATC	2	6	23389	23394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010546	GTA	2	6	23414	23419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010546	TAAC	2	8	23515	23522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_010546	TGA	2	6	23542	23547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010546	TAA	2	6	23556	23561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034946
508	NC_010546	GCATC	2	10	23725	23734	20 %	20 %	20 %	40 %	172034946
509	NC_010546	CTA	2	6	23749	23754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034946
510	NC_010546	GAA	2	6	23760	23765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034946
511	NC_010546	AAG	2	6	24127	24132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034946
512	NC_010546	TAA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034946
513	NC_010546	AAGA	2	8	24268	24275	75 %	0 %	25 %	0 %	172034946
514	NC_010546	CTT	2	6	24460	24465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034946
515	NC_010546	CCAT	2	8	24492	24499	25 %	25 %	0 %	50 %	172034946
516	NC_010546	TTG	2	6	24668	24673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034946
517	NC_010546	CTG	2	6	24679	24684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034946
518	NC_010546	ATG	2	6	24718	24723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034946
519	NC_010546	ATA	2	6	24753	24758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034946
520	NC_010546	T	7	7	24778	24784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010546	AAT	2	6	24796	24801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010546	T	6	6	24831	24836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010546	A	6	6	24867	24872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010546	TAAAA	2	10	25069	25078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010546	AGA	2	6	25079	25084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010546	AAT	2	6	25088	25093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010546	TAG	2	6	25109	25114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010546	AGA	2	6	25121	25126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010546	GTC	2	6	25150	25155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034947
530	NC_010546	T	6	6	25158	25163	0 %	100 %	0 %	0 %	172034947
531	NC_010546	ATC	2	6	25167	25172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034947
532	NC_010546	ATT	2	6	25245	25250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034947
533	NC_010546	A	6	6	25299	25304	100 %	0 %	0 %	0 %	172034947
534	NC_010546	ATCC	2	8	25396	25403	25 %	25 %	0 %	50 %	172034947
535	NC_010546	GTT	2	6	25426	25431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034947
536	NC_010546	GTT	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034947
537	NC_010546	TCA	2	6	25489	25494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034947
538	NC_010546	AGA	2	6	25498	25503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034947
539	NC_010546	CGG	2	6	25524	25529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034947
540	NC_010546	ATT	2	6	25603	25608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034947
541	NC_010546	A	7	7	25634	25640	100 %	0 %	0 %	0 %	172034947
542	NC_010546	GAA	2	6	25646	25651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034947
543	NC_010546	GCA	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034947
544	NC_010546	ATC	2	6	25749	25754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034947
545	NC_010546	AAGA	2	8	25788	25795	75 %	0 %	25 %	0 %	172034947
546	NC_010546	AT	3	6	25887	25892	50 %	50 %	0 %	0 %	172034948
547	NC_010546	GAT	2	6	25903	25908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034948
548	NC_010546	GAGTTA	2	12	25933	25944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034948
549	NC_010546	TCT	2	6	25993	25998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010546	A	6	6	26047	26052	100 %	0 %	0 %	0 %	172034949
551	NC_010546	CA	3	6	26150	26155	50 %	0 %	0 %	50 %	172034949
552	NC_010546	TA	3	6	26161	26166	50 %	50 %	0 %	0 %	172034949
553	NC_010546	AAC	2	6	26175	26180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034949
554	NC_010546	CAA	2	6	26275	26280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034949
555	NC_010546	CAG	2	6	26417	26422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034949
556	NC_010546	CAC	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
557	NC_010546	TCC	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034949
558	NC_010546	CCA	2	6	26506	26511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
559	NC_010546	TCA	2	6	26584	26589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034949
560	NC_010546	CAC	2	6	26600	26605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
561	NC_010546	CGG	2	6	26608	26613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034949
562	NC_010546	TAA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034949
563	NC_010546	CGA	2	6	26631	26636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034949
564	NC_010546	CT	3	6	26642	26647	0 %	50 %	0 %	50 %	172034949
565	NC_010546	CCA	2	6	26770	26775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
566	NC_010546	AAACAC	2	12	26846	26857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034949
567	NC_010546	A	6	6	26904	26909	100 %	0 %	0 %	0 %	172034949
568	NC_010546	GCGATC	2	12	26914	26925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172034949
569	NC_010546	CCG	2	6	26947	26952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034949
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571	NC_010546	CAT	2	6	27029	27034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034949
572	NC_010546	AGC	2	6	27038	27043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034949
573	NC_010546	AAT	2	6	27068	27073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034949
574	NC_010546	CAT	2	6	27077	27082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034949
575	NC_010546	GAA	2	6	27083	27088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034949
576	NC_010546	ACC	2	6	27096	27101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
577	NC_010546	TCC	2	6	27131	27136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034949
578	NC_010546	TCCA	2	8	27143	27150	25 %	25 %	0 %	50 %	172034949
579	NC_010546	AGG	2	6	27330	27335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034949
580	NC_010546	GA	3	6	27418	27423	50 %	0 %	50 %	0 %	172034949
581	NC_010546	TGG	2	6	27429	27434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034949
582	NC_010546	CACT	2	8	27541	27548	25 %	25 %	0 %	50 %	172034949
583	NC_010546	CTTGA	2	10	27662	27671	20 %	40 %	20 %	20 %	172034949
584	NC_010546	CTAAT	2	10	27676	27685	40 %	40 %	0 %	20 %	172034949
585	NC_010546	ACC	2	6	27714	27719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
586	NC_010546	A	7	7	27746	27752	100 %	0 %	0 %	0 %	172034949
587	NC_010546	ACC	2	6	27759	27764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034949
588	NC_010546	TCT	2	6	27771	27776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034949
589	NC_010546	GGTTA	2	10	28059	28068	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010546	TCA	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034950
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592	NC_010546	CTT	2	6	28211	28216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034950
593	NC_010546	CGA	2	6	28246	28251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034950
594	NC_010546	ATC	2	6	28263	28268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034950
595	NC_010546	TAA	2	6	28314	28319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034950
596	NC_010546	CTTTC	2	10	28326	28335	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
597	NC_010546	ATT	2	6	28351	28356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010546	AAT	2	6	28360	28365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010546	T	6	6	28445	28450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010546	ATC	2	6	28462	28467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010546	TAG	2	6	28537	28542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010546	ATA	2	6	28552	28557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010546	AAC	2	6	28580	28585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010546	T	6	6	28615	28620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010546	T	6	6	28625	28630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010546	T	6	6	28708	28713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010546	GT	3	6	28797	28802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010546	TGGC	2	8	28808	28815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
609	NC_010546	CGA	2	6	28844	28849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010546	TCA	2	6	28915	28920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034951
611	NC_010546	GAC	2	6	28934	28939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034951
612	NC_010546	TTC	2	6	28974	28979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034951
613	NC_010546	T	7	7	29175	29181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010546	CAA	2	6	29185	29190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010546	TAT	4	12	29234	29245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010546	ATC	2	6	29249	29254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010546	T	6	6	29262	29267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010546	TAA	2	6	29295	29300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010546	T	6	6	29359	29364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010546	TCC	2	6	29386	29391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_010546	GT	3	6	29634	29639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010546	A	6	6	29677	29682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010546	ATG	2	6	29685	29690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034952
624	NC_010546	TAA	2	6	29804	29809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034952
625	NC_010546	AATCA	2	10	29817	29826	60 %	20 %	0 %	20 %	172034952
626	NC_010546	TAT	2	6	29844	29849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034952
627	NC_010546	A	7	7	29950	29956	100 %	0 %	0 %	0 %	172034952
628	NC_010546	TCCTGA	2	12	29984	29995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172034952
629	NC_010546	AG	3	6	30015	30020	50 %	0 %	50 %	0 %	172034952
630	NC_010546	TCT	2	6	30036	30041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034952
631	NC_010546	TA	3	6	30120	30125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010546	ATC	2	6	30166	30171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010546	TTA	2	6	30194	30199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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