MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010546	AAT	2	6	226103	226108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5002	NC_010546	TCAA	2	8	226134	226141	50 %	25 %	0 %	25 %	172035155
5003	NC_010546	ATT	2	6	226148	226153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035155
5004	NC_010546	CAA	2	6	226165	226170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035155
5005	NC_010546	ATC	2	6	226223	226228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035155
5006	NC_010546	CAG	2	6	226231	226236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035155
5007	NC_010546	TCC	2	6	226244	226249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035155
5008	NC_010546	CCA	2	6	226540	226545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035155
5009	NC_010546	CTTC	2	8	226581	226588	0 %	50 %	0 %	50 %	172035155
5010	NC_010546	AAT	2	6	226589	226594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5011	NC_010546	GGT	2	6	226607	226612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035155
5012	NC_010546	ATTCAA	2	12	226702	226713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035155
5013	NC_010546	GTTT	2	8	226722	226729	0 %	75 %	25 %	0 %	172035155
5014	NC_010546	CCA	2	6	226891	226896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035155
5015	NC_010546	CTTC	2	8	226932	226939	0 %	50 %	0 %	50 %	172035155
5016	NC_010546	AAT	2	6	226940	226945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5017	NC_010546	GGT	2	6	226958	226963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035155
5018	NC_010546	ATTCAA	2	12	227053	227064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035155
5019	NC_010546	GTTT	2	8	227073	227080	0 %	75 %	25 %	0 %	172035155
5020	NC_010546	CCA	2	6	227242	227247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035155
5021	NC_010546	CTTC	2	8	227283	227290	0 %	50 %	0 %	50 %	172035155
5022	NC_010546	AAT	2	6	227291	227296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5023	NC_010546	GGT	2	6	227309	227314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035155
5024	NC_010546	ATTCAA	2	12	227404	227415	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035155
5025	NC_010546	GTTT	2	8	227424	227431	0 %	75 %	25 %	0 %	172035155
5026	NC_010546	CCA	2	6	227593	227598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035155
5027	NC_010546	CTTC	2	8	227634	227641	0 %	50 %	0 %	50 %	172035155
5028	NC_010546	AAT	2	6	227642	227647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5029	NC_010546	GGT	2	6	227660	227665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035155
5030	NC_010546	ATTCAA	2	12	227755	227766	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035155
5031	NC_010546	GTTT	2	8	227775	227782	0 %	75 %	25 %	0 %	172035155
5032	NC_010546	CCA	2	6	227944	227949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035155
5033	NC_010546	CTTC	2	8	227985	227992	0 %	50 %	0 %	50 %	172035155
5034	NC_010546	AAT	2	6	227993	227998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5035	NC_010546	GGT	2	6	228011	228016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035155
5036	NC_010546	ATTCAA	2	12	228106	228117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035155
5037	NC_010546	GTTT	2	8	228126	228133	0 %	75 %	25 %	0 %	172035155
5038	NC_010546	CCA	2	6	228295	228300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035155
5039	NC_010546	AAT	2	6	228344	228349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5040	NC_010546	ATTCAA	2	12	228457	228468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172035155
5041	NC_010546	TCT	2	6	228570	228575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035155
5042	NC_010546	TCA	2	6	228594	228599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035155
5043	NC_010546	T	6	6	228616	228621	0 %	100 %	0 %	0 %	172035155
5044	NC_010546	CTT	2	6	228682	228687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035155
5045	NC_010546	T	7	7	228786	228792	0 %	100 %	0 %	0 %	172035155
5046	NC_010546	GAA	2	6	228813	228818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035155
5047	NC_010546	ATA	2	6	228846	228851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035155
5048	NC_010546	TAT	2	6	228863	228868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_010546	A	6	6	228896	228901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_010546	ACA	2	6	228928	228933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_010546	TAAA	2	8	228969	228976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010546	TAA	2	6	228989	228994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_010546	TAT	2	6	229028	229033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010546	A	9	9	229082	229090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_010546	TA	4	8	229091	229098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010546	AC	3	6	229110	229115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_010546	A	7	7	229126	229132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010546	A	6	6	229148	229153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010546	A	7	7	229155	229161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010546	AAT	2	6	229176	229181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_010546	CTT	2	6	229349	229354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035156
5062	NC_010546	CAA	2	6	229377	229382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035156
5063	NC_010546	CAG	2	6	229431	229436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035156
5064	NC_010546	TAA	2	6	229458	229463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035156
5065	NC_010546	ATC	2	6	229495	229500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035156
5066	NC_010546	CTT	2	6	229503	229508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035156
5067	NC_010546	TCT	2	6	229511	229516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035156
5068	NC_010546	ATA	2	6	229551	229556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035156
5069	NC_010546	CTG	2	6	229566	229571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035156
5070	NC_010546	CAT	2	6	229572	229577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035156
5071	NC_010546	TAA	2	6	229599	229604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035156
5072	NC_010546	AT	3	6	229628	229633	50 %	50 %	0 %	0 %	172035156
5073	NC_010546	GCT	2	6	229709	229714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035156
5074	NC_010546	TTG	2	6	229735	229740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035156
5075	NC_010546	GTC	2	6	229868	229873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035156
5076	NC_010546	ATC	2	6	229921	229926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035156
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5088	NC_010546	TTG	2	6	230458	230463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035156
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5090	NC_010546	CATC	2	8	230516	230523	25 %	25 %	0 %	50 %	172035156
5091	NC_010546	TGC	2	6	230539	230544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035156
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5094	NC_010546	ACAA	2	8	230692	230699	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_010546	A	6	6	230698	230703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010546	AAT	2	6	230763	230768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035157
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5098	NC_010546	ATA	2	6	230836	230841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035157
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5101	NC_010546	A	6	6	230935	230940	100 %	0 %	0 %	0 %	172035157
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5107	NC_010546	AAT	2	6	231164	231169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035157
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5109	NC_010546	TAA	2	6	231200	231205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035157
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5112	NC_010546	ACC	2	6	231283	231288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035157
5113	NC_010546	AAG	2	6	231301	231306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035157
5114	NC_010546	TCT	2	6	231417	231422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035157
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5116	NC_010546	CAAT	2	8	231475	231482	50 %	25 %	0 %	25 %	172035157
5117	NC_010546	ATT	2	6	231494	231499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035157
5118	NC_010546	TAA	2	6	231700	231705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010546	ATTA	2	8	231728	231735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010546	CTT	2	6	231774	231779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035158
5121	NC_010546	T	6	6	231827	231832	0 %	100 %	0 %	0 %	172035158
5122	NC_010546	TC	3	6	231868	231873	0 %	50 %	0 %	50 %	172035158
5123	NC_010546	GCT	2	6	231881	231886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035158
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5125	NC_010546	GAC	2	6	231978	231983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035158
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5128	NC_010546	TTA	2	6	232206	232211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035158
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5146	NC_010546	T	6	6	232789	232794	0 %	100 %	0 %	0 %	172035158
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5235	NC_010546	GCTTGT	2	12	236765	236776	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	172035160
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5238	NC_010546	ACC	2	6	236939	236944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035160
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5240	NC_010546	T	6	6	237046	237051	0 %	100 %	0 %	0 %	172035160
5241	NC_010546	CAACA	2	10	237088	237097	60 %	0 %	0 %	40 %	172035160
5242	NC_010546	CA	3	6	237096	237101	50 %	0 %	0 %	50 %	172035160
5243	NC_010546	CTC	2	6	237102	237107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035160
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5245	NC_010546	ATC	2	6	237205	237210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_010546	TGA	2	6	237224	237229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_010546	CAC	2	6	237237	237242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5248	NC_010546	AATC	2	8	237243	237250	50 %	25 %	0 %	25 %	172035161
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5250	NC_010546	TAA	2	6	237314	237319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035161
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5271	NC_010546	AATG	2	8	238300	238307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_010546	TAA	2	6	238319	238324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_010546	CTTT	2	8	238355	238362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5348	NC_010546	AAATAG	2	12	241958	241969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	172035165
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5359	NC_010546	TA	3	6	242527	242532	50 %	50 %	0 %	0 %	172035167
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5366	NC_010546	A	6	6	242679	242684	100 %	0 %	0 %	0 %	172035167
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5497	NC_010546	A	7	7	247887	247893	100 %	0 %	0 %	0 %	172035170
5498	NC_010546	TAT	2	6	247905	247910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035170
5499	NC_010546	ATT	2	6	247937	247942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035170
5500	NC_010546	TAA	2	6	247977	247982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035170

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