MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010546	TAA	3	9	271873	271881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035195
6002	NC_010546	AGC	2	6	271882	271887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035195
6003	NC_010546	GTT	2	6	271977	271982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035195
6004	NC_010546	CAA	2	6	272067	272072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035195
6005	NC_010546	TA	3	6	272082	272087	50 %	50 %	0 %	0 %	172035195
6006	NC_010546	TCC	3	9	272116	272124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035195
6007	NC_010546	ACG	3	9	272158	272166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035195
6008	NC_010546	AT	3	6	272168	272173	50 %	50 %	0 %	0 %	172035195
6009	NC_010546	ATA	2	6	272220	272225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035195
6010	NC_010546	TTTC	2	8	272325	272332	0 %	75 %	0 %	25 %	172035195
6011	NC_010546	ATT	2	6	272356	272361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035195
6012	NC_010546	T	6	6	272403	272408	0 %	100 %	0 %	0 %	172035195
6013	NC_010546	AAT	2	6	272411	272416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035195
6014	NC_010546	T	6	6	272437	272442	0 %	100 %	0 %	0 %	172035195
6015	NC_010546	TGT	2	6	272534	272539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035195
6016	NC_010546	ATT	2	6	272581	272586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035195
6017	NC_010546	AAT	2	6	272611	272616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035195
6018	NC_010546	TTC	2	6	272617	272622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035195
6019	NC_010546	GTT	2	6	272651	272656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035195
6020	NC_010546	T	7	7	272662	272668	0 %	100 %	0 %	0 %	172035195
6021	NC_010546	TGCTTC	2	12	272674	272685	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	172035195
6022	NC_010546	GAT	2	6	272697	272702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035195
6023	NC_010546	GTT	2	6	272777	272782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035195
6024	NC_010546	TAAA	2	8	272794	272801	75 %	25 %	0 %	0 %	172035195
6025	NC_010546	AATT	2	8	272820	272827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_010546	ATT	2	6	272836	272841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_010546	CTT	2	6	272846	272851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_010546	T	6	6	272898	272903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010546	ATA	2	6	273045	273050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035196
6030	NC_010546	CTC	2	6	273081	273086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035196
6031	NC_010546	TCC	2	6	273196	273201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035196
6032	NC_010546	A	6	6	273211	273216	100 %	0 %	0 %	0 %	172035196
6033	NC_010546	AGG	2	6	273229	273234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035196
6034	NC_010546	CGA	2	6	273249	273254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035196
6035	NC_010546	TAAT	2	8	273267	273274	50 %	50 %	0 %	0 %	172035196
6036	NC_010546	T	6	6	273283	273288	0 %	100 %	0 %	0 %	172035196
6037	NC_010546	CTT	2	6	273312	273317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035196
6038	NC_010546	CA	3	6	273345	273350	50 %	0 %	0 %	50 %	172035196
6039	NC_010546	CAA	2	6	273456	273461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035196
6040	NC_010546	TACCAA	2	12	273519	273530	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	172035196
6041	NC_010546	TAT	2	6	273546	273551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035196
6042	NC_010546	ACC	2	6	273582	273587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035196
6043	NC_010546	A	6	6	273624	273629	100 %	0 %	0 %	0 %	172035196
6044	NC_010546	ATT	2	6	273632	273637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035196
6045	NC_010546	TAT	2	6	273785	273790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_010546	AGC	2	6	273884	273889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_010546	TTA	2	6	273890	273895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010546	AGA	2	6	273929	273934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035197
6049	NC_010546	ATTA	2	8	273947	273954	50 %	50 %	0 %	0 %	172035197
6050	NC_010546	A	7	7	274069	274075	100 %	0 %	0 %	0 %	172035197
6051	NC_010546	A	6	6	274081	274086	100 %	0 %	0 %	0 %	172035197
6052	NC_010546	ATA	2	6	274126	274131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035197
6053	NC_010546	CAA	2	6	274191	274196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035197
6054	NC_010546	TTAACC	2	12	274254	274265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035197
6055	NC_010546	TTA	2	6	274293	274298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035197
6056	NC_010546	T	6	6	274346	274351	0 %	100 %	0 %	0 %	172035197
6057	NC_010546	CT	3	6	274353	274358	0 %	50 %	0 %	50 %	172035197
6058	NC_010546	AAG	2	6	274464	274469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_010546	AACT	2	8	274475	274482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_010546	GCCG	2	8	274537	274544	0 %	0 %	50 %	50 %	172035198
6061	NC_010546	ATG	2	6	274616	274621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035198
6062	NC_010546	TGA	2	6	274629	274634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035198
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6064	NC_010546	CAT	2	6	274680	274685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035198
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6066	NC_010546	AGTG	2	8	274794	274801	25 %	25 %	50 %	0 %	172035198
6067	NC_010546	CTG	2	6	274811	274816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035198
6068	NC_010546	TTA	2	6	274832	274837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035198
6069	NC_010546	CGAT	2	8	274880	274887	25 %	25 %	25 %	25 %	172035198
6070	NC_010546	GGA	2	6	274939	274944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035198
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6072	NC_010546	A	6	6	274991	274996	100 %	0 %	0 %	0 %	172035198
6073	NC_010546	GACTTA	2	12	275056	275067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	172035198
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6078	NC_010546	AGAA	2	8	275337	275344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_010546	T	6	6	275354	275359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_010546	GCT	4	12	275485	275496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035199
6081	NC_010546	ACTT	2	8	275533	275540	25 %	50 %	0 %	25 %	172035199
6082	NC_010546	TAA	2	6	275575	275580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_010546	A	7	7	275588	275594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_010546	TCCAAT	2	12	275600	275611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6087	NC_010546	CATAA	2	10	275720	275729	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6088	NC_010546	ATG	2	6	275740	275745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6096	NC_010546	AGAA	2	8	276110	276117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010546	CTAG	2	8	276183	276190	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_010546	TA	3	6	276274	276279	50 %	50 %	0 %	0 %	172035201
6099	NC_010546	TTA	2	6	276281	276286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035201
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6106	NC_010546	TATCCT	2	12	276764	276775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_010546	AATTA	2	10	276894	276903	60 %	40 %	0 %	0 %	172035202
6108	NC_010546	AAT	2	6	276934	276939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035202
6109	NC_010546	AAT	2	6	276985	276990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035202
6110	NC_010546	AGTAT	2	10	277060	277069	40 %	40 %	20 %	0 %	172035202
6111	NC_010546	ATA	2	6	277172	277177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035202
6112	NC_010546	CCA	2	6	277180	277185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035202
6113	NC_010546	AAC	2	6	277200	277205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035202
6114	NC_010546	TGC	2	6	277216	277221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035202
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6116	NC_010546	ATC	2	6	277358	277363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035202
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6119	NC_010546	A	6	6	277464	277469	100 %	0 %	0 %	0 %	172035202
6120	NC_010546	TGGG	2	8	277574	277581	0 %	25 %	75 %	0 %	172035202
6121	NC_010546	ACA	2	6	277650	277655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035202
6122	NC_010546	TCA	2	6	277719	277724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035202
6123	NC_010546	AATT	2	8	277746	277753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6374	NC_010546	ATG	2	6	289291	289296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035211
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6495	NC_010546	ATTT	2	8	295703	295710	25 %	75 %	0 %	0 %	172035215
6496	NC_010546	AGA	2	6	295717	295722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035215
6497	NC_010546	ATC	2	6	295723	295728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035215
6498	NC_010546	T	6	6	295739	295744	0 %	100 %	0 %	0 %	172035215
6499	NC_010546	CGT	2	6	295745	295750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035215
6500	NC_010546	TAA	2	6	295781	295786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035215

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